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1.
《分子植物育种》2015,(3)
林木分子指纹图谱是优良林木育种资源的管理、利用和产权保护的重要参考资料。本研究基于SSR和SRAP分子标记技术,对福建省漳平五一国有林场马尾松种子园131个亲本无性系进行了指纹图谱构建。从近缘种的168个SSR标记中筛选出15个多态性高、重复性好、条带清晰的SSR标记,在131个无性系中共检测到55个等位基因,平均每个标记3.67个等位基因,平均有效等位基因数为2.04。其中10个SSR位点组合可有效区分116个无性系,增加剩余5个SSR位点可区分的无性系不再增加,但可将剩下无性系(15个)区分为6个组,每个组含2~5个无性系,在此基础上利用筛选出的2对SRAP标记组合可将15个无性系完全区分,最终构建了种子园131个无性系的DNA指纹图谱。基于个体间的遗传距离可将131个无性系分为8类,为后续无性系间的组配和再选育提供参考。 相似文献
2.
基于SSR和SRAP标记的苦瓜品种鉴定及亲缘关系分析 总被引：1，自引：0，他引：1
《分子植物育种》2016,(2)
本研究应用SSR和SRAP 2种标记对11个苦瓜品种进行鉴定和亲缘关系分析。结果发现,应用筛选的8对SSR引物共扩增条带860条,多态性条带占68.0%,10对SRAP引物共扩增条带961条,多态性条带占79.4%。SSR标记检测到品种间遗传相似系数介于0.344~0.779,平均值为0.652;SRAP标记检测到品种间遗传相似系数介于0.373~0.700,平均值为0.625。聚类分结果发现,在遗传相似系数为0.54和0.52时,SSR和SRAP 2种标记都可以将11个品种分为相同的两组。每对SSR和SRAP引物能平均区分3.1和3.7个品种。最少用3对SSR引物或3对SRAP引物组合就可成功区分11个苦瓜品种。研究结果表明,SSR和SRAP标记均可高效地被用于苦瓜的品种鉴定和亲缘关系分析。 相似文献
3.
利用SSR荧光标记构建20个高粱品种指纹图谱 总被引：5，自引：0，他引：5
为建立高粱种子纯度及真实性鉴定技术体系,构建高粱栽培品种DNA指纹图谱数据库是必要的。利用SSR荧光标记技术筛选出36对SSR荧光标记引物,构建我国高粱杂种优势利用以来中晚熟区主推的20个品种的SSR指纹图谱。36对SSR引物共扩增出235个等位基因,平均每个等位基因检测到多态性位点7个,多态性位点变化范围为2~12个。20个高粱品种36个SSR位点的遗传多样性指数和多态性信息量的变化范围分别为0.3490~0.8813和0.3144~0.8696,平均值分别为0.6976和0.6571。从36对SSR引物中筛选到多态性丰富的2对引物作为高粱品种鉴定的特征引物,2对SSR特征引物组合可区分所有供试品种。20个高粱品种的SSR指纹图谱互不相同,可以作为各品种特定的图谱,为品种鉴别提供依据。 相似文献
4.
《分子植物育种》2021,(10)
为了快速区分万寿菊属品种(系),鉴定品种(系)的特异性和真实性,构建分子指纹图谱便显得尤为重要。本研究利用SSR标记对32个万寿菊属品种(系)进行遗传多样性分析及指纹图谱构建。结果表明,48对SSR引物组合中筛选出8对多态性较好的引物,利用这8对引物在32个万寿菊属品种(系)中共扩增出23条谱带,其中多态性谱带19条,多态性百分率为82.60%。万寿菊属品种(系)间遗传相似系数为0.46～0.95,UPGMA聚类分析表明,在相似系数0.46处可被分为2大类群。株高相近的万寿菊属品种(系)被优先聚为一类。利用8对SSR引物构建了32个万寿菊属品种(系)的DNA指纹图谱,为万寿菊属品种(系)的特异性和真实性鉴定提供了理论依据。 相似文献
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6.
《分子植物育种》2020,(13)
利用SSR标记和形态学标记对27个叶用莴苣品种进行DNA指纹图谱分析和遗传多样性分析。从50对引物中筛选出22对引物对叶用莴苣资源进行指纹图谱构建和遗传多样性分析。形态学鉴定主要调查了26个主要的指标,主要包括叶片性状和植株性状。变性聚丙烯酰胺和毛细管电泳相结合的结果显示共扩增出187种多态性基因型,平均每对引物扩增出8.31种。引物多态信息量(PIC)分布范围为0.42～0.92,平均为0.75。用形态标记和分子标记对27个品种进行聚类分析的结果表明,分子标记聚类分析的结果均可将27份材料分为4组,而形态标记可将材料分为2组,本研究结果为叶用莴苣的品种鉴定提供了科学依据。 相似文献
7.
新疆彩色棉23个品种指纹图谱的构建及遗传多样性分析 总被引：6，自引：0，他引：6
以新疆截止2012年审定的23份新彩棉品种为材料,利用SSR标记进行DNA指纹图谱的构建和遗传多样性分析。从5000对SSR引物中,挑选出多态性高、稳定性好、均匀分布在棉花26条染色体上的52对引物,在23份新彩棉品种中筛选出核心引物47对,SSR扩增检测到多态性基因型位点数共计162个,每个标记检测到的基因型位点数在2~7之间,平均为3.45个;引物多态信息量(PIC)值介于0.4537~0.8686之间,平均值为0.7096。结果显示:在23份新彩棉品种中,14份品种采用特异或特征引物可以一次性区分开,其余9份品种需要采用引物组合来实现区别该品种与其他品种。最少选用18对特异引物及组合引物就可以完全区分开新彩棉1~23号品种。利用18对SSR标记构建了新彩棉1号至23号品种的指纹图谱。利用NTSYS-pcV2.10软件聚类分析表明:23个新彩棉品种遗传相似系数变化范围是0.3781~0.9298,平均为0.5511,表明新彩棉品种之间存在着丰富的遗传多样性。 相似文献
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9.
《分子植物育种》2017,(3)
本研究利用毛细管电泳技术对筛选出的8对SSR荧光引物进行检测,构建了80个荷花品种的指纹图谱。8对引物共检测到52个多态位点,多态位点数平均为6.5;多态性信息含量PIC值变化范围为0.41~0.81,平均为0.62。利用其中5对引物SSR022、SSR035、SSR468、SSR87和CL06可区分供试的80个荷花品种。利用获得的SSR指纹图谱数据,对80份荷花品种进行聚类分析,结果表明,在遗传相似系数0.435处供试荷花材料可分为7大类群。本研究利用SSR荧光标记技术,获得了供试荷花材料的指纹图谱,进一步分析了品种间亲缘关系的远近,可为荷花种质资源的分类及鉴别提供依据。 相似文献
10.
11.
主要番茄品种的分子鉴别研究 总被引：17，自引：0，他引：17
采用了RAPD、RGA和SRAP分子标记技术对22个番茄品种进行了分子鉴别的研究。通过引物筛选,选用了7个RAPD随机引物,扩增后共产生了17个多态性位点;2对RGA引物,产生了12个多态性位点;1对SRAP引物,产生了8个多态性位点。分析单引物的品种鉴别能力发现,RGA和SRAP标记具有较高的鉴别效率。为了鉴别22个番茄品种,分析了双引物组合和三引物组合的鉴别能力,双引物组合不能完全区分22个番茄品种,利用引物BI26和PK1 PK2再加上S91或S92中的任一个就可将22个番茄品种区分开来,并获得各品种独特的核酸指纹。另外,通过聚类分析发现,现代番茄品种之间存在着较为复杂的亲缘关系,用有限的标记位点很难取得理想的聚类结果。 相似文献
12.
利用SRAP标记构建18个木薯品种的DNA指纹图谱 总被引：7，自引：0，他引：7
利用SRAP标记,选用36对多态性较好的引物组合,对18个木薯品种进行分析鉴定,扩增出320个位点,其中多态性位点235个,多态性比率达73.4%,平均每对引物组合可产生8.9个位点和6.5个多态性位点;235个多态性位点采用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析,以遗传相似系数0.734为阈值,可将18份供试材料分为4组;选用2对多态性引物Me1-Em5和Me24-Em10,初步构建了18份木薯品种的指纹图谱,根据条带的有无转换为0、1二进制编码形成数字指纹,每个品种拥有唯一的数字指纹区别于其他品种,置信概率达到99.999%。结果表明,采用SRAP标记建立的指纹图谱适用于木薯品种的分类和鉴定。 相似文献
13.
利用SRAP引物组合构建甜菜品种的指纹图谱 总被引：1，自引：1，他引：0
为了构建甜菜品种的指纹图谱,通过对183对SRAP引物组合的筛选,筛选出多态性好、条带清晰易于识别的SRAP引物组合两对(EM4-ME8和EM7-ME10)。利用筛选出的两对引物组合构建17份已经登记品种的指纹图谱,结果表明,引物组合EM7-ME10可以鉴别15个品种,扩增产生15种不同的带型；引物组合EM4-ME8可以鉴别14个品种,扩增产生14种不同的带型；这两对引物组合结合到一起就可以鉴别全部的17个品种。利用SRAP引物组合构建甜菜品种指纹图谱的成功为快速鉴定甜菜品种的真实性提供了一个新的解决办法,也为保护农民和育种家的权益提供了一个新的思路。 相似文献
14.
向日葵品种SSR荧光指纹图谱的构建及遗传关系分析 总被引：1，自引：0，他引：1
本研究以2001年至2015年间审定的16个向日葵主要品种为材料,利用22对SSR荧光标记结合毛细管电泳检测法进行了DNA指纹图谱的构建和遗传关系分析。22对SSR引物共检测出48个多态性片段,大小在100~341 bp之间。每个SSR位点变异范围为2~4个等位基因,平均检测到多态性位点2.18个。多态性信息指数的变化幅度为0.706~0.924,平均值为0.887。对48个等位基因片段大小进行数据记录,建立了各品种特定的SSR指纹图谱。其中的一个引物组合ORS338/ORS229/ORS230/ORS959/ORS316可区分所有的供试材料,为品种鉴别提供依据。聚类分析中,16个向日葵品种的遗传相似系数在0.500 0~0.958 3之间,平均为0.668 1,表明这16个向日葵品种的遗传多样性不够丰富。此工作的开展满足了目前日益增长的品种鉴定的需要,为今后采用SSR荧光标记检测技术进行向日葵品种资源的指纹图谱构建及遗传关系分析提供了依据。 相似文献
15.
花生新品种汕油21种子纯度SSR标记鉴定体系的建立和应用 总被引：5，自引：1，他引：5
为探索花生品种纯度的分子标记鉴定方法,采用SSR标记构建不同花生品种的指纹图谱。结果表明:利用3对SSR标记引物构建20个花生品种的指纹图谱,该图谱可以将汕油21与其它19个花生品种进行区分,这些品种包括汕油162、汕油212、汕油31、汕油33、汕油71、粤油5号、粤油7号、粤油29、粤油32、汕油27、汕油523、粤油9号、粤油13、粤油14、粤油79、粤油114、J11、仲恺花1号和泉608等;以3对SSR引物对汕油21繁育种子60个样品进行种子纯度检测,共有2对标记引物检测到3个杂株样品,该种子批的纯度为95.0%。因此,利用SSR标记构建花生品种指纹图谱并应用于汕油21品种纯度鉴定是可行的。 相似文献
16.
利用SRAP、ISSR、SSR标记绘制黄麻基因源分子指纹图谱 总被引：3，自引：0，他引：3
以国内外引进保存的231份黄麻种质资源为材料,分别采用SRAP、ISSR、SSR分子标记和编程DNA指纹图谱分析软件,绘制黄麻遗传资源基因组DNA指纹图谱。结果表明,通过筛选出的35对SRAP引物对231份黄麻品种进行标记分析,获得96份黄麻品种DNA指纹图谱;11个ISSR多态性引物对96份材料进行DNA标记分析,获得45份黄麻品种DNA指纹图谱;49对SSR多态性引物对48份黄麻品种进行DNA标记分析,获得13份黄麻品种DNA指纹图谱,累计完成了154份黄麻品种基因组DNA分子指纹图谱绘制。每一个被识别的品种都具有其独特的分子"身份证"。其他77份地方品种因与部分品种遗传相似性过高,未能被识别,表明黄麻地方品种存在较为严重的同种异名现象。 相似文献
17.
新疆早熟棉品种SSR指纹图谱构建与品种鉴别 总被引：11，自引：5，他引：6
以新疆自1978年以来审定命名的42个早熟棉品种为材料,利用SSR分子标记对新疆早熟棉品种进行研究。从2300对SSR引物中筛选出了52对具有稳定多态性的引物,每对引物可检测到3～24个多态性片段,共检测到506个,平均9.7个,片段大小介于100～2000bp之间。对所得到的52个SSR指纹图谱进行组合和综合分析,用其中2对就可将所有供试品种区分开来。同时,分别对42个早熟棉品种进行指纹分析,获得各个品种的特异性指纹,可为今后棉花种子真伪快速鉴别奠定基础。 相似文献
18.
通过分析山东省内核桃良种的遗传背景,并构建其分子身份证,以期为核桃品种的选育、良种的质量追溯提供技术支持。本研究以17个核桃品种为试材,利用荧光SSR分子标记方法构建其指纹图谱,在分子层面进行数据分析。17个核桃品种间Nei’s遗传距离0.181~0.720,遗传相似系数0.267~0.867;筛选出5对SSR核心引物构建品种的指纹图谱,核心引物可分成HF9+HF15,HF3+HF9+HF14两组,每组均可完全区分17个品种;以指纹图谱为基础,与商品信息结合,数字化编码生成核桃品种分子身份证。17个核桃品种遗传基础较广,其聚类结果与地理位置相关性不大;5对核心引物多态性较好,可用于构建核桃指纹图谱;编码生成的分子二维码为核桃良种鉴定提供基础。 相似文献
19.
《分子植物育种》2017,(5)
随着银杏果用品种数量逐渐增多,依靠形态学区分已十分困难,构建一个快速有效的分子指纹图谱便显得尤为重要。本研究针对48个主要的银杏果用栽培品种,从本实验室自主开发的SSR引物中筛选出40对重复性高、多态性好的SSR引物对其进行PCR扩增。结果显示,40对SSR引物共扩增出136个等位基因,平均等位基因数为3.4。48个银杏品种的Nei's基因多样性指数(H)为0.467 9,Shannon's指数(Ⅰ)则为0.828 9,遗传多样性水平偏低,且表现出较强的"地域性",这与育种材料和育种手段的单一有着密切关系。最后,仅利用8对多态性高的SSR引物组合就成功构建了能区分48个银杏品种的指纹图谱,将为银杏种质资源的鉴定和遗传利用提供高效技术手段。 相似文献
20.
小白菜品种的SSR指纹图谱及遗传特异性分析 总被引：7，自引：0，他引：7
为研制我国小白菜品种的DUS测试标准,搜集和筛选了形态差异大、不同生态类型的地方品种和目前生产上栽培面积大的杂交一代品种80份,在植物学性状调查的基础上,利用SSR标记对80份小白菜品种进行了遗传特异性分析,构建了SSR指纹图谱.从131对SSR引物中筛选了20对多态引物组合,对80个品种进行了分析,共检测出56个多态性条带,多态性比率73.68%,平均每对引物组合产生2.8个多态性条带.用5对引物Na12E02、Na12A08、Ni4D09、BRMS-269和BRMS-296的组合获得了每个品种的SSR特征带,可以将80个品种区分开来,从而建立80份小白菜品种的SSR指纹图谱.基于SSR标记的聚类分析表明,形态相似或来源相同的品种遗传基础相近,以遗传距离为0.36为划分标准,87.50%的品种具有遗传特异性. 相似文献