| 恩诺沙星曝露下企鹅珍珠贝肠道微生物多样性及优势菌变化规律 |
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| 引用本文： | 陈明强,李有宁,邓正华,于刚,马振华,郑兴,洪嘉炜,魏海军,王雨.恩诺沙星曝露下企鹅珍珠贝肠道微生物多样性及优势菌变化规律[J].南方农业学报,2019,50(4):851-859. |
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| 作者姓名： | 陈明强 李有宁 邓正华 于刚 马振华 郑兴 洪嘉炜 魏海军 王雨 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心,海南三亚 572018农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室,广州 510300中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心,海南三亚,572018 |
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| 基金项目： | 海南省自然科学基金;海南省重点研发计划项目;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;广东省渔港建设;渔业发展专项 |
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| 摘 要： | 目的]明确恩诺沙星曝露下企鹅珍珠贝肠道微生物群落结构尤其是优势菌的变化规律,为企鹅珍珠贝养殖过程中恩诺沙星的科学用药提供参考依据.方法]针对3个恩诺沙星浓度(0、5和10 mg/L)共9个企鹅珍珠贝肠道样本中的细菌构建16S rRNA文库,再采用Illlumina高通量测序技术从门和属水平上比较分析各处理组间肠道微生物群落结构和多样性的差异.结果]从9个企鹅珍珠贝肠道样本中共检测到10个菌门,其优势菌门分别是变形菌门(Pro-teobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、梭杆菌门(Fusobacteria)、螺旋体门(Spirochaetae)、蓝藻门(Cyanobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes);共检测到79个菌属,优势菌属主要包括弧菌属(Vibrio)、发光杆菌属(Photobacterium)、嗜冷菌属(Psychrilyobacter)、假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)、疏螺旋体属(Borrelia)、交替单胞菌属(Alteromonas)、微拟球藻属(Nannochioropsis-oceanica)、弓形杆菌属(Arcobacter)、Thalassotalea、Amphritea、Tenacibaculum和微小杆菌属(Exiguobacterium)等.不同恩诺沙星浓度处理下,企鹅珍珠贝肠道的优势菌门与菌属种类丰度差异明显.经恩诺沙星处理后,企鹅珍珠贝肠道变形菌门相对丰度显著升高(P<0.05,下同)、拟杆菌门相对丰度显著降低;弧菌属相对丰度显著升高,微拟球藻属、Aquibacter、BD1-7_clade及希瓦氏菌属(Shewanella)相对丰度则显著降低;此外,弓形杆菌属相对丰度经10 mg/L恩诺沙星处理后显著升高,Psychrobium相对丰度经5 mg/L恩诺沙星处理后显著升高.结论]经恩诺沙星处理后企鹅珍珠贝肠道微生物的多样性与丰度发生明显变化,且肠道微生物中一些具有特殊功能的优势菌群结构比例也发生变化,该变化规律可为企鹅珍珠贝养殖过程中科学使用恩诺沙星提供参考依据.
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| 关 键 词： | 企鹅珍珠贝 恩诺沙星 肠道微生物 菌群结构 多样性 相对丰度 高通量测序 |
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