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将曾氏的复合区间法推广到多个相关数量性状基因（ＱＴＬ）图谱的联合构建，以Ｆ２世工３个性状为例，列出联合构建的混合模型，以及参数的极大似然估计和假设的似然比测验的方法，模拟示范构建的ＱＴＬ图谱表明，当基因的多效性存在的，与各个性状的独立构建相比联合构建可大大提高ＱＴＬ的检测效率。 相似文献
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许自成 《农业科技译丛(杭州)》1997,(3):12-16
利用５个大小为１３５－２５０株不等的水稻群 材料，将水稻株高的数量性状基因座位定位于ＲＦＬＰ图谱上。总计２３个ＱＴＬｓ分布于水稻１２条染色体上，其中８个ＱＴＬｓ为两个群体所共享。与ＲＦＬＰ标记相关联的１３人主效矮秆或半矮秆基因的位置和已定位的２３人ＱＴＬｓ的位置相结果表明，１３个矮秆或半矮秆基因与ＱＴＬｓ靠得近，这一结论支持“ＱＴＬｓ与主基因是同一基因座位的不同的等位基因”的假说。 相似文献
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水稻产量,株高及其相关性状的QTLs定位 总被引：19，自引：0，他引：19
用具有１７６个ＲＦＬＰ标记的ＤＨ群体及其图谱,对控制水稻产量、株高及其相关性状的ＱＴＬｓ进行区间作图。共定位了４７个ＱＴＬｓ,其中影响产量及其相关性状的ＱＴＬｓ３３个,影响株高及其相关性状的ＱＴＬｓ１４个,并估算了每个ＱＴＬ的加性效应和贡献率。一些性状的定位结果与其他人的研究有所差异,可能是研究材料和环境条件的不同所引起,水稻数量性状基因型与环境互作的研究将对此作进一步探讨。 相似文献
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作物QTL定位研究进展 总被引：10，自引：0，他引：10
作物的许多农艺性状和经济性状是数量性状,研究作物数量性状遗传对农作物育种具有十分重要的意义、近年来,由于分子标记技术的发展,许多作物均已构建了饱和和分子遗传连锁图谱,促进了ＱＴＬ定位统计方法的快速发展,提出的许多方法成功地应用于多种作物的ＱＴＬ定位,为进一步的ＱＴＬ精细定位,分子标记辅助选择和ＱＴＬ克隆分子打下基础,本文简要评述有关这方面研究的现状。 相似文献
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动物生长发育中主基因的QTL定位法 总被引：3，自引：1，他引：2
将系统学研究动物生长发育的方法和控制数量性状主基因在遗传标记图谱上的定位相结合,提出了动物生长发育过程中任一时刻的数量性状基因座位的定位方法（ＱＴＬ）。并对控制数量性状的主基因表达的时序,传统的基因遗传参数的估计,以及系统分析在分子遗传中的应用前景进行了讨论。 相似文献
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系统描述了数量性状基因座位作图的统计方法－－单个遗传标记ＱＴＬ之间重组了最大似然估计法，并将ＬＯＤ值与似然比检验相结合，应用于重组率估值及连锁强度的显著性检验，编写了可在微型机上运行，适合于Ｆ２、ＤＨ、ＢＣ等群体ＱＴＬ作图的通用计算机程序，并提供了水稻广亲和基因及与生育期有关的ＱＴＬ作图的应用实例。 相似文献
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DNA分子标记已广泛应用于植物遗传连锁图谱构建,烟草分子标记遗传连锁图谱的构建始于2001年,已经构建了4张SSR分子标记遗传连锁图。较高密度的分子图谱能有效地应用于烟草不同栽培类型若干数量性状的基因定位、基因图位克隆、比较基因组学和分子标记辅助育种等研究。因此,进一步构建烟草不同栽培类型高密度的遗传连锁图具有重要意义。 相似文献
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生化标记和分子标记在玉米轮回选择中的应用 总被引：2，自引：0，他引：2
生化标记及分子标记在玉米轮回选择中的应用，使育种家对表现型的选择逐步过渡到对主基因和单个数量性状基因（ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅｔｒａｉｔｌｏｃｉ即ＱＴＬ）的操作方面，可作为传统育种方法的辅助手段． 相似文献
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大多数现存的检测数量性状位点的统计方法,不适于去分析带有偏态分布和删失机制的生存性状。因此,将生存分析中参数和半参数模型镶嵌到数量性状区间定位的框架内,去定位生存性状。在生存性状分析领域里,加速失效时间模型被认为是用于分析数据的一个非常重要模型。基于加速失效时间模型,提出定位生存性状的参数模型,采用EM算法获得参数的极大似然估计。同时,视贝叶斯信息标准为模型选择标准。通过选取带有极大似然和寡参数的指定误差分布,构建了优化模型。为了证明方法的有效性,分析了一个实际数据集,结果表明,在生存分布的五个常用分布函数,对数Logistic分布是控制小鼠高氧性急性肺损伤的最优分布函数。 相似文献
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简单线性模型统计方法是业已被证明的与GLM法具有相近参数估计准确度和检测效率的一种二歧性状基因定位分析的简化方法。将适于二歧性状的一元线性模型推广到多类别分类性状基因定位分析中,文中提出采用多元线性模型对多类别分类性状进行基因定位分析。该方法首先将分类性状的各个类别转化为不同的二歧性状,并把每个二维数据看作是连续的,然后采用似然分析法,根据多性状联合定位的统计准则判断QTL的位置和估计QTL效应。模拟结果表明：新方法在大样本和中等遗传力条件下,能够以很高的计算效率相当准确地估计分类性状隐含变量给定的QTL位置和效应。 相似文献
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以F2设计为资源群体，以区间定位分析为QTL定位的方法，通过计算机模拟，系统地比较了不同资源群体规模和性状遗传力下QTL检测效率,QTL位置和效应估计的准确性和精确性，以期揭示出两个因素对QTL定位效果影响的一般性规律。结果表明：适当扩大资源群体的规模，不仅有助于提高QTL的检测效率，而且还可提高QTL位置和效应估计的可靠性；当对高遗传力性状的QTL实施定位时，QTL的检测效率以及QTL位置估计的准确性和精确性相对较高，但QTL效应估计的可靠性则会有所降低。 相似文献
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随机效应模型下标记-QTL连锁分析方法 总被引：4，自引：0，他引：4
在QTL随机模型的框架内，通过对QTL方差组分的最大似然估计，进行家畜一般系谱群体的QTL-标记连锁分析，研究中同时考虑了性状遗传力和QTL效应的不同水平对QTL定位效果的影响。结果表明，采用QTL随机效应模型可以有效地进行标记-QTL间的连锁分析并可获得较高的检验功效，QTL位置与效应参数的估计均在合理的范围内；同时，性状遗传力和QTL方差贡献对QTL定位准确度和功效均有较大的影响，随着性状遗传力和QTL方差贡献的增大，参数估计的准确性和检验功效提高。固定性状遗传力的情况下（h^20=0．1），QTL效应由0．1→0．5时，相应的检验功效由17％提高到49％；当遗传力和QTL效应均提高到0．5时，QTL检验功效最高达到88％。 相似文献
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采用强优势玉米杂交种苏玉16(JB×Y53)的两个亲本自交系,配置F2和相应F2∶3作图群体。利用154个SSR标记构建了分子标记连锁图谱,覆盖全基因组1 735.0 cM,标记间平均图距为11.3 cM。同时考察F2和F2∶3群体的株高、穗位高、抽穗期和散粉期等共10个重要农艺性状,采用联合F2和F2∶3群体的作图方法定位有关QTL。此外,采用QTL Cartographer V2.5软件分别对F2和F2∶3群体进行了有关QTL的重演性验证。结果表明,采用联合作图方法在调查的10个性状上共定位到93个QTL,采用QTL Cartographer V2.5软件共定位到96个QTL,其中56个能用两种方法重演验证。 相似文献
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功能定位的实质是将动态性状变化过程的基本规律镶嵌在QTL定位框架内。拟合与时间相关的QTL基因型的期望均值向量和剩余误差的协方差矩阵是动态性状功能定位的核心内容。根据QTL的统计检测效率,通过比较关于QTL基因型的期望均值向量和剩余误差的协方差矩阵的子模型的不同组合,来筛选优化的功能定位模型。以水稻一个DH群体的叶龄性状为例,我们分别用3个具有生物学意义的子模型和2阶Legendre多项式去拟合QTL基因型的均方向量,用13个平稳和非平稳模型去描述剩余协方差的变化。其结果GM2和“衰减”指数模型组合被确定为用来检测水稻第3个连锁群控制叶龄动态变化QTL的优化模型。 相似文献
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