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1.
利用大白菜抗感干烧心病F2群体构建AFLP遗传连锁图 总被引：7，自引：0，他引：7
大白菜(BrassicacampestrisL.ssp.pekinensis)原产于中国,是我国蔬菜栽培中分布最广、种植面积最大的蔬菜作物之一,也是我国的主要出口创汇蔬菜之一。但是近年来大白菜干烧心病却严重影响了其内部质量和出口创汇。此病是由于缺钙引起的生理性病害,不同品种间在抗干烧心病特性上表现出明显的差异,选育抗干烧心病品种值得引起关注。本实验利用大白菜离体叶片扦插方法,结合多年青岛农科院研究人员的田间观察对大量的大白菜品种进行广泛筛选,得到了抗病品种和感病品种。以大白菜抗干烧心病品种F1-6-5-2-2-2-3和感干烧心病品种P14-2-1-15杂交的F2代115个单株作为构建遗传图谱的群体,通过对192对引物组合的筛选,利用32对引物得到了280个AFLP多态性位点,经Jionmap3.0软件处理,得到了一张含105个标记位点、11个连锁群、覆盖长度为669.7cM的连锁图。每个连锁群上的标记数在4￣27之间,平均图距在3.3￣12.5cM之间,连锁群长度在23.4￣98.9cM之间。105个AFLP位点中偏离孟德尔遗传规律的比率为39.0%。为大白菜干烧心QTL定位和分析奠定了基础。 相似文献
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对大白菜干烧心病抗性不同的材料进行研究,明确其抗性遗传规律,并完成抗性基因的QTL定位分析,为分子标记辅助选择(MAS)育种与抗病机理的研究提供理论依据。采用大白菜干烧心病抗性显著不同的青麻叶类型高代自交系黑227(抗干烧心病)和包头型高代自交系B120(感干烧心病)作为材料,将得到的杂种F1进行小孢子培养得到DH群体,将亲本和F1及DH群体种植于日光温室,根据田间干烧心病发病程度进行分级,进而得出病情指数,并结合已构建的大白菜分子遗传图谱,利用Map QTL 5.0软件对大白菜干烧心病抗性基因进行定位。结果表明,试材所含有的大白菜干烧心病抗性基因符合数量性状遗传的特点,共检测到2个与大白菜干烧心病抗性基因连锁的InDel分子标记Br ID10343和Br ID10349,这2个标记均位于Chr.7,其间的遗传距离为1.031 c M,遗传贡献率均达到40%以上。InDel分子标记Br ID10343和Br ID10349与大白菜干烧心病抗性基因紧密连锁,结果为抗性基因主效QTL的精细定位及MAS抗病育种奠定了良好基础。 相似文献
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大白菜分子连锁图谱的构建与分析 总被引：5，自引：1，他引：4
构建大白菜分子连锁图谱,旨在为紫色等性状的QTL定位奠定基础.以紫菜薹(B.compestris L.var.purpurea Bailey)和结球白菜(B.campestris L.ssp.Pekinensis(Lour.)Olsson)杂交的F2群体为试材,基于231个多态性标记,利用JoinMap 3.0软件,得到包含163个标记、11个连锁群和4个片段的大白菜分子连锁图谱,其中包括117个RSAP标记、38个SRAP标记、5个SSR标记和3个RAPD标记.图谱覆盖基因组长度为821.3 cM,标记间平均图距为5.04 cM.连锁群上23.31%的标记表现偏分离,偏分离标记在连锁群上聚集出现.基于与紫色性状连锁的RAPD标记,推断LG4与大白菜1号染色体对应.该图谱可有效的用于紫色等性状的QTL定位分析. 相似文献
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一个新的白菜苗期TuMV-C4抗性主效QTL定位及连锁分子标记开发 总被引：1，自引：0，他引：1
为寻找与TuMV抗性基因紧密连锁的分子标记,选用高抗病毒病大白菜自交系91-112和高感病毒病自交系T12-19以及由二者为双亲构建的包含100个株系的DH群体为材料,通过SSR和InDel标记的遗传分析,在A09上定位了一个新的与大白菜苗期TuMV-C4抗性相关的主效QTL位点BrTuA09。在此基础上,针对该QTL位点所在的标记区间,根据作图群体双亲的重测序结果,设计合成27对引物,其中11个InDel在双亲间具有多态性,且条带单一、扩增稳定;连锁分析发现,11个InDel标记均被定位在A09连锁群上BrTuA09的置信区间。利用BC1群体进行标记验证发现,这些标记对高抗单株选择的准确率均达到78%以上,可应用于分子标记辅助选择,为大白菜TuMV抗病分子育种奠定了良好的基础。 相似文献
6.
应用DH群体进行白菜叶片数和单株重的QTL定位与分析 总被引：1，自引：0，他引：1
应用AFLP、SRAP、RAPD、SSR及同工酶等5种标记构建的326个标记位点的白菜遗传图谱和81个DH株系群体,采用MapQTL5软件与MQM作图法对白菜的叶片数与单株重进行QTL定位及遗传效应的分析。结果表明,通过两个不同年份的试验,在10个连锁群上共检测到20个QTL,主要分布在R5、R9连锁群上：控制叶片数的有5个,控制单株重的有15个;其中,获得两年稳定表达的QTL共6个：控制叶片数的有1个,控制单株重的有5个;另外,估算了单个QTL的遗传贡献率和加性效应,发现各QTL加性效应各不相等,各位点的遗传贡献率介于9．4％～39．6％之间;控制叶片数的和控制单株重的QTL位点表现为紧密连锁或相似的位置,主要集中在R5连锁群上,这与二者性状表型值相关系数很高相一致。这将为白菜品种改良中产量等性状的分子标记辅助选择提供理论依据。 相似文献
7.
重组近交系群体定位绿豆抗绿豆象基因 总被引：3，自引：2，他引：1
绿豆象是对绿豆危害最严重的仓储害虫,检测和利用抗绿豆象基因是控制该害虫最经济有效的方法。利用高感豆象绿豆栽培种Berken和高抗豆象绿豆野生种ACC41亚种内杂交得到的重组近交系（RIL）群体及据此构建的1个包含79个RFLP分子标记的遗传图谱,通过对3个种植环境条件下收获的RIL群体进行2年的室内人工接虫鉴定,评价其抗绿豆象表现。QTL作图结果表明,在第9连锁群mgM213~VrCS161标记之间的1个QTL在2年3点试验中均被检测到,贡献率在74.05%~79.27%,是抗绿豆象主效基因。该QTL的加性效应值为负,表明来自父本ACC41的这个位点的等位基因可以提高绿豆对绿豆象的抗性。本研究结果对开展绿豆抗绿豆象育种以及抗绿豆象基因的精细定位和克隆有重要意义。 相似文献
8.
黄瓜种子长度的遗传分析及分子标记 总被引：1，自引：0，他引：1
为了今后正确制定籽用黄瓜育种方案和有效地进行品种选育,有必要对黄瓜种子大小进行详细研究。选用种子长短不同的5个黄瓜自交系作为杂交亲本,按照Griffing双列杂交试验方法Ⅱ配制杂交组合。以长种子自交系D06157和短种子自交系D0603为亲本,构建F2分离群体,采用SSR分子标记构建遗传连锁图谱,利用复合区间定位方法进行QTL定位。结果表明：黄瓜种子长度属于数量性状,以显性效应为主,同时存在加性效应,广义遗传力及狭义遗传力较低,分别为28.6777%、10.8384%。构建的4个连锁群含有16个SSR位点,连锁群总长度为287.1 cM,标记间平均距离为17.94 cM。检测出6个与黄瓜种子长度相关的QTL,其中QTL5和QTL6有着较高的对种子长度性状变异的解释率(>5%),距离最近标记的图距分别为2.1 cM、4.3 cM,LOD值分别为7.84、9.69,可解释遗传变异分别为6.07%、6.08%,加性效应值分别为39.12%、37.21%。 相似文献
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海陆渐渗系棉花吐絮期叶绿素含量、荧光参数及相关性状的QTL定位分析 总被引：1，自引：1，他引：0
以海陆渐渗系13-1×辽棉12组配的195个单株的F2群体为作图群体,利用SSR(Simple sequence repeat)标记和Join Map3.0软件构建遗传连锁图谱,构建的遗传连锁图谱包含39个多态性标记、13个连锁群,该图谱总长1174.4 c M,覆盖棉花基因组的26.7%,利用Ici Mapping完备区间作图法对F2:3家系进行相关性状的QTL定位,共检测到30个叶绿素荧光参数、7个叶片干物质含量、6个叶面积指数、1个叶绿素含量的QTL位点,分布在8条染色体上,在同一染色体共标记区间内存在多个性状的QTL,部分位点加性遗传效应来自同一亲本,与干物质含量、最大光化学效应相关的QTL位点在3条染色体上不同标记区间内重复出现,与叶面积指数、最大光化学效应相关的QTL位点在4条染色体上不同标记区间内重复出现,表现出遗传上的一因多效或基因连锁效应,可用于高光效聚合育种。 相似文献
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陆地棉高品质品系纤维品质性状QTL的分子标记及定位 总被引：4，自引：1，他引：3
为进一步挖掘利用高品质品系NM03102的优异纤维品质性状的基因,利用陆地棉鲁棉研21作为母本、NM03102为父本构建了F2和F2∶3分离群体。通过7892对SSR引物对亲本进行筛选,获得222对多态性引物,进一步对195个F2群体单株分析得到242个标记位点。其中,182个标记位点连锁构建37个连锁群,共覆盖1661.6 cM,每个连锁群平均包含4.9个标记位点,标记间平均相距9.1 cM,其中35个连锁群被定位到了20条染色体上。利用F2和F2∶3纤维品质数据,通过复合区间作图法,共检测到20个纤维品质性状QTL。其中,1个纤维强度的QTL和1个纤维整齐度的QTL与已有的报道一致,1个纤维强度的QTL和1个麦克隆值的QTL在两世代中稳定存在,这为标记辅助选择奠定了基础。 相似文献
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Using a linkage mapping approach to identify QTL for day-neutrality in the octoploid strawberry 总被引：1，自引：0，他引：1
C. K. Weebadde D. Wang C. E. Finn K. S. Lewers J. J. Luby J. Bushakra T. M. Sjulin J. F. Hancock 《Plant Breeding》2008,127(1):94-101
A linkage mapping approach was used to identify quantitative trait loci (QTL) associated with day-neutrality in the commercial strawberry, Fragaria × ananassa (Duch ex Rozier). Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) markers were used to build a genetic map with a population of 127 lines developed by crossing the day-neutral (DN) 'Tribute' with the short-day (SD) 'Honeoye'. The population was genotyped with AFLP markers and 429 single dose restriction fragments (SDRF) were placed on a consensus map of 1541 cM with 43 linkage groups. Individuals from the mapping population were observed for their flowering habit throughout the growing season in Michigan (MI), Minnesota (MN), Maryland (MD), Oregon (OR) and California (CA). Eight QTL were found that were either location specific or shared among locations. None of these QTL explained >36% of the phenotypic variation, indicating that the inheritance of day-neutrality is likely a polygenic trait. 相似文献
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玉米抗穗粒腐病QTL定位 总被引：5，自引：0，他引：5
用已构建的包括88个AFLP标记和151个SSR标记的遗传图谱和230个F2植株用于抗病QTL定位研究,在四川雅安、绵阳对F2株系进行抗病性鉴定,采用复合区间定位法进行抗病QTL检测。在雅安检测到位于第2、3、4、6和9染色体上的抗病QTL 6个,解释表型变异的8.3%~25.7%;在绵阳检测到位于第1、6、7和9染色体上的抗病QTL 4个,解释表型变异的11.3%~26.4%。在10个抗病QTL中,位于第6和第9染色体上的2个同时在两点被检测到,贡献率均超过15%,表明玉米穗粒腐病确实存在遗传抗病性。利用2个环境抗病指数的平均值进行抗性QTL检测,共检测到位于第1、6和7连锁群上的3个抗性QTL,单个QTL的贡献率在8.9%~17.2%之间。结果有助于了解玉米穗粒腐病的抗性机制,并为分子标记辅助选择提供理论支撑。 相似文献
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Fusarium head blight (FHB) is a destructive disease of wheat worldwide. FHB resistance genes from Sumai 3 and its derivatives such as Ning 7840 have been well characterized through molecular mapping. In this study, resistance genes in Wangshuibai, a Chinese landrace with high and stable FHB resistance, were analyzed through molecular mapping. A population of 104 F2-derived F7 recombinant inbred lines (RILs) was developed from the cross between resistant landrace Wangshuibai and susceptible variety Alondras. A total of 32 informative amplified fragment length polymorphism (AFLP) primer pairs (EcoRI/MseI) amplified 410 AFLP markers segregating among the RILs. Among them, 250 markers were mapped in 23 linkage groups covering a genetic distance of 2,430 cM. In addition, 90 simple sequence repeat (SSR) markers were integrated into the AFLP map. Fifteen markers associated with three quantitative trait loci (QTL) for FHB resistance (P < 0.01) were located on two chromosomes. One QTL was mapped on 1B and two others were mapped on 3B. One QTL on 3BS showed a major effect and explained up to 23.8% of the phenotypic variation for type II FHB resistance. 相似文献
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Construction of a genetic linkage map and QTL analysis of fiber-related traits in upland cotton (Gossypium hirsutum L.) 总被引：1，自引：0，他引：1
Zheng-Sheng Zhang Yue-Hua Xiao Ming Luo Xian-Bi Li Xiao-Ying Luo Lei Hou De-Mou Li Yan Pei 《Euphytica》2005,144(1-2):91-99
A genetic linkage map with 70 loci (55 SSR, 12 AFLP and 3 morphological loci) was constructed using 117 F2 plants obtained from a cross between two upland cotton cultivars Yumian 1 and T586, which have relatively high levels of
DNA marker polymorphism and differ remarkably in fiber-related traits. The linkage map comprised of 20 linkage groups, covering
525 cM with an average distance of 7.5 cM between two markers, or approximately 11.8% of the recombination length of the cotton
genome. The present genetic linkage map was used to identify and map the quantitative trait loci (QTLs) affecting lint percentage
and fiber quality traits in 117 F2:3 family lines. Sixteen QTLs for lint percentage and fiber quality traits were identified in six linkage groups by multiple
interval mapping: four QTLs for lint percentage, two QTLs for fiber 2.5% span length, three QTLs for fiber length uniformity,
three QTLs for fiber strength, two QTLs for fiber elongation and two QTLs for micronaire reading. The QTL controlling fiber-related
traits were mainly additive, and meanwhile including dominant and overdominant. Several QTLs affecting different fiber-related
traits were detected within the same chromosome region, suggesting that genes controlling fiber traits may be linked or the
result of pleiotropy. 相似文献
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基于株平均值的胚乳性状QTL作图的极大似然方法 总被引：6，自引：2，他引：4
根据三倍体胚乳性状的数量遗传模型,发展出一种新的专用于胚乳性状数量基因座位（QTL）区间作图的统计方法。该方法以分离群体中各植株的分子标记基因型以及植株上若干粒种子胚乳性状的平均值为数据模式,采用基于平均值混合分布理论的极大似然方法进行QTL分析。QTL效应估计通过EM算法实现。由于该方法利用标记基因型内QTL基因型的混合分布特性,因此,它比同样基于株平均值的最小平方QTL分析方法以及迭代重新加权最小平方QTL分析方法具有更高的统计功效和精确度。方法的可行性和有效性通过计算机模拟数据分析得到了进一步验证。 相似文献
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B. Chaitieng A. Kaga O. K. Han X. W. Wang S. Wongkaew P. Laosuwan N. Tomooka D. A. Vaughan 《Plant Breeding》2002,121(6):521-525
Both restriction fragment length polymorphism (RFLP) and amplified fragment length polymorphism (AFLP) analyses were employed to map a new source of resistance to powdery mildew in mungbean. Disease scores of an F2 population derived from the cross between a moderately resistant breeding line VC1210A and a susceptible wild relative (Vigna radiata var. sublobata, accession TC1966) showed a continuous distribution and was treated as a quantitative trait. Although no significant quantitative trait loci (QTL) that can explain the variation was detected by QTL analysis based on the reconstructed RFLP linkage map, new marker loci associated with resistance were discovered by AFLP analysis. The RFLP loci detected by two of the cloned AFLP bands are associated with resistance and constitute a new linkage group. A major resistance quantitative trait locus was found on this linkage group that accounted for 64.9% of the variation in resistance to powdery mildew. One of the probes developed in this study has the potential to assist in breeding for powdery mildew resistance in mungbean. 相似文献
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H. J. Zheng A. Z. Wu C. C. Zheng Y. F. Wang R. Cai X. F. Shen R. R. Xu P. Liu L. J. Kong S. T. Dong 《Plant Breeding》2009,128(1):54-62
A maize genetic linkage map derived from 115 simple sequence repeat (SSR) markers was constructed from an F2 population. The F2 was generated from a cross between a stay-green inbred line (Q319) and a normal inbred line (Mo17). The map resolved 10 linkage groups and spanned 1431.0 cM in length with an average genetic distance of 12.44 cM between two neighbouring loci. A total of 14 quantitative trait loci (QTL) were detected for stay-green traits at different postflowering time intervals and identified by composite interval mapping. The respective QTL contribution to phenotypic variance ranged from 5.40% to 11.49%, with trait synergistic action from Q319. Moreover, maize stay-green traits were closely correlated to grain yield. Additional QTL analyses indicated that multiple intervals of stay-green QTL overlapped with yield QTL. 相似文献
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四向杂交设计QTL分析的极大似然方法 总被引：2，自引：0，他引：2
四向杂交（four-way cross）设计是指4个纯系亲本参与杂交衍生分离群体的一种交配设计。尽管国际上已经提出基于四向杂交设计的迭代重新加权最小平方（iteratively reweighed least squares，IRWLS）QTL作图方法，但该方法忽略了双侧标记基因型内QTL基因型的混合分布特性，当QTL位置和标记的位置不重合时作图精度较低。本文根据四向杂交设计的数量遗传模型，发展出基于四向杂交设计和混合分布理论的QTL作图的极大似然估计方法。首先利用染色体上所有标记基因型联合计算该染色体上任一假定位置QTL的条件概率，然后根据混合分布理论建立基于EM算法实现的QTL作图的极大似然估计方法。以计算机模拟数据研究了QTL遗传力、样本容量和分子标记信息含量3个因素对方法的影响，结果表明,（1）在QTL的被发现能力上，标记信息不完全的四向杂交设计仅略低于信息完全时的四向杂交设计；（2）随着QTL遗传力、样本容量和标记信息含量的增大，QTL位置以及效应估计值的准确度和精确度逐步提高。 相似文献