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1.
种质资源鉴定是研究与利用冬瓜种质资源的基础。为了明确冬瓜种质资源遗传多样性,本研究基于表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)分子标记的人工绘制品种鉴别示意图(MCID)法鉴定40份冬瓜种质资源。利用筛选出的7对引物对冬瓜种质资源进行PCR扩增,应用MCID法构建冬瓜品种鉴定图。结果表明,利用7对引物扩增的特征性谱带能够将冬瓜品种在分子水平上区分开,同时能够构建40份冬瓜种质资源的品种鉴定图。利用Ntsys2.10e软件进行聚类分析,在遗传相似系数0.77处,将冬瓜资源分为3个类群。品种鉴定图能够快速地找到区分品种的引物,比聚类图更加直观。基于EST-SSR标记的MCID法是一种有效的冬瓜资源鉴定方法。本研究对冬瓜资源鉴定具有重要意义。 相似文献
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烟草品种RAPD分子标记遗传差异研究 总被引：20，自引：0，他引：20
用２３５个随机引物对来源于中国,美国等国家的２３个烤烟和地方晒晾烟品种基因组ＤＮＡ进行了ＲＡＰＤ分析。结果表明：２５个引物可以扩增出多态性产物;利用其中１６个引物共扩增出１２８条带,其中４６条品种间表现多态性,这种多态性可以进行品种鉴定;根据多态性的带计算了品种间遗传距离,按类平均法可将２３个品种划分６类,各类内含不 地理来源和不同调制类型的品种,说明品种地理来源和调制类型差异与遗传差异没有必然的 相似文献
3.
通过构建我国多花黑麦草主栽品种的SSR标记指纹图谱数据库,以实现对多花黑麦草品种的快速、准确鉴定.本研究利用SSR标记,基于多态性高、稳定性强和连锁群分布均匀的原则,从100对多花黑麦草(Lolium multiflorum Lam.)基因组来源的SSR引物中,筛选出12对引物用来构建了21个多花黑麦草品种(系)的指纹图谱.12对SSR引物共扩增出108种多态性基因型,多态性比率达94.15％,每对引物的基因型从5～22种不等,平均每对引物扩增出9种基因型,多态性信息量(PIC)变幅为0.744～0.934,平均为0.843,此12对引物可以在构建多花黑麦草品种DNA指纹数据库作为核心引物推荐使用.21个多花黑麦草品种(系)基因型间遗传相似性系数在0.4956～0.8571之间,UPGMA聚类分析表明,在相似系数0.69处可将全部材料分为3大类.7对引物在9个品种上具有唯一特征带,采用15-08C单对引物即可将21个多花黑麦草品种完全区分开,该对引物不仅多态性高(PIC=0.934),且具备多个品种的特征谱带.基于该引物建立了供试品种指纹图谱标准模式图,每个品种具有唯一的指纹图谱(带型),为牧草品种的审定和保护以及选配优良杂交组合培育新品种提供了重要的理论依据. 相似文献
4.
我国棉花主栽品种的RAPD指纹图谱研究 总被引：38，自引：0，他引：38
利用ＲＡＰＤ技术，对我国９个棉花主栽品种基因组进行ＤＮＡ片段扩增，以研究棉花不同栽培品种的指纹图谱。结果表明：１８个不同的随机引物中有１３个扩增出多态性ＤＮＡ片段，其中１个引物（ＯＰＰ－０９）可使每一品种具有其自身的特征谱带，展示了ＲＡＰＤ技术可从ＤＮＡ水平上鉴别我国现有棉花推广品种的分子差异，用它鉴定品种纯度是可行的。 相似文献
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6.
SSR标记评价西瓜品种的一致性 总被引：3，自引：0，他引：3
为了评价SSR标记对西瓜品种一致性鉴定的可行性,以及建立依据SSR标记的西瓜一致性鉴定标准,本研究采用11对西瓜SSR引物,检测了78个西瓜(Citrullus lanatus)品种以及2009～2013连续5个年度北京市西瓜区域试验97个品种的11个SSR标记位点的一致性比率。每个品种取48个个体,每条染色体上选取一个标记。通过统计11对核心引物对175个西瓜品种的检测结果以及不同品种在不同位点的一致性分布的特征特性,发现品种内的随机单株个体在不同引物位点中一致性分布情况都不一样,品种内单株的某一个SSR位点的一致性比率不代表这个品种的一致性,也不能简单的依据品种内个体的某一个SSR位点的一致性比率来评估这个品种的一致性,需要综合品种内随机单株个体11个位点的平均一致性比率来评价其一致性。综合分析西瓜11对SSR核心引物对175个品种一致性比率的统计结果,提出可以将SSR位点一致性比率作为评价西瓜品种一致性的辅助标准,判断西瓜品种的一致性时,需综合单个引物的一致性r和所有引物位点的平均一致性比率R两个指标进行评价,将西瓜品种一致性级别分为5级,并说明了利用SSR标记评估西瓜品种一致性的指标以及检测方法中需注意的细节,初步拟出西瓜一致性评估标准。 相似文献
7.
为了建立河南粳稻品种的DNA指纹图谱,了解河南粳稻种植品种的遗传多样性,本研究利用均匀分布于水稻(Oryza sativaL.)12条染色体的37对SSR引物,以河南1963～2010年间主要推广种植的37个粳稻(O.sativaL.ssp.japonica)品种为材料,进行简单序列重复(SSR)指纹图谱构建和遗传多样性分析。结果表明,33对引物具有特异多态性片段,共检测到114个等位基因,平均每位点3.53个等位基因;引物多态性频率为0.054～0.739。37个品种的遗传相似系数为0.627～0.992,平均为0.812。17个品种都至少具有1对SSR特征引物,其余20个品种的鉴定需要结合不同的SSR引物。利用19对核心SSR引物构建的指纹图谱能逐一区分出36个粳稻品种。采用非加权类平均法(UPGMA)进行聚类分析,在遗传相似系数0.710处可将37个品种分为2大类,河南选育品种基本都聚到同一大类群,表明河南推广的粳稻品种遗传基础狭窄。 相似文献
8.
为了解节水抗旱稻品种的多样性,利用SSR分子标记技术对24份节水抗旱稻和2份普通水稻品种进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。结果表明,24对引物共扩增出96个多态性片段,平均每对引物可检测到4个等位基因,每个SSR位点可以检测到2~6个等位基因。引物多态信息含量(PIC)的变化范围为0.36~0.75,平均值为0.58。指纹图谱显示至少可以利用RM71、RM72、RM336、RM337、RM1195和RM5414这6个核心标记的不同组合鉴别区分26份供试材料。聚类分析结果表明,26份材料间遗传相似系数为0.54~0.98,在遗传相似系数0.65处可以将供试材料分为籼、粳两类,较好地反映了供试材料的亲缘关系。本研究结果为节水抗旱稻新品种保护、真伪鉴定及亲本选配提供了参考。 相似文献
9.
为探索衰减全反射傅里叶变换红外光谱技术(ATR-FTIR)在小麦籽粒品种(系)识别和籽粒性状突变体鉴别上的应用,本研究采集了91个小麦品种(系)和576个小麦M5突变体及235个对照株系籽粒的ATR-FTIR光谱,其中71个小麦品种(系)用于建立小麦籽粒ATR-FTIR识别模型,20个小麦品种(系)用于外部验证;对建模光谱数据进行7种预处理,在3 600~1 000 cm-1波段内建立小麦籽粒品种(系)识别模型,外部验证检验该模型的准确性;并应用该模型从M5突变株系中鉴定籽粒性状突变体。结果表明,使用多元散射矫正+Norris平滑(MSC+ND)预处理方法建立的小麦籽粒ATR-FTIR识别模型能完全鉴别71个小麦品种(系)的籽粒,且外部验证也证实了该模型的准确性;应用建立的小麦籽粒ATR-FTIR识别模型,从突变株系中鉴定了4个籽粒性状潜在突变体,突变率为0.69%。本研究建立了小麦籽粒ATR-FTIR识别模型,实现了对不同小麦品种(系)籽粒的区分,并将该模型应用于突变体鉴别,拓宽了ATR-FTIR光谱技术在小麦上的应用领域,同时为筛选小麦籽粒性状突变体提供了新的途径。 相似文献
10.
为构建无籽西瓜品种的DNA指纹,实现无籽西瓜品种的快速准确鉴定,客观评价品种的遗传多样性,本研究利用核心SSR标记对我国54份无籽西瓜(Citrullus lanatus)主栽品种进行了分析。结果显示,23对多态性引物共扩增出63种基因型,基因型数2～5个不等,平均2.74个;平均多态性信息量(PIC)为0.39,变化范围为0.04～0.67,有5个品种具有特征谱带;54个品种遗传相似系数变化范围为0.643 9～1.0,平均0.859 3,参试品种具有较高的遗传相似性;组合23对引物,除无法区分雪峰花皮无籽与郑抗无籽1号、郑抗新1号与广西3号、黒宝无籽与桂冠1号,其余品种均能一一区分开,利用PIC0.4的10对引物构建了5份主要参试品种的DNA标准指纹图谱;采用类平均法进行聚类分析,在相似系数0.82处,可将54个品种分为7大类。本研究建立了参试品种的标准DNA指纹图谱,为我国无籽西瓜品种的真实性鉴定和知识产权保护提供了技术基础。 相似文献
11.
适于玉米杂交种纯度鉴定的SSR核心引物的确定 总被引：9，自引：0，他引：9
为了确定一套适于玉米杂交种纯度鉴定的核心SSR引物,利用10个SSR引物对420份已知玉米(Zea mays)杂交种进行DNA指纹分析。综合考虑多态性和杂合率两个指标,确定bnlg161和bnlg1450为玉米杂交种纯度鉴定的首选核心引物,利用这两个引物进行筛选,412个品种(占98%)能够找到具有杂合带型的鉴定引物,确定5个引物bnlg439、bnlg125、umc2105、umc1705和bnlg1792为玉米杂交种纯度鉴定的备选核心引物。研究了纯度鉴定所用特异引物的选择,将特异引物分为两类:第一类是利用单个引物检测,某品种的基因型仅出现1次,将该引物作为该品种在特定品种范围内的特异引物,在420个品种中,累计29个品种具有第一类特异引物,其中umc1705和bnlg1450作为特异引物的次数最多,均为8个,phi072和phi065没有作为特异引物;第二类是根据引物基因频率表,将预测基因型频率低于2.40E-03(即1/420)的基因型作为特异基因型,除了phi072和bnlg161外,其它8个引物均可能成为具有特定基因型品种的第二类特异引物。利用推荐的7个纯度鉴定用核心引物可进一步筛选每个玉米杂交种的双亲互补型引物,建立了已知玉米杂交种的纯度鉴定DNA指纹图谱。 相似文献
12.
Aliphatic primary and biogenic amines of grape varieties from two vintages were studied. We established that appearance and/or increase of both primary aliphatic and biogenic amines is due to microbiota living in/on grape berries. Aszú, gray rotten grapes infected mainly with Botrytis cinerea, grape berries infected mainly with Penicillium species, and intact grape berries were compared on the basis of amine composition using t-test, analysis of variance, and multivariate statistical analysis (principal component analysis and linear discriminant analysis). The amine composition and amine content of Aszú grapes were significantly different (p < 0.05) from those of intact grapes despite the effect of the vineyards and the vintages. Grape samples coming from the same growing location, intact, Aszú grapes, and grape berries infected mainly with Penicillium species could be separated from each other with multivariate statistical analysis. We distinguished intact, Aszú (noble rotten), and gray rotten berries from each other as well. Evaluating amine values of grape samples independently of the place of origin, the Aszú and green rotten berries could not be differentiated. The varieties and vineyards have affected the amine composition of Aszú grapes, while these effects on intact grapes appeared only slightly. 相似文献
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环介导等温扩增技术快速检测大西洋鲑的研究 总被引：1，自引：0，他引：1
为探究环等温扩增技术(LAMP)在鲑科鱼类物种鉴定方面的应用,以大西洋鲑为研究对象,针对其线粒体CR区段设计特异性的LAMP引物,并通过单因素试验和正交试验研究反应体系中d NTP Mix、Mg~(2+)、甜菜碱终浓度对LAMP扩增结果的影响。结果表明,大西洋鲑LAMP扩增的最优条件为:引物SS-CR-F3/SS-CR-B3各0.2 m M,SS-CR-FIP/SS-CR-BIP各1.6 m M,dNTP Mix 1.4 m M,Mg~(2+)6 m M,甜菜碱0.8M,Bst DNA聚合酶8 U,扩增温度为65℃,反应时间60 min。在此条件下LAMP扩增产物电泳检测特异性强、稳定性好,对大西洋鲑DNA的检出限达0.01 ng·μL~(-1),并可对混合样本进行检测。本研究结果为大西洋鲑快速物种鉴定提供了一种重要技术手段,该技术可应用于鲑科鱼类物种鉴别的日常检验检疫和市场监管工作中。 相似文献
14.
DNA条形码技术能够快速、准确地识别物种,对于开展基础性的分类学研究和应用性的生物多样性研究极为重要。本文以广西畜牧研究所牧草种质资源圃的8个物种共22个品种为材料,进行植物条形码ITS测序。PCR结果显示ITS的扩增成功率达到100%,同源性的分析表明各物种中的ITS序列变异显著,共找到99个可以用来区分物种的变异位点,系统进化树的结果表明利用ITS序列进行物种水平鉴定成功率达100%,能够作为DNA条形码识别植物物种。 相似文献
15.
Alessandra Busti Maria Eugenia Caceres Ornella Calderini Sergio Arcioni Fulvio Pupilli 《Genetic Resources and Crop Evolution》2004,51(4):443-448
RFLP molecular markers have been used for the identification of 12 commercial varieties of tall fescue (Festuca arundinacea Schreb.). Of these, 7 could be distinguished on the basis of the presence/absence of specific and unique bands whereas the other 5 could be distinguished on the basis of band combinations. No differences in the RFLP pattern were detected between accessions of the same variety, whether obtained from the same source or from different sources. Bulked DNA probes from 100 plants are recommended as representative sample for allogamic crops. The use of molecular markers for seed certification in tall fescue is discussed. 相似文献
16.
With the commercial farming and exploitation of Chinese alligators (Alligator sinensis), illegal and inappropriately labeled Chinese alligator meat has appeared in markets. To prevent the illegal hunting and commerce for Chinese alligators, it will be important to develop an expedient and practical method for the identification of Chinese alligator meat. In this study, a pair of the species-specific PCR primers (Alli-M and Alli-R) was designed using sequence variations of mitochondrial DNA (mtDNA) cytochrome b gene between Chinese alligators and other crocodilians. By the multiplex PCR of using the species-specific primers and 12S rRNA universal primers L1091 and H1478, 31 samples (27 meat samples, 4 skin samples) were identified. The result of amplification displayed that only the fresh and the cooked meat samples from the Chinese alligator could be amplified with two bands. We also present a case of identification of a crocodilian body part found in a local market using the newly developed primers. The specific primers designed in this study could be widely used for the rapid and accurate identification of not only alligator meat but also other commercial products from Chinese alligator. 相似文献
17.
A. Dansi H.D. Mignouna J. Zoundjihékpon A. Sangare N. Ahoussou R. Asiedu 《Genetic Resources and Crop Evolution》2000,47(6):619-625
DNA from twenty-three late maturing cultivars of Guinea yams (D. cayenensis/D. rotundata complex) from the Benin Republic that could not be separated using isozyme markers, were examined using randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) markers with decamer primers of arbitrary sequence. All the twelve primers tested were informative and yielded 63 amplified DNA bands from which 47 (75%) were polymorphic. Although no single primer produced polymorphic bands in all cultivars, the great majority of the cultivars were separated with the combinations of polymorphic bands generated by various primers. Putative duplicates and cultivar misclassifications were identified. Many morphologically distinct cultivars were close. The dwarf cultivar Tam-Sam considered as derived from Tabane, appeared more distant from the latter than was believed. RAPD analysis was found as a practical tool for the identification of duplicates toward establishment of an accurate core collection of Guinea yams in Benin Republic and in the other countries of the African yam belt. 相似文献
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为开发石蒜属简单重复序列(SSR)分子标记,并研究SSR引物在石蒜属内的通用性,本研究对石蒜属石蒜、忽地笑、中国石蒜、长筒石蒜、换锦花、香石蒜6个种质转录组测序,检测SSR位点并设计引物,通过PCR扩增和毛细管电泳判断引物的有效性和多态性,绘制石蒜属17个种质资源的指纹图谱并对杂交后代的真实性进行早期检测。结果表明,共获得404 481条Unigenes,利用数据库进行同源比对和功能注释,并对Unigene进行SSR位点挖掘和分析,共检测到59 612个SSR位点。其中,单核苷酸重复>二核苷酸重复>三核苷酸重复,分别占SSR总数的62.88%、20.06%和14.66%,四核苷酸及以上重复单元相对较少。选取并合成8对荧光引物进行PCR扩增,通过毛细管电泳检测发现,8对荧光引物共检测到60个多态位点,多态位点数平均为7.50,多态性信息含量(PIC)值变化范围为0.148 0~0.940 8,平均值为0.593 0。利用引物扩增带型组合法构建了石蒜属17个种资源的指纹图谱,其中引物QZ209可区分所有供试材料,并可用于杂交后代鉴定。本研究开发的SSR标记具有丰富的多态性,在石蒜属植物的资源多样性分析、杂交种鉴定及遗传图谱的构建应用中具有重要意义。 相似文献
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为筛选出大豆萌发期抗旱性鉴定的适宜试验条件,以大豆品种陇中黄601、恳鉴豆15、九农29、长农16为供试材料,采用蛭石法和滤纸法进行发芽试验,运用内源转录间隔区(Internally Transcribed Spacer,ITS)序列分析法进行发芽床筛选,测定各供试大豆品种的发芽率、硬实豆数、发霉豆数,并进行了蛭石湿度和PEG-6000浓度筛选。结果表明,蛭石法发芽试验能明显减少大豆发芽试验中产生霉菌的种类与数量,适宜在大豆萌发期抗旱性鉴定中应用。且在蛭石湿度为170%、PEG-6000浓度为22%的条件下,不同大豆品种间的发芽率差异比较明显,硬实豆数和发霉豆数少,试验数据可靠,可作为大豆萌发期抗旱性鉴定试验的适宜条件。且在此条件下,4个供试大豆品种的抗旱性表现由强到弱依次为陇中黄601、九农29、长农16、恳鉴豆15。 相似文献