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大花蕙兰种质资源亲缘关系的RAPD分析 总被引：2，自引：0，他引：2
【目的】从分子水平研究大花蕙兰品种资源之间的遗传亲缘关系，为大花蕙兰种质资源的保存和利用及其杂交亲本的选配提供依据。【方法】利用RAPD标记方法对来自日本、韩国、中国和美国的48个大花蕙兰品种和2个国产兰属原生种的种质资源亲缘关系进行了检测。【结果】从100个10碱基随机引物中筛选出20个多态性高的引物，共扩增出258条DNA带，其中253条为多态带（占98.1%），平均每个引物扩增多态性带12.6条。50份种质之间的相似系数变化范围为0.364～0.817，平均相似系数为0.581。基于RAPD的扩增结果建立的UPGMA亲缘关系聚类图，50份种质在相似系数0.592处被划分为5大类群。【结论】供试50份种质间的遗传亲缘关系与其来源地、花色、花枝类型和杂交系谱有一定的相关性。RAPD技术能很好的用于大花蕙兰品种亲缘关系的研究。 相似文献
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【目的】探究国兰种质资源遗传多样性水平,并构建分子指纹图谱及分子身份证,为在分子水平上鉴定国兰种质提供技术支撑,也为国兰种质资源开发、保存利用及种质创新奠定基础。【方法】以收集于华南及邻近地区的139份国兰栽培品种和野生种质为材料,采用改良的CTAB法提取基因组DNA,由13条正向引物和16条反向引物随机组成208对SRAP引物,每对引物用品种‘宋梅’和‘大勋’扩增产物进行筛选;PCR扩增产物应用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,电泳胶图进行人工读带,并计算多态性引物的总扩增条带数、多态性条带数和多态性条带比率。按照Botstein公式计算多态信息含量;用POPGENE32软件计算观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s基因多样性指数、Shannon’s信息指数,并进行遗传多样性分析。用NTSYS-pc2.10e软件UPGMA方法进行聚类分析,并计算遗传相似性系数。采用引物对组合的方法,构建139份国兰种质资源数字指纹图谱。【结果】从208对SRAP引物中共筛选出17对多态性好且重复性高的引物,对供试材料进行PCR扩增,共扩增出DNA条带489条,其中多态性谱带484条,多态性比率(PPB)为98.89%,观测等位基因数平均值为2.00,多态性信息含量平均值为0.94,每个位点的有效等位基因数平均值为1.49,Nei’s基因多样多样性指数平均值为0.30,Shannon信息指数平均值为0.45。UPGMA聚类分析表明,139份国兰种质资源的遗传相似系数变化范围为0.51-0.91。在相似系数为0.70时,可划分为6个类群。用SRAP多种引物组合方法可有效区分所有材料,并构建出139份国兰种质资源特异性分子身份证,置信概率达到99.99%。根据聚类结果可以将国兰种质分为４组：一为春兰组,由春兰种质单独构成;二为建墨兰组,主要由建兰和墨兰种质组成;三为寒蕙兰组,主要由寒兰、蕙兰和杂交系组成;四为剑莲兰组,由春剑和莲瓣兰种质组成。而四组之间剑莲兰组与寒蕙兰组亲缘关系最近,与建墨兰组次之,与春兰组亲缘关系较远。【结论】所试国兰种质具有较丰富的遗传多样性水平,基于17对SRAP引物组合所构建的139份国兰种质的分子身份识别体系具有唯一性和高效性,SRAP标记是在分子水平鉴定国兰种质的有效方法之一。 相似文献
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利用SRAP分子标记对42份春兰品种及1份多花兰、1份春剑及3份杂交兰进行遗传多样性分析。筛选出的15对引物组合共扩增出185个位点,其中多态性位点184个,平均每对引物组合产生12.27个多态性位点。引物组合Me8-Em16的Nei’s基因多样性数H（0.3993）、shannon信息指数I值（0.5794）和有效等位基因数Ne（1.7280）都是最高值。47份材料的遗传相似系数变化范围为0.63~0.80,UPGMA 聚类分析表明,在遗传相似系数为0.662处,将47份材料划分成五大类群.本研究较好地揭示了47份材料亲缘关系的远近,为春兰各品种间的分类和杂交亲本的选择提供重要理论依据。 相似文献
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应用RAPD标记技术研究大花蕙兰种质资源亲缘关系 总被引：2，自引：0，他引：2
利用RAPD标记技术对来自2个企业的18个大花蕙兰品种进行了检测。结果表明：从50个10碱基随机引物中筛选出15个多态性高、重复性好的引物,共扩增出92条DNA条带,其中90条为多态性带,占97.8%,平均每个引物扩增多态性带6条。18个种质之间的相似系数变化范围为0.1975～0.6704,平均相似系数为0.4761;遗传距离变化范围为0.3296～0.8025,平均遗传距离0.5239。基于RAPD的扩增结果建立了UPGMA亲缘关系聚类图,18份种质在遗传距离0.5239处被划分为4个类群。供试的18份种质间的遗传亲缘关系与其花色和花枝类型存在一定的相关性。 相似文献
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【目的】分析广西乐业县野生春兰种质资源的遗传多样性,构建其DNA指纹图谱,为野生春兰种质资源的分类和鉴定提供科学依据。【方法】采用iPBS分子标记分析收集于广西乐业县81份野生春兰种质资源和4个春兰栽培品种的多态性位点比率(PPL)、多态性信息含量(PIC)、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样性(He)和Shannon信息指数(I)。从83条iPBS引物中筛选出扩增条带清晰、多态性高、重复性好的引物,对供试85份春兰种质的基因组DNA进行PCR扩增,统计凝胶电泳特征性谱带;采用POPGEN 1.32计算各野生春兰种质的遗传多样性指数,并基于其遗传相似系数进行UPGMA聚类;利用引物扩增条带多态性位点构建春兰种质数字指纹图谱。【结果】筛选出的6条引物扩增获得105条清晰谱带,其中,多态性条带95条,多态性比例为90.48%;85份春兰种质的平均PIC、平均Na、平均Ne、平均He和平均I分别为0.8050、1.7923、1.2204、0.2765和0.4590。供试春兰种质间的遗传相似性系数变辐为0.690～0.981,在相似系数0.704处,可将85份春... 相似文献
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甜瓜种质资源遗传多样性ISSR分析 总被引：1，自引：1，他引：0
[目的]对甜瓜种质资源遗传多样性进行ISSR分析。[方法]以27份甜瓜品种为材料,对其基因组DNA进行ISSR分析,计算它们之间的遗传相似系数并进行聚类分析。[结果]从69个ISSR引物中筛选出9条扩增谱带清晰、反应稳定的引物,共扩增出73条条带,其中56条为多态性条带,平均每个引物6.2条。品种间遗传相似系数在0.65～0.97间,表明这27份甜瓜品种间的遗传基础相对较狭窄。利用UPGMA聚类分析,以相似系数0.65为标准,将27份甜瓜种质划分为薄皮甜瓜和厚皮甜瓜2大类群;以相似系数0.80为标准,将薄皮甜瓜分为7个亚类群。[结论]为遗传背景相对狭窄的甜瓜品种选育工作提供了分子水平上的依据。 相似文献
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利用SSR分子标记,对4个白杨杂交新品种及父母本和3个近缘品种进行了指纹图谱构建和遗传关系分析。结果表明:筛选出的9对引物共扩增出106条清晰条带,平均每对引物扩增条带为11.7条,其中,多态性条带89条,多态性比率为83.1%,说明这些品种间具有较高的遗传多样性。9个品种间的遗传相似系数在0.41~0.75之间;通过系统聚类分析发现,4个杂交新品种与父本截叶毛白杨遗传相似度较高。选用扩增效果好,重复性高的3对引物构建了DNA指纹图谱,为这些品种的商业化生产应用提供了技术依据。 相似文献
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草地早熟禾种质资源遗传多样性的RAPD鉴定与分类研究 总被引：5，自引：0，他引：5
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)标记,筛选出69个随机引物对32份草地早熟禾品种遗传谱带进行分析,46个引物共扩增出了197条扩增片断,其中多态性带数为195条,每个引物扩增出1～9条多态性带,平均每条引物扩增出4.3条。根据Jaccard相似系数分析RAPD结果,并利用NTSYS软件,按UPGMA平均法进行聚类。结果表明,第一大组群包括18个品种,第二大组群包括3个品种,第三大组群包括2个品种,第四大组群包括8个品种,第五大组群仅1个品种,为C_2。 相似文献
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以引进的冬种马铃薯品种为研究对象,通过ISSR-PCR分子标记技术对36个马铃薯品种进行分子标记鉴定,分析其遗传多样性,用DNA提取试剂盒提取马铃薯总DNA,筛选合适的引物,建立PCR扩增体系.结果表明:提取的总DNA质量较好,利用筛选出的9个引物经过PCR扩增后共得到81条清晰的条带,平均多态性条带比率达80.25％;聚类分析结果表明,36个马铃薯品种之间的遗传相似系数为0.78～0.91,以遗传相似系数0.80为阈值可以把36个马铃薯品种分为4大类,为冬种马铃薯的选育提供理论依据. 相似文献
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[目的]为快速选育抗病高粱新品种提供理论依据。[方法]采用CTAB法提取高粱基因组DNA,运用RAPD分子标记技术对高粱的抗丝黑穗病基因进行初步分析。[结果]琼脂糖凝胶电泳检测结果表明,采用CTAB法提取高粱叶片DNA有较好的提取效果。通过对70个随机引物进行筛选,获得了34个具有多态性扩增谱带的RAPD引物,确定为适宜引物。34个适宜引物共扩增出107条谱带,平均每个引物扩增出3.1条谱带,使高粱基因组呈现出1种多态性。[结论]高粱抗丝黑穗病基因的RAPD扩增谱带集中分布在600～3 000 bp。 相似文献
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用聚合酶链式反应技术鉴定杂交稻种子纯度的初步研究 总被引：7，自引：4，他引：3
应用聚合酶链式反应（ＰＣＲ）技术,对３个杂交稻组合及其相应亲本的核ＤＮＡ进行了分析,筛选出９个随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）随机引物和１对简单重复序列（ＳＳＲ）引物,可对供试材料进行真伪和纯度鉴定,该技术具有快速,简便,准确的特点,每人每天可测定１８０份样品,适用于杂交稻种子的商业化鉴定。 相似文献
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通过筛选的 1 0个随机引物 ,利用 RAPD技术 ,对丹顶鹤及灰鹤的池 DN A进行了多态性研究。结果表明 :1 0个引物共产生条带 1 3 4个 ,扩增产物片段长度一般为 3 1 0 bp～ 2 .1 kb;利用的引物不同 ,鹤种间的特异性条带也不同 ,从而可以分析鹤种间的遗传差异。根据池 DN A多态性分析 ,两鹤种间的相似性指数为 0 .2 2 3。说明 RAPD技术可作为鹤类遗传结构分析的辅助手段之一 相似文献
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Random amplified polymorphic DNA （RAPD） was used to study the diversity of seven E. pulcherrima with different color leaves. Aight 10 bp primers selected from 30 arbitrary primers were applied for amplifying the Euphorbia pulcherrima DNA. Total 62 bands were produced, among which 22 bands （35.48%） were polymorphic. The average numbers of polymorphic DNA bands amplified by each primer were 7.8. Cluster analysis results showed that the genetic background of seven E. pulcherrima was relatively narrow and they had the higher similarity coefficient, which indicated that these seven strains had a near relationship, and that RAPD marking technology may be the effective means for E. pulcherrima classification. 相似文献
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新疆梨种质资源亲缘关系的ISSR和RAPD分析 总被引：3，自引：0，他引：3
[目的]探讨新疆梨种质资源亲缘关系以及遗传多样性,旨在为供试梨资源的分类提供科学依据.[方法]采用ISSR和RAPD分子标记对48份梨种质资源进行聚类分析和遗传关系研究.[结果]14条ISSR引物共扩增出113条清晰的谱带,其中101条显示多态性,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带.19条RAPD引物共扩增出163条清晰的谱带,其中多态性谱带138条,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带.基于ISSR和RAPD两种标记,利用UPGMA分别构建了48份梨资源的聚类树状图.ISSR和RAPD分别聚类以及两种标记混合聚类均将48份梨种质分为3类:第Ⅰ类群中包括1份种质;第Ⅱ类群中包括23份种质;第Ⅲ类群中包括24份种质.[结论]两种标记适合于梨种质资源亲缘关系和遗传多样性分析,可为梨资源的开发利用及新品种的选育提供科学依据. 相似文献
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本实验应用RAPD技术,对辽宁多绒山羊、辽宁绒山羊、内蒙古阿尔巴斯白绒山羊和杂种多绒山羊的22个DNA模板进行了多态性比较和遗传距离分析,根据聚类分析构建了系统发生树状图.36条引物中筛选出11条引物具有多态性扩增片段.得到多态性位点59个,占总位点数的90.77%,分析显示杂种多绒山羊和辽宁绒山羊的亲缘关系较近. 相似文献
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"夏光"、"早夏16"甘蓝杂交种DNA指纹图谱的构建 总被引：4，自引：0，他引：4
用SDS法提取甘蓝(Brassica oleraceavar.capitata)杂交种“夏光”、“早夏16”及其各自亲本的基因组DNA,通过SSR、RAPD两种分子标记方法构建其DNA指纹图谱用于纯度鉴定。利用30对甘蓝SSR引物和50个适用于甘蓝的RAPD引物,以各杂交种及其亲本的基因组DNA为模板组合进行筛选,结果显示:多数SSR引物对两组合扩增带型一致,未能建立SSR指纹图谱;通过RAPD标记方法筛选出能鉴定两杂交种纯度的引物分别为S15、S42、S147和S42、S78、S88,其中引物S42对两组合均能扩增出特异的RAPD指纹图谱,并将RAPD指纹图谱转变为相应的数字指纹。 相似文献