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1.
甘蓝型油菜BAN同源基因片段克隆与序列分析 总被引：4，自引：0，他引：4
参照拟南芥（Arabidopsis thaliana)BAN基因和cDNA的保守序列设计引物，对甘蓝型、白菜型、芥菜型油菜和拟南芥及其它十字花科栽培品种的基因组总DNA进行PCR扩增，均获得与拟南芥BAN基因扩增片段大小极其相似的PCR扩增产物，表明BAN基因可能广泛存在于十字花科植物中。甘蓝型油菜和拟南芥BAN扩增片段测序比较分析显示，拟南芥BAN片段（779bp)与已往的报道完全相同，甘蓝型油菜的BAN片段（780bp)与拟南芥BAN外显子的同源性为90％，但与内含子的同源性仅为74％。甘蓝型油菜BAN氨基酸序列与80多种植物的NADPH还原酶类有不同程度的同源性。 相似文献
2.
植物分子标记技术原理及其在茶树育种中的应用 总被引：15，自引：1，他引：15
本简述了限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism，RFLP)、随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA，RAPD)、任意引物PCR(Abitray Primer-PCR，APPCR)微卫星(microsatellite)或称简单序列重复(simple sequence repeat，SSR)、简单重复间序列ISSR(Inter-Simple Sequence Repeat)、序列标签位点(sequence tagged site，STS)技术和割裂扩增多态性(Cleaved Amplified Polymorphic Sequence，CAPS)技术，扩增片段长度多态性(amplIfied fragment length polymorphism，AFLP)等植物分子标记技术原理，综述了该技术在茶树分类学及遗传多样性的研究、品种鉴定和亲缘关系鉴定、构建茶树的遗传图谱以及分子标记辅助育种等方面的应用现状。 相似文献
3.
甘蓝与芸薹属5个近缘物种的基因组原位杂交分析 总被引：14，自引：1，他引：14
利用基因组原位杂交(GISH)技术，研究了甘蓝基因组与芸薹属其它5个近缘物种基因组间的相互关系。以标记的甘蓝(CC，2n=18)的基因组总DNA为探针，分别同二倍体甘蓝、白菜型油菜(AA，2n=20)、黑芥(BB，2n=16)和异源四倍体芥菜型油菜(AABB，2n=36)、埃塞俄比亚芥(BBCC，2n=34)、甘蓝型油菜(AACC，2n=38)的中期染色体杂交，甘蓝、白菜型油菜和甘蓝型油菜的所有染色体上都有杂交信号，不能区分A、C基因组。黑芥染色体上只有零星的弱小信号，埃塞俄比亚芥的中期染色体显示出18个明显的信号，可以区分出C、B基因组；芥菜型油菜的中期染色体显示出20个明显的信号，其余染色体上信号很弱或无，可以区分出A、B基因组。说明在长期的进化过程中，甘蓝与白菜型油菜、甘蓝型油菜的亲缘关系较近，基因组的分化程度较小，而甘蓝与黑芥的亲缘关系较远，基因组的分化程度较前者高；甘蓝与芥菜型油菜和埃塞俄比亚芥间的亲缘关系介于上述二者之间。 相似文献
4.
ACGM标记在小麦属中的通用性 总被引：5，自引：0，他引：5
为检验水稻基因组数据在小麦属中的通用性。利用基于水稻基因组数据设计的扩增共有序列遗传标记（ACGM）扩增小麦属12种不同材料，结果有32对引物可以至少在1种小麦属材料中获得扩增产物。占引物总数的80％；在能够获得特异性产物的32对引物中，有4对引物的产物在供试材料之间没有多态性位点；有28对引物可以在供试小麦材料之间获得多态产物，占引物总数的70％。这表明以水稻基因组序列开发的ACGM标记在小麦中有一定的通用性。 相似文献
5.
为研究西藏白菜型黄籽油菜种质资源的遗传多样性，提高其育种利用效率。采用SCoT标记方法，对30份白菜型黄籽油菜种质资源进行遗传多样性分析，并结合生物学特性信息进行综合分析。通过对50条SCoT标记引物的筛选，获得24条重复性好、多态性高、遗传信息丰富的引物，并对参试种质资源进行PCR扩增，共获得214个DNA位点，其中具有多态性的位点有182个，平均多态性位点百分率为87.33%。应用NTSYSPc 2.10e软件分析得到，供试种质资源的相似系数在0.473～0.930之间，进行非加权组平均法（UPGMA）聚类分析得出树状图，在相似系数为0.797时，可将30份材料完全区分成5组。结果表明，西藏白菜型黄籽油菜之间的遗传多样性较为丰富，并综合生物学特性和分子水平试验研究，发现塔巴寺黄籽油菜某些性状与芥菜型油菜相似，初步认为塔巴寺黄籽油菜可能是与芥菜型油菜杂交的后代或者本身就携带类似芥菜型油菜的隐性基因，此假设可在后期分子水平实验中进一步论证。 相似文献
6.
大豆EST-SSR标记开发及与Genomic-SSR的比较研究* 总被引：9，自引：0，他引：9
本研究对458220条大豆EST序列进行SSR搜索,共检测出EST-SSR序列39989条, 经拼接得到无冗余EST-SSR序列8190条,包括357种重复基元。其中二、三核苷酸重复基元类型居多,分别占无冗余EST总数的11.13%和16%,统计得到二核苷酸重复类型12种,三核苷酸重复类型60种。以含有简单重复序列的无冗余EST序列设计200对引物,其中148对引物有清晰且单一条带扩增产物,以30份大豆品种资源进行引物筛选,获得多态性引物31对。以21份大豆不同基因型的基因组DNA为模板选取30对显示多态性的大豆EST-SSR引物和30对大豆基因组SSR引物进行扩增,带型统计结果显示：大豆EST-SSR与基因组SSR在供试基因型间多态性指数均值分别为0.55 和0.44,二者揭示的多态性水平差异不大。从而说明利用生物信息学方法基于大豆EST开发SSR标记是切实可行的,大豆EST-SSR可以用于大豆遗传多样性分析,是大豆DNA分子标记体系的一个重要补充。 相似文献
7.
用20个随机引物对55份来自湖南白菜型油菜进行遗传多样性分析,共获得322个RAPD标记位点,其中220个位点具有多态性,多态率达68.3%.利用322个标记位点,用UPMGA法建立了湖南省55份白菜型油菜的亲缘关系聚类图,结果显示,总体上亲缘关系较近的品种在地理分布上靠得较近,聚类将55个品种分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ簇,第Ⅰ簇49个品种,第Ⅱ簇2个品种,第Ⅲ簇4个品种.来自泸溪县的泸溪甜油菜和溆浦县的溆浦油菜之间的遗传距离最小(0.0398),亲缘关系最近. 用SPSS统计软件对农艺性状聚类,结果分为A、B两个大簇,分别由27和28个品种组成.对来自同一县的多个品种的RAPD结果进行了遗传多样性指数分析,除汉寿县白菜型油菜的Shannon指数小于Simpson指数外,其他13个县的白菜型油菜Shannon指数均大于Simpson指数;新晃县白菜型油菜Shannon指数和Simpson指数均为最高,洞口县白菜型油菜Shannon指数和Simpson指数均为最低. 相似文献
8.
翻译控制肿瘤蛋白(translationally controlled tumour protein,TCTP)是生物体中一种普遍存在且高度保守的蛋白.作为一种多功能蛋白,TCTP在各种复杂的生命活动中发挥重要作用.本研究根据已知的HbTCTP cDNA序列设计引物,对PCR扩增产物测序获得HbTCTP基因组序列.比对HbTCTP基因组和cDNA序列发现HbTCTP由4个内含子和5个外显子组成,内含子与外显子剪接处符合GT/AG法则.根据HbTCTP序列及基因结构信息开发简单重复序列(SSR)和内含子长度多态性(ILP)标记,并在10个橡胶树品系中分析SSR和ILP标记多态性.结果表明,SSR和ILP标记在10个橡胶树品系中均出现多态性,多态性分别由SSR重复次数多少和内含子长短引起. 相似文献
9.
通过田间试验取样分析，比较了诸葛菜、甘蓝型油菜、芥菜型油菜、白菜型油菜在石灰土上的无机营养状况。结果表明：诸葛菜有极强的耐低浓度的P、K、B、Zn、Mn等的能力。对Na和Cu有拒吸作用。这种能力是诸葛菜的喀斯特适生性的机制之一。 相似文献
10.
简单序列重复在真核生物的基因组中含量非常丰富,且常常随机、均匀分布于整个基因组中。SSR标记广泛应用于动、植物基因定位、群体遗传多样性分析、遗传连锁图谱构建、指纹图谱构建、种质鉴定、分子标记辅助选择等方向。随着大量全基因组序列的公布,NCBI等数据库中可利用的序列信息量激增。但在常规分子生物学研究中,仍然延续传统的小规模SSR标记开发模式,开发标记数量非常有限、效率较低。结合MISA脚本指令、Primer3引物设计软件、e-PCR特异性扩增分析软件,对玉米全基因组水平SSR位点进行搜索、引物设计、特异性扩增分析以及扩增长度差异分析,开发高密度的SSR标记。通过引物合成、PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳,从常规分子生物学水平验证所开发标记的可靠性。 相似文献
11.
Seven primer pairs flanking di- and tri-nucleotide repeat sequences, identified from previously sequenced regions of the potato genome, were examined for their potential use in DNA-fingerprinting of thirty-nineSolanum tuberosum subsp. tuberosum cultivars (released between 1861 and 1988) and one diploidS. phureja breeding line. Of the simple sequence repeats (SSRs), the primers for six SSRs amplified DNA sequences within the potato genome between cultivars for a total of 14 bands. The polymerase chain reaction (PCR)based amplification products generated from each primer pair consisted of 1 to 2 bands per cultivar but band variation among cultivars demonstrated up to 4 bands per SSR. A similarity matrix generated from five SSRs was able to distinguish 24 of the 40 cultivars. However, when the potato cultivars were grouped by tuber type (round white-skinned, long white-skinned, russetskinned, red-skinned, and yellow flesh) only five pairs of cultivars remained indistinguishable: Atlantic/Katahdin, Belchip/Wauseon, Red LaSoda/Bliss Triumph, Red Pontiac/Norland, and Burbank/Spunta. Although SSRs did not generate unique fingerprints for all of the North American genotypes examined, the potential to discriminate most cultivars should increase as additional SSRs are identified in potato. 相似文献
12.
油菜与诸葛菜属间远缘杂交的初步研究 总被引：1，自引：0，他引：1
为了克服甘蓝型油菜与诸葛菜远缘杂交双受精前雌雄不亲和性,本实验采用60ppm的赤霉素、100ppm的甘氨酸涂抹油菜柱头、10ppm的H_3BO_3 5％的蔗糖涂抹去掉柱头的油菜花柱和蒙导法。赤霉素效果最好,获10粒种子,甘氨酸有一定效果得到3粒种子。而截去柱头和蒙导法均未见效果。在获得的13粒发育不全种子中,7粒种子萌发成苗。幼苗形态介于油菜与诸葛菜之间。 相似文献
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两种油菜花瓣缺失突变体 无花瓣性状的遗传分析 。 总被引：2，自引：1，他引：2
以两种不同类型油菜花瓣缺失突变体为实验材料,通过与正常有花瓣油菜杂交并回交构建F2 和BC1 群 体,分析两种油菜无花瓣突变体的无花瓣性状的遗传规律。根据田间各遗传群体花瓣度( PDgr)的观察和统计表 明,甘蓝型油菜突变体APT02无花瓣性状由两对主效隐性基因和一对隐性修饰基因控制;白菜型油菜突变体 AM032无花瓣性状由一对隐性基因控制。两种油菜无花瓣突变体无花瓣性状的遗传都不存在母体细胞质效应。 相似文献
14.
根据植物细胞质雄性不育恢复基因编码的PPR（pentatricopeptide repeat）蛋白的特点,结合拟南芥PPR基因簇相似序列,扩增油菜野芥细胞质雄性不育(Nsa CMS) 基因组DNA,筛选出一对简并引物,在Nsa不育系育性恢复后的可育材料和野芥亲本中可以同时扩增出符合预期的片段。片段长度为309bp,与萝卜CMS恢复基因核苷酸序列的一致性为69%,与拟南芥1号染色体臂上PPR基因簇核苷酸序列的一致性大于70%,与含波里马（Pol）CMS恢复基因的白菜型油菜相关序列一致性达85%。该片段编码的氨基酸序列含有两个相邻排列的PPR基序,可作为Nsa CMS育性恢复基因的候选片段。 相似文献
15.
PCR步行法克隆油菜自交不亲和基因 总被引：6，自引：0，他引：6
同源序列法与PCR步行法相结合,在油菜中克隆自交不亲和基因SLG和eSRK (extra-cellular SRK).所克隆的SLG序列长为882bp,克隆的eSRK序列长度分别为1495bp(青海大黄)、1494bp(黄籽沙逊)、1727bp(关中油白菜);其GeneBank登陆号分别为AY448025、AY448026、AY448027、AY448028、AY448029、AY448030.缺失突变可能是导致青海大黄和黄籽沙逊自交亲和的原因.克隆的SLG基因与甘蓝和白菜型油菜的SLG基因有很高的同源性,而eSRK基因与甘蓝和白菜型油菜的SRK基因的同源性较高.同源序列法与PCR walking法相结合,可以有效地克隆基因;但在克隆SLG基因的两翼序列时遇到了困难,说明PCR步行法仍有待改进. 相似文献
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稻属AA染色体组8个种间SSR多样性与亲缘关系 总被引：1，自引：1，他引：0
选用平均分布于水稻基因组的30对SSR 引物,对AA染色体组8个野生稻种共42份材料的遗传多样性及遗传关系进行了研究。结果显示,本试验选取的30个SSR标记均具有多态性,多态性位点百分率为100%。30个多态性位点共扩增出的等位基因数为224, 每个位点可扩增出3～10个等位基因,平均7.47个;等位基因有效数(Ae)变幅为1.25～891,平均5.45。多样性指数中,Shannon多样性指数(I)为0.454～2.386,平均1.826;而Nei基因多样性指数变幅为0.199～0.888,平均0.774。系统聚类和带型分析结果表明,亚洲栽培稻(Oryza sativa) 与普通野生稻(O. rufipogon) 的亲缘关系最近,非洲栽培稻(O. glaberrima) 则与巴蒂野生稻(O. barthii) 关系最为密切,杂草稻(O. spontanea) 与普通野生稻 (O. rufipogon)、亚洲栽培稻(O. sativa) 之间有较近的亲缘关系,而展颖野生稻(O. glumaepatula)、长雄蕊野生稻(O. longistaminata)与AA组其他稻种之间的亲缘关系较远。 相似文献
17.
本文采用淀粉凝胶平板电泳法,对新疆野生油菜、黑芥、芥菜型油菜和白菜型油菜芽期的酸性磷酸化酶同工酶进行比较研究。结果表明:(1)新疆野生油菜与黑芥的同工酶谱有明显的差别,各条带的迁移率也不相同,酶谱相似度指数极小,(2)从酶谱带的数目、宽窄、迁移率和酶谱相似度指数分析,芥菜型油菜与新疆野生油菜亲缘关系最近,与白菜型次之,而与黑芥最远。新疆栽培芥菜型油菜可能起源于新疆野生油菜。 相似文献
18.
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Inter simple sequence repeat(ISSR) polymorphism was used to determine genetic diversity and phylogenetic relationships in 90 genotypes of wild and cultivated species of Oryza from different geographical regions of the world. In all the 17 primers used in ISSR-PCR, a total of 11 464 bands were amplified at 253 band positions/loci. The primer UBC-809 amplified the maximum bands(1 059) at 21 band positions. UBC-810 and UBC-835 amplified the minimum of 391 bands each at 7 and 14 band positions, respectively. The mean polymorphism information content ranged from 0.44 to 0.84 and resolving power ranged from 8.69 to 23.53. Un-weighted pair group method with arithmetic mean dendrogram and population structure based on the 17 primers separated all genotypes into 4 major clusters with a genetic similarity of 53%–100%. The first two clusters consisted of 30 O. rufipogon accessions each. In the third cluster, O. nivara and O. longistaminata grouped as one sub-cluster and all other O. nivara accessions and cultivars grouped as another sub-cluster. The fourth cluster had only five O. rufipogon accessions which can be a source of new genes. Four sub-populations were identified within O. rufipogon and two sub-populations within O. nivara at K = 7. A subset of six primers with high resolving power values were the most informative and grouped all genotypes almost similarly as the 17 primers did. Use of these six highly informative primers in ISSR-PCR is a cost effective and robust method for assessing genetic diversity in large germplasm collections of wild rice species. 相似文献