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1.
【目的】分析犏牛、黄牛和娟姗牛瘤胃微生物多样性的差异,并对菌群功能进行预测。【方法】选取甘南藏族自治州合作市同一牧场放养的生理状态正常、年龄相近（1.5岁左右）的犏牛、黄牛和娟姗牛各6头,抽取瘤胃液于冻存管,放入液氮保存。基于16S rRNA测序技术,对供试牛瘤胃液样本基因组DNA进行V3~V4区扩增及测序,对所得序列处理后进行OTU聚类分析和物种分类,并利用Tax4Fun对菌落的16S rRNA基因序列进行KEGG功能注释。【结果】Alpha多样性分析显示,犏牛瘤胃微生物多样性和丰富度显著高于黄牛和娟姗牛（P＜0.05）。门分类水平上,犏牛瘤胃液中厚壁菌门、脱硫杆菌门、疣微菌门、髌骨细菌门和纤维菌门显著高于黄牛（P＜0.05）,脱硫杆菌门和疣微菌门显著高于娟姗牛（P＜0.05）。属分类水平上的差异主要表现在厚壁菌门与拟杆菌门所属的各菌群中,犏牛瘤胃液中普雷沃菌属、瘤胃球菌属和解琥珀酸菌属丰度显著低于黄牛（P＜0.05）;理研菌科_RC9菌群丰度显著高于黄牛（P＜0.05）;犏牛和娟姗牛瘤胃中克里斯氏菌科_R-7菌群、瘤胃菌科_NK4A214菌群、g_norank_f_UCG-011和未分类毛螺菌科显著高于黄牛（P＜0.05）。瘤胃菌群功能预测发现,犏牛富集在碳水化合物代谢、核苷酸代谢和翻译二级通路上的功能丰度显著高于黄牛（P＜0.05）,但与娟姗牛差异不显著（P＞0.05）;黄牛二级通路中辅助因子和维生素的代谢功能丰度显著高于犏牛和娟姗牛（P＜0.05）。【结论】犏牛和黄牛间瘤胃菌群组成差异较大,娟姗牛菌群组成介于犏牛和黄牛之间;犏牛瘤胃菌群发酵最具优势,可能为其适应高原地区严酷的生存环境发挥了重要作用。 相似文献
2.
本文通过考察血酮(血液中酮体)浓度、产羔情况及粪便微生物区系组成，评估过瘤胃胆碱(RPC)和过瘤胃葡萄糖(RPG)缓解围产期母羊能量负平衡的效果。试验期共57 d,从产前30 d到产后20 d,预饲期7 d。选取80只妊娠期(120～130 d)湖羊，随机分为4组，对照组饲喂基础饲粮，RPC组每只每天添加3 g RPC,RPG组添加15 g RPG,RPC+RPG组添加3 g RPC和15 g RPG。结果表明，1)RPG组母羊在产羔当天血酮浓度显著低于对照组(P<0.05);2)RPC+RPG组羔羊初生质量显著高于其他组(P<0.05);3)RPC和RPG的添加没有改变门水平和属水平上母羊粪便的优势菌种类，但影响了核心菌群的相对丰度，各试验组厚壁菌门和瘤胃球菌科UCG-010相对丰度均显著低于对照组(P<0.05),RPC+RPG组拟杆菌门相对丰度显著高于其他组(P<0.05),RPG组毛螺菌科AC2044群相对丰度显著高于对照组(P<0.05)。由此得出，围产期母羊饲粮中添加RPC和RPG均有助于提高羔羊初生质量，提高母羊肠道中碳水化合物利用菌拟杆菌门... 相似文献
3.
为了研究不同蛋白水平对育肥藏羊瘤胃细菌多样性的影响，选取健康且体况相近的3月龄早期断奶藏羊公羔15只，平均体重为(（22.05 ± 2.06) kg，随机分为3组，日粮粗蛋白水平分别为10.08%（Ⅰ组），12.84%（Ⅱ组）和14.97%（Ⅲ组）。预试期7 d，正试期112 d。饲养实验结束后对试验羊进行屠宰并于不同位点采集瘤胃液样品，测定瘤胃细菌的相对丰度。结果表明：（1）Shannon指数和Simpson指数各组之间无显著性差异（P > 0.05），ACE指数和Chao l指数Ⅰ组显著高于Ⅱ组和Ⅲ组（P < 0.05）。（2）门水平下，拟杆菌门（Bacteroidetes）和厚壁菌门（Firmicutes）为瘤胃细菌的优势菌门，且均随日粮蛋白水平提高而显著增加（P < 0.05）；变形菌门（Proteobacteria）和放线菌门（Actinobacteria）相对丰度Ⅱ组显著较高（P > 0.05）。（3）科水平下，毛螺菌科（Lachnospiraceae）相对丰度较高，但各组之间差异不显著（P > 0.05）； 瘤胃球菌科（Ruminococcaceae）相对丰度Ⅱ组和Ⅲ组显著高于Ⅰ组（P < 0.05）；韦荣氏菌科（Veillonellaceae）相对丰度Ⅲ组显著高于Ⅰ组（P < 0.05）。（4）属水平下，Prevotella（普雷沃氏菌属）的相对丰度Ⅲ组显著高于Ⅰ组和Ⅱ组（P < 0.05），瘤胃球菌属（Ruminococcus）Ⅱ组相对丰度显著较高（P < 0.05）。 （5）PCA分析显示各组间瘤胃细菌结构差异不明显，但采食低蛋白水平日粮的藏羊瘤胃细菌相似度更高，能更好聚类在一起。综上可知，不同蛋白水平对育肥藏羊瘤胃细菌多样性无显著影响，但可影响其丰富度；同时随着日粮蛋白水平的提高，厚壁菌门（Firmicutes）和拟杆菌门（Bacteroidetes）相对丰度显著增加，普雷沃氏菌属（Prevotella）在日粮蛋白水平为14.97%时更适宜生长，瘤胃球菌属（Ruminococcus）则在日粮蛋白水平为12.84%时活性更高。 相似文献
4.
【目的】探究藏猪和DLY猪结肠的消化酶活性、菌群结构和短链脂肪酸含量的差异,为2种猪的生产和理论研究提供参考。【方法】分别选取5头同一天分娩的藏仔猪和杜洛克×长白×约克三元杂交猪（DLY猪）,饲养至210日龄,称量藏猪和DLY猪的体质量,并计算2种猪的平均日增质量。将藏猪和DLY猪屠宰后采集结肠粪便样品,分别利用Elisa试剂盒、高通量测序技术和气相色谱法测定藏猪和DLY猪结肠消化酶（纤维素酶和半纤维素酶）活性、菌群结构和短链脂肪酸（乙酸、丙酸、异丁酸、丁酸、异戊酸和戊酸）含量,分析2种猪结肠中以上差异指标之间的相关性。【结果】DLY猪的平均日增质量显著高于藏猪（P＜0.05）。藏猪与DLY猪结肠中纤维素酶和半纤维酶的活性均无显著差异（P＞0.05）;藏猪结肠的6种Alpha多样性指数均显著高于DLY猪（P＜0.05）。在门分类水平上,相较于DLY猪,藏猪结肠中拟杆菌门、疣微菌门和蓝细菌门的相对丰度显著升高,而厚壁菌门、梭杆菌门和浮霉菌门的相对丰度显著降低（P＜0.05）;在科分类水平上,藏猪的普雷沃氏菌科、月形单胞菌科、红螺菌科、弯曲菌科、阿克曼氏菌科和紫单胞菌科相对丰度显著高于DLY猪,而瘤胃球菌科、梭菌科、消化链球菌科、肠杆菌科和浮霉状菌科相对丰度显著低于DLY猪（P＜0.05）。在属和种分类水平上,共有8个菌属和4个菌种在藏猪和DLY猪中存在显著差异,其中藏猪的月形单胞菌属、阿克曼氏菌属、弯曲杆菌属、马赛菌属、布劳特氏菌属以及纤维杆菌、普拉梭菌和罗伊氏乳杆菌相对丰度显著高于DLY猪,而梭菌属、艰难梭菌属、埃希氏菌属和大肠埃希氏菌相对丰度显著低于DLY猪（P＜0.05）。藏猪结肠中乙酸、丙酸和丁酸含量显著低于DLY猪（P＜0.05）。在藏猪和DLY猪结肠中,拟杆菌门与厚壁菌门相对丰度和丁酸含量存在极显著负相关性,而厚壁菌门相对丰度与丁酸含量存在极显著正相关性（P＜0.01）;厚壁菌门和梭菌属相对丰度与乙酸含量具有显著正相关性,而月形单胞菌属相对丰度与丙酸含量具有显著负相关性（P＜0.05）。【结论】在本试验条件下,藏猪和DLY猪结肠菌群结构及短链脂肪酸含量均存在差异,表明藏猪和DLY猪结肠微生物对营养物质消化影响可能不同。 相似文献
5.
【目的】明确不同菌剂处理青贮甘蔗尾叶对山羊瘤胃微生物多样性的影响,为青贮甘蔗尾叶在山羊养殖生产中的应用提供参考依据。【方法】选取72只平均体重24.5 kg的努比亚山羊,随机分为对照组（CK）及3个试验组（T1～T3）,每组2个重复,每个重复9只。CK组饲喂自然青贮甘蔗尾叶的全混合日粮（TMR）,T1组饲喂经植物乳杆菌、干酪乳杆菌、发酵乳杆菌及鼠李糖乳杆菌处理青贮甘蔗尾叶的TMR,T2组饲喂经黑曲霉、枯草芽胞杆菌及米曲霉处理青贮甘蔗尾叶的TMR,T3组饲喂经枯草芽胞杆菌和乳酸片球菌处理青贮甘蔗尾叶的TMR。预试期7 d,试验期42 d。饲喂结束后基于Illumina高通量测序技术探究不同菌剂处理青贮甘蔗尾叶对努比亚山羊瘤胃微生物多样性的影响。【结果】从4个处理组努比亚山羊瘤胃液中最终获得的OUT数量排序为T3组（1637个）> T2组（1603个）> CK组（1576个）> T1组（1560个）;各处理组间的Chao1指数排序为T3组> T2组> T1组> CK组,但差异不显著（P> 0.05,下同）;Shannon指数排序为T3组> T2组> T1组> CK组,其中T3组显著高于CK组和T1组（P< 0.05,下同）;Simpson指数排序为T1组> CK组> T2组> T3组,各组间差异也不显著。在门分类水平上,拟杆菌门（Bacteroidetes）和厚壁菌门（Firmicutes）是努比亚山羊瘤胃液中的绝对优势菌门,拟杆菌门相对丰度为57.50%～65.40%,以T1组的相对丰度最高;厚壁菌门相对丰度为14.39%～24.38%,T3组的相对丰度显著高于其他处理组;蓝藻菌门（Cyanobacteria）也表现为T3组的相对丰度最高。在属分类水平上,普雷沃氏菌属-1（Prevotella-1）是努比亚山羊瘤胃液中的绝对优势菌属,其对应的相对丰度排序为T3组> T1组> T2组> CK组,但组间差异不显著;未知属f型拟杆菌目RF16菌（Bacteroidales RF16 group_norank）、普雷沃氏菌科UCG-001（Prevotellaceae UCG-001）和解琥珀酸菌属（Succiniclasticum）的相对丰度均表现为T3组显著高于其他处理组。【结论】经枯草芽孢杆菌+乳酸片球菌处理的甘蔗尾叶青贮效果最佳,以其饲喂努比亚山羊可增加瘤胃微生物种群数量及多样性水平,进而提高努比亚山羊瘤胃降解粗纤维的能力及机体对非纤维性碳水化合物的消化能力。 相似文献
6.
【目的】探究苜蓿干草与燕麦干草的组合效应对关中奶山羊采食量、瘤胃发酵参数、产奶量、乳品质的影响,为合理利用苜蓿干草和燕麦干草资源提高关中奶山羊的生产性能提供支持。【方法】选取体况相近的泌乳中期关中奶山羊240只,随机分为对照组及T1、T2和T3组,每组3个重复,每个重复20只羊。对照组饲喂50%配方精料＋50%苜蓿干草,T1组饲喂50%配方精料＋25%苜蓿干草＋25%燕麦干草（m（苜蓿）∶m（燕麦）=1∶1）,T2组饲喂50%配方精料＋30%苜蓿干草＋20%燕麦干草（m（苜蓿）∶m（燕麦）=3∶2）,T3组饲喂50%配方精料＋37.5%苜蓿干草＋12.5%燕麦干草（m（苜蓿）∶m（燕麦）=3∶1）,进行75 d的饲喂试验。期间进行采食量、产奶量、瘤胃发酵参数（pH,NH3-N、乙酸、丙酸、异丁酸、丁酸、异戊酸、戊酸、总挥发性脂肪酸含量及乙酸/丙酸）、乳成分（乳蛋白、乳脂肪、乳糖、全乳固体含量及脂蛋比）数据的采集及测定。【结果】与对照组相比,T3组奶山羊的日干物质采食量和产奶量显著提高（P＜0.05）。4个处理组奶山羊瘤胃液的pH差异不显著,T1和T3组奶山羊瘤胃液的NH3-N显著高于对照组和T2组（P＜0.05）。T1、T2和T3组奶山羊瘤胃液的乙酸、丙酸、戊酸、乙酸/丙酸和总挥发性脂肪酸含量显著高于对照组（P＜0.05）;T3组的乳脂肪、全乳固体含量和脂蛋比显著高于其他3组（P＜0.05）。T3组和对照组乳蛋白含量显著高于T1和T2组（P＜0.05）,4组奶山羊瘤胃液乳糖含量差异不显著（P＞0.05）。【结论】苜蓿干草与燕麦干草以质量比3∶1比例组合,可以提高关中奶山羊的消化性能和生产性能,改善奶山羊乳品质。 相似文献
7.
为探讨阿茹拉-7味散早期干预形成的瘤胃共生菌与大肠杆菌性腹泻犊牛免疫力相互作用的影响，选择30头荷斯坦犊牛随机分为正常对照组(NC)、未治疗组(UC)、抗菌药物组(CIP，0.50 mg/kg)、蒙药阿茹拉-7味散低(BSP.L，1.25 g/kg)、中(BSP.M，2.50 g/kg)、高(BSP.H，5.0 g/kg)剂量组，每组5头，给药7 d后，采集血样。利用16S rRNA测序技术检测瘤胃微生物组成和ELISA检测血清中白介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF-α)、白介素4(IL-4)、白介素2(IL-2)和干扰素γ(IFN-γ)的含量。结果表明:(1)与NC组相比，UC组中ACE指数显著降低(P<0.05)；与UC组相比，BSP.M组中Chao1指数、Shannon指数和ACE指数显著升高(P<0.05)。(2)与NC组相比，UC组中梭杆菌门(Fusobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和大肠杆菌(Escherichia coli)的水平显著升高(P<0.05)；与UC组相比，BSP.L、BSP.M和BSP.H组中梭杆菌门、变形菌门和大肠杆菌的水平显著降低(P<0.05)，且BSP.L组中柔嫩梭菌属(Faecalibacterium)的水平显著升高(P<0.05)。(3)BSP.M组犊牛体重和平均日增重显著增加(P<0.05)，还可以降低腹泻率。(4)与UC组相比，BSP.M组血清中IL-4、IL-2和IFN-γ的含量显著升高，显著降低IL-6和TNF-α的含量(P<0.05)。综上所述，中剂量阿茹拉-7味散早期干预形成的瘤胃微生物环境对感染致病性大肠杆菌犊牛瘤胃菌群数量增加，丰富度和多样性上升，增加有益菌群所占比例，降低条件致病菌所占比例，增强抗炎、免疫能力，降低腹泻发生的风险。 相似文献
8.
【目的】利用Fosmid文库功能筛选法,获得山羊瘤胃微生物源蛋白酶基因并进行原核表达。【方法】利用功能底物筛选法从山羊瘤胃微生物源Fosmid文库中筛选具有蛋白酶活性的克隆子,对其进行Illumina二代测序,对预测到的基因进行功能注释,根据基因丰度结果确定后续研究的功能基因。利用大肠杆菌BL21(DE3)对功能基因进行诱导表达,对表达产物进行酶活性测定。通过CRISPR/Cas9基因编辑技术,将密码子优化后的功能基因分别敲入枯草芽孢杆菌C6基因组ctc位点并进行表达验证。【结果】从Fosmid文库1 700个克隆子中筛选到1个具有蛋白酶活性的阳性克隆Pro4-C5。通过二代测序技术,鉴定出3个潜在的蛋白酶基因gene0833（内肽酶,EC编号：EC3.4.21.53）、gene0196（金属内肽酶,EC编号：EC3.4.24）和gene0585（羧肽酶,EC编号：EC3.4.17.14）以及1个L-天冬酰胺酶基因（gene0683,EC编号：EC3.5.1.1）。以pET-28a(+)为表达载体,通过大肠杆菌BL21(DE3)原核诱导表达发现,gene0585和gene0196未表达;gene0833表达的蛋白分子质量为87 ku,蛋白酶活性为10.45 U/mL;gene0683表达的蛋白分子质量为37 ku,L-天冬酰胺酶活性为88.52 U/mL,同时发现该蛋白也具有蛋白酶活性,酶活性为5.25 U/mL。将密码子优化后的gene0683和gene0833定点敲入枯草芽孢杆菌C6基因组中表达发现,gene0833未表达,gene0683表达的蛋白酶活性为109.72 U/mL,相比原始菌株（100.97 U/mL）显著提高了8.67%（P＜0.01）;L-天冬酰胺酶活性为31.63 U/mL,相比原始菌株（22.79 U/mL）显著提高了30.06%（P＜0.01）。【结论】从山羊瘤胃微生物源Fosmid文库中筛选和鉴定出了2个具有蛋白酶活性的功能基因（gene0833和gene0683）,均来源于微小杆菌属（Exiguobacterium）,其中gene0683在大肠杆菌和枯草芽孢杆菌中的表达产物具有较高的蛋白酶和L 天冬酰胺酶酶活性。 相似文献
9.
为评价来源于疏叶骆驼刺青贮饲料的枯草芽孢杆菌能否作为微生物饲料添加剂,选取体况相近的12只多浪羊为试验动物,试验采用4×4拉丁方设计,每个处理3只羊。Ⅰ组为对照组,饲喂基础日粮;Ⅱ组、Ⅲ组、Ⅳ组为试验组,分别饲喂添加活菌数为3.2×10~9、3.2×10~(10)、3.2×10~(11)CFU/g的枯草芽孢杆菌的基础日粮,通过分析多浪羊的平均日增质量、养分的表观消化率、瘤胃发酵参数、血常规和血液生化指标的变化,研究枯草芽孢杆菌对多浪羊的影响。结果表明,饲料中添加3种剂量的枯草芽孢杆菌均能提高多浪羊的平均日增质量,提高干物质(DM)、粗蛋白(CP)、中性洗涤纤维(NDF)和酸性洗涤纤维(ADF)的表观消化率(P0.05);对多浪羊瘤胃pH值、总挥发性脂肪酸(TVFA)、丙酸、丁酸和戊酸含量均无明显或显著影响(P0.05)。添加3.2×10~9、3.2×10~(11)CFU/g枯草芽孢杆菌组的瘤胃NH3-N含量显著高于对照组(P0.05)。Ⅱ组的血常规(平均血蛋白含量除外)和血液生化指标(白球比除外)与对照组无显著差异(P0.05),因此添加3.2×10~9CFU/g枯草芽孢杆菌组效果最好。 相似文献
10.
为探讨在饲料中添加枯草芽孢杆菌和粪肠球菌对鲫鱼生长发育、免疫机能及肠道菌群的影响,将900尾鲫鱼分为3个试验组,分别饲喂基础饲料(S1)、添加枯草芽孢杆菌与粪肠球菌混合饲料(S2)和添加枯草芽孢杆菌饲料(S3),在饲喂47 d后检测3组鲫鱼的生长性能、免疫指标和肠道菌群生物多样性。结果显示,添加枯草芽孢杆菌和粪肠球菌混合饲料组鲫鱼的增质量率、特定生长率和饵料系数均显著高于其他组(P<0.05),该组鲫鱼血清的丙二醛(MDA)含量显著下降且低于其他2组(P<0.05),超氧化物歧化酶(SOD)和碱性磷酸酶(AKP)活性较其他2组显著升高(P<0.05);3组鲫鱼肠道菌群中多为厚壁菌门和变形菌门,共有优势菌属均为梭菌属,其中枯草芽孢杆菌和粪肠球菌混合饲料饲养组(S2组)鲫鱼的肠道菌群更具多样性。由此可见,枯草芽孢杆菌和粪肠球菌可有效促进鲫鱼生长,改善鲫鱼肠道菌群结构,增强其免疫机能。 相似文献