三角帆蚌alpha-2巨球蛋白cDNA全长的克隆及表达特征
作者:
作者单位:

作者简介:

通讯作者:

中图分类号:

基金项目:

省自然科学基金


Full-length cDNA cloning and expression characterization of alpha-2 macroglobulin from Hyriopsis cumingii
Author:
Affiliation:

Fund Project:

  • 摘要
  • |
  • 图/表
  • |
  • 访问统计
  • |
  • 参考文献
  • |
  • 相似文献
  • |
  • 引证文献
  • |
  • 资源附件
  • |
  • 文章评论
    摘要:

    本研究通过RACE法克隆了三角帆蚌α2M全长cDNA序列,已经提交Genbank,核苷酸序列登陆号:DQ993157.1。该基因cDNA全长5124 bp,其中编码区4836 bp, 5’端非编码区35 bp, 3’端非编码区为253 bp(含polyA尾31 bp),生物信息学方法分析后发现,该基因能编码1611个氨基酸,其中前23个氨基酸残基为信号肽序列,成熟蛋白分子量为177571.8D,等电点为5.49,蛋白的不稳定系数为39.53,表明该蛋白是稳定的。同时,利用Ralpha-2巨球蛋白是河蚌体内重要的天然免疫因子,参与广泛的免疫防御和调节。通过RACE法克隆了三角帆蚌α2M全长cDNA序列,提交Genbank,获得核苷酸序列登陆号:DQ993157.1。同时,采用生物信息学方法对alpha-2巨球蛋白进行了系统分析。该基因cDNA全长5 124 bp,其中编码区4 836 bp, 5′端非编码区35 bp, 3′端非编码区为253 bp(含polyA尾31 bp),该基因能编码1 611个氨基酸,其中前23个氨基酸残基为信号肽序列,成熟蛋白分子量为177 571.8u,等电点为5.49。蛋白的不稳定系数为39.53,表明该蛋白是稳定的。在此基础上,以18 S作为内标,利用半定量RT-PCR法检测α2M基因在三角帆蚌不同组织和不同生理状态下的表达情况。结果表明,alpha-2巨球蛋白仅在血细胞中有表达,而在外套膜、闭壳肌、肠和性腺中没有表达。经注射大肠杆菌和嗜水气单胞菌12h后,三角帆蚌体内α2M的表达水平都有一定量的升高,证明α2M是三角帆蚌基础免疫系统中的组成部分。本研究丰富了软体动物免疫学研究内容,为三角帆蚌抗病机理提供理论资料。T-PCR法检测α2M基因在三角帆蚌不同组织的表达情况,仅在血细胞中有表达,而在外套膜、闭壳肌、肠和性腺中没有表达。经注射大肠杆菌和嗜水气单胞菌12 h后,三角帆蚌体内α2M的表达水平都有一定量的升高,证明α2M是三角帆蚌基础免疫系统中的重要组成部分。

    Abstract:

    In this study, α2M gene from Hyriopsis cumingii was cloned. The accession number in the Genbank is DQ993157.1.The full-length cDNA spans 5124bp, which contains an open reading frame of 4836bp, 5’ untranslated region of 35bp and 3’untranslated region of 253bp. The open reading frame encodes a protein of 1611 amino acids. The first 23 amino acids in the N-terminus is recognized as a signal peptide. The relative molecular weight of the deduced protein is 177571.8D, isoelectric point is 5.49, and instability index is 39.53, which is classified as stable. Furthermore, Expression of α2M in different tissues of Hyriopsis cumingii was determined by RT-PCR and the result showed no expression was detected in mantel, conductor muscle, intestine, sexual gland except hemocyte. After injecting by Escherichia coli and Aeromonas hydrophila, α2M expression level had a certain amount of rise 12h later, which fully proved the existence of α2M immune system in Hyriopsis cumingii.

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

施志仪.三角帆蚌alpha-2巨球蛋白cDNA全长的克隆及表达特征[J].水产学报,2008,32(4):526~532

复制
分享
文章指标
  • 点击次数:
  • 下载次数:
  • HTML阅读次数:
  • 引用次数:
历史
  • 收稿日期:2007-06-08
  • 最后修改日期:2007-08-20
  • 录用日期:2007-11-12
  • 在线发布日期: 2008-07-07
  • 出版日期: