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部分柚类品种的数量分类和主成分分析 总被引：4，自引：2，他引：2
利用SPSS12.0软件对柚类31个品种的23个果实形态学性状进行了品种的Q型聚类及其性状的R型聚类,并对23个形态学性状进行了主成分分析。结果显示:Q型聚类可分为4个组群;R型聚类可分为5个组;经主成分分析,23个性状可综合为7个主成分,其累积贡献率达78.7%,根据前7个主成分与性状间的相关性,选出了影响力比较大的13个性状。 相似文献
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李先信 《湖南农业大学学报(自然科学版)》2013,39(4):363-370
采用形态学标记与序列相关扩增多态性(SRAP)分子标记技术,对分布于湖南特定生态条件下的47份地方柚类种质资源的遗传多样性及亲缘关系进行分析。结果表明：①根据花与果实性状等形态学标记进行聚类分析,在欧式遗传距离10处可将柚类资源分为6个组群;②基于柚资源的SRAP分子标记进行分析,47份地方柚资源间的遗传相似系数为0.65～0.93,在相似系数0.798处可分为7个组群;③SRAP标记扩增结果表明,17对引物共扩增出319条带,其中275条带具有多态性,平均每对引物扩增出多态性带16.2条,多态性比率86.52%,基因多样度0.724 3,表明湖南柚类品种间具有丰富的遗传多样性;④将形态学标记聚类结果与SRAP分子标记聚类结果进行比较,发现二者都能很好地将柚类品种进行分类,SRAP标记不受环境因素影响,所揭示的柚类种质间的遗传差异更准确。综合以上结果,利用SRAP标记产生的特异性遗传标记可以区别大部分湖南地方柚类种质资源。 相似文献
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以异位保存的57份野苹果种质资源为材料，对其16个数值型性状和27个果实描述型性状进行综合评价，采用变异系数、分布频率、相关性分析、主成分分析和聚类的方式进行分析研究。结果表明，16个数值型性状的变异系数为15.63%～60.32%,平均值为31.84%,16个数值型性状中以果实纵径的变异系数最小，果实维生素C含量的变异系数最大；描述型性状分布频率表明，野苹果种质资源的果实外观评价优于果实内质评价；相关性分析结果表明，单果质量与果实纵径和果实横径呈极显著正相关关系(P<0.01),与果实总黄酮含量呈显著负相关关系(P<0.05);主成分分析结果表明，7个主成分的总计贡献率达80.785%,其中第1主成分与叶片性状和果实总黄酮含量有关，第2主成分与果实特性有关，第3主成分与果形因子有关，第4主成分与果梗性状有关，第5主成分与果实品质有关，第6主成分与果实可溶性固形物含量和果实硬度有关，第7主成分与花的性状和果实品质有关；16个性状以聚类的分析方法，将供试材料聚为3类，其中Ⅰ、Ⅲ类群可以作为优良的选育品种，培育出优质及耐贮藏的苹果，第Ⅱ类群可以提供宝贵材料作为选育高黄酮含量的野... 相似文献
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蜡梅品种的数量分类和主成分分析 总被引：9，自引：5，他引：9
为了解决蜡梅品种分类的问题 ,该文采用了Q型聚类对蜡梅品种进行了数量分类研究 ,对 16个表型性状进行了主成分分析。结果表明 :Q型聚类基本上可以按花大小和花型将 2 0个不同的基因型分为 7类。经过主成分分析 ,可将原 16个性状综合为 6个主成分 ,其累积贡献率可达 85 %以上。文中提出用中轮花被片长度代替花径来度量花的大小 ,并将花大小做为蜡梅品种分类的第一级分类标准。 相似文献
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选取12个日本甜柿品种的果实性状、SPAD、果实品质等12项性状指标,运用主成分分析法综合评价日本甜柿不同品种的性状表现.结果表明:选取的4个有效主成分反映出了全部指标79.934 6%的信息,计算出各主成分的因子得分,构建了综合评价模型,得出了12个日本甜柿品种性状表现的综合得分,筛选出了阳丰、富有和次郎3个综合性状表现较好的日本甜柿品种.该主成分分析法评价结果具有全面性和科学性,与生产实际表现一致. 相似文献
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采用25个果实性状指标和19对SSR引物对四川栽培的19份李种质资源进行主成分分析和聚类分析,并以欧式距离、前3个主成分和遗传相似性为基础,分别作系统聚类、三维排序图和UPGMA聚类。结果表明:19份李种质25个果实性状指标的平均变异系数为54.71%,其中果皮红绿色差值a*值的变异系数最大,为436.14%,果核侧径的变异系数最小,为9.99%;系统聚类可将李果实分为深色系大果型和浅色系小果型;主成分分析中,前3个主成分累计贡献率为73.27%,第1主成分(果重因子)的贡献率为49.45%,第2主成分(果形与色泽因子)的贡献率为14.21%,第3主成分(营养因子)的贡献率为9.62%;以主成分PC1、PC2和PC3向量为轴的三维排序图清晰地展示出各种质在果实性状上的相对差异;SSR标记显示供试材料的遗传多样性丰富,UPGMA聚类与系统聚类和主成分三维排序的结果基本一致。 相似文献
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【目的】对国家果树种质武昌砂梨圃保存的49份广西砂梨地方品种的果实品质性状进行分析和综合评价,为挖掘利用广西砂梨地方品种优异资源提供依据。【方法】分析12个果实品质性状的变异系数、Shannon-Weaver指数等指标,应用聚类分析对品种和性状进行分类,并应用主成分分析进行果实品质的综合评价。【结果】广西砂梨地方品种的果实品质性状的变异系数范围为9.25%~52.57%,其Shannon-Weaver指数（H'）范围在1.827~2.037。单果重、果实纵径、果实横径和果形指数的均值分别为223.2 g、7.19 cm、7.18 cm和1.00,变异系数分别为33.20%、16.9%、11.26%和12.24%,H'分别是1.851、1.965、1.907和1.949。果肉硬度、可溶性固形物、可溶性糖、可滴定酸、维生素C和石细胞含量的均值分别为12.00 kg/cm2、10.49%、5.63%、0.31%、1.75 mg/100 g和0.90%,变异系数分别为14.40%、9.25%、15.18%、52.57%、18.25%和35.18%,H'分别为1.957、2.037、1.935、1.910、1.827和1.933,其中可溶性固形物含量的H'（2.037）最大,可滴定酸含量变异系数（52.57%）最大,多样性最丰富。固酸比和糖酸比的均值分别为42.73和22.65,变异系数分别为45.50%和44.76%,H'分别为1.956和1.848。R型聚类将12个梨果实品质性状聚成4类。经相关分析及R型聚类分析表明,果实品质部分性状之间的逻辑相关性明显,多数性状之间存在着显著（P<0.05）或极显著（P<0.01）的相关性。通过主成分分析提取了4个主成分,可反映原始数据80.424%的信息量;建立基于主成分的梨果实品质综合评价模型,筛选获得9份综合得分在1.000以上的地方品种。采用Q聚类将广西49个砂梨地方品种分为3大类,分别对应品质优良、品质中等和品质差3个类型。【结论】广西砂梨地方品种果实品质性状具有丰富的多样性,发掘出1份大果型特异种质苍悟大砂梨,可作为大果型特异资源进行开发利用;通过建立基于主成分的梨果实品质综合评价模型评价广西砂梨地方品种的果实品质结果可靠,可为砂梨地方品种果实品质综合评价提供一定的理论参考。 相似文献
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为进行薏苡品种选育,以25份不同薏苡种质资源为研究材料,调查株高、主茎节数、主茎叶 片数、茎粗、总分蘖数、有效分蘖数、无效分蘖数、有效分蘖率、总果粒数、实果粒数、空果粒数和实果粒率共12个性状,对得到的各种质性状数据采用SAS,DPS软件进行主成分分析和聚类分析。结果表明：形态因子、产量因子、有效分蘖率因子、实果率因子和总分蘖数因子等5个主要因子对变异的累积贡献率可达9536%,依据主成分向量可将25份薏苡种质系统聚类为4类。本研究为云南薏苡品种选育提供了理论基础,提高了优良薏苡品种的选育效率。 相似文献
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茄子形态学性状主成分分析及聚类分析 总被引：7，自引：0，他引：7
对55个茄子种质资源的植株、果实等18个形态学性状进行了主成分和聚类分析.结果表明,果型指数变异系数较高,为74.41%,果形指数、主茎颜色、果表色、果实纵径、果实横径是茄子形态学变异的主要来源;果形因子、生长势因子、熟性因子、外观品质因子、光合因子和单果重6个主成分代表81.071%变异;依据种质问遗传距离将供试材料聚为圆茄、卵圆茄和长茄3个大类群. 相似文献
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在对中国紫薇Lagerstroemia indica品种进行调查的基础上,根据形态特征选取调查品种中的51个紫薇品种和对照种南紫薇L. subcostata和福建紫薇L. limii,共计53个样品为分类运算单位,把数量分类学中的聚类分析方法应用于紫薇品种分类,探讨紫薇品种分类的等级和标准,建立完善的中国紫薇品种分类系统。Q型聚类分析的结果表明：将种系作为紫薇品种分类的一级标准,将花色作为紫薇品种分类的二级标准,这与传统紫薇品种分类的观点基本相符,说明分类结果具有一定的合理性。图1表2参6 相似文献
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Cong GUO Wei GUAN XiangGuo ZENG QingHua ZHANG FaYun XIANG YueJun SONG YongChao HAN 《中国农业科学》2019,52(24):4632-4646
【Objective】The objective of this study was to analyze 11 phenotype indexes of 60 rose cultivars and to illustrate the variation rules and the genetic diversity coefficient of each index and the correlation between them. The principal component analysis was used to select an optimal evaluation and calculation method to provide reference for rational clustering of rose cultivars. 【Method】Taking 11 statistical characters of 60 modern rose cultivars in field as the research object, the variation index and Shannon-wiener genetic diversity index of each character data in rose cultivars were analyzed with SPSS19.0 and Microsoft Excel 2007, and the correlation analysis and principal component analysis of each character were carried out. Based on the composite score of principal components and each principal component score, the clustering of the rose cultivars were done.【Result】The statistical results of phenotypic traits showed that, the majority of the tested roses were erect and expanded shrubs, which accounted for 53% and 35% of the total cultivars respectively. The number of leaflets of mature leaves was 5, accounting for 68% of total cultivars. The average whole leaf length, top leaflet width, internode length and average flower diameter of 60 rose cultivars were 11.6, 3.2, 3.6 and 7.6 cm, respectively. The variation coefficient of each quantitative index ranged from 21% to 25%, which was not large. The main color of rose was pure color, accounting for 82% of the total. Among them, purple and yellow flowers were the most. The cultivars with successive flower heads accounted for 65% of the total number, and the flower shapes were mainly ball-shaped and cup-shaped, accounting for 33% and 32% of the total cultivars, respectively. The main senescence modes of rose flowers were petal abscission and flower withering, accounting for 47% and 43% of the total cultivars, respectively. The variation range of the genetic diversity coefficient of each index was between 0.62 and 3.73, among which the diversity index of 8 traits was above 1, the highest was the whole leaf length, and the lowest was the leaflet number. The genetic diversity coefficient of flower color among qualitative traits was the highest. There was an extremely significant positive correlation between whole leaf length and the top leaflet width, the internode length and the whole leaf length, the internode length and the top leaflet width. The flower head number was very significantly negatively correlated with the internode length. There was a significantly positive correlation between the senescence type and the growth habit, the number of flower heads was significantly positive correlated with the number of leaflets and the flower type, but significantly negative correlated with the flower diameter. The results of principal component analysis showed that the 11 phenotype indexes could be simplified into 4 principal component factors, and the variance contribution rate of the 4 principal components was up to 63.28%, among which the variance contribution rate of the first principal component was up to 21.1%. Each principal component factor mainly represented the index variables, such as leaf shape, flower shape, number of flower heads, number of petals and flower aging mode. Based on the composite score of principal components and each principal component score, the 60 cultivars of roses were clustered, and the distribution range of the composite score of principal components of each cultivar was from -1.878 to 1.522. The rose cultivars could be divided into 4 clusters according to the scores, and each cluster was represented by 8, 36, 15 and 1 cultivars, respectively. The classification of each cluster reflected the comprehensive performance of roses in the field. 【Conclusion】Modern rose had a rich diversity of flower color and leaf shape indexes, and some flower shape indexes were significantly related to leaf shape or growth habit. The conclusions would contribute to rose breeding and selecting. The four principal component indexes and the clustering of cultivars selected in the study provided theoretical basis for the preservation and application of the existing rose cultivars. 相似文献
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桃花种质资源的数量分类学研究 总被引：14，自引：0，他引：14
采用数量分类学方法对３１个桃花（Ｐｒｕｎｕｓｐｅｒｓｉｃａ）近缘种及品种进行亲缘演化关系的研究．Ｑ型聚类结果表明新疆桃（Ｐｒｕｎｕｓｆｅｒｇａｎｅｎｓｉｓ）与桃花亲缘关系很近,寿星桃类、垂枝桃类、紫叶桃类内具有较近的亲缘关系;Ｒ型聚类结果揭示了２３个性状特征对进化具有独立的作用．最后,作者还讨论了建立桃花品种分类管理信息系统的初步思路． 相似文献
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利用NTsys-pc2.10e软件对20种海南产芋螺的27个性状特征分别进行了Q型聚类分析、R型聚类分析和主成分分析,据此对芋螺的多样性进行了研究。结果表明,利用Q型聚类分析可将20种海南产芋螺分为二大组3个亚组;利用R型聚类分析可将27种性状特征分为2个大组;主成分分析反映出芋螺分类的重要特征是贝壳大小、内唇和壳口特征;基于芋螺前3位主成分基础上的三维图与聚类分析结果图一致。聚类分析树状图较好地反映了20种芋螺之间的亲缘关系,R型聚类分析与主成分分析相结合有助于选择关键而重要的芋螺分类特征。 相似文献
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河南省柿种质资源表型多样性研究 总被引：6，自引：2，他引：4
为了解河南省柿种质资源类型、分布状况,分析其表型多样性程度。对河南省各地柿种质资源进行调查收集,并测定了146份种质资源果实、叶片和种子的43个表型性状,分析其表型多样性,初步进行了种质资源分类与鉴定。河南省柿种质资源均为完全涩柿(PCA),24个描述性表型性状变异类型多,17个性状的所有类型均有分布,仅缺乏7个性状中的10个类型;19个数量性状变异程度高且变异幅度大,其变异系数范围为11.06%~50.88%,极值相差均在2倍以上;各器官变异程度大小顺序为果实种子叶片;不同地区间各表型变异程度不同。R型聚类将43个表型性状划分为5大类,各性状基本按照器官类型分别聚为一类;Q型聚类将146份资源划分为5个类群,根据表型特征,可初步鉴定部分同物异名或同名异物品种。河南省各地柿资源存在丰富的多样性,其表型变异类型多,变异程度高且变异幅度大,做好本地区柿资源收集、保存、鉴定和评价等工作,对柿新品种选育和杂交育种等工作具有重要意义。 相似文献
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根据数值分类学的原理,分别于大蒜生长期和收获后,对来源于我国各地的57份大蒜品种资源的15个性状指标进行调查,并进行了主成分和聚类分析。前4个主成分对总的特征根累计贡献率为85.54%,其中第一主成分贡献率为63.68%,主要生物学信息为蒜头产量构成因子。根据主成分分析,评选出性状优良品种资源9份,分别可作为蒜头和蒜薹品种改良的目标种质。欧式距离聚类图在D=26.00时把57个品种资源划分为4个类群加7个品种,揭示了不同地区品种资源的相对遗传距离和区域生态特点,根据不同类群品种间的亲缘关系和性状特点,结合主成分分析的因子特点,可为大蒜品种改良利用提供科学依据。 相似文献