| 金边鲤皮肤黑色素合成及转运相关基因表达分析 |
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| 引用本文： | 韦玲静,吕业坚,邹辉,文衍红,甘宝江,张桂姣,张盛,严雪瑜,叶香尘.金边鲤皮肤黑色素合成及转运相关基因表达分析[J].南方农业学报,2020,51(2):453-460. |
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| 作者姓名： | 韦玲静 吕业坚 邹辉 文衍红 甘宝江 张桂姣 张盛 严雪瑜 叶香尘 |
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| 作者单位： | 广西水产引育种中心,南宁,530031柳州市水产技术推广站,广西柳州,545066融水县水产技术推广站,广西融水,545300 |
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| 摘 要： | 目的]研究影响金边鲤皮肤色素沉着的关键基因及信号通路,揭示其皮肤颜色差异形成的原因,为金边鲤良种培育提供候选基因信息.方法]基于突变型金边鲤黄色皮肤(Y组)和黑色皮肤(B组)及野生型金边鲤黑色皮肤(W组)的转录组测序数据,筛选分析获得部分共有差异表达基因,利用实时荧光定量PCR检测差异表达基因和黑色素合成相关基因的表达情况,并分析各基因间的相关性.结果]依据转录组数据筛选获得ACT3、MYH2、TPM1、TPM2和TPM3共5个来源于心肌肾上腺素信号通路及与细胞动力相关的基因;除ACT3基因外,其余4个基因(MYH2、TPM1、TPM2和TPM3)在Y组皮肤中的相对表达量均显著低于B组和W组(P<0.05,下同),与转录组分析的差异基因表达趋势一致.MC-1R、TYR、TYRP1和TYRP2等4个黑色素合成相关基因在金边鲤皮肤中的表达情况为:B组皮肤中MC-1R基因的相对表达量显著高于Y组和W组;TYR、TYRP1和TYRP2基因在3组皮肤中的相对表达量排序均为W组>B组>Y组,其中W组的相对表达量显著高于B组和Y组.相关性分析结果显示,MC-1R和TYR基因与ACT3、MYH2、TPM1、TPM2和TPM3基因呈显著或极显著(P<0.01)正相关,而TYRP1和TYRP2基因与这5个差异表达基因均无显著相关性(P>0.05).结论]ACT3、MYH2、TPM1、TPM2和TPM3基因及其所在的心肌肾上腺素信号通路可能影响黑色素合成与运动,且与黑色素合成相关基因存在相关性,可作为金边鲤体色变异研究中的标记基因.
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| 关 键 词： | 金边鲤 黑色素 差异表达基因 黑色素合成相关基因 心肌肾上腺素通路 色素沉着 |
Skin melanin synthesis of Jinbian carp and expression analysis of transport related genes |
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| WEI Ling-jing,LYU Ye-jian,ZOU Hui,WEN Yan-hong,GAN Bao-jiang,Zhang Gui-jiao,ZHANG Sheng,YAN Xue-yu,YE Xiang-chen.Skin melanin synthesis of Jinbian carp and expression analysis of transport related genes[J].Journal of Southern Agriculture,2020,51(2):453-460. |
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| Authors: | WEI Ling-jing LYU Ye-jian ZOU Hui WEN Yan-hong GAN Bao-jiang Zhang Gui-jiao ZHANG Sheng YAN Xue-yu YE Xiang-chen |
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