| 中国兰ISSR-PCR反应体系优化及引物筛选 |
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| 引用本文： | 黄晓慧,巫伟峰,陈春,张毅智,汪长水,徐建球,陈发兴,陈孝丑.中国兰ISSR-PCR反应体系优化及引物筛选[J].南方农业学报,2018,49(7):1282-1288. |
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| 作者姓名： | 黄晓慧 巫伟峰 陈春 张毅智 汪长水 徐建球 陈发兴 陈孝丑 |
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| 作者单位： | 福建省林业科技试验中心,福建 南靖,363600福建农林大学 园艺学院,福州,350000 |
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| 摘 要： | 目的]优化中国兰的ISSR-PCR反应体系,并筛选适用于中国兰ISSR分析的候选引物,为ISSR分子标记在中国兰的辅助育种及亲缘关系和遗传多样性分析等提供技术参考.方法]以6个中国兰品种为材料,采集其叶片样品,分别用研钵法和研磨仪法进行破碎研磨,比较两种方法提取DNA的效果,利用L25(53)正交试验和单因素试验对DNA模板量、引物浓度、2×Taq Master Mix添加量、循环数和退火温度进行优化,建立最佳ISSR-PCR反应体系,并从ISSR分子标记通用引物中筛选适用于中国兰的ISSR分析候选引物.结果]研磨仪法提取的DNA浓度明显高于研钵研磨法,但二者提取的DNA质量均较好(OD260/OD280为1.7~2.0).对ISSR-PCR反应体系扩增结果的影响程度排序为DNA模板量>引物浓度>2×Taq Master Mix添加量.综合考虑成本和DNA模板量,最佳ISSR-PCR反应体系(20.0μL):DNA模板10.0 ng、引物0.8μmol/L和2×Taq Master Mix 9.0μL.最佳循环数为35,最佳退火温度为49.6℃.基于上述优化结果,从100条引物中共筛选出42条适用于中国兰的ISSR候选引物.结论]研磨仪法可有效提高中国兰基因组DNA的提取率和质量,且利用优化后的ISSR-PCR反应体系和扩增程序及筛选出的引物,扩增获得的条带清晰、稳定,多样性好,可用于中国兰的遗传多样性和亲缘关系等分析研究.
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| 关 键 词： | 中国兰 ISSR 分子标记 反应 引物筛选 |
Optimization and primer screening of ISSR-PCR reaction system for Chinese Orchids |
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| HUANG Xiao-hui,WU Wei-feng,CHEN Chun,ZHANG Yi-zhi,WANG Chang-shui,XU Jian-qiu,CHEN Fa-xing,CHEN Xiao-chou.Optimization and primer screening of ISSR-PCR reaction system for Chinese Orchids[J].Journal of Southern Agriculture,2018,49(7):1282-1288. |
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| Authors: | HUANG Xiao-hui WU Wei-feng CHEN Chun ZHANG Yi-zhi WANG Chang-shui XU Jian-qiu CHEN Fa-xing CHEN Xiao-chou |
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