共查询到20条相似文献，搜索用时 296 毫秒
1.
利用筛选出的多态性高、谱带清晰的8条ISSR引物和18对SRAP引物分别对海南省保存的69份红毛丹种质资源进行PCR扩增,8条ISSR引物共检测到425条多态性条带,其中品种(系)特异条带47个,平均位点多态性信息含量(PIC值)为0.928,可鉴别的种质资源数25~67份;18对SRAP引物共检测到894条多态性条带,其中品种(系)特异条带69个,平均位点多态性信息含量(PIC值)为0.936,可区分的种质资源数为17~63份。综合各项指标,利用ISSR16和ISSR5引物21个条带用于构建红毛丹种质DNA指纹图谱,该图谱可有效区分69份红毛丹种质资源。 相似文献
2.
《果树学报》2015,(5)
【目的】研究不同性状石榴品种的遗传关系和遗传多样性,为石榴种质资源分类、品种鉴定和有效利用提供参考依据。【方法】以具有不同性状的82个石榴品种为材料,用ISSR标记分析石榴种质资源的遗传多样性和品种亲缘关系。【结果】用筛选出的10条扩增清晰、多态性较好的引物对82个品种进行PCR扩增,共扩增出186个位点,其中多态性位点178个,多态性位点百分率(PPB)为95.69%,平均等位基因数(Na)为1.957 0,平均有效等位基因数(Ne)为1.302 4,平均Nei's的基因多样性指数(He)为0.214 0,平均Shannon信息指数(I)为0.356 7,品种间遗传相似系数(Gs)为0.478 4~0.994 6,UPGMA聚类结果在Gs为0.735时,将82个品种分为4大类。遗传相似系数矩阵和Cophenetic值之间的相关系数为0.985,说明聚类结果较准确。【结论】利用ISSR标记技术可有效揭示石榴种质资源的遗传多样性和品种间亲缘关系,82个石榴品种遗传多样性丰富。ISSR聚类结果与根据花瓣类型、结实性、籽粒硬度性状的分类结果吻合度较高,与地理生态环境也有一定的相关性。研究结果对石榴种质资源的保存、分类鉴定及杂交育种有重要参考意义。 相似文献
3.
ISSR和RAPD分子标记技术在不同君子兰品种遗传多样性上的应用 总被引：1，自引：1，他引：0
采用ISSR标记和RAPD标记技术研究了15个君子兰品种的遗传多样性。结果表明:从55条寡聚核苷酸引物中筛选出10条简单重复序列引物,共扩增出65条带,平均每条引物扩增出6.5条带,其中5.4条多态性带,多态性比率为81.95%;从55条寡聚核苷酸引物中筛选出11条多态性引物,共扩增出47条带,平均每条引物扩增出4.27条带,其中32条多态性带,多态性比率为67.88%。POPGEN软件计算出君子兰品种间遗传距离为0.1123~0.6330,平均值为0.3263。基于遗传相似系数的UPGMA聚类分析将15个品种明显聚为二组,国兰系列品种为一组,日本兰系列品种组成另一组。 相似文献
4.
南丰蜜橘及近缘品种的ISSR标记 总被引：3，自引：0，他引：3
利用ISSR分子标记对22份南丰蜜橘及其近缘品种的遗传多样性水平进行研究。从31个ISSR引物中筛选出13个引物,通过琼脂糖凝胶电泳共检测到119条稳定的条带,片段大小介于0.5～4 kb之间,条带数在8～13之间;扩增片段中多态性位点98个,平均多态性比率为82.35%。各品种间的Ne i`s基因多样性指数(H)和Shannon信息多样性指数分别为0.289 5和0.433 3,品种间遗传相似指数(GS)范围为0.487 4～0.949 6。通过UPGMA聚类分析,当遗传相似系数为0.72时,可以将22份南丰蜜橘及近缘品种分成3大类。 相似文献
5.
6.
我国南方长茄种质资源的ISSR标记分析 总被引：26，自引：1，他引：26
从分子水平用ISSR标记法对南方长茄资源的遗传多样性进行分析,从100个ISSR引物中共筛选出12个多态性明显、条带清晰、反应稳定的引物,对57个样品DNA共扩增出116条谱带,平均每个引物扩增出9·67条带,其中多态性位点84个(71%)。品种间遗传相似系数在0·51~0·98之间,表明茄子栽培种内品种间的遗传基础相对较狭窄。利用UPGMA聚类分析,能将57个南方长茄品种划分为6个类群,类群的划分与地方来源没有很大的关系。 相似文献
7.
牡丹89 个不同种源品种遗传多样性和亲缘关系分析 总被引：2，自引：0，他引：2
利用ISSR分子标记技术,从121条ISSR备选引物中筛选出条带清晰、多态性好的19条引物对89个牡丹品种的遗传多样性进行了分析。通过优化PCR试验条件,共获得188条带,其中177条表现出多态性,多态位点的百分率为94.1%。通过计算机软件分析,供试牡丹品种平均有效等位基因数为1.514,平均Nei’s基因多样性指数为0.3085,平均Shannon’s信息指数为0.4713;各品种间的相似系数介于0.3294 ~ 0.7744之间,平均为0.5722。利用UPGMA法作图,供试的89个品种可聚为2个类群,很好地将不同来源的品种区分开来。 相似文献
8.
24个山东石榴品种遗传多样性的ISSR分析 总被引：1，自引：0，他引：1
采用ISSR分子标记技术,利用8条ISSR引物对24个山东石榴品种进行遗传多样性分析。结果表明:共检测到178个DNA位点,平均每条引物扩增出22.25个DNA位点,其中有122个多态性DNA位点,多态性位点比率为68.54%。平均观察等位基因数、平均有效等位基因数、平均Nei’s基因多样性指数、平均Shannon信息指数分别为1.685 4、1.379 0、0.228 2、0.345 3;品种的遗传相似系数为0.674 2~0.910 1,其中‘峄城多刺’与‘峄城竹叶青’这2个品种的亲缘关系最远,而‘峄城大红皮酸’与‘峄城大青皮酸’的亲缘关系最近。通过UPGMA法构建分子树状图,以遗传相似系数约0.806为阈值,将供试的24个山东石榴品种分为6类,表明ISSR分子标记技术可有效用于石榴品种的遗传多样性分析。 相似文献
9.
ISSR．PCR技术在桂花品种分类研究中的应用 总被引：24，自引：5，他引：24
利用ISSR．PCR方法对桂花的19个品种进行了基因组多态性分析，从74个ISSR引物中筛选出13个多态性引物用于正式扩增，共扩增出9o条DNA片段，其中多态性DNA条带79条，占总扩增片段的87．8％ ，平均每个引物扩增的DNA带的数目为6．92条。根据ISSR扩增结果，应用RAPDistance软件进行Nei相似性系数和遗传距离计算，利用UPGMA法构建聚类树状图。聚类分析的结果把供试桂花的l9个品种分为8个大类，并对4个品种群的遗传关系和种下分类系统进行了探讨。 相似文献
10.
杏92份种质资源的ISSR分析 总被引：2，自引：0，他引：2
利用ISSR分子标记对92份杏抗寒种质资源进行了遗传多样性分析。从35条引物中筛选出10条用于杏资源的ISSR扩增,共扩增出86条带,其中多态性条带83条,多态性百分比为96.5%。用UPGMA法聚类分析,结果显示,龙垦14号杏(Armeniaca vulgaris)、A1B20(A.vulgaris)、牡红杏(A.vulgaris)3个普通杏品种聚为1类,辽杏(A.mandshurica)单独聚为1类,其他88份杏资源聚为1类,不同种质资源间表现出丰富的遗传多样性。 相似文献
11.
In this study RAPD markers were used to determine the diversity level among 24 Iranian pomegranate genotypes. One hundred decamer random primers were used for PCR reactions, among which 16 showed reliable polymorphic patterns. These primers produced 178 bands, of which 102 were polymorphic. Cluster analysis of the genotypes was performed based on data from polymorphic RAPD bands, using Jaccard's similarity coefficient and UPGMA clustering method. The highest and lowest similarities detected between genotypes were 0.89 and 0.29, respectively. At a similarity of 60%, the genotypes were divided into four sub-clusters. Cophenetic correlation coefficient between similarity matrix and cophenetic matrix of dendrogram was relatively high (r = 0.9) showing the goodness of fit of the dendrogram. RAPD markers showed to be a useful tool for studying the genetic diversity of pomegranate. 相似文献
12.
茶树品种资源遗传多样性的AFLP研究 总被引：22，自引：1，他引：22
利用AFLP - 银染分子标记技术, 对40个茶树品种(系) 进行遗传多样性与亲缘关系分析。选用多态性高、分辨力强的引物组合E-ACG/M-AAC、E-AGG/M-AAG与E-AGG/M-AGT分别对供试材料的基因组DNA进行扩增, 共获得226条清晰可辨的带, 其中多态性带207条, 多态位点百分率为91.59% ,这表明供试品种资源在DNA水平上酶切位点的分布存在广泛的变异。40份资源所检出的位点平均有效等位基因数、平均基因多样度、平均Shannon信息指数, 分别为1.59 ±0.09、0.35 ±0.04、0.53 ±0.05。应用SPSS软件计算遗传距离介于0.13～0148之间, 平均为0.32; UPGMA法将40份资源分成4个类群, 从相似性系数分析了各品种资源间的亲缘关系。 相似文献
13.
Rania Jbir Néjib Hasnaoui Messaoud Mars Mohamed Marrakchi Mokhtar Trifi 《Scientia Horticulturae》2008
The amplified fragment length polymorphism (AFLP) analysis of DNA was used to characterize 34 pomegranate cultivars. By using a combination of six primers, a total of 327 markers were scored with a mean of 57.5. The high percentage of polymorphic bands (ppb) of 94.7 and the resolving power (Rp) collective rate value of 129.14 were scored. Data proved that the tested primers were informative to discriminate among cultivars and to survey the genetic diversity in this fruit crop. It has been assumed that the local pomegranate germplasm is characterized by a typically continuous genetic diversity. The derived dendrogram proved that cultivars are clustered independently from their geographical origin and their denomination. In addition, AFLP permitted the generation of a nearly unlimited number of molecular markers that are reliable in differentiating the cultivars and/or the polyclonal varieties. 相似文献
14.
不同山楂品种亲缘关系的RAPD分析 总被引：3，自引：0，他引：3
为探讨山楂品种间的亲缘关系,采用RAPD技术对20个不同品种的山楂材料进行了基因组DNA多态性分析。从120个引物中筛选出15个10bp的随机引物对所选山楂品种的DNA样品进行PCR扩增,共得到216条谱带,177条表现多态性,多态性比率达81.9%,其中包含27条特异性谱带,揭示了山楂植物丰富的遗传多样性。且利用NTSYS软件和UPGMA法对扩增结果进行了品种间相似系数的计算及聚类分析,结果表明相似系数在0.71～0.87,实生楂与其他山楂品种亲缘关系较远。 相似文献
15.
云南25份石榴资源的RAPD分析 总被引：3，自引：0，他引：3
用RAPD标记技术分析了25份云南地方石榴材料(品种或类型)的亲缘关系,从128个随机引物中筛选出12个重复性好、条带清晰的多态性引物,并用这些引物对25份云南石榴材料进行RAPD扩增,共扩增出110条谱带,平均每个引物9.17条。多态性程度达到71.8%。用Statistic分析软件计算出的遗传距离为0.027～0.342,对25份材料进行了UPGA法聚类,亲缘关系树状图显示,25份云南石榴材料的遗传背景较复杂,难以划分类群。研究结果与生产上根据风味、花色、皮色、子粒颜色、核软硬程度等某一性状及栽培目的的分类方法不一致。 相似文献
16.
香蕉A基因组品种间遗传关系的SSR检测 总被引：3，自引：2，他引：3
应用SSR技术,对32个香蕉A基因组类型品种(系)的遗传关系进行了检测。40对SSR引物在32个品种(系)中分别扩增带数在3～15个,平均每个SSR座位可检测2.99个多态性带;引物的多态信息量(PIC)在0.00～0.88,平均0.62。依据SSR数据计算的品种间遗传距离在0.00%～34.27%,平均12.45%,大多数品种间的遗传变异非常有限,但也存在着遗传差异突出的品种:FHIA25、Yangambi KM5、Pisang Jari Buaya、Rose和皇帝蕉。依据26%的遗传距离,除了FHIA25和Pisang Jari Buaya单独化成1组外,其它30个品种可以分为2组:品种间遗传差异相对较高的组I和品种间遗传差异相对较低的组Ⅱ。Williams与引进的洪都拉斯3号、M931之间,洪都拉斯1号和洪都拉斯2号之间,高脚青芽蕉和高脚顿地雷分别没有区分开来,这可能是同物异名,也可能是同一品种未能分辨的突变体。 相似文献
17.
23个石榴基因型遗传多样性的SRAP分析 总被引：13，自引：1，他引：12
以23个石榴基因型为试材,利用7对SRAP引物进行PCR扩增,共扩增出1380个条带,其中多态性条带662个,多态率为48%。应用DPS分析软件构建UPGMA聚类图,23个基因型遗传距离在0.0769～0.4131。在遗传距离0.33处,可将石榴基因型分为A、B、C、D和E5个类群。4种单瓣白花基因型都聚类在A组;B组都是单瓣红花、味甜的鲜食品种;C组中鲜食品种果皮都不着色;4种不同花色或叶型的单瓣、赏食兼用基因型则聚在D组;观赏型墨石榴与其它基因型显著不同,单独聚为一类(E组)。引物对组合ME4/EM4-800bp缺失条带是青皮石榴的特异缺失标记,ME4/EM4-480bp缺失条带是峄城红和河阴软籽石榴的特异缺失标记,ME2/EM3-120bp缺失条带是峄城红、白皮酸和大青皮的特异缺失标记。研究结果表明,石榴基因型有着丰富的遗传多样性,SRAP技术可有效运用于石榴基因型的遗传分析。 相似文献
18.
19.
Pomegranate (Punica granatum L.) is one of the oldest known edible fruits. It is native to Iran and spread from Iran to other areas. In this study amplified fragment length polymorphism (AFLP) was used to detect intra- and inter-population genetic diversity of pomegranate. A group of 67 accessions belonged to 4 populations from Iran was studied using eight primer combinations. A total of 221 scorable bands were amplified, of which, 118 (54.13%) were polymorphic. Resolving power (Rp) ranged from 5.70 to 9.21, and the average of polymorphism information content (PIC) per primer pair was 0.40. According to Nei's gene diversity and allelic statistics, Isfahan population had a highest genetic diversity (H = 0.3646, I = 0.5327, Ne = 1.6467). Coefficient of gene differentiation between populations (GST) was 0.124, indicated that mainly proportion of genetic variation (87.6%), was within populations and the remaining (12.4%) of the variation was among populations that, also supported by analysis of molecular variance (AMOVA). The gene flow (Nm) varied from 0.969 to 10.404 between pair-wise populations and was 3.504 among all of the populations. The Jaccard similarity coefficient between individuals ranged from 0.26 to 0.88. The UPGMA dendrogram clustered all 67 accessions into 6 groups. In some cases accessions from same region were grouped together but in most cases, there was gene exchange. To study the genetic relationships among populations, a principal coordinate analysis (PCoA) based on Nei's genetic distances was performed. Results of this study showed that AFLP marker can be a useful tool for investigating the genetic diversity of pomegranate genotypes. 相似文献
20.
普通核桃(Juglans regia)3个群体遗传结构的SSR分析 总被引：7，自引：1，他引：6
以新疆伊犁野核桃、喀什实生核桃及部分栽培品种共80份种质材料为试材,利用来自黑核桃的7对SSR引物进行群体遗传结构分析。结果显示,7对引物多态性带比率为92.3%～100%,均具有较高的多态性;伊犁野核桃、喀什实生核桃及栽培品种3个群体的期望杂合度分别为0.2325、0.3085、0.305,香农系数分别为0.3361、0.4669、0.4646,多态性带百分率分别为56.52、95.83、86.84%,表明3个核桃群体具有较高的遗传多样性水平,3个指标均显示喀什群体的最高、伊犁的最低;从3个群体中随机选出10个株系或品种进行聚类分析,所有参试株系或品种相互交叉,说明伊犁野核桃、喀什实生核桃和栽培品种之间存在基因渗透和交流(基因流Nm=2.0934);讨论了伊犁野核桃、喀什实生核桃和栽培品种的亲缘演化关系,研究结果为"我国是世界栽培核桃的起源中心之一"的论断进一步提供了分子证据。 相似文献