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荧光原位杂交技术的发展及其在植物基因组研究中的应用 总被引：1，自引：0，他引：1
荧光原位杂交(FISH)技术能够实现DNA序列在染色体上的物理定位,已经广泛应用于植物基因组研究中。本综述基于FISH技术分辨率和灵敏度的提高,从探针类型和靶标染色体类型两个方面总结了FISH技术的发展进程及不同FISH技术的应用优势和不足之处。在技术应用方面,总结了FISH技术在植物染色体识别、核型分析、系统进化及亲缘关系分析、异源染色质及转基因鉴定、基因定位和物理图谱构建等研究中的应用进展,并对其应用前景进行了展望,以期为植物基因组研究提供更多的研究思路。 相似文献
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新疆野生油菜与野芥遗传性状的比较研究 总被引：8，自引：0，他引：8
对新疆野生油菜和野芥的ｃｐＤＮＡ，染色体数及核型，叶表皮气孔保卫细胞叶绿体数，生殖隔离，植株形态和生长发育等研究结果表明，新疆野生油菜就是野芥。鉴于野芥在我国还没有记载和报道，因此，新疆野生油菜的发现就是野芥在中国的新发现。野芥在加拿大被称为“毒草”。文章对防止野芥蔓延，野芥作为种质资源利用的可能性和在油菜起源进化中的地位等问题作了讨论。 相似文献
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3种鼠尾草属植物的核型分析 总被引：2，自引：2，他引：0
为了解新种质芡欧鼠尾草与鼠尾草属常见植物一串红、一串蓝之间的亲缘关系,并为其远缘杂交和遗传改良提供基础,本实验在细胞遗传学水平,对鼠尾草属芡欧鼠尾草、一串红、一串蓝3种植物染色体核型进行分析。结果显示芡欧鼠尾草二倍体体细胞染色体数目为12条,核型公式是2n=12=2m+2sm+8st,核型不对称系数(AS.K%)为74.9%,核型分类标准属于“3A”型;一串红二倍体体细胞染色体数目为44条,核型公式是2n=44=34m+2sm+8st,核型不对称系数(AS.K%)为62.4%,核型分类标准属于“2A”型;一串蓝二倍体体细胞染色体数目为18条,核型公式是2n=18=12m+6sm,核型不对称系数(AS.K%)为59.0%,属于“2A”型。通过核型分析,芡欧鼠尾草、一串红、一串蓝的染色体具有明显的差异性,所以认为这3种鼠尾草属植物的亲缘关系较远。 相似文献
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纤毛鹅观草原变种与竖立鹅观草变种在我国广泛分布,是重要的小麦族野生种质资源。为了研究种间和居群间的染色体变异和遗传多样性,本研究对 15 份材料进行核型参数差异分析,发现所有材料均为中部着丝点染色体或近中部着丝点染色体,具 2 对随体染色体,分别为Ⅰ St 和 V Y ;平均臂比的变化范围为 1.21~1.40;染色体长度比的变化范围为 1.59~1.80;核不对称系数为 0.51~0.62,核型类型均为 2A。基于荧光原位杂交（FISH）的核型分析共发现 61 个 FISH 信号变异,其中 Y 染色体的变异（33）大于 St 染色体（28）,构建居群间的“核心 FISH 核型”能对 14 对染色体进行区分。结果表明纤毛鹅观草原变种与竖立鹅观草变种居群在细胞核型数据和（FISH）核型上均存在丰富的多样性。 相似文献
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CNGC是植物中普遍存在的环核苷酸门控通道,对植物的逆境响应有重要作用。系统分析甘蓝型油菜BnCNGC基因家族成员全基因组分布、结构、进化及其响应不同逆境胁迫的表达特性,对于阐明其生物学功能具有重要意义。本研究利用拟南芥和甘蓝CNGC蛋白保守结构域及特异基序氨基酸序列在全基因组水平鉴定了甘蓝型油菜BnCNGC家族成员,分析其基因结构、染色体定位、蛋白理化性质、蛋白保守结构域、系统进化及启动子顺式作用元件等。利用转录组数据,筛选甘蓝型油菜逆境响应候选BnCNGC成员,并采用实时荧光定量PCR分析其在核盘菌、PEG模拟干旱胁迫下的表达模式。结果显示,共鉴定到49个甘蓝型油菜BnCNGC成员,分布于除A08、C06的17对染色体上,含有5～10个内含子,其上游1500 bp包含大量逆境胁迫响应元件。BnCNGC家族成员编码的蛋白质含413～801个氨基酸,相对分子量(MW)范围47.62～110.58kD,等电点(pI)范围6.10～9.88。系统进化分析表明,BnCNGC分为Group Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ四类。转录组数据分析表明, BnCNGC9、BnCNGC27和BnCNGC48均参与逆境胁... 相似文献
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超氧化物歧化酶(SOD)是重要的抗氧酶,在生物体内广泛存在。以油菜基因数据库为搜索平台,通过对油菜超氧化物歧化酶基因家族进行生物信息学分析。结果表明:油菜SOD基因家族主要含有32个基因,蛋白质的氨基酸序列长度86 aa^386 aa之间。BanSODs基因具有相对保守的结构,即包含SOD DNA结构域;HMA DNA结构域;Mn/N DNA结构域;Mn/C DNA结构域,SOD蛋白结构中含有7个α螺旋和4个β折叠结构域。进化树分析表明油菜SOD蛋白序列与谷子、小立碗藓蛋白序列具有相对较高的同源性。该研究结果可以为进一步了解油菜SOD基因家族和玉米抗氧化机制提供一定参考。 相似文献
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油菜小孢子培养影响因素及黄籽油菜双单倍体群体的构建 总被引：5，自引：0，他引：5
针对我国油菜小孢子培养供体材料一般种植在大田,受外界环境影响较大,出胚率较低的现状,对大田环境条件下小孢子培养的主要影响因素进行了研究。同时,为了构建黄籽油菜双单倍体群体,研究了黄籽油菜的出胚情况。结果表明,不同取样时间对小孢子胚状体再生频率的影响很大;秋水仙素处理游离小孢子对胚状体的诱导有一定的负面影响,浓度越高,影响越大;黄籽油菜的出胚率较低(0.56枚/皿),同样条件下,不到黑籽油菜的1/8。不同黄籽单株间出胚率差异较大,变异幅度在0.04~1.97枚/皿。采用小孢子苗直接移栽大田技术,移栽成活率达89.0%,经染色体加倍后,最终构建了含有127个株系的黄籽油菜双单倍体群体。 相似文献
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含油量是油菜最重要的性状之一, 目前已有较多的油菜种子含油量定位研究, 然而各研究系统相对独立, 群体与标记的差别使得难以比较不同研究结果。本研究连续4年种植了一个含308份材料的油菜自然群体, 结合60K SNP芯片数据对种子含油量进行了全基因组关联分析(GWAS), 并将所鉴定的显著位点与早前2个自然群体及10个分离群体鉴定到的位点进行全基因组比较与整合。结果显示, 通过GWAS共检测到8个与种子含油量显著关联的位点, 单个位点解释的表型变异度为3.22%~5.13%; 结合其他12个群体的定位结果, 共获得193个油菜含油量整合位点, 分布于油菜的所有19条染色体, A亚基因组平均每条染色体有13个位点, 显著高于C亚基因组(7个)。对不同群体鉴定结果的比较发现, 7个整合区间能在至少3个群体中被检测到, 均位于A亚基因组染色体(A01、A02、A03、A06、A08、A09和A10)上, 其中有3个与C亚基因组上的区间存在同源性, 在这3个区间中共鉴定到26个已知的油脂代谢相关基因。本研究将193个位点锚定到法国公布的甘蓝型油菜参考基因组, 构建了一个可视的油菜种子含油量位点全基因组整合系统, 可为油菜种子含油量重要位点的确定提供帮助, 并为制定提高油菜种子含油量的育种方案提供参考。 相似文献
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Ying Fu Dongqing Zhang Madeleine Gleeson Yaofeng Zhang Baogang Lin Shuijin Hua Houdong Ding Martin Frauen Jiana Li Wei Qian Huasheng Yu 《Euphytica》2017,213(1):17
Increasing seed oil content is one of the most important breeding targets for rapeseed (Brassica napus). In this study, we combined quantitative trait loci (QTL) mapping and marker-trait association analysis to dissect the genetic basis of seed oil content in rapeseed. A doubled haploid (DH) population with 261 lines was grown in two highly contrasting macro-environments, Germany with winter ecotype environment and China with semi-winter ecotype environment, to explore the effect of environment effect of on seed oil content. Notable macro-environment effect was found for seed oil content. 19 QTL for seed oil content were identified across the two macro-environments. For association analysis, a total of 142 rapeseed breeding lines with diverse oil contents were grow in China macro-environment. We identified 23 simple sequence repeat (SSR) markers that were significantly associated with the seed oil content. Comparative analysis revealed that five QTL identified in the DH population, located on chromosomes A03, A09, A10 and C09, were co-localized with 11 significantly associated SSR markers that were identified from the association mapping population. Of which, the QTL on chromosome A10 was found to be homeologous with the QTL on chromosome C09 by aligning QTL confidence intervals with the reference genomes B. napus. Those QTL associated with specific macro-environments provides valuable insight into the genetic regulation of seed oil content and will facilitate marker-assisted breeding of B. napus. 相似文献
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以抗旱能力强的油菜Holiday为材料,以干旱处理的样品为Tester,正常水分管理(对照)为Driver构建干旱诱导的甘蓝型油菜叶片正向抑制性消减杂交 (SSH)文库。随机挑选24个阳性克隆进行PCR验证,结果表明,其中23个含有插入片段,平均大小在750 bp左右。将96个阳性克隆测序,并拼接和去除冗余,获得重叠群4条,单拷贝序列82条,平均长度为542 bp。经BlastX程序比对蛋白数据库发现,11条EST没有找到同源性序列,75条有同源序列。KOBAS分析发现,28条EST被定位到67条代谢途径中,根据P值推测,光合中的碳固定、有氧呼吸的电子供体、氮代谢、乙醛酸和二羧酸代谢在植物干旱胁迫中发挥着极为重要的作用。这些EST涉及到的功能中所占比例最大的分别是细胞器(58.82%)、结合(30.77%)和新陈代谢过程(43.72%),表明甘蓝型油菜面对干旱胁迫时,细胞器组件上的功能发挥了重要的作用,结合基因和蛋白被激活,加强了新陈代谢。 相似文献
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Alexandra V. Amosova Lyudmila V. Zemtsova Olga Yu. Yurkevich Elena N. Zhidkova Tomasz Książczyk Natalia G. Shostak Anatoly A. Muravlev Anna M. Artemyeva Tatiana E. Samatadze Svyatoslav A. Zoshchuk Olga V. Muravenko 《Euphytica》2017,213(9):217
Resynthesized Brassica napus L. is an important source for broadening genetic diversity and producing lines with desired characteristics. It is also a fine model to study the processes of genomic reorganizations in recently formed polyploids. We firstly performed molecular cytogenetic characterization of newly resynthesized rapeseed (B. rapa ssp. narinosa × B. oleracea ssp. capitata) and its parental species, and also examined genomic changes in hybrids of the succeeding generations grown under pressure of selection of yellow-seeded progeny. For karyotype studies, FISH/GISH with 45S, 5S rDNA, C genome specific BoB014O06 BAC clone and genomic DNA of parental B. rapa was performed. Synthetic S0–S2 hybrids had common rapeseed karyotypes (2n = 38) including 14 loci of 45S rDNA sites and 10 loci of 5S rDNA. Progeny selection led to gradual deletion of C genome chromosomes in hybrid karyotypes. So, in karyotypes of S6 and S7 hybrids, the chromosome number was reduced to 2n = 20–22, and only chromosomes of A genome bearing 10–13 loci of 45S rDNA and 8–10 loci of 5S rDNA, variations in chromosome number, chromosome rearrangements as well as examples of trisomy and monosomy were revealed. Our findings indicate an enhanced genome instability in resynthesized rapeseed lines developed under the pressure of selection which might lead to chromosome rearrangements or/and deletions and even elimination of the whole parental genome in hybrids in succeeding generations. The approach can be useful for the development of rapeseed lines with trisomy, chromosome addition/substitution lines important for genetics and plant breeding. 相似文献
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重离子束是一种新型辐照源，它对油菜的影响以往研究较少。本文报道了30 Gy、50 Gy和80 Gy 12C重离子束辐照对油菜M1和M2生育期、植物学性状、品质性状，根尖和花粉母细胞的染色体行为和DNA分子多态性等方面的影响。结果表明：50 Gy和80 Gy辐照处理可引起油菜生育期提早，生长繁茂，部分植株发生变异，出现瘤状根、矮茎、淡绿匙形叶，多雌蕊花，双生角果和黄籽株等。80 Gy辐照处理使油菜种子含油量有不同程度提高，并出现油酸含量高于70%以上植株。 30~80 Gy辐照处理，使根尖染色体和花粉母细胞染色体产生畸变，畸变类型有微核、小核、异常四分体、染色体桥、落后染色体、断片等，其中以微核细胞最多，且辐照剂量愈大畸变率愈高。50 Gy和80 Gy辐照处理对油菜DNA分子有影响，RAPD分析表明，用40个引物对处理后油菜进行扩增，共扩增出43个DNA片段，表明不同处理植株存在一定多态性。 相似文献
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显性黄籽油菜种子特性研究 总被引：5，自引：0，他引：5
本文以甘蓝型显性黄籽油菜为材料,研究了黄籽杂交种和亲本种子特性,结果表明:(1)该黄籽与遗传背景相同的黑籽相比,皮壳率低2.68个百分点、含油量高2.01个百分点、蛋白质高1.60个百分点;黄籽杂交种的含油量比黄籽父本具有明显的杂种优势.对皮壳和胚的分析表明,黄籽皮壳中的含油量和蛋白质含量明显高于黑籽,而胚中增加较少.表明黄籽的含油量和蛋白质含量比黑籽高,主要是因为:黄籽的胚的比例增加,并且黄籽皮壳和胚中的油分含量和蛋白质含量均比黑籽高.(2)在黄籽油中,饱和脂肪酸的含量减少,不饱和脂肪酸的含量增加,其中,亚麻酸的含量增加最多.(3)黄籽与黑籽的色泽差异,主要是由于花色素和黑色素含量的差异引起,黑籽的花色素和黑色素含量分别是黄籽的4.86倍和4.24倍. 相似文献
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分析1988—2017年四川省油菜生产的时空演变特征,为进一步稳定四川油菜种植面积和优化油菜生产区域布局提供科学参考。对1988—2017年四川省油菜生产相关数据进行分析整理,利用区域重心分析法和比较优势指数法对区域布局和优势差异进行量化计算。结果表明,1988—2017年四川省油菜播种面积与总产量呈正相关的波动增长趋势,且油菜产量较油菜播种面积增长更快,油菜生产在区域间和区域内部分布不均。油菜播种面积和单产水平对油菜总产量有直接影响。1988—2017年四川省油菜生产重心基本稳定,油菜的主要生产区域由成都平原向川东北迁移,同时向川南地区扩展。结合分析结果,四川省应重视油菜生产布局规划,充分发挥各区域比较优势,加强基础设施建设投入,促进油菜种植规模化,积极引进农业科技人才,推广双低、高产、多抗、广适应的油菜新品种。 相似文献
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甘蓝型黄籽油菜与黑籽油菜苗期生理特性的比较研究 总被引：1，自引：0，他引：1
油菜苗期的植株长势与抗性及后期产量密切相关。为探索甘蓝型黄籽油菜抗逆性较弱和产量较低的原因,以2对不同遗传来源的甘蓝型黄、黑籽油菜近等基因系为材料,研究了苗期植株的主要生理特性。结果表明,甘蓝型黄籽油菜苗期生长势弱,叶绿素含量和类胡萝卜素含量,光合速率和叶面积指数（LAI）均比相同遗传背景下的黑籽油菜低;与黑籽油菜相比,甘蓝型黄籽油菜无论是在不同的叶龄期,还是在植株的不同部位,均表现出“糖高氮低”的代谢特点,且越冬期叶片的硝态氮含量和硝酸还原酶活性也低;根颈粗和单株干物质重也明显小。甘蓝型黄籽油菜苗期生长势弱,冬前干物质积累偏少,进而影响其春后的生殖生长,这可能是其产量较低的重要原因之一。 相似文献