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萱草部分野生种和栽培品种亲缘关系的AFLP分析 总被引：5，自引：1，他引：4
借助AFLP标记对35份萱草野生种和栽培品种进行亲缘关系研究, 结果表明, 7对引物组合对萱草共扩增出条带380条, 其中多态性条带357条, 平均多态性达到93.39% , 单对引物扩增条带19～85条, 平均每对引物组合扩增多态性条带51条。7对引物扩增出的多态性条带均超过90.0%。种质资源相似系数为0.3822～0.9656, 平均相似系数为0.7039。UPGMA聚类结果将供试材料分为3类, 即早花、中花和晚花类, 同一产地的品种基本能聚在一起。AFLP标记技术能较好地从分子水平揭示萱草种质资源的亲缘关系。 相似文献
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杧果主要品种遗传多态性的AFLP标记研究 总被引：13，自引：0，他引：13
采用扩增片段长度多态性AFLP标记对国内外31个杧果主要品种进行分类与亲缘关系研究。结果表明: 筛选出的14对引物组合在31份杧果种质中共扩增出了1 761条带, 其中多态性带的比例为97%。平均每对引物产生125.8条带和121.6条多态性带, 总的多态性带率为97%; 基于AFLP标记, 以0.48的相似系数为阈值, 所有供试 果材料被分为7大组群, 第一组群内以0.52为阈值, 又可分为6组。与形态标记相比, 基于AFLP标记的杧果分类体系更能反映杧果品种间的亲缘关系。 相似文献
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RAPD和SRAP分子标记在金针菇菌种鉴定中的应用 总被引：1，自引：0，他引：1
试验从分子生物学和形态学角度，利用SRAP和RAPD分子标记技术对7个金针菇菌株进行遗传多样性分析。SRAP共扩增出469条DNA条带。大部分条带分子量在200～3000bp，多态性条带为377条，占总条带数的80．4％，每对引物平均获得41．9条多态性条带。RAPD扩增出476个条带。其中多态性条带为274条，占总条带数的57．6％，每个引物平均获得343条多态性条带。结果证明，RAPD与SRAP分子标记技术在试验中分别在以相似系数0．91和0．72为阈值时，7个供试菌株的分组大致是相同的。金913和金19同源性最大，在2种分子标记技术中相似系数分别达到了0．9903和0．8966，表明金913和金19可能是同物异名，而金405与其他菌株的亲缘关系最远，其远缘优势应在杂交育种中引起重视。 相似文献
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应用荧光AFLP和拮抗实验对26株灵芝菌种进行了遗传多样性分析。荧光AFLP分析的结果表明,采用9对EcoRI／MseI引物（其中MseI引物为FAM荧光标记物）对26个菌株进行AFLP扩增,共得到1944条清晰易辨的多态性条带。聚类分析表明,26株灵芝菌株在遗传相似系数0．28处聚为3类,分别是美国灵芝类、赤芝类和树舌类。种间的遗传相似系数变化范围在0．23—0．73。荧光AFLP分析结果与拮抗性实验结果基本一致,可见拮抗试验在灵芝亲缘关系的初步鉴定中是有效的,荧光AFLP则更能区分出亲缘关系较近的灵芝菌株。 相似文献
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变叶海棠遗传多样性的AFLP分析 总被引：6，自引：2，他引：6
用8对引物对变叶海棠30个不同的变异类型进行了AFLP分析, 共扩增出656条带, 其中多态性带为568条, 平均每对引物扩增出71条多态性带, 多态性带百分率为86.59% , 各变异类型多态性比例介于0.3582～0.6296之间; 依据简单匹配系数对AFLP扩增结果进行UPGMA聚类, 30个变异类型在0.68水平上分为12个类群; 该试验从DNA水平上探明了变叶海棠的遗传多样性是变叶海棠与陇东海棠和花叶海棠产生渗入杂交形成的。 相似文献
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利用DNA标记(AFLP标记和SRAP标记)研究了11份芡、4份鸡王莲和1份克鲁兹王莲之间的亲缘关系,13对AFLP引物共产生490条条带,多态性条带447条(91.22%);9对SRAP引物共产生162条条带,多态性条带151条(93.21%);用UPGMA法建立的分子标记聚类树显示,克鲁兹王莲与其他材料(包括鸡王莲)差异很大,而鸡王莲与芡也有一定的差异。此外,对5份芡杂交材料的品质性状进行了检测,利用品质性状的数据进行聚类分析的结果表明,材料间的遗传距离很近,难以分辨相同种属不同材料的遗传关系和分类地位。 相似文献
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仁用杏品种SRAP遗传多样性分析及指纹检索系统的开发 总被引：1，自引：0，他引：1
利用SRAP标记对24份仁用杏品种进行了遗传多样性分析。15对引物共扩增出280条带,其中241条为多态性谱带,多态性比率为85.34%;每个引物组合扩增谱带数在13 ~ 24条之间,平均为18.7条;多态性信息含量（PIC）在0.28 ~ 0.65之间,平均为0.51。基于引物Me4-Em4扩增的多态性谱带,构建的指纹检索系统可以区分24个仁用杏品种。根据SRAP扩增结果,利用UPGMA法构建树状聚类图,在相似系数为0.70处可将24个仁用杏品种分为4组,聚类结果与形态分类基本一致。 相似文献
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安徽砀山酥梨自然保护区梨种质资源AFLP分析 总被引：3，自引：0，他引：3
为探讨安徽砀山酥梨自然保护区梨种质资源遗传多样性和鉴定砀山酥梨营养系变异,以该保护区内27个梨资源代表类型为试材,利用AFLP分子标记技术开展研究。运用从36对选择性扩增引物中筛选的3对引物组合进行扩增,每对引物可扩增出50条以上的清晰条带,扩增片段长度为30～600bp,9个引物组合共扩增出清晰可靠的DNA谱带540条。其中498条为多态性条带,平均多态性比率为92.2%。聚类分析表明,当遗传距离阈值为39.2～40.1时,全部供试生物型可分为6类:第1类为砀山酥梨及其变异类型和原产砀山的地方品种、杂交种;第2类包括雪花梨、鸭梨、紫酥、慈梨、早美酥、丰水、新高,白梨和砂梨聚在了一类;第3类包括库尔勒香梨、红香酥;南果梨、红巴梨、杜梨各为一类。与砀山酥梨相比,砀山酥梨的8个营养系变异类型均扩增出了特异带,特异条带出现的数量为5～15条不等。说明安徽砀山酥梨自然保护区梨种质资源遗传多样性丰富;砀山酥梨8个营养系变异类型均在DNA水平发生了不同程度的突变。 相似文献
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黄瓜种质资源遗传多样性及其亲缘关系的AFLP分析 总被引：39，自引：4，他引：39
采用AFLP分子标记技术，对中国黄瓜种质资源遗传多样性及其与外来种质的关系进行了分析， 结果表明8对AFLP引物在70份黄瓜种质中共扩增出425条带，多态性带的比例为66％。供试黄瓜种质的平 均期望杂合度为0．376，中国种质的平均期望杂合度为0．387，明显高于国外种质的n 291。西双版纳黄瓜和印度野生黄瓜具有一些栽培种质没有的特异位点，中国栽培种质的特异位点多于外来栽培种质，后者也有一些中国栽培种质没有的特异位点。聚类分析将70份种质分为三大组群，即西双版纳黄瓜(Cucumis sativus L.vaF．xishuangbannanesis Qi et Yuan)组群，e sativus var．hardwickii野生黄瓜组群和栽培黄瓜组群。西双版纳黄瓜与栽培黄瓜的距离最远，与野生黄瓜次之。按一定的遗传距离可以将中国和外来栽培种质分开。大多数 华南型和华北型种质归属于不同的亚组。这些结果有助于有目的地利用这些变异拓宽育种材料的遗传背景。 相似文献
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Vipin Kumar Shailendra Sharma Shubham Kero Shiveta Sharma Amit K. Sharma Mukesh Kumar K. Venkataramana Bhat 《Scientia Horticulturae》2008
AFLP technique was applied to assess genetic diversity among 44 common bean accessions that included 6 exotic accessions, 15 Indian land races and 23 released varieties. Eight AFLP primer pairs were used that produced 820 products of which 698 were polymorphic (85.12%). Wide variations were observed among all the accessions for the number of amplification products, percent polymorphism and average polymorphism information content (PIC). The Jaccard's similarity indices (J) based on the AFLP profiles were subjected to UPGMA cluster analysis. The dendrogram generated revealed seven major groups. Seventeen out of 23 released varieties were restricted to clusters VI and VII. The value of r = 0.934 in Mantel's test for cophenetic corrlelation applied to the cluster analysis indicated the high fitness of the accessions to a group. The germplasm used in the present study had narrow genetic base, although moderate to high genetic diversity was observed. The details of diversity analysis and the potential use of Indian common bean accessions in common bean breeding programme are provided in the present study. 相似文献
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Twenty-one rootstock accessions were analyzed with seven grape microsatellite (SSR) primers and seven AFLP primer combinations. SSR primers detected 56 alleles across 21 genotypes and primer heterozygosity varied from 0.617 to 0.856. Similarly 252 AFLP bands were obtained with seven primer pairs. The average similarity index for different rootstocks was relatively low and ranged from 0.068 to 0.36 for AFLP data and from 0.13 to 0.36 for SSR data. A combination of three SSR primers was sufficient to distinguish 21 rootstocks. In cluster analysis majority of rootstocks belonging to same species grouped together. Although the dendrograms obtained with two marker systems were not identical, rootstocks belonging to same species or having common parents were grouped together in both the dendrograms. 相似文献
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大花蕙兰遗传多样性及亲缘关系的AFLP分析 总被引：16，自引：0，他引：16
对来源于日本、韩国和美国的42个大花蕙兰品种和两个国产兰属原生种进行了遗传多样性和亲缘关系的AFLP分析, 9对多态性引物在50～500 bp内共扩增出1 597条带, 其中多态性带1 565条, 多态性比率9810%。单引物对扩增的带数156～193条, 平均每对引物扩增带数177条。42个品种具特征带或缺失带。大花蕙兰品种间的遗传多样性丰富, 品种间的相似系数0.3399 ～0.8223, 平均相似系数0.5783。UPGMA聚类结果将供试品种分为4大类, 与根据花枝类型或花径大小、花色等形态指标分类的结果相吻合, 同一产地来源甚至同一育种公司选育出的品种能基本上聚类在一起, 反映出了品种间的亲缘关系。 相似文献