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YIN Wei HUANG Yi-jun PI Rong-biao SU Xing-wen ZHAO Ling-zhi QIU Peng-xin YAN Guang-mei 《园艺学报》2007,23(11):2141-2146
AIM: To Screen and identify differentially expressed genes that involved in apoptosis model in rat cerebellar granule neurons (CGNs).METHODS: The rat cerebellar granule neurons were isolated and primarily cultured.Fluorescent differential display RT-PCR (FDD RT-PCR) was performed to screen differentially expressed ESTs in the apoptosis model of primarily cultured rat CGNs.ESTs were subcloned into pGEM-T EasyTM vector and then sequenced.Alignment assay in non-redunant database was applied for encoding information.Reverse Northern blotting was used to appraise the results from DDRT-PCR.RESULTS: 164 pieces of differentially expressed ESTs were obtained by FDDRT-PCR.17 of them were subcloned and sequenced.5 ESTs of 17 were confirmed to be positive results by reverse Northern blotting.CONCLUSION: DD-PCR is a rapid,simple-operation and sensitive method for screening differentially expressed genes,which would contribute to the molecular mechanisms of apoptosis/survive of CGNs. 相似文献
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番茄酸性转化酶cDNA片段的克隆与表达分析 总被引：3，自引：0，他引：3
根据番茄细胞壁束缚性和可溶性酸性转化酶基因序列分别设计引物, 以普通栽培型番茄(Lycopersicon esculentum ) ‘辽园多丽’和‘桃太郎’及野生番茄(Lycopersicon chmielewskii) 的幼苗为材料提取总RNA, 采用RT2PCR方法, 扩增出目的cDNA序列的部分片段并克隆到pMD18-T载体中。经测序后发现不同基因型番茄的酸性转化酶基因具有高度同源性, 达到99.5%。进一步检测其在‘辽园多丽’果实发育不同时期的表达变化, 结果表明主要在成熟果实的胶质胎座中大量表达, 而在果实的其它部位几乎检测不到其表达。 相似文献
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大花蕙兰授粉后子房cDNA差异表达片段序列分析 总被引：1，自引：0，他引：1
应用mRNA差异显示(DDRT-PCR) 方法比较分析了大花蕙兰(Cymbidium hybridium ) 授粉后2 d与未授粉子房的基因表达差异。结果分离到了7个在授粉后子房中特异表达的cDNA片段, 分别命名为CDD-313, CDD-272, CDD-265, CDD-243, CDD-193, CDD-218,CDD-470。在GenBank中进行同源性比较发现前4个没有同源序列与之匹配; 后3个片段推导的氨基酸序列分别与ABC型transporter, GTPase和40S核糖体蛋白质S3 (RPS3) 有高度同源性。反向Northern杂交进一步证实它们存在, 并在授粉子房中高度表达。其中, 最为有意义的是CDD-470, 其推定的氨基酸与参与细胞生长分化的植物源多功能蛋白RPS3高度同源性, 进而推测其与RPS3有相似的功能, 可能与兰花子房发育有关, 这为解释花发育分子机制提供了新资料。 相似文献
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利用SSH分离TDZ诱导金钗石斛成花相关基因 总被引：1，自引：0，他引：1
以金钗石斛（Dendrobium nobile Lindl.）腋芽为材料,利用抑制消减杂交（SSH）技术构建了TDZ处理后金钗石斛腋芽的正向和反向SSH文库。通过PCR和反向Northern杂交验证后,得到的正向文库的314个阳性克隆和反向文库的59个克隆测序后经过聚类,最终得到39条受TDZ正向调控的EST序列,以及21条受其反向调控的EST序列。对其中某些差异基因进行半定量RT-PCR,结果显示这些基因的表达受TDZ的影响。利用Blastn和Blastx进行比对分析,其中20个没有同源序列,属于未知功能基因。其余序列的同源基因编码的产物参与包括光合作用、合成代谢、转录调控等多种生物学过程。在反向文库中分离到1个MADS-box基因的同源序列和1个Sos同源基因,而正向文库中存在多个反转录转座子,这些结果表明TDZ可以影响开花过程中的某些转录因子和信号基因的表达,进而促进金钗石斛开花。 相似文献
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