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畜禽微卫星的特性 总被引：1，自引：0，他引：1
1微卫星及其研究简史微卫星（Microsatellitte）DNA（以下简称微卫星）是以1—6hP的核着酸序列（称为核心序列，COreSequence）为基本单位，呈串联重复状散在分布于整个基因组中的一种高度重复序列，又称简单串联重复（STR，SimpleTandenlRepeat）或简单序列重复（SSR，SimpleSequenceRepeat），它J一泛存在于真核生物及部分原核生物的基因组中，是多拷贝均匀分布的，就某一微卫星而言，其重复数是可变的，这构成了微卫星多态性的基础。有关微卫星的报道始见于1974年，Skinner等［”1在研究寄生蟹的卫星DNA时发现了一类简单串联重… 相似文献
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微卫星技术是20世纪80年代末期发展起来的能有效区别不同物种、不同群体及不同基因型个体的分子标记,可作为第二代分子标记。微卫星标记广泛分布于各真核生物基因组中,且随机分布。微卫星DNA(Microsatellite)是一类以1~6 bp的核苷酸为基本单位,呈串联重复状散在分布于整个基因组的重复序列,具有数量多,分布广且均匀,多态性丰富和 相似文献
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微卫星DNA(Microsatellete DNA),又称为简单重复序列(SSR,single sequence repeats),是一类由2～6个核苷酸为重复单位组成的长达几十个核苷酸的重复序列如(GA)n ,(AC)n,(GAA)n等,广泛存在于原核及真核基因组中.本文针对SSR标记的原理、操作程序及其在家蚕中的研究现状作了简要介绍. 相似文献
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微卫星标记(microsatellite)又称为短串联重复序列(si m-ple tandemrepeats,STRs),是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列,由2~6个核苷酸的串联重复片段构成,由于重复单位的重复次数在个体间呈高度变异性并且数量丰富,因此微卫星标记的应用非常广泛〔1〕。微卫星位点通常通过PCR扩增,扩增产物通过电泳分析并根据大小分离等位基因进行检测。本试验研究的目的就是分析山西瘦肉型猪SD-Ⅲ系卫星标记SW489和SW2049的遗传多态性,从分子水平上了解山西瘦肉型猪SD-Ⅲ系,为猪的动物育种提供科学依据。1材料和方法1.1试验材料1.1.1试验猪… 相似文献
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藏鸡为我国高原特有地方品种,为了保护其地方品种资源,开发高原特色产业,本研究采用MISA软件检测藏鸡全基因组序列中存在的微卫星位点,并找出其SSR开始分析。研究结果发现:共找到411 761个微卫星序列,含微卫星的序列共14 295条,微卫星平均每隔2 607.56 kb出现一个序列,其中1 055种重复基元模式在藏鸡DNA序列中被找到,所占比例份额最高的是(TA)n(47.49%),10~15 bp的是微卫星序列长度所在的主要区域。因此,藏鸡微卫星标记的开发利用为藏鸡品种的分子鉴定打下基础,可以加快藏鸡杂交选育进程,以便获得较好的开发前景和产生巨大的经济效益。 相似文献
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1微卫星DNA的结构
微卫星DNA又称短串联重复或简单重复序列,由侧翼序列和重复串联的核心序列2部分组成,核心序列长度一般为1～6个碱基,首尾相连组成重复串联序列[1],其中最常见的是2个碱基的双核苷酸重复,即（TG）n和（CA）n,每个微卫星DNA的核心序列结构相同 相似文献
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麦洼牦牛基因组三碱基重复微卫星的挖掘及其遗传多态性分析 总被引：2，自引：0，他引：2
为了解麦洼牦牛现有群体的遗传多样性及种群遗传分化特征,试验通过生物信息学方法从已公布的牦牛基因组中筛选到9 466个三碱基重复微卫星位点,以191个麦洼牦牛基因组DNA样品为模板对各个位点进行PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳基因分型。经过哈迪-温伯格平衡检验,在15个三碱基微卫星位点中,有5个位点偏离哈迪-温伯格平衡（P<0.05）。15个微卫星位点均为高度多态性（PIC>0.5）,群体平均观测杂合度（Ho）、平均期望杂合度（He）和平均多态信息含量（PIC）分别达到0.5041、0.8152和0.7831。进一步通过Structure 3.0软件分析发现,麦洼牦牛群体结构单一,无分化特征,表明麦洼牦牛品种虽然具有较高的遗传多态性但是无分化迹象。 相似文献
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微卫星标记BMS2508在4个山羊品种中的遗传多样性研究 总被引：5，自引：3，他引：5
微卫星DNA又称简单序列重复、短串联重复序列和简单序列长度多态性,广泛存在于真核生物基因组中.微卫星多态性是由于减数分裂过程中不等交换造成变异而产生的,具有保守性,其核心序列为2～6 bp,重复约10～20次,属于等显性遗传.自1989年在人类基因组研究发现微卫星多态性后,目前在马、牛、猪、绵羊和鸡等动物基因组中也筛选出了大量的微卫星标记,但山羊等动物中则相对较少. 相似文献
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俄罗斯蜜蜂是欧洲人大约在十九世纪中期向俄罗斯符拉迪沃斯托克及其周边海冰边疆(即俄罗斯远东地区)移居时带入的西方蜜蜂;欧洲黑蜂在欧洲向东方向的地理分布极限地域是位于俄罗斯西部平原(欧洲部分)与东部高原、山地(亚洲部分)之间的乌拉尔山脉,即俄罗斯中部地区。为了初步揭示俄罗斯蜜蜂与欧洲黑蜂之间的遗传关系,本研究通过聚合酶链反应体外扩增基因组微卫星标记的方法,对俄罗斯远东地区采样点的俄罗斯蜜蜂(俄罗斯当地人称之为俄罗斯远东黑蜂)和俄罗斯中部地区采样点的欧洲黑蜂(俄罗斯当地人称之为俄罗斯中部蜜蜂)进行了比对分析。聚丙烯酰胺凝胶电泳的结果显示,绝大多数蜜蜂样本在11个基因组微卫星位点均出现等位序列条带,两种蜜蜂样本的等位序列条带数构成了各自特有的基因组微卫星DNA等位序列标记谱图。这提示,俄罗斯蜜蜂样本的基因组微卫星DNA等位序列标记谱图作为俄罗斯蜜蜂保种群的遗传标识码,很可能具有特异性(相对于欧洲黑蜂样本的基因组微卫星DNA等位序列标记谱图)。 相似文献
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微卫星DNA标记技术在畜禽遗传多样性研究中的应用 总被引：4，自引：0，他引：4
20世纪70年代人们已经知道，微卫星位点是广泛分布于真核生物基因组中的一种特殊序列，但直到1982年Hamada等在研究中发现从酵母到脊椎动物中普遍存在着多拷贝的多聚(dT-dG)微卫星DNA，Tautz和Rentz证实了这一发现。尽管从发现到现在只有二三十年的时间，但由于微卫星具有种类多、多态性高、进化速度快以及呈孟德尔共显性遗传等优点，使其 相似文献
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微卫星DNA,亦称简单序列重复,是指以2~6个核苷酸为基本序列串联重复的短片段〔1〕。微卫星标记与其它分子标记技术相比,具有分布广泛、多态信息含量高、呈共显性遗传等优点,因此在品种资源分类及畜禽遗传多样性的评估和保存中,微卫星被作为重要的遗传标记之一〔2〕。我国家兔分子生物学标记的研究起步较晚,最近几年才开始,利用微卫星标记来研究家兔的群体遗传特性是在2003年才开始的,相比较而言,国外则开展的较早,技术比较成熟,研究也相对较深入。1国内研究进展殷宝法、魏万红等,使用8对微卫星引物对高原鼠兔血样中的DNA微卫星位点(Sol33… 相似文献
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《畜牧与兽医》2014,(8):9-13
利用生物信息学方法搜索猪全基因组中完整型微卫星序列,并对其基因组中微卫星数量、频率以及分布规律进行了研究。搜索到猪全基因组中16个碱基重复类型微卫星位点数为1 149 884个,占其全基因组长度的比率为0.85%,出现频率为1/2.22 kb。猪第1条染色体(143 330个)中微卫星数量最多,其次是第2、6和13条染色体,而较少的是第12、18条染色体和Y染色体。猪性染色体X和Y序列长度差异极显著,X染色体序列长度是Y染色体的88.10倍,其微卫星数量也存在明显差异(58 437 vs 814)。通过检验表明,猪染色体长度与其所含微卫星数量具有高度正相关性(r=0.913,P<0.01)。猪全基因组中完整型微卫星各重复类型中,单碱基重复类型数量最多,占其微卫星总数量的比率为62.95%;其次依次是二碱基、四碱基、三碱基、五碱基、六碱基重复类型。猪全基因组中微卫星重复拷贝类别数量较多的是A、AC、AT、AAC、AAT、AAAT AAAC、AAAG、AAGG,而数量较少的是C、CG、AGC、AGT、ACT、AGCG、AGTC、ACTG和CCGG。 相似文献