| 基于mtDNA Cyt b序列变异探究柴达木黄牛的母系遗传多样性及遗传背景 |
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| 引用本文： | 杨秋蕾,魏旭东,马志杰,陈生梅,晁生玉,乌兰巴特尔.基于mtDNA Cyt b序列变异探究柴达木黄牛的母系遗传多样性及遗传背景[J].浙江农业学报,2023(2):285-292. |
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| 作者姓名： | 杨秋蕾 魏旭东 马志杰 陈生梅 晁生玉 乌兰巴特尔 |
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| 作者单位： | 1. 青海大学畜牧兽医科学院;2. 青海省海西州农业技术推广服务中心 |
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| 基金项目： | 青海省自然科学基金(2021-ZJ-914,2017-ZJ-906)；;国家自然科学基金(31960656)； |
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| 摘 要： | 为探究柴达木黄牛的母系遗传多样性及遗传背景，本研究随机选取柴达木黄牛5个主产区268个个体，通过PCR方法和直接测序技术得到其mtDNA Cyt b基因全序列，使用生物信息学软件分析其遗传多样性、分化及母系起源，进而在分子水平上揭示其母系遗传多样性水平、分化程度及母系遗传背景。结果表明：柴达木黄牛Cyt b基因核苷酸序列长度为1 140 bp,比对分析共检测到29个核苷酸多态位点，其中单一多态位点4个，简约信息位点25个；依据序列间核苷酸变异共确定了12种单倍型，其中优势单倍型为H2,品种单倍型多样度为0.588 2±0.030 0,核苷酸多样度为0.004 0±0.002 2,表明柴达木黄牛具有较丰富的母系遗传多样性。柴达木黄牛品种内5个群体间分化指数Fst值在-0.010 4～0.161 8,提示品种内群体间分化程度存在差异，其中格尔木群体与乌兰群体间分化程度最大(Fst=0.161 8),大柴旦群体和茫崖群体间的分化程度最小(Fst=-0.010 4)。基于UPGMA法的品种内群体间聚类关系表明，柴达木黄牛品种内5个群体可聚为2类，其中格尔木群体与都兰群体最先聚在一起，大柴旦群体...
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| 关 键 词： | 柴达木黄牛 mtDNA Cyt b 遗传多样性 分化 母系起源 |
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