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1.
《杂交水稻》2010,(Z1)
杂交水稻制种需对不育系割叶,此过程不但要求较高的操作技术和高强度的劳动,且对抽出的幼嫩稻穗也有伤害。本课题组在研究太湖流域粳稻地方品种资源生物多样性的过程中,发现了剑叶斜下伸的粳香糯A7444。本研究利用粳稻保持系863B(P1)与A7444(P2)进行配组,构建了P1、P2、F1、B1、B2和F2 6个世代,对剑叶角度进行分离分析。结果表明:剑叶角度受2对主基因+多基因控制,以主基因遗传为主。在分离分析的基础上,调查了P1与P2及其863B/A7444∥863B的B1世代141个单株SSR标记基因型和剑叶角度,构建该组合的SSR标记连锁图谱并分析剑叶角度QTL。利用WinQTLCart 2.5软件中的CIM方法检测到4个控制剑叶角度的QTL,其中位于第8染色体上的qFLA-8-1和qFLA-8-2为新的控制剑叶角度的主效QTL。qFLA-8-1位于SSR标记RM152-RM281之间,贡献率为55.24%,加性效应为65.33,增效等位基因来自863B,RM152在863B和A7444间扩增出的bp数分别为150 bp和145 bp,RM281在863B和A7444间扩增出的bp数分别为140 bp和145 bp。qFLA-8-2位于RM264-RM6215之间,贡献率为62.37%,加性效应为66.75,增效等位基因来自A7444,RM264在863B和A7444间扩增出的bp数分别为170 bp和167 bp,RM6215在863B和A7444间扩增出的bp数分别为185 bp和182 bp。 相似文献
2.
《中国水稻科学》2016,(1)
为更好地理解水稻大剑叶角的分子遗传机制,对已初定位的控制剑叶角度的qFla-8进行精细定位和候选基因预测。利用以863B为受体亲本、A7444为供体亲本衍生的BC3F3群体中仅在目标基因区段杂合的172个单株自交构建的次级分离群体,对qFla-8所在的RM6215-RM8265区间9个SSR标记的基因型进行鉴定,结合表型数据进一步缩短qFla-8所在染色体区段。结果发现qFla-8位点所在染色体区段存在两个紧密连锁的位点qFla-8-1和qFla-8-2。其中,qFla-8-1位于RM6215和RM3153之间,可解释22.33%的表型变异;qFla-8-2位于RM1309和RM3491之间,可解释23.81%的表型变异。进一步对加性效应较大的qFla-8-2精细定位,通过开发插入缺失(InDel)分子标记,将qFla-8-2位点限定于InDel标记Z7和SSR标记RM23071之间,该区间的物理距离为67 kb。该区段包含3个预测基因Os08g0408200,Os08g0408300和Os08g0408500,分别编码功能类似GAMYB的WD40结构域蛋白、假定蛋白以及类APETALA2蛋白。 相似文献
3.
水稻第1染色体短臂粒长和粒宽QTL的精细定位 总被引：2，自引：0，他引：2
以第1染色体短臂RM1-RM3746和RM151-RM243区间内呈杂合、背景基本纯合的2个水稻剩余杂合体（RHL）衍生两个F6群体,将控制水稻粒长和粒宽的2个粒形QTL（qGL 1和qGW 1）定位于RM3746-RM243区间内。在此基础上,应用SSR标记检测,从其中1个群体中筛选到杂合区间分别为RM151-RM10404、RM10398-RM5359、RM10435-RM259和RM10381-RM243的4个单株,应用SSR标记进一步检测4套F2群体,从每套F2群体中分别筛选到母本珍汕97B和父本密阳46纯合型材料各10株,自交获得4套近等基因系材料并考查其粒长和粒宽。利用交迭重组染色体片段代换系分析法,将控制粒长和粒宽的QTL （qGL 1和qGW 1）界定于437.5 kb的RM10390-RM1344区间和392.9 kb的RM10376-RM10398区间,增效等位基因均来自母本珍汕97B,表明qGL 1和qGW 1是紧密连锁的不同座位。 相似文献
4.
《麦类作物学报》2016,(4)
为了解小麦穗长性状的遗传特性,并将其应用于分子标记辅助育种,以大穗材料高麦1号/密小穗的292个植株的F2群体为材料,利用SSR标记对穗长进行了QTL定位分析。结果表明,选用500对SSR引物对高麦1号和密小穗两个亲本进行多态性检测,共获得180对在双亲间有多态性的引物,多态性引物检出率为36.0%。利用这180对引物进一步进行F2群体筛选,有96对引物在群体中表现出多态性,占多态性标记的53.3%。利用QTL_IciMapping软件构建出小麦染色体组的8个连锁群图谱,并将96对SSR引物定位到遗传连锁图谱上。图谱全长1 383.29cM,标记间的平均遗传距离15.37cM。平均每个连锁群有11.25个标记,含有标记最多的是4A和6B染色体,各有17个标记,其次是3A和7B染色体,含有9~14个标记,1B和5D染色体含有的标记最少,只有5~7个。共检测出7个与穗长相关的QTL位点,包括6个加性QTL和1个加性+显性QTL。7个QTL的加性效应值均为正值,单个QTL的贡献率为2.04%~15.26%。其中3A染色体上的QTL位点距离其最近标记只有0.58cM,为连锁最紧密的一个位点,并且其加性效应值最大,可解释表型变异的15.26%。因此,3A染色体上存在控制穗长的主效基因。 相似文献
5.
HU Wen-de ZHANG Hong JIANG Jian-hua WANG Ying-ying SUN Da-yun WANG Xiao-shuai LIANG Kui HONG De-lin 《水稻科学》2012,19(4):277-285
Genetic segregation analysis for flag leaf angle was conducted using six generations of P1,P2,F1,B1,B2 and F2 derived from a cross of 863B(a maintainer line of japonica rice) and A7444(a germplasm with large flag leaf angle).Genotypes and phenotypes of flag leaf angle were investigated in 863B(P1),A7444(P2) and 141 plants in BC1F1(863B/A7444$$$$863B) population.An SSR genetic linkage map was constructed and QTLs for flag leaf angle were detected.The genetic map containing 79 information loci was constructed,which covers a total distance of 441.6 cM,averaging 5.6 cM between two neighboring loci.Results showed that the trait was controlled by two major genes plus polygene and the major genes were more important.Fifteen markers showed highly significant correlations with flag leaf angle based on single marker regression analysis.Two QTLs(qFLA2 and qFLA8) for flag leaf angle were detected by both composite interval method in software WinQTLCart 2.5 and composite interval method based on mixed linear model in QTL Network 2.0.The qFLA2 explained 10.50% and 13.28% of phenotypic variation,respectively,and was located at the interval of RM300 and RM145 on the short arm of chromosome 2.The qFLA8 explained 9.59% and 7.64% of phenotypic variation,respectively,and was located at the interval flanking RM6215 and RM8265 on the long arm of chromosome 8.The positive alleles at the two QTLs were both contributed from A7444. 相似文献
6.
粳稻发芽期耐碱性的QTL检测 总被引：2，自引：0，他引：2
以粳粳交高产106/长白9号的200个F2:3株系为作图群体,在0.15% Na2CO3溶液碱胁迫下,进行了水稻发芽率及其相对碱害率的鉴定评价,并以SSR标记构建的分子连锁图谱为基础,对水稻发芽率及其相对碱害率进行了数量性状基因座(QTL)检测。结果表明,在F3株系群中水稻发芽率及其相对碱害率均呈单峰接近正态的连续分布。共检测到碱胁迫下与水稻发芽率相关的QTL 7个,对表型变异的贡献率范围为4.05%～12.61%,其中位于第6染色体RM225-RM204区间的qGC 6和位于第9染色体RM219-RM3700区间的qGC 9对表型变异的贡献率分别为12.61%和10.85%。共检测到与水稻发芽率相对碱害率相关的QTL 6个,对表型变异的贡献率为4.82%～28.07%,其中位于第2染色体RM29-RM221区间的qRGC 2、位于第6染色体RM225-RM204区间的qRGC 6 1、位于第9染色体RM219-RM3700区间的qRGC 9和位于第12染色体RM260-RM3226区间的qRGC 12对表型变异的贡献率较大,分别为28.07％、15.35％、15.61％和18.91％,为主效QTL,但其相应的区间距离均较远,需要进一步深入研究。所检测的QTL增效等位基因主要表现为部分显性和超显性。 相似文献
7.
利用重组近交系群体检测花生青枯病抗性SSR标记 总被引：7，自引：1，他引：7
用抗青枯病花生品种远杂9102与感病品种Chico杂交，从F2起用单粒传法构建了花生重组近交系群体（RIL）F6和F7。采用354对SSR引物对重组近交系F6群体的基因组DNA鉴定，获得多态性标记45个。结合重组近交系群体F6和F7青枯病抗性鉴定结果，应用相关软件统计分析，构建了栽培种花生部分遗传连锁图。图谱总长度为603.9cM，含29个标记（28个SSR标记和1个表型标记）的8个连锁群，还有17个独立的SSR标记；获得了与青枯病抗性相关的SSR标记2个（7G02和PM137），位于该图谱的第1连锁群上，与青枯病抗性基因间的遗传距离为10.9cM和13.8cM，并且位于抗性基因的两侧，两标记间的距离为23.7cM。 相似文献
8.
【目的】通过对水稻剑叶性状的综合评价,明确剑叶相关性状间及与6个农艺性状的关系。检测剑叶相关性状的QTL,为优良株型品种选育,剑叶性状基因的精细定位和克隆奠定基础。【方法】以日本优质粳稻品种越光和葡萄牙粳稻地方种Bertone构建的回交群体两个世代为实验材料,利用BC3F1群体基因型构建遗传连锁图谱;测定亲本和BC3F2群体各株系剑叶SPAD、剑叶长、剑叶宽,计算剑叶长宽比、剑叶面积;利用隶属函数和标准差系数赋予权重法获得剑叶性状综合评价值(D值),分析其与6个农艺性状间的关系。分别利用单标记分析(SPA)和区间作图(IM)检测水稻剑叶相关性状QTL。【结果】在抽穗灌浆期,两亲本剑叶SPAD值呈现先升高后降低的动态变化。BC3F2群体的5个剑叶相关性状变异丰富,总体表现趋向轮回亲本越光。4个剑叶形态性状间相关性均达到极显著水平,与剑叶SPAD的相关性不显著。主成分和逐步线性回归分析表明剑叶宽、剑叶SPAD、剑叶长、剑叶面积是影响剑叶综合评价值(D值)的主要因子。高D值株系的株高、穗长、茎基粗和单株产量均极显著高于低D值株系,两者的分蘖数和有效穗数差异不显著。共检测到18个控制剑叶性状的QTL,分布在水稻第1、4、7和8染色体上,贡献率分布范围为4.00%~28.00%(SPA)和3.41%~27.00%(IM),除qFLSPAD1之外的17个QTL增效基因均来自Bertone。在第8染色体上的RM22720-RM404区间发现1个QTL簇,含6个主效QTL,分别为qFLL8.1、qFLL8.2、qFLA8.1、qFLA8.2、qD8.1和qD8.2。【结论】获得了剑叶宽、剑叶SPAD、剑叶长和剑叶面积4个评价剑叶性状的关键指标;明确了剑叶性状与单株产量之间的正相关关系;检测到18个剑叶相关性状QTL,位于第8染色体RM22720-RM404区间的QTL簇,是影响剑叶性状的1个重要染色体区域。 相似文献
9.
对元江普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)(简称元江普野)荷花塘3号为供体、籼稻(O.sativassp.indica)恢复系蜀恢527为轮回亲本构建的种间近等基因系群体进行数量性状位点(QTL)分析,在近等基因导入系YJ10-03-01中鉴定了一个抽穗扬花期耐热QTL。利用均匀分布在水稻12条染色体上的360个SSR标记检测近等基因系YJ10-03-01和籼稻恢复系蜀恢527,共获得9个多态性标记。单标记分析表明第5染色体短臂上的多态性标记与抽穗扬花期耐热性极显著相关。进一步在人工气候室模拟高温条件下处理YJ10-03-01与蜀恢527杂交得到F2分离群体(1027个单株)并进行SSR标记分析,以水稻结实率为耐热指标,利用复合区间作图方法在第5染色体短臂上检测到一个抽穗扬花期耐热性QTL,暂命名为qHTH5。该QTL在F2及F3世代分别解释8.6%和19.4%的表型变异。在F3世代,继续利用目标区间标记RM7320和RM7444之间的SSR标记鉴定纯合重组体,利用置换作图法将QTL定位在约304.2kb之内(RM592-RM17921)。 相似文献
10.
稻米蒸煮品质性状的QTL定位 总被引：5，自引：1，他引：4
以D50/HB277衍生的由190个家系组成的F7重组自交系群体为研究材料,构建了包含102个SSR标记的遗传连锁图谱,覆盖水稻基因组1226.4 cM区域,平均图距为12.02 cM。利用Windows QTL Cartographer 2.5软件,对蒸煮品质进行QTL分析。在杭州和海南两地实验中,共检测到6个具有显著加性效应的QTL。其中,分别控制直链淀粉含量和胶稠度的主效QTL（qAC6和qGC6）均位于第6染色体短臂RM508和RM587之间,控制碱消值的主效QTL（qASV6）位于第6染色体短臂RM111和RM3438之间,且均能在两地稳定表达。 相似文献
11.
Construction of SSR Linkage Map and Analysis of QTLs for Rolled Leaf in Japonica Rice 总被引：2，自引：0，他引：2
Genetic analysis of rolled leaf is important to rice ideotype breeding. To detect loci controlling rolled leaf of japonica restorer lines, SSR marker genotypes and phenotypes of flag leaf rolling index (LRI) were investigated in Xiushui 79 (P1, a japonica rice variety), C Bao (P2, a japonica restorer line) and 254 recombinant inbred lines derived from the cross between P1 and P2 , and in two environments. A genetic map of this cross was constructed, QTLs for LRI were detected and their interactions with environments were analyzed. Among 818 pairs of SSR primers, 90 primers showed polymorphism between P1 and P2, and 12 markers showed highly significant correlation with LRI in both environments based on single marker regression analysis. The genetic map containing 74 information loci has a total distance of 744.6 cM, with an average of 10.1 cM between two adjacent loci. Three QTLs (qRL-1, qRL-7 and qRL-8-1) were detected with two softwares: WinQTLCart 2.5 and QTLNetwork2.0. qRL-8-1 was a new locus, accounting for 15.5% and 12.8% of phenotypic variations in the two environments, respectively. The phenotypic variation explained by additive effect was 6.6%. No interaction was found between qRL-8-1 genotype and environments. 相似文献
12.
粳稻SSR连锁图谱的构建及恢复系卷叶性状QTL分析 总被引：6，自引：3，他引：3
调查了粳稻品种秀水79 (P1)与粳稻恢复系C堡 (P2)及其衍生的254个重组自交系的SSR标记基因型和两个环境下主茎剑叶卷曲度,构建了该组合的SSR标记连锁图谱并分析了剑叶卷曲度QTL及其与环境的互作。在检测的818对SSR引物中,有90对引物在P1与P2之间扩增出多态性条带。单标记回归分析显示有12个标记在两个环境下均显示与剑叶卷曲度呈极显著相关。74个信息位点构成的连锁图谱全长744.6 cM,位点间平均图距10.1 cM。利用两种分析软件 WinQTLcart 2.5和QTLNetwork 2.0共同检测到3个QTL (qRL 1、qRL 7和qRL 8 1),其中qRL 8 1是新发现的,在两个环境下贡献率分别为15.5%和12.8%,加性贡献率为6.6%,且与环境不存在互作。 相似文献
13.
利用染色体片段置换系定位水稻芽期耐冷性QTL 总被引：2，自引：0，他引：2
以籼稻品种9311为受体、粳稻品种日本晴为供体构建的95个染色体片段置换系为材料,在5℃低温条件下进行芽期耐冷性鉴定。结果表明,6个置换系低温处理后的成苗率与受体亲本9311有一定差异,其耐冷性略强于9311。利用代换作图法共鉴定出4个与芽期耐冷性相关的QTL,分别位于水稻第5和第7染色体上。其中qCTB-5-1、qCTB-5-2和qCTB-5-3分别被定位在第5染色体RM267与RM1237、RM2422与RM6054及RM3321与RM1054之间遗传距离分别为21.3cM、27.4cM和12.7cM的置换片段上;qCTB-7被定位在第7染色体RM11-RM2752区间遗传距离为6.8cM的置换片段上。 相似文献
14.
春小麦旗叶长度、宽度及叶绿素含量QTL分析 总被引：1，自引：0，他引：1
为了提高高产和理想株型小麦的选育效率,以普通小麦(Triticum aestivum L.)宁春4号和宁春27号杂交得到的128个F9代重组自交系(RILs)为试验材料,利用从1 001个SSR标记中筛选出的307个在亲本之间存在多态性的标记对该群体进行遗传分析和QTL检测.构建了覆盖小麦21对染色体的包含291个SSR标记的遗传连锁图谱,遗传距离总计2 576.09 cM,标记间平均遗传距离为8.85 cM.以复合区间作图法(ICIM)分别对旗叶长度、宽度和叶绿素含量进行加性QTL检测,分别检测到6、8和4个QTL.多数QTL只在单一生态环境下检测到,说明这些性状受一定环境因素的影响. 相似文献
15.
粳稻垩白性状的QTL检测 总被引：1，自引：0，他引：1
利用大粒粳稻DL115与小粒粳稻XL005杂交获得的F2群体200个单株为作图群体,采用复合区间作图方法,利用SSR标记对稻米垩白性状进行了数量性状基因座(QTL)检测。研究结果表明,稻米垩白粒率、垩白大小和垩白度在F3株系均呈连续分布,表现为由多基因控制的数量性状。检测到与稻米垩白性状相关的QTL 8个,分别位于第3（5个）、第5（2个）和第6（1个）染色体上,包括与垩白粒率有关的QTL 3个,与垩白大小相关的QTL 2个,与垩白度有关的QTL 3个。其中位于第3染色体RM6832-RM411、RM15456-RM6832和RM6266-RM15456区间的qPGWC3、qACE3b和qDEC3b,分别解释垩白粒率、垩白大小和垩白度表型变异的43.89%、18.83%和19.57%,为主效QTL。上述3个主效QTL所在染色体上的位置与前人研究结果均不一致,认为是新的QTL。所检测到的8个QTL中,除qPGWC6的增效等位基因来自无垩白亲本XL005外,其他7个QTL的增效等位基因均来自垩白性状值较大的亲本DL115。垩白粒率和垩白大小基因作用表现为部分显性,垩白度基因作用表现为加性。 相似文献
16.
为了发掘更多控制小麦旗叶大小及穗部相关性状的QTL,以兰考906和小偃81创制的133个F6~F7重组自交系为试验材料,在6个环境下利用SSR标记对旗叶大小及穗部相关性状进行QTL定位。结果表明,有202对SSR标记被用于构建遗传连锁图谱,图谱覆盖小麦21条染色体,全长1 678.93cM,标记间平均距离8.30cM。采用完备区间作图法共检测到30个QTL,分布在1B、2A、3D、4A、4B、4D、5D、6A、6B、6D和7D染色体上。其中,旗叶宽QTL有7个,穗长QTL有9个,小穗数QTL有5个,穗粒数QTL有5个,小穗着生密度QTL有4个,不同环境下单个QTL可解释的表型变异率为4.94%~23.14%,有14个QTL的表型贡献率大于10%,有8个QTL可在2个或2个以上环境中被检测到。其中,Qflw-4A在3个环境中被检测到,贡献率为10.13%~20.77%,是控制旗叶宽的稳定主效QTL;Qsl-4D.2在4个环境中被检测到,贡献率为12.58%~23.14%,是控制穗长的稳定主效QTL;Qker-5D在2个环境中被检测到,贡献率为11.44%~14.32%,是控制穗粒数的稳定主效QTL。这3个稳定主效QTL可作为改良叶宽和增加穗粒数的功能QTL作进一步研究。 相似文献
17.
DONG Chen-fei CAI Qing-sheng WANG Cai-lin Jiro HARADA Keisuke NEMOTO SHEN Yi-xin 《水稻科学》2008,15(3):195
Genetic improvement of the digestibility of rice strew for increasing the utilization of the whole rice plant as feedstuffs is an important way to solve the feedstuffs shortage in southeastem China. To elucidate the genetic basis of the traits affecting the digestibility of rice straw, a rice population of 111 recombinant inbred lines (RILs) derived from a cross of Nekken 2xGaya was used to map the quantitative traits loci (QTLs) for in vitro dry matter digestion (IVDMD), the percentages of nonstructurel carbohydrate (NSC) and acid detergent fiber (exclusive of residual ash, ADFom) in 2005 and 2006. IVDMD was positively correlated with NSC, and negatively correlated with ADFom. A total of 16 QTLs were detected in the two years, and the amounts of variation explained by individual QTLs ranged from 6.9% to 15.5%. Some QTLs for IVDMD and ADFom on chromosome 2 were detected in the two years. On chromosome 2, the interval RM475-RM3515 contained QTLs for IVDMD in the two years and for NSC in 2006 only, while the interval RM3874-RM5305 influenced ADFom in the two years and NSC in 2005 only. At those loci, Gaya contributed favorable alleles to IVDMD and NSC, while Nekken 2 contributed positive alleles to ADFom. 相似文献