口蹄疫病毒全基因组序列特征分析     

杨鹏华  倪凤娥 《河南农业科学》2011,40(11):140-144

对口蹄疫病毒全基因组序列特征的分析有助于了解口蹄疫病毒复制、翻译等生命活动的相关机制.利用DNAStar和DNAMAN软件,对249株口蹄疫病毒全基因组序列进行了比对分析.结果表明,口蹄疫病毒ORF的长度为5 982～7 020 bp,平均长度为6 975 bp,编码1 994～2 340个氨基酸.各基因的核酸序列同源...  相似文献   

关于序贯抽样检验          下载免费PDF全文

管宇 《浙江农林大学学报》2002,19(1):90-94

利用Wald 的序贯概率比检验中接收产品时对应的批检验数:n1 ＊(0 , c11), n2 ＊(1 , c12),, nk ＊(k -1 , c1k), , 设计出一种改进型序贯检验(其中当c1t s 时(t =1 , , s), 取c1t ＊=c1t ;当c1t s 时, 取c1t＊ =s):n1＊(0 , c11), n2 ＊(1 , c12＊), , ns ＊(s -1 , s)。证明了当次品率较小(p p0)时, 改进型序贯检验的平均抽检个数N ＊(p)与序贯概率比检验的N(p)比较接近, 但抽检周期要小得多。表1 参6  相似文献   

水稻田福寿螺序贯抽样技术研究     

赖朝晖  吴降星  许燎原  陈宏明  陈宇博  周丁国 《江西农业学报》2009,21(9):88-90

在对宁波市水稻田福寿螺种群分布进行调查分析的基础上,研究了福寿螺在水稻田中的序贯抽样技术。结果表明:福寿螺的平均拥挤度M*与平均密度m的回归方程为M*=1.6194+1.2123 m;以Iwao的序贯抽样为基础,结合Kuno的序贯抽样的复序贯抽样技术为:防治指标上限T0(′n)=3n+1.96(9.7689n)~(1/2),下限T0′′(n)=3 n-1.96(9.7689n)~(1/2),截止线T(n)=2.6194/(D02-0.2123/n)(t=1.96,D0=0.15),最大抽样样本数为n=62。  相似文献   

基于新增序偶的传递闭包求解算法     

张世龙  唐雅娜  邹阿金 《仲恺农业工程学院学报》2014,27(2):23-26

针对在已有传递闭包的基础上新增序偶后的传递闭包求解问题,提出了一种基于新增序偶的传递闭包求解算法,并给出了详细证明过程.该算法在已有的传递闭包基础上,通过把新增序偶及该序偶的所有派生间接指向序偶添加到已有的传递闭包中实现求解过程,从而使算法的时间复杂度降低为O(n2),并且不受稀疏矩阵或序偶链的链长等不确定因素影响,最后通过一个实例说明了该算法的执行过程.  相似文献   

桃果肉近核色素copia-like反转录转座子序列分析及分子标记的建立（英文）     

《（《农业科学与技术》）编辑部》2018,(5)

通过对与桃果实近核色素紧密连锁的SRAP标记Me07Em02扩增得到的片段进行了验证、回收、测序和分析,并登录桃基因组Peach v1.0进行比对,获得部分copia-like反转录转座子的部分序列,应用DANMAN和DNASTAR序列分析软件辅助,在桃基因组数据库和GenBank中进行BLASTn比对获得了桃copia-like反转录转座子的全基因组序列,位于Peach v1.0基因组的Scaffold-1的9 939 764～9 944 771 bp位置,全长5 008 bp,其左右两边的长末端重复序列(LTR)完全一致,长度为444 bp,其最大开放阅读框(ORF)位于该序列的487～4 545bp,编码1 535个氨基酸,将该氨基酸序列提交到GenBank中进行Protein BLAST比对,结果显示该序列也具有典型的copia-like反转录转座子的氨基酸序列特征。同时初步建立了桃反转录转座子标记方法,并对桃的遗传多样性进行了分析。  相似文献   

中国梨木虱在梨树上的序贯抽样技术研究   总被引：1，自引：1，他引：1  

王立如  徐永江  徐绍清  陈庭华 《浙江农业学报》2004,16(6):364-367

在对浙江东部沿海地区梨园中国梨木虱(Psylla chinensis Yang et Li)调查分析的基础上,研究了中国梨木虱在梨树上的序贯抽样技术.结果表明:中国梨木虱的平均拥挤度与平均密度回归方程为=-0.59 1.41,相关性极显著;以Iwao的序贯抽样为基础,结合Kuno的序贯抽样提出复序贯抽样技术,防治指标上限T0'(n)=3n 24.92n,下限T0″(n)=3n-24.92n,截止线T(n)=(-0.59 1)/(D02-(1.41-1)/(n))(t＝2,D0＝0.15),最大的样本数为n＝27.  相似文献   

基于NBS-LRR类R基因保守结构域克隆瓠瓜抗病基因同源序列     

赵芹  谢大森  何晓明  罗少波  彭庆务 《华南农业大学学报》2015,36(5):92-98

【目的】分离鉴定瓠瓜Lagenaria siceraria抗病种质的抗病基因同源序列(Resistance gene analogs,RGAs),为瓠瓜功能性抗病基因的克隆及分子标记辅助育种奠定基础.【方法】根据已知核苷酸结合位点和富亮氨酸重复(Nucleotide binding site and leucine rich repeat,NBS-LRR)类抗病基因保守区设计简并引物,从"大籽瓠"抗性材料基因组DNA中分离抗病基因同源序列,并利用生物信息学软件进行长度变异、保守结构域、同源比对与系统进化分析.【结果和结论】基于同源克隆策略,获得23条瓠瓜NBS抗病同源序列,命名为HNB1~HNB23,Gen Bank登录号为KJ908192~KJ908214.序列分析及同源比对结果表明,这些RGAs长度变异在242~261 nt之间,18条序列具有连续开放阅读框(Open reading frame,ORF),推导氨基酸序列具有P-loop、Kinase-2a典型NBS类R基因保守结构域;核苷酸序列相似性为41.5%~98.8%,氨基酸序列相似性为21.5%~100.0%;利用NCBI Blast同源搜索发现,与其他植物尤其是冬瓜、黄瓜、葫芦及丝瓜的已知R基因具有40%~100%相似性;氨基酸序列聚类分析将其分为5个组;同源进化分析表明,23条瓠瓜RGAs均为non-TIR-NBS-LRR类R基因,与推导氨基酸序列多重比较结果一致.  相似文献   

一种高效的数据不变长加密算法及其实现     

林清波  曾炳生 《福建农林大学学报(自然科学版)》2005,34(4):540-544

提出了对序列X进行不变长加密的方法,若X的长度为n,则利用该方法对X进行加密运算后产生的新序列X′的长度还是n.该加密算法及其相应的解密算法所需的时间和空间复杂度均为O(n).该算法适用于数据库在不改变字段宽度的前提下对记录进行简单有效的加密和解密.  相似文献   

芥蓝查尔酮合成酶基因BaCHS的克隆与序列分析   总被引：1，自引：1，他引：0  

蒋明  苗立祥  胡齐赞  贺蔡明  陈珍 《浙江农业学报》2009,21(4)

查尔酮合成酶基因是类黄酮生物合成途径的关键基因,在植物发育和逆境反应中起着重要作用.根据已发表的查尔酮合成酶基因序列设计全长引物,以芥蓝(Brassica albograbra)叶片基因组DNA和花蕾cDNA为模板,克隆到了芥蓝查尔酮合成酶基因全长序列,命名为BaCHS.该基因DNA全长为1 263 bp,具一个长度为75 bp的内含子,编码区长度为1 188 bp,编码395个氨基酸.序列比对结果表明,BaCHS基因编码的氨基酸序列与其他十字花科植物之间的同源性很高,仅存在个别氨基酸残基的差别.  相似文献   

一株猪副粘病毒的分子鉴定   总被引：1，自引：0，他引：1  

马帝  谢建云  邵伟娟  林建成  吴祖立  高诚 《上海交通大学学报(农业科学版)》2003,21(Z1):18-22

以 1株从发病猪中分离到的副粘病毒( MP01株)为研究对象,用反转录-聚合酶链式反应( RT- PCR)对它的 F基因进行分段扩增、定向克隆到 pUC119质粒载体,然后测定它们的核苷酸序列,并推导出相应的氨基酸序列. MP01株的 F基因全长 1 662 bp,编码 553个氨基酸,它们的裂解位点的氨基酸序列为 112G- K- Q- G- R- L117,是 NDV弱毒株特有的序列结构.序列分析结果表明,它与国内标准毒株 F48E9的核苷酸同源率为 90%,氨基酸的同源率为 93%;它与弱毒株 La Sota的核苷酸同源率为 91%,氨基酸同源率为 94%.  相似文献