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为从富含次生代谢物的光皮桦Betula luminifera嫩叶中获得高质量DNA,设计了5种先提核再提DNA的CTAB法Ⅰ,CTAB法Ⅱ,CTAB法Ⅲ,CTAB法Ⅳ及改进的SDS法,并以常规CTAB法为对照。用不同的方法就光皮桦基因组DNA进行了提取,采用琼脂糖凝胶电泳检测、A260/A280值测定、限制性内切酶处理和PCR扩增等方法对所提的DNA进行了比较分析。结果表明:实验设计的5种改进方法提取的DNA质量要比常规法的好,但提取的效果差异较大。其中改进的CTAB法Ⅰ是提取光皮桦基因组DNA的最佳方法;PCR扩增结果表明,不同的DNA提取方法会影响PCR带型的变化。图3表1参13 相似文献
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以美国白蛾[Hyphantria cunea (Drury)]冬蛹为材料,采用CTAB法、SDS法、改进SDS法和试剂盒法以及不同处理时间提取美国白蛾的基因组DNA.分别采用3组扩增COⅠ序列、2组扩增COⅡ序列和1组扩增Cyt b序列的引物,对美国白蛾基因组DNA进行PCR扩增.结果表明:采用CTAB法、SDS法和改进的SDS法均能提取到完整DNA,其中低浓度SDS法效果最佳;6组引物都能扩增出相应片段,以用于扩增COⅠ序列的2组引物效果较好. 相似文献
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通过传统CTAB法、改良CTAB法、高盐低p H法、改良SDS法、试剂盒法等5种方法,对大黄种子进行基因组DNA提取,为了筛选一种适合大黄种子基因组DNA的提取方法,同时用紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳对5种方法所提的DNA进行检测,并将5种方法所提取的DNA进行PCR扩增检测。结果表明,高盐低pH法提取的DNA得率最好,时间较短,价格便宜,PCR扩增条带清晰,能满足分子标记的要求。 相似文献
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以6种不同生长型桃幼叶为材料,为适应SSR分析要求,对常规CTAB法、改进CTAB法、常规SDS法以及SDS-CTAB结合法4种基因组DNA提取方法的效果进行了比较研究.结果表明:常规CTAB法所提取的DNA呈黏稠状的浅褐色沉淀,难以溶解;常规SDS法和SDS-CTAB结合法提取的桃基因组DNA浓度较低,在品种间差异较大;而改进CTAB法提取DNA完整性较好,D260nm/D280nm值介于1.8 ~2.0,RNA去除干净,其SSR分析(引物CPPCT26)条带清晰,多态性好,表明此方法提取的不同生长型桃幼叶基因组DNA完全适于SSR分析. 相似文献
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[目的]改进蒙古黄芪(Astragalus membranaceus var.mongholicus)总DNA的CTAB提取法。[方法]以蒙古黄芪为试验材料,通过提取试验研究了利用改进CTAB法从植物组织中提取总DNA的效果。[结果]提取DNA的凝胶电泳图谱上呈现出清晰、整齐的条带且拖带较少,说明所提DNA的纯度较高,质量较好。利用改进CTAB法提取的DNA进行trnS-trnG扩增的产量高,说明提取的DNA可用于测序等后续分析。用提取的基因组DNA为模板,用多对特异性ISSR引物对其进行PCR扩增,聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱表明各基因组DNA均扩增出多态性谱带,且带型清晰,易区分,说明利用提取的基因组DNA进行ISSR分子标记检测的效果良好。[结论]改进CTAB法可有效消除次生物质对DNA的干扰,提取的基因组DNA可用于叶绿体trnS-trnG测序分析和ISSR分子标记分析。 相似文献
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富含多糖的强旱生植物半日花基因组DNA提取方法 总被引:1,自引:0,他引:1
半日花(Helianthemum soongoricum)属强旱生植物,其组织富含多糖和多酚等次生代谢物质,采用常规CTAB和SDS等方法提取的半日花基因组DNA由于含有多糖等杂质,无法进行PCR扩增和限制性酶切等试验,为此,在CTAB法的基础上进行了改进。第1步通过向植物组织CTAB提取液中添加高盐和乙醇来沉淀部分多糖,第2步将获得的DNA粗提液,经过CTAB分离溶液沉淀、NaCl溶解、乙醇沉淀等方法,可有效去除半日花组织中的残余多糖等杂质,提取DNA的质量和纯度经凝胶电泳条带清晰、无降解、无多糖等杂质。PCR扩增和限制性内切酶的结果表明,通过改进的方法所获得的DNA,可以进行PCR扩增试验,扩增条带清晰,基因组DNA能被限制性内切酶完全酶切,该方法为后续半日花分子生物学研究奠定了重要基础。 相似文献
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采用CTAB法、SDS法、吸附柱法对辣椒及其制品中的基因组DNA进行提取,分别通过核酸蛋白测定仪、琼脂糖凝胶电泳、实时荧光PCR扩增检测。结果表明,CTAB法、SDS法、吸附柱法均能从鲜辣椒、干辣椒、油辣椒、辣椒酱中抽提得到DNA,从核酸蛋白测定仪检测得到的DNA提取物OD260/OD280值可看出,CTAB法和SDS法提取的DNA纯度较吸附柱法的低;DNA样品的琼脂糖凝胶电泳发现,各样品均无大范围明显拖尾,说明DNA提取完整度较好;实时荧光PCR检测分析3种提取方法的不同样品基因组DNA均出现PCR扩增曲线。经试验比较确定,提取方法的效率由高到低依次为吸附柱法>SDS法>CTAB法。可见,吸附柱法最适用于辣椒及其制品中核酸提取。 相似文献
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《现代农业科技》2016,(2)
川续断叶片中很有较多的蛋白质、多糖、酚类以及其他一些次生代谢物,采用传统的CTAB法很难得到高质量的DNA。试验以川续断叶片为材料,提出一种改良的CTAB法提取叶片基因组DNA,对提取的基因组DNA进行琼脂糖电泳检测及紫外分光光度计分析。利用中药材条形码ITS2序列的引物对提取的基因组DNA进行PCR验证。结果表明,改良的CTAB法得到的DNA质量较好,其OD260/OD280的值介于1.8~2.0之间,ITS2序列的引物PCR扩增成功率达到100%。改良的CTAB法为较为理想的川续断基因组DNA提取方法,获得的总DNA能够满足下游的PCR试验要求。 相似文献
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A Method Suitable for Extracting Genomic DNA from Animal and Plant——Modified CTAB Method 总被引:6,自引:0,他引:6
[Objective] The study aimed to introduea a rapid and effective method that is suitable for extracting genomic DNA from animal and plant. [Method] The genomic DNAs were extracted from tender leaves of 24 peanut cuhivars and from the liver, lung and kidney of white mouse through the spe-cifically modified CTAB method. The DNAs were run on agarose gel, next detected by DNA/Protein analyzer. Finally PCR amplification was conducted to detect the quality of DNAs extracted using the modified CTAB method. [Result] The clear and orderly bands were observed in gel detection, and the val-ues of OD260/OD280 for DNAs extracted via modified CTAB method were between 1.77 - I. 83. The DNAs performed well in PCR amplification. [Conclu-sion] The DNAs extracted by modified CTAB method could satisfy the requirement of PCR amplification. 相似文献
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快速小量提取小麦叶片DNA的一种简易方法 总被引:6,自引:3,他引:3
[目的]寻求少量、快速提取小麦幼叶DNA的方法。[方法]以小麦幼叶(只要是健康的绿叶,老叶也可)为试验材料,用改良的CTAB法小量快速提取转基因小麦总DNA。具体步骤为:①直接用已灭菌的1.5ml离心管夹取小麦叶片(无需称量),然后在液氮中快速冷冻后用玻璃棒研磨成细粉(研磨直接在离心管中进行,不必先在研钵中研磨然后再转移到离心管里,能够有效减少材料损失),加入600山预热(65℃)的2%CTAB提取缓冲液,快速振荡摇匀。置于65℃的水浴锅中温育30min,期间温和混匀几次。②取出离心管,冷却至室温,加入600m氯仿:异戊醇(24:1)充分混匀,于4℃下12000r/min离心8min(只抽提1次)。③取上清,加入等体积预冷的异丙醇,缓慢混匀,至有絮状DNA析出,-20℃放置30min以上。④4℃下12000r/min离心8min。弃上清液,将沉淀用700μl70%乙醇清洗2次,离心,弃乙醇,室温下挥发乙醇,加入适量ddH:O或0.1×TE溶解沉淀(DNA),-20℃保存。所提取的DNA以0.8%琼脂糖凝胶电泳检测。[结果]改良的CTAB法提取小麦基因组DNA所提取的DNA纯度高、无降解现象,适用于进行常规PCR扩增,并且需要材料量少、成本低,还可缩短操作周期、节省时间。[结论]该研究为小麦DNA的提取提供了一种所需材料量少、简便、快速的方法。 相似文献
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A Method Suitable for Extracting Genomic DNA from Animal and Plant——Modified CTAB Method 总被引:1,自引:0,他引:1
YAN Miao-miao WEI Guang-cheng PAN Xiao-hong MA Huai-lei LI Wei-zhen Yantai Campus of Binzhou Medical College Yantai 《(《农业科学与技术》)编辑部》2008,(2)
[Objective] The study aimed to introduce a rapid and effective method that is suitable for extracting genomic DNA from animal and plant. [Method] The genomic DNAs were extracted from tender leaves of 24 peanut cultivars and from the liver,lung and kidney of white mouse through the specifically modified CTAB method. The DNAs were run on agarose gel,next detected by DNA/Protein analyzer. Finally PCR amplification was conducted to detect the quality of DNAs extracted using the modified CTAB method. [Result] The clear and orderly bands were observed in gel detection,and the values of OD260/OD280 for DNAs extracted via modified CTAB method were between 1.77-1.83. The DNAs performed well in PCR amplification. [Conclusion] The DNAs extracted by modified CTAB method could satisfy the requirement of PCR amplification. 相似文献