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为给梨品种S基因芯片的制备及梨品种自交不亲和性S-RNase基因和S基因型的检测奠定基础,结合已有的对梨自交不亲和S-RNase基因的研究成果及Genbank中梨S-RNase基因信息,利用生物学比对软件Genedoce对梨S-RNase等位基因序列进行比对,得到等位基因HV区的特异序列;用oligo6.71、Premier Premier 5.0和Clustal.W等生物学软件设计特异性高、解链温度Tm值接近、长度均一的oligo探针,获得了24条32 mer的oligo探针。 相似文献
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基于基因芯片的梨品种S基因型鉴定的技术方法 总被引:3,自引:0,他引:3
梨是典型的配子体自交不亲和植物,梨品种自交不亲和基因型(S基因型)确定的研究对于梨的栽培和遗传改良具有重要的意义.综合分析了运用杂交授粉试验、PCR-RFLP技术、DNA序列分析、cDNA克隆等技术在确定梨品种S基因型方面的优点和不足之处,提出了运用基因芯片技术确定梨品种S基因型的新方法,并分析了该技术的优势以及在梨品种S基因型确定方面的应用前景. 相似文献
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中国梨品种自交不亲和新基因的分离鉴定 总被引:4,自引:0,他引:4
采用分子生物学技术、田间杂交试验和生物信息学方法研究了中国梨自交不亲和基因和品种的S基因型.从中国白梨和沙梨品种中分离鉴定了15个梨自交不亲和新基因;分析了新S基因的序列特征;确定了中国白梨中至少存在17个S等位基因,中国沙梨中至少存在10个S等位基因;鉴别了34个梨品种的S基因型.这些新S基因的发现和品种S基因型的确定为中国梨品种的优化配置、丰产栽培和遗传改良提供了科学依据. 相似文献
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综述运用杂交授粉试验、蛋白质产物分析、PCR-RFLP技术、DNA序列分析和cDNA克隆等技术确定梨品种自交不亲和基因型研究的技术进展,分析了这些技术在确定梨品种自交不亲和基因型确定方面的优点和不足之处,总结了运用这些技术研究梨自交不亲和性的成果,从基因型的确定和自交不亲和基因的应用角度提出了研究的前景. 相似文献
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11个中国梨品种S基因型的鉴定 总被引:1,自引:0,他引:1
采用梨自交不亲和基因的特异引物"FTQQYQ"和"anti-IIWPNV",对11个梨品种的基因组DNA进行了特异PCR扩增,对扩增片段进行回收、克隆和测序。利用生物信息学软件对各序列进行比对分析,最后确定了各品种的S基因型,即早熟句句、新疆黄梨、绿句句、魁克句句等4个新疆梨品种的S基因型均为S22S28;圆香为S16S15,福安尖把为S16S22,晋蜜梨为S21S28,兰州软儿为SdS12,迟咸丰为S5aS18,红秀2号为S1S12,鸭广梨为S19S30。 相似文献
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中国砂梨7个自交不亲和新基因的分离与测序 总被引:2,自引:0,他引:2
S-RNase是配子体自交不亲和植物雌蕊的基因产物,它降解具有相同基因型的花粉mRNA或rRNA,导致植物的自交不亲和.借鉴日本梨S-RNase基因的分析方法,对中国砂梨5个品种的基因组DNA进行PCR-RFLP系统检测和DNA序列分析,从中发现了7个新的S-RNase等位基因,分别命名为S11-RNase、S12-RNase、S13-RNase、S14-RNase、S15-RNase、S16-RNase和S25-RNase基因,其部分序列已登录到GenBank. 相似文献
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砂梨是重要的经济树种,表现出典型的配子体自交不亲和性,在生产和育种上需鉴定品种的S基因犁以确定品种间的亲和性.选取7个砂梨品种为试验材料,使用梨S-RNase(S基因)通用引物进行基因组PCR扩增,产物通过1.8%的琼脂糖凝胶电泳分析.结果表明:‘楚比香'等4个品种中产生了预期的2条电泳条带,而其他3个品种都只产生1条带产物,通过6%的聚丙烯酰胺电泳对该3个品种的PCR产物进一步分析,结果产物被成功分离.将7个品种中分离到的14个条带分别回收、克隆、测序及序列分析,从中鉴别出10个具有梨S-RNase基因序列特征的S基因,其中‘政和大雪梨'中494 bp的基因片段被鉴定为新的S基因,暂命名为S43-RNase(GenBank接受号EF566873).RT-PCR试验证明S43-RNase仅在化柱中特异表达,符合S-RNase的表达特征.通过比对S43-RNase的基因组序列和cDNA序列,确定其内含子大小为294 bp.在推导氨基酸水平上,S43-RNase与苹果亚科其他S-RNase表现出65%~92%的相似性. 相似文献
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以中国白梨9个品种为实验材料,在分子水平上对其基因组DNA进行了PCR-RFLP系统检测、DNA序列测定及生物信息学分析,鉴定了6个品种的S基因型和3个品种的一个S等位基因,并从天生伏和蜜梨中分离鉴定了一个新的S等位基因,命名为梨S29-RNase基因,该基因与S13的DNA序列最接近,推导氨基酸序列与S13仅有2个氨基酸序列的差异. 相似文献
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MA Qing-hua WANG Gui-xi LIANG Wei-jian CHEN Xin LIANG Li-song ZHAO Tian-tian 《林业研究》2013,24(3):397-402
The genus Corylus is an important member in the Betulaceae family of the order Fagales. Self-incompatibility is one of the choke points in breeding and hazelnut production. This reviewe describes, the progress on pollen-stigma compatibility in Corylus, including basic reproductive characteristics, S-alleles testing and their applications, inter-specific hybridization, self-compatibility in wild species, and recent molecular research on the genetic mechanism of compatibility. Compared with other species, progress on pollen-stigma compatibility (sporophytic self-incompatibility, SSI) in Corylus is slow, especially those in the Brassicaceae family. De novo approaches should be used to target the unique reproductive characteristics of hazelnuts. The continuous improvement of technological platforms based on molecular biology should broaden the pathways in investigating compatibility in Corylus. In addition, research should be conducted on overcoming selfand crossincompatibility, and approaches based on biological, chemical, and physical principles should be introduced. Both theoretical and practical study of compatibility in Corylus should be devoted to change the self-incompatibility trait into a benefit in the species evolvement and nut quality establishment. 相似文献
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配子体自交不亲和基因产物作用机制研究进展 总被引:1,自引:0,他引:1
综述了配子体植物的自交不亲和基因产物作用机制的研究进展,并一一总结作图.在明确S基因产物活性之前,人们基于一些间接的证据提出了抗原抗体、蛋白质-糖等模式.实验证实S-核酸酶活性后,人们提出了膜受体和胞内抑制剂模式.近年来,又有人提出了更为完善的修正抑制子模式等其他作用模式. 相似文献