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大黄鱼cGPDH和mGPDH基因克隆及低温胁迫下的表达差异分析
引用本文:张东玲,徐浩,张震西,王志勇.大黄鱼cGPDH和mGPDH基因克隆及低温胁迫下的表达差异分析[J].中国水产科学,2021,28(3):253-264.
作者姓名:张东玲  徐浩  张震西  王志勇
作者单位:集美大学水产学院, 农业农村部东海海水健康养殖重点实验室, 福建 厦门 361021
基金项目:国家自然科学基金重点项目(U1705231); 福建省自然科学基金项目(2019J01692); 福建省教育厅项目(JT180274); 福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室开放课题资助项目(2015fjxcq07); 厦门市科技计划项目(3502Z20193052).
摘    要:为探究 cGPDH 和 mGPDH 在大黄鱼(Larimichthys crocea)适应低水温过程中所起的调控作用, 本研究采用 RACE-PCR 技术克隆了大黄鱼 cGPDH 和 mGPDH 基因全长 cDNA 序列, cGPDH 和 mGPDH 基因序列全长分别为 1577 bp 和 2319 bp, 包含长度为 1050 bp 和 2193 bp 的开放阅读框, 分别编码 349 和 730 个氨基酸; 氨基酸比对分析发现大黄鱼 cGPDH 和 mGPDH 与其他硬骨鱼类同源性较高, cGPDH 包含一个特征性序列 GXGXXG, mGPDH 包含 2 个 EF-hand 功能结构域; 进化树分析表明大黄鱼 cGPDH 和 mGPDH 与其他硬骨鱼类聚为一枝, 与棘头梅童鱼 (Collichthys lucidus)亲缘关系最近。生物信息学分析发现大黄鱼 cGPDH 和 mGPDH 均不含跨膜结构域, cGPDH 亚细胞定位于细胞质可能性最大, 三维结构包含一个 C 端 α 螺旋底物结合结构, 8 个 N 端 β 折叠结构和一个单体结构, mGPDH 定位于线粒体的可能性最大。qRT-PCR 分析显示 cGPDH 和 mGPDH 在所检测的 12 个组织中均有表达, cGPDH mRNA 主要表达在血液, 其次为鳃、头肾和肠道, 肌肉组织中表达量最低; 而 mGPDH mRNA 在头肾表达量最高, 肌肉组织表达量最低。在持续的冷胁迫下, 水温 15 ℃到 9 ℃每天降温 2 ℃, 9 ℃到 7 ℃每天降温 1 ℃, 7 ℃保持 5 d, 大黄鱼 cGPDH 和 mGPDH 在脑和肌肉表达趋势均显著上调。研究结果表明, cGPDH 和 mGPDH 基因可能在大黄鱼适应冬季低水温过程中发挥重要作用。

关 键 词:大黄鱼    cGPDH    mGPDH    低温    基因调控    基因表达

Molecular cloning of cGPDH and mGPDH and their expression analy-sis under low-temperature stress in Larimichthys crocea
Zhang Dongling,Xu Hao,Zhang Zhenxi,Wang Zhiyong.Molecular cloning of cGPDH and mGPDH and their expression analy-sis under low-temperature stress in Larimichthys crocea[J].Journal of Fishery Sciences of China,2021,28(3):253-264.
Authors:Zhang Dongling  Xu Hao  Zhang Zhenxi  Wang Zhiyong
Abstract:
Keywords:
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