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微卫星DNA (Microsatellite DNA)与其他DNA分子标记相比较,具有数量多、分布广且均匀、多态性丰 富、呈孟德尔共显性遗传、易于检测、分析快速方便等一系列优点,并在动植物遗传多样性评估、遗传连锁图谱构建、 绘制系统发生树、QTL定位、标记辅助选择、疾病诊断及血缘关系鉴定等研究领域中得到广泛应用。本文就微卫星标记 及其在羊品种遗传育种中的应用作一综述。 相似文献
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微卫星DNA(Microsatellite DNA)与其他DNA分子标记相比较,具有数量多、分布广且均匀、多态性丰富、呈孟德尔共显性遗传、易于检测、分析快速方便等一系列优点,并在动植物遗传多样性评估、遗传连锁图谱构建、绘制系统发生树、QTL定位、标记辅助选择、疾病诊断及血缘关系鉴定等研究领域中得到广泛应用.本文就微卫星标记及其在羊品种遗传育种中的应用作一综述. 相似文献
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综述了遗传标记中的生物化学标记和分子标记在四川黑山羊遗传育种中的应用,重点论述了分子标记随机扩增多态DNA、DNA指纹、随机片段长度多态、微卫星DNA、线粒体DNA在四川黑山羊的起源和进化、群体亲缘关系及群体遗传结构分析、重要经济性状标记、基因图谱的构建和QTL定位、标记辅助选择(MAS)、系谱鉴定与亲子鉴定,以及杂种优势预测等方面的应用。并对其发展前景作了展望。 相似文献
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洼地绵羊与四个羊种分子遗传标记的比较研究 总被引：4，自引：0，他引：4
采用RAPD技术，利用混合基因池(DNA pool)法，对洼地绵羊、小尾采羊、大尾寒羊、滩羊和鲁北白山羊进行了遗洚相关分析。其中洼地绵羊与大尾寒羊间的遗传距离为0．0560，与小尾寒羊的遗传距离为00678，与滩羊的遗传距离为0.1266，而与鲁北白山羊的遗传距离为0．3607。可以认为洼地绵羊、小尾寒羊、大尾寒羊、滩羊有共同的原始祖先，均是由蒙古羊在不同的生态条件下，经过长时期的自然选择和人工选择而形成的地方优良品种。根据遗传距离做出了它们之间的聚类图。同时在分析过程中发现，洼地绵羊、小尾寒羊、大尾寒羊和鲁北白山羊均出现了具有品种特征的特异性条带。可以作为各自的分子标记来进行品种鉴定。 相似文献
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用寡核苷酸探针对近交系小鼠DNA指纹图谱的分析 总被引：3，自引：0，他引：3
应用DNA指纹技术，用非放射性标记的寡核苷酸探针(GGAT)。对3个清洁级近交小鼠品系C57、DBA／2、BALB／c进行检测，分析其DNA指纹图谱。结果显示，不同品系近交系小鼠的DNA指纹图谱有明显差异，而品系内小鼠之间的DNA指纹图谱基本一致。证明DNA指纹技术能够较好地检测出近交系小鼠的基因纯合性，反映其遗传质量，可以应用于对近交系小鼠的遗传质量监测。 相似文献
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利用11对AFLP引物组合,检测了哈萨克羊、阿勒泰羊、巴什拜羊池DNA遗传变异,构建了各品种的AFLP DNA 指纹图谱,根据AFLP分析结果,统计了每个引物组合在各品种中检测到的多态性条带,计算了3个品种的遗传相似系数,并据此构建了UPGMA聚类关系图,分析了它们的遗传关系.结果表明:11对AFLP引物组合在3个地方绵羊品种中共检测到310条带,平均每个引物组合产生28.18条带,变化范围在25～34条,其中多态性条带32条,占扩增总带教的10.32%,每对引物平均扩增多态性带2.909条.品种间的遗传相似系数以哈萨克绵羊与阿勒泰绵羊的最高(O.699),哈萨克绵羊与巴什拜绵羊最小(0.592),聚类结果与这些羊的育成史、分化及地理分布一致. 相似文献
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本研究利用微卫星标记分析了印度南部山羊品种间的遗传多样性及遗传关系。试验采集了印度南部的5个山羊品种(Attappady山羊、Osmanabadi山羊、Sangamneri山羊、Malabari山羊、Kanniadu山羊)及印度东部的1个山羊品种(Ganjam山羊)共288份DNA样品,在25个微卫星位点共检测到190个等位基因。Kanniadu山羊的遗传多样性最为丰富(0.73),Osmanabadi山羊遗传多样性最低(0.61)。Ganjam山羊与Malabari山羊遗传距离最近,为0.22;Kanniadu山羊与Malabari山羊遗传距离最远,为0.83。不同山羊品种间的遗传差异度显然不等于零。所有品种中的大多数位点为杂合子,Fis值为0.20,为中度近交。主成分分析结果表明,山羊品种的聚类取决于地理位置。在制定这些山羊品种的保种方案时应考虑其地理起源。 相似文献
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Plasma melatonin levels in relation to the light-dark cycle and parental background in domestic pigs
Andersson H 《Acta veterinaria Scandinavica》2001,42(2):287-294
To study porcine melatonin secretion in a stable environment 3 daytime (10.00-15.00) and 3 nighttime (22.00-03.00) plasma samples were collected by jugular venipuncture from 15 gilts, 16 sows, 3 boars and 48 piglets (24 females and 24 males from 8 litters) and analysed for melatonin content. Nighttime melatonin concentrations were higher than daytime melatonin concentrations (p < 0.001), whereas no effect of sampling order could be discerned. The 3 adult Hampshire boars had higher melatonin concentrations during the day and the night, than the 31 adult Yorkshire females (p < 0.05). There was no clear difference between gilts and sows in plasma melatonin. The gilts from one of the litters had higher plasma melatonin concentrations than the gilts in 3 other litters (p < 0.05). Among the 48 piglets, the increase of nocturnal melatonin secretion differed between litters (p < 0.01), whereas the influence of father was not quite significant (p = 0.12). No difference in daytime melatonin concentrations between litters could be found, and there was no difference in melatonin levels between the male and female piglets. In conclusion, this study demonstrates that domestic pigs express a nocturnal increase of melatonin secretion in a standard stable environment. For some animals the amplitude of nighttime melatonin secretion was very low, although always higher than the daytime base levels. Furthermore, the levels of nighttime melatonin secretion differed between litters, which suggests a genetic background. 相似文献
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应用SSR分子标记,对河南省15个居群共288份狗牙根材料进行遗传多样性及群体遗传结构分析,结果表明,10对引物共扩增出173条条带,其中163条为多态性条带,多态性条带百分率为94.29%,表明河南省狗牙根具有丰富的多态性。15个居群间的遗传分化系数为0.3857,即发生在居群间的遗传变异达到38.57%,大部分的遗传变异发生在居群内部,居群间基因流为0.7964,居群之间存在一定程度的基因交流。不同居群间遗传一致度的变化范围是0.746~0.964,平均为0.767。15个居群间的UPGMA聚类分析结果表明居群间没有完全按照地理来源进行聚类,遗传距离和地理距离矩阵之间的Mantel检验结果表明狗牙根居群间的遗传距离与地理距离之间无相关性。288份狗牙根材料之间的遗传距离为0.0173~0.5205,平均为0.3113,UPGMA聚类结果将所有材料分为3组。基于Structure软件的群体遗传结构分析结果表明,可将288份狗牙根材料分为2个亚群和一个混合型群体,与288份材料的UPGMA聚类结果基本一致,由此可判断两个亚群的遗传背景单一,混合型群体存在一定的种质基因渗透,遗传背景较为复杂。 相似文献
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我国主要地方绵羊品种遗传亲缘关系 总被引：12，自引：0，他引：12
利用 10种 10碱基的随机引物 ,分析了我国 8个地方绵羊品种计 88只绵羊的随机扩增多态 DNA。结果表明 ,我国地方绵羊品种基因组 DNA多态位点百分率为 81.36 % ,群体平均遗传多样性指数为 1.3370 ,具有丰富的群体遗传多样性。但滩羊、小尾寒羊、藏绵羊和蒙古羊群体遗传多样性程度较低 ,应加强保种措施。群体遗传分化指数为0 .9172 ,说明遗传变异主要存在于群体间。品种间的分子聚类关系基本上反映了品种间的遗传亲缘关系 ,与品种的形成历史及我国地方绵羊的起源进化学说基本一致 ,具有相同来源的蒙古羊、乌珠穆沁羊、小尾寒羊和湖羊的分子聚类关系表明 ,4个地方绵羊品种间已经有了明显的遗传分化 ,小尾寒羊、乌珠穆沁羊间遗传分化较低 ,湖羊与蒙古羊之间相对较高 ,而小尾寒羊和乌珠穆沁羊与湖羊和蒙古羊之间的遗传分化最高 相似文献
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论文从分子遗传学的角度对鸭的遗传资源在群体遗传多样性、群体起源、进化及构建遗传图谱等多个方面的评估进行综述,并对分子遗传标记技术在鸭遗传资源的保护利用上的应用进行概述,以期通过现代动物分子育种技术加快鸭的育种进程。 相似文献
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A.C. Acosta O. Uffo A. Sanz R. Ronda R. Osta C. Rodellar I. Martin‐Burriel P. Zaragoza 《Zeitschrift für Tierzüchtung und Züchtungsbiologie》2013,130(1):79-86
Conservation and improvement strategies in farm animals should be based on a combination of genetic and phenotypic characteristics. Genotype data from 30 microsatellites were used to assess the genetic diversity and relationships among five Cuban cattle breeds (Siboney de Cuba, Criollo Cubano, Cebú Cubano, Mambí de Cuba and Taíno de Cuba). All microsatellite markers were highly polymorphic in all the breeds. The expected heterozygosity ranged from 0.67 ± 0.02 in the Taíno de Cuba breed to 0.75 ± 0.02 in the Mambí de Cuba breed, and the observed heterozygosity ranged from 0.66 ± 0.03 in the Cebú Cubano breed to 0.73 ± 0.02 in the Siboney de Cuba breed. The genetic differentiation between the breeds was significant (p < 0.01) based on the infinitesimal model (FST). The exact test for Hardy‐Weinberg equilibrium within breeds showed a significant deviation in each breed (p < 0.0003) for one or more loci. The genetic distance and structure analysis showed that a significant amount of genetic variation is maintained in the local cattle population and that all breeds studied could be considered genetically distinct. The Siboney de Cuba and Mambí de Cuba breeds seem to be the most genetically related among the studied five breeds. 相似文献
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42份紫花苜蓿种质资源遗传多样性的SSR分析 总被引：1，自引：0，他引：1
为了补充现有苜蓿(Medicago sativa)种质资源的遗传多样性信息,采用SSR分子标记技术对1份野生紫花苜蓿种质和41份栽培紫花苜蓿品种的遗传多样性进行了研究。15对引物在供试苜蓿材料中共获得231条扩增带,其中163条具有多态性。引物的多态位点百分率、Nei’s基因多样性指数和Shannon信息指数的平均值分别为71.55%、0.210 0和0.326 3。供试材料间的相似系数介于0.641~0.913,平均为0.791,栽培品种间的平均相似系数相对较大,野生种质资源与栽培品种间的平均相似系数相对较小。聚类分析表明,供试材料在相似系数0.778处可聚为五大类,单独聚为类的陇东野生紫花苜蓿、CW 200和CW 787都表现出了与其他材料间较远的亲缘关系。基于主成分分析图,可把供试材料分为四大类,其中第Ⅰ、Ⅱ类与第Ⅲ、Ⅳ类材料间的亲缘关系较远。综上,供试苜蓿种质资源具有较丰富的遗传多样性,部分种质资源表现出了相对独立的遗传特性。 相似文献
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利用１５对ＳＳＲ引物和１０个ＩＳＳＲ引物对紫花苜蓿复合体３个种黄花苜蓿、多变苜蓿及紫花苜蓿共１０个居群的遗传多样性及亲缘关系进行研究。结果表明,ＳＳＲ标记下,１０个居群中多变苜蓿ＶＧ 居群多态位点百分率、Ｓｈａｎｎｏｎ信息指数及Ｎｅｉ’ｓ基因多样性指数均最高;ＩＳＳＲ标记下,黄花苜蓿ＦＨ居群以上３个指数均最高;黄花苜蓿居群ＦＨ在２种分子标记下都存在特有位点。说明在１０个居群中多变苜蓿居群ＶＧ与黄花苜蓿居群ＦＨ表现出较丰富的遗传多样性,值得进一步保护。ＵＰＧＭＡ聚类分析结果表明,在２种分子标记下３个种可以被有效区分,结合它们在新疆境内的分布,本研究支持仍将紫花苜蓿、黄花苜蓿和多变苜蓿划分为３个种。 相似文献
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Mtileni BJ Muchadeyi FC Maiwashe A Groeneveld E Groeneveld LF Dzama K Weigend S 《Zeitschrift für Tierzüchtung und Züchtungsbiologie》2011,128(3):209-218
In this study, we compare the level and distribution of genetic variation between South African conserved and village chicken populations using microsatellite markers. In addition, diversity in South African chickens was compared to that of a reference data set consisting of other African and purebred commercial lines. Three chicken populations Venda, Ovambo and Eastern Cape and four conserved flocks of the Venda, Ovambo, Naked Neck and Potchefstroom Koekoek from the Poultry Breeding Resource Unit of the Agricultural Research Council were genotyped at 29 autosomal microsatellite loci. All markers were polymorphic. Village chicken populations were more diverse than conservation flocks. structure software was used to cluster individuals to a predefined number of 2 ≤ K ≤ 6 clusters. The most probable clustering was found at K = 5 (95% identical runs). At this level of differentiation, the four conservation flocks separated as four independent clusters, while the three village chicken populations together formed another cluster. Thus, cluster analysis indicated a clear subdivision of each of the conservation flocks that were different from the three village chicken populations. The contribution of each South African chicken populations to the total diversity of the chickens studied was determined by calculating the optimal core set contributions based on Marker estimated kinship. Safe set analysis was carried out using bootstrapped kinship values calculated to relate the added genetic diversity of seven South African chicken populations to a set of reference populations consisting of other African and purebred commercial broiler and layer chickens. In both core set and the safe set analyses, village chicken populations scored slightly higher to the reference set compared to conservation flocks. Overall, the present study demonstrated that the conservation flocks of South African chickens displayed considerable genetic variability that is different from that of the assumed founder populations (village chickens). 相似文献
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随着萨福克羊、杜泊羊、澳洲美利奴羊等国外优良绵羊品种的大量引进,显著提高绵羊生产性能的同时,其携带的各种遗传缺陷病在全国范围内快速蔓延,这将给羊产业带来巨大的经济损失,严重威胁我国绵羊育种和羊业的健康发展.近年来,发达国家通过对种羊进行遗传缺陷病基因诊断进行遗传净化,而我国相关工作尚处于起步阶段.文章就皮肤脆裂症、羔羊蜘蛛综合症和致死型短颌-心脏扩大-肾发育不全综合症等单基因遗传缺陷病的遗传基础、临床症状和检测方法研究进展进行了综述,以期为我国绵羊遗传缺陷病净化提供理论借鉴. 相似文献