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1.
大白菜抗芜菁花叶病毒(TuMV)EST-SSR信息分析与引物筛选 总被引：1，自引：0，他引：1
为了研究大白菜抗芜菁花叶病毒(TuMV),对大白菜及芸薹属中与抗性有关的EST序列进行了搜索和SSR筛选,并根据SSR两端的序列设计引物,以1对大白菜TuMV抗、感材料的基因组DNA为模板,对上述引物进行了筛选。结果表明,在132条大白菜EST和895条芸薹属抗性EST序列中,共筛选出166个符合条件的SSR(16.2%)。其中包含6种核苷酸重复基元,占主导地位的分别是二核苷酸重复(33.7%)和三核苷酸重复(50.0%),其余重复类型所占比例较小。根据上述SSR两翼的序列,共设计引物196对。引物筛选结果表明,能够进行成功扩增的有156对,占79.6%,其中35对引物在2份材料中具有多态性。因此,利用芸薹属中抗性有关的EST序列设计SSR引物,可用于大白菜TuMV抗性有关基因的标记。 相似文献
2.
利用大白菜抗根肿病基因CRa和CRb分子标记(SC2930和KBr H129J18R)引物组,对78份大白菜材料进行抗根肿病分子标记鉴定。结果表明,在这78份材料中,有34份材料含有SC2930-T(CRa抗病标记)标记,其中杂合抗病位点材料17份,纯合抗病位点材料17份。有37份材料含有KBr H129J18R抗病标记,其中纯合抗病位点材料15份,杂合抗病位点材料22份。有20份材料不含有CRa和CRb所对应的抗病标记,23份材料含有2个抗病标记。该研究初步明确了78份参试大白菜材料所含抗根肿病基因CRa和CRb类型,为大白菜抗根肿病育种提供材料选择依据。 相似文献
3.
为加快燕麦分子辅助育种进程,以1981-1983年进行抗旱性鉴定的42份燕麦种质(18份低抗、13份中抗、11份高抗)和12个未鉴定的燕麦育成品种为试验材料,采用PstⅠ/MspⅠ双酶切的dd-GBS基因分型技术构建燕麦简化基因组参考序列,通过Stacks、主成分分析、Fisher Test和Blast分析研究燕麦SNP分子标记。测序结果表明,燕麦个体的高质量reads数在4 111 218～19 019 296,利用Stacks软件成功组装753 325条燕麦简化基因组参考序列,共注释74 657个群体SNP位点。主成分分析表明,燕麦SNP基因型大致聚为2簇,其中一簇主要由14份低抗种质组成,另一簇则包含全部11份高抗种质。进一步的Fisher Test差异显著性统计分析表明,相对于燕麦低抗种质材料,共有2 937个SNP标记在燕麦高抗种质材料中差异显著((错误发现率False Discovery Rate,FDR)0. 05),其中,55个SNP标记差异极显著(FDR 0. 001)。将上述55个SNP标记所在源序列与小麦基因组序列在Phytozome数据库中进行比对(Blast)发现,14个SNP位点可能参与燕麦抗旱生物学信号通路基因的表达,其中包括参与植物激素信号转导来调控燕麦的抗逆性。通过GBS技术成功组装的燕麦简化基因组参考序列,丰富了当前燕麦的基因组数据库。通过统计学分析得到的55个SNP标记与小麦基因组数据库进行比对,结果发现,14个SNP标记将对燕麦分子辅助育种和加速育种进程具有重要的指导意义,更可为今后的燕麦种质资源大规模快速筛选奠定技术基础。 相似文献
4.
以感病烟草品种为材料,提取总RNA,根据已报道的eIF4E基因cDNA的序列,在保守区域和差异区域分别设计特异性引物,采用RT-PCR克隆出eIF4E基因的目的片段。以中间载体pKANNIBAL和表达载体pART27为基础,构建成以CaMV35S启动子为驱动的含有“正向eIF4E目的片段-pdk intron-反向eIF4E目的片段”的RNAi烟草表达载体,构建的RNAi载体将抑制eIF4E基因表达,为了解其基因功能和烟草抗病毒育种打下基础。 相似文献
5.
NBS (nucleotide binding site)类基因是植物界中最重要的一类抗病基因。用信息学方法从普通小麦(Triticum aestivum L.)全基因组中分离出2406条含有NBS结构的完整蛋白序列,每条包含48~2272个氨基酸。根据NBS结构域两端是否连接CC或LRR结构域,将TaNBS分为N、CN、NL和CNL4类。对TaNBS所在scaffold序列的SSR位点进行诊断,从1203条scaffold序列上发现2177个SSR位点,以二碱基重复位点最多,占73.5%。针对小麦2AL染色体上的51个SSR位点开发标记,缺体-四体和双端体验证结果表明,有39个标记(76.5%)为2AL特异标记,其中24个特异标记在抗白粉病材料Khapli (2AL上携带Pm4a)和感病材料Chancellor间存在多态性。利用近等基因系Khapli/8*Cc筛选出3个可能与Pm4a连锁的NBS-SSR标记,分别是Sxaas_2AL22、Sxaas_2AL39和Sxaas_2AL46。本研究开发的与抗病序列紧密连锁的特异SSR标记可用于2AL染色体上抗病新基因的检测以及已有抗病基因的候选序列筛选。 相似文献
6.
基于SNP标记小麦自然群体遗传多样性及复合图谱的构建 总被引：2，自引：0，他引：2
《分子植物育种》2015,(7)
本研究利用Illumina i Select 90K(81 587个SNP)基因芯片对中国冬麦区205份小麦育成品种(系)构成的自然群体进行基因分型,分析中国冬麦区小麦的遗传多样性并整合群体的复合遗传图谱。用于检测的81 587个SNP标记位点中,利用32 432个具有品种间多态性的位点进行群体遗传多样性分析,检测到64 864个等位变异,每个位点平均2个等位变异,SNP位点的多态性信息含量(PIC)变化范围为0.05~0.38,平均为0.26;聚类分析将205份小麦材料按亲缘关系划分为4个类群。复合遗传图谱包含24 355个SNP标记位点,覆盖小麦全基因组3 674.16 c M,单个染色体长度为118.91~241.38 c M,标记间平均遗传距离为0.15 c M;小麦的3个染色体组中,B基因组中包含的SNP标记最多(12 321,50.60%),其次是A基因组(9 523,39.10%),D基因组含标记最少(2 511,10.31%)。研究结果为利用该群体进行标记/性状间的关联分析提供遗传信息,并为小麦杂交亲本的选择和新品种培育提供参考。 相似文献
7.
《分子植物育种》2020,(12)
简单重复序列(SSR)是具有极大的信息含量且被广泛应用的一类分子标记。甜瓜线粒体基因组的公布为SSR标记的开发提供了契机。基于甜瓜线粒体基因组富含SSR位点及父系遗传特性,开发并研究线粒体基因组SSR标记在甜瓜育种及种质资源调查等方面的应用。在甜瓜线粒体基因组上共发现808个SSR位点,并对328个位点进行了标记的开发。使用11份甜瓜变种进行PCR筛选及分析后,获得了由89对高多态性引物组成的核心标记,成功应用于甜瓜品种‘夏蜜’的种子纯度鉴定。并基于线粒体SSR标记多样性构建了80份甜瓜材料的UPGMA聚类分析,结果显示粗网纹厚皮甜瓜类型形成一个独立的分支,其他分支具有明显的地域分布特色。本研究结果表明,同一地域不同亚类甜瓜早期可能存在广泛的杂交,人类的育种过程导致了甜瓜不同亚种资源的混杂,这将为后续甜瓜远缘杂交亲本的选择提供重要参考。 相似文献
8.
为揭示湖南省油菜种质资源库中核心种质的遗传多样性,本研究利用油菜组60K基因芯片对266份甘蓝型油菜品系及其10份近缘种品系10份进行全基因组SNP位点分析,原始数据通过Visual Basic软件筛选,利用Powermarker软件计算SNP位点PIC值和供试材料的遗传距离、聚类分析。结果表明：根据SNP标记缺失率和染色体分布均匀度共筛选到24 593个SNP位点,平均每条染色体分布1 294个多态性位点,位点的Nei’s基因多样性指数(H)、主要等位基因频率(MAF)和多态性信息含量(PIC)平均值分别为0.401、0.688 3、0.316;276份供试材料间遗传距离在0.000 1～0.477之间,平均为0.329 6,Kinship值为0的占71.49%;供试材料可分成5个大类,其中最大类(含有250份种质)又可分为9个亚类,供试材料的类群分布与种质类型、地理来源一致。研究结果表明供试育种亲本种质遗传多样性丰富,可更客观反映供试材料的亲缘关系,为种质资源的育种利用提供理论依据。 相似文献
9.
一个新的白菜苗期TuMV-C4抗性主效QTL定位及连锁分子标记开发 总被引：1，自引：0，他引：1
为寻找与TuMV抗性基因紧密连锁的分子标记,选用高抗病毒病大白菜自交系91-112和高感病毒病自交系T12-19以及由二者为双亲构建的包含100个株系的DH群体为材料,通过SSR和InDel标记的遗传分析,在A09上定位了一个新的与大白菜苗期TuMV-C4抗性相关的主效QTL位点BrTuA09。在此基础上,针对该QTL位点所在的标记区间,根据作图群体双亲的重测序结果,设计合成27对引物,其中11个InDel在双亲间具有多态性,且条带单一、扩增稳定;连锁分析发现,11个InDel标记均被定位在A09连锁群上BrTuA09的置信区间。利用BC1群体进行标记验证发现,这些标记对高抗单株选择的准确率均达到78%以上,可应用于分子标记辅助选择,为大白菜TuMV抗病分子育种奠定了良好的基础。 相似文献
10.
为了明确主栽的大白菜以及大白菜育种材料与根肿菌生理小种之间的抗性关系,以现有4,7,10和11号生理小种为菌源,用注射法进行接种,对25份供试大白菜材料进行抗病性鉴定,同时利用分子标记检测供试材料中所含的根肿病抗性位点。结果表明:供试大白菜中,山地王2号等8份试材对4个生理小种都表现抗病,德高CR117等7份试材对4个生理小种都表现感病,C1等4份试材对2个生理小种感病,华抗301等6份试材只对4号生理小种感病;所有试材均含有Crr1抗病位点,德高CR117等11份试材含有Crr2抗病位点,仅在京春CR3中检测到Crr3抗病位点,除德高CR铁甲1号和大地CR118外,其他试材中均检测到了CRk抗病位点,有21,16份试材中分别检测到抗病位点CRa和CRb,而CRc抗病位点仅在星光和CR75中存在。总之,不同大白菜材料对同一生理小种抗性反应不同,同一个材料对不同生理小种的抗性反应不同;所有生理小种中4号生理小种最强,其次为7号生理小种;大白菜材料抗病位点多一定抗病性强;Crr1抗病位点对材料抗性影响不大。 相似文献
11.
Hisashi Udagawa Kazuharu Koga Akira Shinjo Hiroyasu Kitashiba Yoshimitsu Takakura 《Breeding Science》2021,71(2):193
The plant eukaryotic translation-initiation factors eIF4E and eIF(iso)4E play key roles in infection by plant RNA viruses, especially potyviruses. Mutations in the genes that encode these factors reduce susceptibility to the viruses. In the amphidiploid plant tobacco (Nicotiana tabacum L.), eIF4E1-S deletion mutants resist Potato virus Y (PVY), but resistance-breaking strains (RB-PVY) have appeared. In an earlier study, we demonstrated that the loss-of-function of eIF(iso)4E-T reduces susceptibility to RB-PVY. Here, we show that simultaneous inhibition of eIF4E1-S and eIF(iso)4E-T synergistically confers enhanced resistance to both PVY and RB-PVY without host growth or development defects. PVY symptoms and accumulation in a tobacco line lacking eIF4E1-S were detected at 14 days post-inoculation (dpi) and RB-PVY symptoms in lines without functional eIF(iso)4E-T were observed at 24 dpi. RB-PVY emerged in a PVY-infected tobacco line lacking eIF4E1-S. In contrast, lines without functional eIF4E1-S and eIF(iso)4E-T were nearly immune to PVY and RB-PVY, and little accumulation of either virus was detected even at 56 dpi. Thus, the lines will be promising for PVY-resistance breeding. This study provides a novel strategy to develop tobacco highly resistant to PVY and RB-PVY, and insights into the mechanisms responsible for high-level resistance. 相似文献
12.
Quantitative trait loci analysis for resistance against Turnip mosaic virus based on a doubled-haploid population in Chinese cabbage 总被引：2，自引：0，他引：2
Turnip mosaic virus (TuMV) as the major virus infecting Brassica crops, often cause severe yield and quality losses in Chinese cabbage production in China. In this study, quantitative trait loci (QTL) analysis for TuMV resistance was conducted with a population of 100 doubled-haploid lines derived from the F1 between 91-112 (resistant) and T12-19 (susceptible) through microspore culture. A total of 376 molecular markers including 235 amplified fragment length polymorphisms, 129 random amplified polymorphic DNAs, 10 simple sequence repeats, one SCAR and one morphological marker were employed to construct a linkage map with 10 linkage groups covering 809.1 cM with an average distance of 2.2 cM between loci. Resistance was assessed by artificial inoculation at the seedling stage and at the adult stage in field conditions, respectively. Four QTLs controlling TuMV resistance were identified with JoinMap QTL 4.0 and interval mapping method. Two QTLs ( Tu1 , Tu2 ) were associated with resistance at the seedling stage, each accounting for 58.2% and 14.7% of the phenotypic variation, respectively. Two QTLs ( Tu3 , Tu4 ) were found corresponding to the disease resistance at the adult plant stage, explaining 48.5% and 32.0% of the phenotypic variation, respectively. Marker-assisted selection for these major QTLs involved in TuMV resistance could be useful in Chinese-cabbage breeding programmes. 相似文献
13.
大白菜抗源“8407”是河北省农林科学院蔬菜研究所选育的高抗芜菁花叶病毒(TuMV)的抗源材料.1985年经国家专家组验收为国家大白菜抗源.1987年鉴定,“8407”对全国十个省市19个TuMV分离物中的17个表现免疫,两个有轻微症状,因此被确认为我国大白菜对TuMV垂直抗性最好的抗源材料.该材料是1978至1983年从青麻叶系统内蒙古长炮弹品种,经连续6代自交选育而成.在逐年自交的同时,进行了亲和指数和配合力的测定.1983年用“8407”抗源和另一自交系,育成高抗TuMV兼抗霜霉病和软腐病的多抗型“8361”新品种. 相似文献
14.
甘蓝多抗性抗源筛选及抗病品种选配鉴定分析 总被引：2，自引：0，他引：2
通过对甘蓝种质材料815份自交系的主要经济性状和抗病性的初步选择,入选了比较优良的自交系612份。然后利用研究建立的甘蓝室内苗期TuMV、Br、CMV抗性鉴定方法,结合田间自然抗病性鉴定方法,鉴定筛选出H8501、B8502、J8806、B9505等4个抗源。并以抗源为母本,以经济性状优良,配合力高和抗病的另5个自交系为父本杂交18个组合。经对组合抗病性和主要经济性状鉴定分析,结果表现组合均抗病,同时优质性和丰产性均优良的有8个组合,其中4个组合参加品种区域试验并通过了省级和国家品种审定。 相似文献
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Development of gene‐based markers for the Turnip mosaic virus resistance gene retr02 in Brassica rapa 
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下载免费PDF全文 Guo‐Liang Li Wei Qian Shu‐Jiang Zhang Shi‐Fan Zhang Fei Li Hui Zhang Jian Wu Xiao‐Wu Wang Ri‐Fei Sun 《Plant Breeding》2016,135(4):466-470
Turnip mosaic virus (TuMV) is responsible for a serious disease that affects the production of Chinese cabbage. Previous studies have cloned a series of TuMV resistance genes and developed molecular markers. In this study, a derived cleaved amplified polymorphism sequence (dCAPS) marker and a Kompetitive Allele Specific PCR (KASP) marker were developed based on a single recessive gene, retr02, which confers broad‐spectrum TuMV resistance in Chinese cabbage by means of an additional G at the junction of exon 1 and intron 1. The two markers were able to detect the retr02 allele in Chinese cabbage accessions used in breeding programmes. Compared with the dCAPS marker, the KASP marker was flexible, cost‐effective and quick to process, which is likely to be beneficial in establishing high‐throughput assays for marker‐assisted selection. 相似文献
16.
大白菜亲缘关系研究 总被引：1，自引：0，他引：1
为更有效地利用现有资源、挖掘优异基因为育种和生产服务,对大白菜种质资源进行亲缘关系研究在理论和应用上都具有重要意义。本研究利用6对AFLP引物对89份来源和特性不同的大白菜（Brassica campestris L. ssp. pekinensis）种质进行系统评价和分类研究。6对AFLP引物共扩增出286条带,123条为多态性带,占总数的43.01%。不同引物组合扩增出的总带数和多态性带数差异较大,其中,引物组合E-ACT/M-CAC的扩增效果最好,多态性条带最多,占总带数的54.35%。聚类分析显示：中国大白菜种质资源遗传多样性丰富,参试种质间最大遗传距离为0.359,遗传背景广泛。以0.73的相似系数为阈值,所有材料被分为四大组群,其中浙江黄芽菜单独构成一个组群,明显地区分于其他大多数大白菜品种（“主体”组群）。在“主体”组群中,参试的台湾种质和大陆种质分为两个亚组,日本和韩国种质均被聚到了大陆种质亚组,表明供试的日本和韩国材料与中国大陆种质遗传亲缘关系密切。 相似文献
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‘黑叶’大白菜抗根肿病雄性不育系转育研究 总被引：1，自引：1，他引：0
为选育抗根肿病大白菜新品种,根据“复等位基因”遗传假说及大白菜对根肿病的抗性由一对显性核基因控制的结论,以抗根肿病大白菜甲型雄性不育“两用系”的不育株为抗源和不育源,以‘黑叶’大白菜为轮回父本,经过杂交、连续回交、自交、测交、兄妹交和抗病接种筛选鉴定等方法,将抗根肿病基因和核不育基因导入‘黑叶’大白菜中,获得抗根肿病‘黑叶’大白菜新甲型雄性不育“两用系”和“临时保持系”。抗根肿病的大白菜雄性不育系的育成,为抗根肿病新品种选育提供参考。 相似文献
18.
河北省白菜主要栽培品种吸收累积重金属镉的特征和质量安全性研究 总被引：2，自引：0，他引：2
采用土培试验研究了河北省20个白菜主要栽培品种吸收累积重金属Cd的特征和质量安全性。试验结果表明,在土壤加入同一Cd含量（1.0、5.0 mg/kg）的条件下,不同白菜品种地上部的Cd含量、吸Cd量和对Cd的富集系数均存在明显的差异(p<0.05) ,最高相差近3-4倍。按严格的蔬菜标准GB15201—94规定蔬菜中Cd最高允许限量标准0.05 mg/kg,种植白菜新北京三号、北京小杂60、太空三号和丰抗78在土壤Cd含量达到1.0 mg/kg时生产的白菜仍能符合食品安全标准。按GB2762—2005规定的叶菜类蔬菜中Cd最高允许限量标准,即使土壤Cd含量达到5.0 mg/kg时,种植的白菜新北京三号、北京小杂60和丰抗78仍是安全的。同一白菜品种的Cd富集系数是相对稳定,可以作为白菜安全生产时品种选择的重要指标。 相似文献
19.
不结球白菜(Brassica campestris ssp. chinensis Makino)种质资源SRAP遗传分化分析 总被引：1，自引：0，他引：1
利用SRAP分子标记分析了国内外64份不结球白菜种质资源的DNA遗传多样性和遗传分化。21对引物组合共检测出215个位点,其中112个为多态性位点,多态性比率达52.09%,平均每对引物组合产生10.24个位点和5.33个多态性位点。不结球白菜各类型中普通白菜的Nei’s基因多样性指数（0.1410）和遗传丰富度[(190) 88.37%]最高;各生态区域中江淮流域不结球白菜的Nei’s基因多样性指数（0.1451）和遗传丰富度[(185) 86.05%]最高;国内的Nei’s基因多样性指数(0.1293)和遗传丰富度[(188) 87.44%]分别高于国外。遗传变异估算表明,不结球白菜遗传分化系数58.22%,大部分变异存在于种群间;基因流为0.4031,说明群体间基因流动较少,遗传分化程度较高。以遗传相似系数0.872为截值,可把不结球球白菜分为Ⅵ个类群。 相似文献