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1.
徐云碧 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》1994,(6)
描述了分子标记－数量性状基因座位（ＱＴＬ）之间重组率的矩估计法和最大似然估计法，两种方法都考虑了ＱＴＬ基因型间数量性状方差的同质性和异质性。ＭｏｎｔｅＣａｒｌｏ模拟表明，采用最大似然法能比矩估计法获得更为准确的重组率估计值，标记－ＱＴＬ之间的松驰连锁通常与重组率及有关参数估值的偏倚有关，将ＬＯＤ值与似然比检验相结合，为重组率估值及连锁强度的相互比较提供了有效的方法。 相似文献
2.
分子标记与QTL间重组率的估计及Monte Carlb模拟 总被引：1，自引：0，他引：1
徐云碧 《浙江农业大学学报》1994,20(6):579-586
描述了分子标记－数量性状基因座位（ＱＴＬ）之间重组率的矩估计法和最大似然估计法，两种方法都考虑ＱＴＬ基因型间数量性状方差的同质性和异质性，Ｍｏｎｔｅ Ｃａｒｌｏ模拟表明，采用最大拟然法能比矩估计法获得更为准确的重组率估计值，标记－ＱＴＬ之间的松弛连锁通常重组率及有关参数估值的偏倚有关，将ＬＯＤ值与似然比检验相结合，为重组率估值及连锁强度的相互比较提供了有效的方法。 相似文献
3.
徐云碧 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》1994,(6)
通过比较矩估计法和最大似然法在标记－ＱＴＬ连锁检测、重组率估计及ＱＴＬ基因型的均值和方差估计方面的效率，探讨了样本容量对这些参数估计的影响。结果表明，ＬＯＤ估计值随作图群体样本容量的增加而增加，重组率估值的偏倚随样本容量的增加而减少。ＱＴＬ基因型均值和方差估计值偏倚的程度均随理论重组率的增加而增加，随群体样本容量的增加而减少，最大似然法的估计效率高于矩估计法，且当理论重组率较高时尤为明显，在ｒ＝０．０－０．３０范围内，要获得无偏的重组率、均值和方差估计值，采用矩估计法时，要求样本容量ｎ＞１０００，而采用最大似然法一般只要求样本容量，ｎ≥３００．当标记－ＱＴＬ完全独立时，两种方法均不能获得这些参数的无偏估计值。 相似文献
4.
QTL作图效率的影响因素—群体大小 总被引：9，自引：0，他引：9
徐云碧 《浙江农业大学学报》1994,20(6):573-578
通过比较矩估计法和最大似然法在标记－ＱＴＬ连锁检测、重组率估计及ＱＴＬ基因型的均值和方差估计方面的效率，探讨了样本容量对这些参数估计的影响，结果表明，ＬＯＤ估计值随作图群体样本容量的增加而增加，重组率估值的偏倚随样本容量的增加而减少，ＱＴＬ基因型均值和方差估计值偏倚的程度均随理论重组率的增加而增加，随群体样本容量的增加而减少，最大似然法的估计效率高于矩估计法，且当理论重组率较高时尤其明显，在ｒ＝０ 相似文献
5.
系统描述了数量性状基因座位作图的统计方法－－单个遗传标记ＱＴＬ之间重组了最大似然估计法，并将ＬＯＤ值与似然比检验相结合，应用于重组率估值及连锁强度的显著性检验，编写了可在微型机上运行，适合于Ｆ２、ＤＨ、ＢＣ等群体ＱＴＬ作图的通用计算机程序，并提供了水稻广亲和基因及与生育期有关的ＱＴＬ作图的应用实例。 相似文献
6.
采用最大似然区间定位法对阈性状的标记QTL进行连锁分析,并对影响阈性状QTL检测效率的主要因素(性状遗传力、QTL的方差贡献率、标记间重组率、阈值)进行了模拟研究。实验设计的群体为利用标记位点和QTL位点上都为杂合子的公畜与来自随机平衡群体的母畜群交配产生的半同胞个体组成,模拟产生的资源群体大小为500头。研究结果表明:当性状的遗传力较高,QTL方差贡献较大时,检验统计量LR值较大,检验效果较好;遗传力较低,QTL方差贡献较小时,LR值较小,QTL检测效果较差。另外,标记间重组率和阈值对QTL定位的准确度也有直接的影响,随着标记间重组率的增大,QTL定位的效果越差,当阈值在0.2~5之间时,QTL检测效果最好。 相似文献
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两对互作基因重组率EM算法估计的模拟研究 总被引：3，自引：0，他引：3
推导出存在上位性互作的网对连锁基因在F2群体中各表型的概率和条件概率以便利用EM（expectation and maximization：期望最大化）算法估计重组率，还获得了重组率的标准误公式。通过Monte Carlo模拟发现：用EM算法和Fisher法估计重组率时其结果一致；前者易推广到两组基因间具有上位性互作的情形，模拟显示其无偏性好。 相似文献
9.
将最佳线性无偏预测（布拉普－ＢＬＵＰ）法及约束极大似然估计（ＲＥＭＬ）法应用于南阳南牛几个数量性状遗传力的估计，得出其中８月龄体高，体斜长，胸围，管围及坐骨端宽的遗传力的约束极大似然估计值分别为０．３８１３、０．５９６０、０．３７３８、０．３７３０和０．３３５５，１．５岁体高，体斜长，胸围，管围及体重的遗传力的约束极大似然估计值分别为０．５２９７、０．６２３９、０．３９２９、０．１２４２和０．４２ 相似文献
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高粱丝黑穗病3号生理小种抗性遗传研究及抗病基因分子标记 总被引：3，自引：1，他引：3
【目的】筛选抗丝黑穗病3号生理小种基因的分子标记,从而实现实验室内对抗丝黑穗病的选择,免去在育种中对抗丝黑穗病的田间鉴定。【方法】本研究采用SSR技术,应用分离群体分组分析法,分别利用恢复系分离群体（2381R/矮四）和保持系分离群体（Tx622B/7050B）,筛选抗丝黑穗病3号生理小种基因的分子标记。【结果】试验得出结果如下,高粱对丝黑穗病菌3号生理小种的抗性属于质量性状遗传,抗性表现为显性,只要亲本之一抗病,F1代即表现抗病;发现了2个在抗病品系中稳定出现、可作为高粱抗丝黑穗病3号生理小种基因标记应用的SSR标记：Xtxp13和Xtxp145。Xtxp13位于B染色体上,Xtxp145位于I染色体上,与抗病基因的重组率分别为9.6%和10.4%,距离抗病基因的遗传图距分别约为9.6 cM和10.4 cM。【结论】高粱对丝黑穗病菌3号生理小种的抗性可能受2对彼此独立的非等位基因控制,并且基因之间存在着互作;筛选SSR标记时发现,高粱抗丝黑穗病基因的分子标记较易在保持系群体中找到,在恢复系群体中DNA片段多态性较少,表明恢复系和保持系在抗性机制上可能存在差异。 相似文献
12.
品种生育期是水稻最重要的农艺性状之一,通过遗传育种方法改变品种的生育期,特别是缩短生育期．对水稻生产的发展具有重要意义。研究材料乐香202B是由乐山市农科所提供的早熟稳定性较好的品种．对其研究表明,乐香202B具显性早熟基因,经遗传分析表明,符合3:1分离比,且不具感光性及胞质效应。将该基因初步定位在染色体第2染色体短臂端,暂定名为Ef-2(x)。与微卫星标记RM279、RM154有连锁关系,遗传距离分别为13．5cM和8．9cM。该基因的定位为下一步的基因分离和克隆奠定了基础。 相似文献
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罗耀武 《河北农业大学学报》1988,(4)
同源四倍体的遗传比一般二倍体要复杂得多,本文介绍了同源四倍体不同基因型依染色体随机分离、依染色单体随机分离以及完全均衡分离的遗传方式。同时也讨论了“双减数值”以及利用它测定基因与着丝点之间重组值的方法。此外还讨论了测定基因与基因之间重组值的方法。这些对于同源四倍体的遗传育种研究都有重要参考价值。 相似文献
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Marker-free GFP transgenic tobacco plants were constructed based on Cre/lox site-specific recombination system. A GFP gene was introduced into the tobacco genome using the Bar gene as a linked selectable marker flanked by recombination sites in a directed orientation. The Bar gene expression box was subsequently excised from the plant genome by a strategy of Cre gene retransformation. After removal of the Cre-NPT Ⅱ locus by genetic segregation through self-cross, plants that incorporated only the GFP transgene were obtained. Transgenic tobacco plants mediated by Agrobacterium tumefaciens were obtained, which resisted herbicide Basta and GFP expressed well, then the Cre gene was subsequently introduced into 5 plants of them, respectively, by retransformation. The leaf disks from Cre transgenic plants were used to test the resistance to Basta on the medium with 8 mg L-1 of PPT. The results showed that few discs were able to regenerate normally, and the excision at 76-100% efficiency depended on individual retransformation events. Evidence for a precise recombination event was confirmed by cloning the nucleotides sequence surrounding the lox sites of the Basta sensitive plants. The result indicated that the excision event in the recombination sites was precise and conservative, without loss or alteration of any submarginal nucleotides of the recombination sites. Bar gene excised plants were selfpollinated to allow segregation of the GFP gene from the Cre-NPT Ⅱ locus. The progenies from self-pollinated plants were scored for Kan senstivity, then the segregation of GFP gene from Cre-NPT Ⅱ locus in the Kan senstive plants were confirmed by PCR analysis subsequently. Hence, constructing marker-free transgenic tobacco plants by Cre/lox sitespecific recombination system was reliable, and the strategy presented here should be applicable to other plants for the construction of marker-free transgenic plants as well. 相似文献
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对大学遗传学教学中基因、等位基因及复等位基因,减数分裂与三大遗传规律(分离规律、独立分配规律和连锁遗传规律),“多因一效”与“一因多效”,遗传图距与重组率,三点测验绘制遗传图谱,遗传图距与物理图距,基因重组与基因的精细结构等7个疑难点内容进行分析,并就相关内容加以补充,有助于加深学生对该内容的理解。 相似文献
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水稻507ys黄绿叶突变体的遗传鉴定与候选基因分析 总被引：2，自引：0，他引：2
【目的】对水稻507ys黄绿叶突变体进行遗传鉴定与候选基因分析。【方法】用化学诱变剂甲基磺酸乙酯（EMS）处理粳稻品种日本晴（Nipponbare）,从突变体库中获得一份黄绿叶突变体507ys。对该突变体进行表型观察以及主要农艺性状调查分析。将507ys与正常绿色品种进行杂交,调查F1代的叶色表型和F2群体的叶色分离情况,分析该突变表型的遗传行为。利用（507ys/明恢63）的F2作为定位群体,对507ys突变基因进行精细定位且遴选候选基因,对候选基因进行DNA测序验证及编码蛋白序列同源性分析。同时,测定507ys突变体和野生型亲本的光合色素含量,并利用高效液相色谱（HPLC）精确分析它们的叶绿素组成成分,以进一步揭示507ys黄绿叶突变基因的候选基因。【结果】507ys黄绿叶突变体整个生育期呈黄绿色。与野生型亲本日本晴相比,507ys突变体在分蘖期叶片的叶绿素和类胡萝卜素含量分别下降52.1%和58.1%,成熟期株高、每株有效穗数、每穗着粒数和结实率分别减少8.3%、51.0%、7.4%和11.6%。507ys与正常绿色品种日本晴和明恢63杂交的F1表现正常的绿色,F2群体绿色正常植株与黄绿叶突变植株分离比符合3﹕1,表明507ys的黄绿叶突变性状由1对隐性核基因控制。该突变基因定位在第10染色体长臂近端部SSR标记RM333和InDel标记L3之间,遗传距离分别为0.56 cM和0.14 cM,两标记之间的物理距离约为60.2 kb,此区间内包含13个有注释的预测基因。基因组序列分析发现,507ys突变体中编码叶绿素酸酯a加氧酶的OsCAO1（LOC_Os10g41780）在编码区第2 198位碱基（CDS第1 057位碱基）处,碱基G突变为碱基A,造成编码蛋白的氨基酸序列第353位的谷氨酸（E）突变成赖氨酸（K）。对叶绿素组成成分分析表明,507ys突变体叶片中只有叶绿素a,没有叶绿素b。【结论】507ys突变体基因是已报道的叶绿素酸酯a加氧酶基因OsCAO1的等位基因。507ys突变体在OsCAO1外显子上发生的一个点突变使得其体内叶绿素酸酯a加氧酶失活,造成叶绿素b合成受阻。 相似文献