共查询到19条相似文献，搜索用时 250 毫秒
1.
2.
《林业实用技术》2016,(5)
为了研究卷边桩菇[Paxillus involutus(Batsch)Fr.]不同分离部位、不同培养基对菌丝生长的影响,并鉴别卷边桩菇组织分离株的真伪,对采集的野生卷边桩菇子实体进行了菌种分离,并对获得的菌丝进行了rDNA ITS序列分析。结果表明:A3是卷边桩菇菌丝分离较适宜的培养基配方,菌盖与菌柄连接处为分离的最佳部位。对卷边桩菇分离株rDNA ITS片段进行PCR扩增,扩增产物长度为724bp,登录NCBI与GenBank中已知的菌种进行Blastn比对,序列相似性在99%~93%之间,下载相似性高的菌种的ITS序列,通过ClustalW进行序列比对,MEGA5.2构建系统发育树,通过树图分析,鉴定出分离的菌株为卷边桩菇纯菌种。 相似文献
3.
首次应用通用引物ITS1与ITS4从杨树叶枯病菌中扩增出目的片段为601bp的rDNAITS序列(登录号为DQ011257)。与GenBank核酸序列数据库进行比对表明:本菌株与Alternariaalternata(AY787684)及Alternariaalternate(AY354228)相似率为98%,验证为Alternariaalternate。杨树叶枯病菌生物学特性如下:分生孢子萌发最适温度25℃,最适pH为6。菌丝生长最适温度为25℃,在10℃与30℃时生长极其缓慢,高于35℃时,生长停止;菌丝生长最适pH为6,在PDA 杨树煎汁培养基上生长最好。 相似文献
4.
采用组织分离法对采集的一株野生大型真菌花脸香蘑[Lepista sordida(Fr.) Singer]子实体进行菌种分离,结合形态鉴定法及ITS分子序列鉴定法对菌种进行了鉴定,并对该菌种菌丝生物学特性进行了初步研究。结果表明,分离株rDNA ITS片段长度为651 bp,测序结果登录NCBI与GenBank中已知菌种进行BLAST比对,序列相似性在97%～100%之间,下载相似高的ITS序列,用Clustal W进行序列比对,MEGA 2.0软件构建系统树,结合形态特征,鉴定分离菌种为花脸香蘑纯菌种。生物学特性研究结果表明:适宜菌丝生长的碳源为可溶性淀粉,适宜的氮源为硝酸铵,适宜的pH值为7.0,菌丝最适温度为25℃。 相似文献
5.
6.
以采自蒙山的蒙山鹅耳枥和鹅耳枥各5株为试材,进行核糖体DNA(nrDNA)内转录间隔区(ITS)序列检测,并将ITS序列导入NCBI数据库比对,分析蒙山鹅耳枥和鹅耳枥亲缘关系。结果显示:1)蒙山鹅耳枥和鹅耳枥ITS序列高度相似,601个碱基序列中只有1个碱基差别。2)蒙山鹅耳枥ITS序列与NCBI数据库中Carpinus sp.Wen 9187(编号EJ011711729.1)序列相似度为100%,与同属近缘种鹅耳枥序列相似度为99%。结论:1)蒙山鹅耳枥是独立物种。2)蒙山鹅耳枥不再属于山东特有物种,分布区除蒙山外韩国也可见其分布。 相似文献
7.
以研究东北三省樟子松球壳孢菌Sphaeropsis sapinea的遗传多样性为目的,自黑龙江、吉林、辽宁省不同地区收集、分离获得樟子松球壳孢菌45个菌株,寄主均为樟子松;收集美国菌株2个,分别分离自脂松、班克松.运用形态学和分子生物学手段比较47个菌株的形态学及18S rDNAITS序列.结果表明:(1)所有47个菌株在形态上没有明显差别;(2)除美国菌株STBl外,其他46个菌株在培养特性上没有明显差别;(3)东北三省的45个菌株之间的遗传距离均小于0.09,与寄主为脂松的A型菌株(STAl)亲缘关系较近,相似度高于98%,与寄主为班克松的B型菌株(STBl)遗传距离为0.13,亲缘关系较远.(4)同一地域、不同地域来源的菌株其ITs序列相同,而地理来源相同的菌株其ITs序列也存在一定的差异;(5)相同寄主上的菌株其ITs序列存在差异,而不同寄主上的菌株其ITS序列相同.综上得出以下结论:东北三省不同地区樟子松上的45个松球壳孢菌菌株为A型.球壳孢菌菌株之间的遗传差异与菌株的寄主及地域性没有明显的关系. 相似文献
8.
9.
基于ITS和cpDNA序列的梭梭和白梭梭物种分化 总被引：2，自引：0，他引：2
【目的】基于nrDNA和cpDNA 2种基因,探讨中国同域分布的梭梭和白梭梭的物种分化,分析2种基因的单片段及其片段组合对2种植物的物种鉴别力,并分析生态位分化的程度及其对物种进化的影响,为梭梭和白梭梭的系统发育和谱系地理等研究提供基础数据。【方法】基于2个nrDNA序列(ITS2、ITS1-ITS4)和3个cpDNA非编码区序列(trnS-trnG、rps4和trnV),对古尔班通古特沙漠南缘同域分布的梭梭和白梭梭共30个个体进行序列分析;利用距离法(基于Kimura 2-parameter)研究2种植物的遗传分化;基于贝叶斯方法分析个体间的分子系统关系;并利用距离法、系统发育树法、BLAST比对法和诊断特征法评价ITS和cpDNA的单序列及其组合对2种植物的物种鉴别力。在此基础上,利用生态位分析软件ENMTools V1.4定量分析梭梭与白梭梭生态位分化的程度。【结果】1)对于梭梭和白梭梭,2个ITS序列拼接比对的总长均为1 117 bp,G+C含量平均分别为34.74%和34.82%,总的信息位点数分别占片段总长的2.33%和1.43%; 3个cpDNA序列拼接比对的总长均为2 344 bp,G+C含量平均分别为59.62%和59.39%,信息位点数分别占片段总长的0.68%和0.43%。2)基于ITS和cpDNA序列组合构建的贝叶斯系统发育树都表明梭梭和白梭梭各聚为一支。3)基于ITS和cpDNA序列组合计算的2种植物的种间最小遗传距离均大于种内的最大遗传距离,并且种间种内都存在1个明显的距离间隙,表明本研究所用的ITS和cpDNA的序列组合可以作为鉴定梭梭和白梭梭的DNA条形码序列。4)基于4种方法评价的ITS和cpDNA序列对梭梭和白梭梭的物种鉴别力表明:2个ITS的单序列及其序列组合的鉴别率均为100%; cpDNA序列中,rps4的单序列及其与trnS-trnG,trnV的两两序列组合的鉴别率均为0,而trnS-trnG,trnV的单序列及其序列组合,以及trnS-trnG+trnV+rps4组合的鉴别率均为100%。5)生态位参数D值和I值的观察值和一致性检验的模拟值都集中在0.65和0.90左右,表明梭梭和白梭梭的生态位分化不明显。【结论】基于ITS和cpDNA序列组合,梭梭和白梭梭物种间的遗传分化明显,分子系统关系清楚; ITS和cpDNA序列组合都可以作为鉴定梭梭和白梭梭的DNA条形码序列;梭梭和白梭梭的生态位分化不明显,说明生态因素很可能对2种植物的分化与进化没有起到明显的作用,2种植物很可能也具有相近的进化历史。本研究的结论可以为梭梭和白梭梭的系统发育、遗传和进化研究提供重要的理论依据和数据支撑。 相似文献
10.
以甲壳素为唯一碳源,利用对硝基-N-乙酰苯胺为显色剂,通过变色圈法从湘江河岸边的土壤中筛选到产甲壳素脱乙酰酶的霉菌7株。其中A4菌株具有较强的产甲壳素脱乙酰酶能力。结合形态学和ITS区序列特征,A4菌株初步鉴定为串珠状赤霉菌。 相似文献
11.
12.
The internal transcribed spacer (ITS) regions of rDNA and the intervening 5.8S rRNA gene for the powdery mildew fungi Erysiphe (sect. Microsphaera) pulchra and Phyllactinia guttata were amplified using standard polymerase chain reaction (PCR) protocols and the universal primer pairs, ITS1 and ITS4. PCR products for ITS were analysed by electrophoresis in a 1.5% agarose gel and sequenced. The size of the amplified ITS products (approximately 650 bp) were not sufficiently different to allow reliable differentiation of E. pulchra and P. guttata; however, their sequences were distinct. Specific primers for E. pulchra and P. guttata were developed and evaluated for use as diagnostic tools. The diagnostic band size from E. pulchra‐specific primer pair was 568 bp while the P. guttata band was 597 bp; the two primer pairs were highly specific to E. pulchra and P. guttata. Comparison of ITS sequences with information in the GenBank showed a very close similarity between sequences of E. pulchra isolates from Cornus florida in the USA and isolates collected on Cornus kousa in Japan. BLAST analysis of the sequence of the 650‐bp band from P. guttata revealed a close alignment with sequences of P. moricola (92%), P. kakicola (94%), and P. fraxini (92%). The sequence of P. guttata in C. florida also had a 98% identity with P. guttata in Calycanthus occidentalis and 94% identity with P. guttata in Corylus cornuta. 相似文献
13.
ITS sequences of ten kinds of plants of Lespedeza and an out group were obtained by primer design PCR, sequencing and cluster analysis. The results show that ITS1 section length was 228–243 bp, 5.8S sequence length was 165 bp which was very conservative; ITS2 section lengths varied from 215 to 220 bp and the conservative sites occupied 88.1%. Phylogenetic analysis of ITS sequences using PAUP 4.0 software and their genetic relationship were discussed. 相似文献
14.
15.
杉木rDNA ITS-1区的克隆及序列测定 总被引：5，自引：0，他引：5
编码核糖体ＲＮＡ的基因是由一些高度重复序列组成的多基因家族。ｒＲＮＡ基因以串联重复形式存在于染色体上,每个细胞中的拷贝数目在１０００～１０,０００之间,由于ｒＲＮＡ基因中包含了进化速度不等的编码区、非编码转录区和非转录区,因而可以选择其中保守程度不同的片段作分子标记研究植物的系统发育及遗传变异。ＩＴＳ是核糖体ＤＮＡ中介于１８ｓ和５－８ｓ之间（ＩＴＳ－１）以及５－８ｓ和２６ｓ（ＩＴＳ－２）之间的转录间隔区,目前已研究过的被子植物ＩＴＳ－１一般小于７００ｂｐ（ＡｌｖａｒｅｚＢｕｌｙｌｌａｅｔａｌ．… 相似文献
16.
Oliveira OM Vellosa JC Fernandes AS Buffa-Filho W Hakime-Silva RA Furlan M Brunetti IL 《Fitoterapia》2007,78(3):263-264
The ethanolic extract of Agaricus blazei and ethyl acetate and hydroalcoholic fractions were evaluated for their antioxidant activity. 相似文献
17.
杨树溃疡病病原的多重PCR检测技术 总被引：2，自引：0，他引：2
利用真菌通用引物ITS1/ITS4,EF1-728F/EF1-986R对4种杨树溃疡病病原菌株和环境样本的核糖体DNA内部转录间隔区ITS序列和转录延伸因子EF-1α基因序列分别进行普通和多重PCR检测,再进行测序比对分析。结果表明:退火温度为55.6℃,各引物终浓度为0.2μmol·L-1,可以成功地扩增出菌株和环境样本的目的条带,并通过测序比对鉴定出多种来自培养和环境病害组织中的溃疡病病菌,多重PCR能够检测到1ng的基因组DNA。研究结果将为建立溃疡病病原多重PCR鉴定技术和以环境溃疡病病害样本为直接检测鉴定对象的高通量的基因芯片检测方法奠定基础。 相似文献
18.