| 基于线粒体COⅠ基因和D-Loop区序列的7个鲤群体遗传差异分析 |
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| 引用本文： | 邹辉,韦玲静,黄杰,甘宝江,莫洁琳,杨著山,滕忠作,刘康,叶香尘.基于线粒体COⅠ基因和D-Loop区序列的7个鲤群体遗传差异分析[J].南方农业学报,2020,51(5):1209-1216. |
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| 作者姓名： | 邹辉 韦玲静 黄杰 甘宝江 莫洁琳 杨著山 滕忠作 刘康 叶香尘 |
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| 作者单位： | 广西水产引育种中心,南宁,530031柳州市渔业技术推广站,广西柳州,545006三江县水产技术推广站,广西三江,545500融水县水产技术推广站,广西柳州,545300 |
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| 摘 要： | 目的]从分子水平探究不同鲤群体的遗传进化差异,明确金边鲤线粒体基因的遗传进化多样性,为深入开展其遗传资源保护及综合利用提供理论依据.方法]采用PCR直接测序分析金边鲤、晒江鲤、太湖鲤、福瑞鲤、建鲤、兴国红鲤和黑龙江野鲤等7个鲤群体的线粒体COⅠ基因和D-Loop区序列,通过MegAlign 7.0和DnaSP 5.0对多态位点数(S)、单倍型数(H)、核苷酸多样度(Pi)、单倍型多样度(Hd)、平均核苷酸差异(K)及群体内和群体间的遗传距离等遗传信息进行分析,运用Arlequin 3.5进行基因AMOVA分析,并以MEGA 7.0的邻接法(NJ)构建遗传进化树.结果]获得7个鲤群体的COⅠ基因序列长787 bp和D-Loop区序列长878 bp.7个鲤群体间的COⅠ基因平均遗传距离为0.0035,其中金边鲤与晒江鲤的群体遗传距离最大(0.0011),与建鲤的群体遗传距离最小(0.0004);D-Loop区序列平均遗传距离为0.0292,其中金边鲤与黑龙江野鲤的群体遗传距离最大(0.0269),与福瑞鲤和建鲤的群体遗传距离最小,均为0.0102.在161份样品中,COⅠ基因共检测到12种单倍型,以单倍型HAP2最多;D-Loop区序列共检测到41种单倍型,其中HAP1、HAP2、HAP3、HAP4、HAP6、HAP7、HAP13和HAP15为金边鲤的特有单倍型.COⅠ基因的群体间变异贡献率为19.27%,群体内变异贡献率为80.73%;D-Loop区序列的群体间变异贡献率为20.29%,群体内变异贡献率为79.71%.从基于K2P遗传距离构建的遗传进化树可看出,建鲤、福瑞鲤和太湖鲤3个群体的亲缘关系最近,且同时与金边鲤聚为一小支.结论]金边鲤的遗传多样性处于较高水平,可进一步选育获得金边鲤独有的优良性状品系,或通过基因辅助技术与其他鲤品种进行杂交而获得更优秀的新品系.
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| 关 键 词： | 金边鲤 COⅠ基因 D-Loop区 遗传多样性 遗传变异 |
Genetic differences among seven carp populations based on mitochondrial CO Ⅰ gene and D-Loop region sequences |
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| ZOU Hui,WEI Ling-jing,HUANG Jie,GAN Bao-jiang,MO Jie-lin,YANG Zhu-shan,TENG Zhong-zuo,LIU Kang,YE Xiang-chen.Genetic differences among seven carp populations based on mitochondrial CO Ⅰ gene and D-Loop region sequences[J].Journal of Southern Agriculture,2020,51(5):1209-1216. |
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| Authors: | ZOU Hui WEI Ling-jing HUANG Jie GAN Bao-jiang MO Jie-lin YANG Zhu-shan TENG Zhong-zuo LIU Kang YE Xiang-chen |
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