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马尾松针叶DNA提取方法研究 总被引:6,自引:2,他引:4
采用3种不同的方法(CTAB法、SDS法和试剂盒法)提取马尾松幼嫩针叶基因组DNA,并分别从取样材料类型、样品的保存、提取液中PVP含量、取样质量、抽提过程中提取程序的改进等方面进行提取马尾松基因组DNA效果的凝胶电泳比较.结果表明:CTAB法适合于在马尾松群体分子生物学研究中基因组DNA的提取:采用低温冷藏法保存的春季抽梢针叶0.2g,在CTAB的提取液中加入2%的PVP,常规CTAB法提取程序中添加等体积的混合液(V酚:V氯仿:V异戊醇=25:24:1)并在此前加入1/10体积的10×CTAB,可以有效地提高马尾松基因组DNA的提取质量,获得显带平直、纯度较高的马尾松基因组DNA,OD260/OD280值在1.8左右.这为马尾松群体分子生物学的研究提供了一个经济、简便而有效的DNA提取方法. 相似文献
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为获得高质量的基因组DNA,以平邑甜茶及其与扎矮山定子杂交所得四倍性矮生后代33#、45#新鲜叶片为试材,分别采用常规CTAB法、改良的CTAB法和基因组试剂盒法提取平邑甜茶总DNA,进行琼脂糖凝胶电泳,使用核酸蛋白仪对DNA质量和纯度进行检测。结果表明:利用基因组试剂盒法、常规CTAB法和改良CTAB法均可获得DNA,但获得的DNA质量和纯度存在一定的差异。试剂盒法和CTAB法可以获得较高质量的DNA。但由于基因组试剂盒法成本相对较高,改良CTAB法较耗时,建议采用常规CTAB法提取平邑甜茶及其杂交后代33#、45#品种基因组DNA。 相似文献
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五唇兰组织内含有大量的酚类、多糖以及此生代谢产物,DNA提取较为困难。为获得高质量的五唇兰基因组DNA,文中采用传统十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法、常规十二烷基硫酸钠(SDS)法和改进的CTAB法对五唇兰基因组DNA的提取进行比较。结果表明:改进的CTAB法比传统CTAB法和常规SDS法都好,可以得到质量较好的DNA,电泳条带清晰,通过紫外分光光度计检测,A260/A280为2.0以上。 相似文献
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胡杨根、茎、叶、愈伤组织总RNA提取的研究 总被引:1,自引:0,他引:1
胡杨根、茎、叶、愈伤组织等器官和组织的总RNA高质量提取是进行以胡杨RNA为基础的分子生物学研究的基础。以2 a生胡杨实生苗根系为材料,用CTAB-PVP提取缓冲液裂解细胞并变性蛋白,经氯仿/异戊醇(24∶1,v/v)抽提后,用3种不同的沉淀方法获得胡杨根系总RNA,电泳和定量测试等分析提取质量。结果表明,LiCl沉淀法结合70%乙醇洗涤沉淀两次获得的的胡杨根系总RNA,条带清晰、亮度高,且没有明显的DNA污染;actin基因片段设计引物对胡杨根系总RNA进行RT-PCR扩增,扩增片段与预期大小一致,表明该RNA可用于逆转录合成cDNA,提取物RNA中的Li 残留对逆转录酶活性的抑制作用不明显;该方法用以提取2 a生胡杨实生苗茎、叶及愈伤组织总RNA,均获得高质量总RNA。CTAB-PVP-LiCl(附70%乙醇洗涤RNA沉淀2次)的方法可用于胡杨根、茎、叶和愈伤组织总RNA的提取。 相似文献
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《森林与环境学报》2015,(1)
为探究山枇杷基因组DNA提取方法及群体内个体之间的遗传多样性,以采自福建省戴云山脉九仙山山枇杷(Garcinia multiflora)自然群体的41份叶片样品为材料,比较2种改良十六烷基三甲基溴化铵法(CTAB)对其基因组DNA的提取效果,并通过简单序列重复区间—聚合酶链式反应(ISSR-PCR)扩增反应体系分析其群体内遗传多样性。结果表明,CTAB-2法通过适当提高CTAB浓度,添加聚乙烯吡咯烷酮(PVP)和酚—氯仿—异戊醇,获得的基因组DNA纯度和质量较好;筛选的11条ISSR引物共扩增85个条带,其中多态性条带61条,占71.76%;NTSYS 2.10e软件设定阈值(GS)为0.78,该山枇杷样品归为4个类群,样品遗传相似系数介于0.588-0.929,平均为0.779,说明该群体的遗传基础较宽;利用STRUCTURE 2.2软件将样品分为4个类群,结合后验概率(Q值)分布表表明部分个体之间存在较丰富的遗传信息交流。 相似文献