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借助细胞流式仪进行枇杷基因组学测序材料的倍性鉴定 总被引:2,自引:0,他引:2
利用流式细胞仪进行测试枇杷品种的染色体倍数鉴定,并用低深度测序结果进行验证,据此为选择枇杷全基因组测序材料提供依据。结果表明,来自华南农业大学种质资源圃和四川石棉的‘大五星’均与‘解放钟’一样为二倍体,而来自四川农业大学的两份‘大五星’枇杷1号和188号材料均为三倍体。测序结果显示,来自华南农业大学资源圃的‘解放钟’枇杷为二倍体,773 Mb;而来自四川农大的‘大五星’枇杷1号和188号可能都为三倍体,基因组大小分别为749 Mb和765 Mb。以已确定基因组大小的植物萝卜、番茄和大豆为参照测定了‘解放钟’枇杷的基因组大小,结果为654.399 Mb。 相似文献
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《蔬菜》2021,(3):28-28
北京市农林科学院蔬菜研究中心(国家蔬菜工程技术研究中心)左进华副研究员团队与英国诺丁汉大学DonaldGrierson教授(英国皇家科学院院士、中国工程院外籍院士)团队在国际上首次发布了高质量的佛手瓜基因组,通过三代测序技术结合Illumina测序和Hi-C技术,最终组装基因组大小为606.42 Mb,共97.04%的测序序列被锚定在14对染色体上,其中包含473个contigs和103个scaffolds,N50长度分别为8.40 Mb和46.56 Mb,基因组中65.94%为重复序列,含有28237个蛋白质编码基因,为佛手瓜遗传育种和基因发掘提供重要的基因信息。 相似文献
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马铃薯与番茄融合之回交后代染色体的原位杂交检测 总被引:4,自引:0,他引:4
对3份马铃薯、番茄融合产物与马铃薯的回交二代BC2材料进行原位杂交,可以清楚地区分马铃薯染色体和番茄(外源)染色体,番茄染色体的数目为2~6条。其中2份材料6731-19和6731-24中番茄染色体的数目稳定,另一份材料6731-22,其外源染色体数目不稳定。 相似文献
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以结球甘蓝(Brassica oleracea L. var. capitata)育种骨干亲本R2-P2(圆球形,抽薹晚,硫苷含量低,高感黑腐病、枯萎病和霜霉病)为轮回亲本,以野生甘蓝自交系R4-P1(不结球,抽薹早,蜡质厚,硫苷含量高,对黑腐病、枯萎病和霜霉病等多种病害具有抗性)为供体亲本,通过连续回交、自交和分子标记辅助选择,构建出一套由163个具有R2-P2遗传背景且具有R4-P1供体染色体片段单株组成的染色体片段替换系(Chromosome segment substitution line)。该替换系群体具有102个染色体替换片段,均匀分布在1~9号染色体上,平均每个株系携带1.3个染色体片段,平均替换长度为5.62 Mb。替换片段总长度为573.74 Mb,覆盖亲本R4-P1全基因组的73.4%,其中单片段替换片段总长度为139.91 Mb,覆盖全基因组的26.5%,双片段替换片段总长231.41Mb,覆盖亲本R4-P1全基因组的43.82%,含有3个替换片段总长度为201.3 Mb,覆盖供体亲本基因组25.98%。 相似文献
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《果树学报》2015,(4)
【目的】为了解菠萝蜜基因组特点,研究测定了10份菠萝蜜株系的倍性和基因组大小。【方法】分别以番茄和‘妃子笑’荔枝细胞核DNA含量为内标,Otto为提取液,采用流式细胞术(FCM)测定经碘化丙啶(PI)染色的内标和菠萝蜜细胞核混合样品发出的PI荧光强度,通过比较内标和菠萝蜜DNA峰值的荧光均值比值关系,计算出不同株系菠萝蜜的倍性和基因组大小。【结果】所测的10份菠萝蜜株系都为二倍体,干苞菠萝蜜株系的基因组在(1 243.75±9.21)~(1 540.63±3.55)Mb,湿苞菠萝蜜株系的基因组约为(1 902.87±8.08)Mb。【结论】不同菠萝蜜株系之间基因组大小存在显著差异,且湿苞株系大于干苞株系。 相似文献
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功能基因组学在蔬菜中的应用 总被引:2,自引:0,他引:2
随着黄瓜、番茄、马铃薯和大白菜等蔬菜作物国际基因组计划的启动和即将完成,宣告蔬菜作物进入功能基因组学时代。本文综述了功能基因组学的研究内容和技术,及在蔬菜作物中的应用,并分析了未来的发展趋势。 相似文献
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为明确山西省晋中市侵染番茄的病毒种类,采用双链RNA(double-stranded RNA,ds RNA)技术和非序列依赖PCR扩增(sequence-independent amplification,SIA)方法对感病番茄进行分子鉴定。序列测定及分析发现,具有花叶、卷曲症状的番茄为烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)所侵染。进一步克隆TMV番茄分离物(TMV-SXFQ)的全基因组序列,得到TMV-SXFQ(Gen Bank登录号为JX993906)全长为6 394 bp,含4个开放阅读框(open reading frame,ORF)。序列比对分析表明,TMV-SXFQ与烟草花叶病毒属其他分离物的同源性为86.3%~99.6%;系统进化分析表明,TMV-SXFQ与韩国分离物IM聚为一簇、亲缘关系最近。 相似文献
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无选择标记的植物表达载体的构建 总被引:1,自引:0,他引:1
以双元载体pBINPLUS为基础,在T-DNA侧翼区通过两次特异PCR、酶切和连接相结合的方法,构建了一个无标记载体pBINMF (marker-free vector)。通过酶切后测序分析,这个无标记载体在T-DNA左、右边界之间只有一个多克隆位点 (multiple cloned sites, MCS)。为了验证该载体的遗传稳定性,将gus基因克隆到该载体上并通过农杆菌介导的方法转化番茄栽培品种Moneymaker,特异PCR扩增目的基因和GUS组织染色结果表明,gus基因已经整合进入番茄基因组并得以表达。该载体为今后直接获得无标记基因、生物安全的转化体,尤其为象马铃薯、木薯等无性繁殖材料的无标记基因转化提供了可靠、有效的工具。 相似文献
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番茄褪绿病毒在湖南省首次发生 总被引:1,自引:0,他引:1
2016年7月在湖南省蔬菜病害调查中发现,4种茄科蔬菜表现出叶脉间褪绿、叶片黄化等症状,疑似被番茄褪绿病毒(Tomato chlorosis virus,To CV)感染,同时叶片背面聚集了大量烟粉虱。采用To CV热激蛋白(heat shock protein 70,HSP70)序列的特异性引物对采集的番茄、茄子、辣椒、马铃薯样品和烟粉虱样品进行RT-PCR检测,均扩增出目标条带,且扩增序列与北京番茄To CV分离物(KC887999.1)部分序列相似度为99.0%,确认采集样品被To CV感染。4种茄科蔬菜To CV的感染率达70%~100%;发病叶片上烟粉虱的带毒率为66.7%~87.5%;鉴定出烟粉虱的生物类型为MED烟粉虱。这是湖南省首次确认该病毒,需要引起关注和加强防范。 相似文献
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R. Gonzalez Ponce M. L. Salas 《The Journal of Horticultural Science and Biotechnology》2013,88(2):254-258
SummaryThe capacity of nitrate absorption, accumulation and reduction was studied in four species of the Solanaceae. Two were cultivated species, tomato (Lycopersicon esculentum Mill.) and pepper (Capsicum annuum L.), and two weed species, black nightshade (Solanum nigrum L.) and thorn apple (Datura ferox L.), which often infest these crops. Black nightshade and thorn apple absorbed nitrates most rapidly. Maximum nitrate accumulation was observed earlier in tomato than in the other species, and as in pepper coincided with the flower bud stage. Maximum nitrate accumulation in black nightshade and thorn apple took place during flowering. Only in tomato and thorn apple did maximum nitrate reductase activity occur at the time of maximum nitrate accumulation. Growth and soil nitrate absorption was slowest in pepper, but nitrate accumulation by the plant and nitrate reductase activity was more sustained than in the other species. It was concluded that if these weeds emerge simultaneously with the crops, competition for nitrates by thorn apple, and especially black nightshade, would be greater than for the tomato crop and even more so for the pepper crop. 相似文献
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