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草鱼的微卫星亲权鉴定
引用本文:任昆,白俊杰,樊佳佳,全迎春,于凌云.草鱼的微卫星亲权鉴定[J].南方农业学报,2013,44(8):1367-1371.
作者姓名:任昆  白俊杰  樊佳佳  全迎春  于凌云
作者单位:中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广州510380上海海洋大学水产与生命学院,上海201306中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广州,510380
基金项目:国家大宗淡水鱼产业技术体系建设项目国家高技术研究发展计划(863计划)国家科技支撑计划
摘    要:目的]从亲权排除率、鉴别准确率、鉴别成功率等方面评价微卫星标记鉴别草鱼亲权关系的可行性,为草鱼系谱信息的确定奠定基础.方法]利用8个微卫星标记检测5个草鱼家系亲本(F.)及其子代(F1)的基因型,以Cervus 3.0软件进行亲权鉴定,并统计微卫星位点的等位基因数(Na)、多态信息含量(PIC)、观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)等;最后通过模拟分析和试验验证,评估8个微卫星位点最多可鉴定的亲本数及其与鉴定率、置信度之间的关系.结果]8个微卫星位点中,当两个亲本基因型未知时,单个亲本排除率(E-1P)介于0.342~0.668,平均值为0.520;当一个亲本基因型已知时,另一个亲本的排除率(E-2P)介于0.521~0.802,平均值为0.681;一对亲本组合的亲权排除率(E-PP)介于0.711~0.937,平均值为0.847.以95%置信水平和100%鉴定率为标准,模拟分析及试验验证结果表明,所选择的8个微卫星位点最多可以鉴定598个已知性别的亲本或431个未知性别的亲本.结论]所选的Hl18、H137、H165、H148、4703、C2489、H57、H81等8对微卫星标记可在生产及科研试验中用于获取草鱼系谱信息.

关 键 词:草鱼    微卫星标记    亲权鉴定    系谱信息    置信度    亲权排除率    鉴别准确率

Parentage identification of grass carp (Ctenopharyngodon idella)using micro-satellites
REN Kun,BAI Jun-jie,FAN Jia-jia,QUAN Ying-chun,YU Ling-yun.Parentage identification of grass carp (Ctenopharyngodon idella)using micro-satellites[J].Journal of Southern Agriculture,2013,44(8):1367-1371.
Authors:REN Kun  BAI Jun-jie  FAN Jia-jia  QUAN Ying-chun  YU Ling-yun
Abstract:
Keywords:
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