不同生长环境下水稻结实率数量性状位点的检测   总被引：4，自引：0，他引：4  

韩龙植  张三元  乔永利  金钟焕  徐福荣  曹桂兰  南钟浩  戴陆园  芮钟斗  高熙宗 《作物学报》2006,32(7):1024-1030

以籼稻密阳23与粳稻吉冷1号配制所获得的F_2:3群体200个家系作为作图群体，在北京、昆明、三亚、公主岭和韩国春川等5个点进行水稻结实率的鉴定，并利用SSR标记对水稻结实率数量性状位点进行检测。结果表明，水稻结实率表型值及其在F₃家系群中的分布以及所检测到的QTL数目因生长环境不同而有较大差异，说明QTL与环境有明显的互作效应。水稻结实率在F₃家系群中呈接近正态或偏态的连续分布，是多个基因所控制的数量性状。共检测到与水稻结实率相关的QTL 14个，分布于第1、2、3、4、6、7、8、10和12染色体上，对表型变异的贡献率为4.9%～15.3%。分别位于第1、2、6和12染色体RM1~RM259、RM263~RM6、RM340~RM30、RM270~RM17区间的qSSR1、qSSR2、qSSR6和qSSR12至少在2种生长环境下均检测到，对表型变异的贡献率分别为4.9%～8.4%、4.8%～7.2%、7.6%～10.7%和7.4%～10.4%。以上多数QTL增效等位基因均来自吉冷1号，基因作用方式主要为部分显性或显性或超显性。  相似文献   

模拟干旱条件下水稻苗期形态性状的QTL定位   总被引：2，自引：2，他引：0  

刘宇强  赵宏伟  王敬国  刘化龙  王晋  贾琰 《作物杂志》2013,(2):42-48

以抗旱性差异较大的亲本小白粳子和空育131以及其后代180个F2∶3家系群体为试验材料,构建了包含99个SSR分子标记的遗传连锁图谱,利用浓度为15％PEG-6000模拟干旱胁迫条件.在两种条件下,共检测到影响胚芽鞘长、苗高、主根长和根数的QTL 26个,分别位于水稻的第1、2、3、4、5、6、7、8、12条染色体上,贡献率变幅在4.53％～37.22％之间.其中控制苗高的QTL11个,控制胚芽鞘长的QTL 5个,控制主根长的QTL 5个,控制根数的QTL 5个.在第2条染色体的RM1358-RM1347区间和第6条染色体上的RM461-RM162区间发现了控制多个性状的QTL,在第2条染色体的RM1358-RM1347区间和第8条染色体的RM1384-RM547区间还检测到了在两种条件下同时控制胚芽鞘长和主根长的QTL.  相似文献   

水稻品种魔王谷粒形、剑叶性状和株高QTL定位   总被引：1，自引：0，他引：1  

彭伟业  孙平勇  潘素君  李魏  戴良英 《作物学报》2018,44(11):1673-1680

以粳稻魔王谷和籼稻CO39配组衍生的280个重组自交系为材料, 2015年和2016年对其粒形、剑叶形态、株高性状进行了相关性分析和QTL检测。剑叶长分别与粒厚和株高存在极显著负相关和正相关, 剑叶宽与粒宽存在极显著正相关。检测到17个粒形QTL, 分布于第1、第2、第3、第4、第5、第6、第7、第9和第10染色体上, 贡献率为3.51%~48.65%; 其中, 第3染色体RM6080-RM6283区间对粒长和千粒重兼具显著作用, 第5染色体RM8211-RM3381区间同时影响粒宽和粒厚。检测到12个控制剑叶形态性状的QTL, 分布于第1、第3、第4、第6、第7和第9染色体上, 贡献率为4.26%~38.40%; 有5个多效QTL区间, 其中, 第4染色体RM252-SFP4_6区间同时控制剑叶长、剑叶宽、剑叶面积和粒长, 第9染色体RM257-RM3909区间同时影响剑叶面积和粒长。只检测到一个控制株高的QTL, 位于第1染色体的RM6333-RM5536区间, 是一个主效QTL, 贡献率为28.76%。这些结果为进一步开展粒形、剑叶形态、株高基因的精细定位、克隆和分子辅助育种奠定了基础。  相似文献   

应用明恢86和佳辐占的F2群体定位水稻部分重要农艺性状和产量构成的QTL     

郑景生  江良荣  曾建敏  林文雄  李义珍 《分子植物育种》2003,(6)

应用籼稻品种明恢86和佳辐占为亲本建立的F2群体及相应的SSR分子标记连锁图,用区间定位法的Additive和Free两种模型分别对水稻部分重要农艺性状和产量构成性状的QTL进行了定位分析.结果Additive模型共检测到3个QTL,均位于第1号染色体的RM1-RM283区间,分别控制水稻生育期、株高和每穗粒数,基因成簇分布.Free模型共检测到5个QTL,其中控制水稻生育期、株高和每穗粒数的3个QTL的位置和效应大小与Additive模型基本相同;另外还检测到2个影响结实率和千粒重的QTL分别位于第7号染色体的RM180-RM214和第2号染色体的RM279-RM154区间,其贡献率均较小.同时,分析比较了研究结果与前人不同的原因.  相似文献   

利用“永久F2”群体进行小麦幼苗根系性状QTL分析   总被引：5，自引：1，他引：4  

李卓坤  彭涛  张卫东  谢全刚  田纪春 《作物学报》2010,36(3):442-448

为了研究小麦苗期根系性状的遗传,以小麦品种花培3号和豫麦57的杂交DH群体组配了一套含168个杂交组合的“永久F₂”群体。利用WinRHIZO根系分析系统测定四叶一心期小麦水培幼苗根系总长度、直径、表面积、体积、根尖数、最大根长、茎叶干重、根干重及根茎干重比9个性状。采用复合区间作图法分析幼苗根系8个性状的QTL,定位了7个加性效应QTL和12对上位性互作QTL,包括加性效应、显性效应,加加互作、加显互作和显显互作,分布在1A、1D、2A、2B、2D、3A、3B、5D、6D和7D染色体上,单个QTL可解释0.01%~11.91%的遗传变异。在染色体2D上XWMC41至XBARC349.2区间检测到同时控制总根长和根干重的一个QTL。上位性对苗期根系生长发育有重要作用。试验结果表明,苗期根系性状的遗传机制较复杂, 因此在育种中要综合考虑根系各性状之间的关系,保证根系协调统一、发达健壮。  相似文献   

水稻染色体片段代换系对氮反应的QTL分析   总被引：3，自引：0，他引：3  

吕海霞  周广生  丁泽红  孙永建  余四斌 《分子植物育种》2010,8(6)

利用来源于93-11(受体)和日本晴(供体)构建的染色体片段代换系,采用盆栽试验分析其在两种氮水平下产量相关性状的差异,包括株高、每穗实粒数、单株产量、根干重、地上部干物重以及氮素利用效率等。结果表明,与正常条件相比,低氮胁迫条件下代换系的单株产量与生物学产量显著降低。两种氮水平下共定位到54个QTLs,其中仅有6个在两种氮水平下同时检测到,说明水稻对不同氮肥反应由不同的基因调控。定位到5个氮肥农学利用效率QTLs,其中,第6染色体的qNAE6解释表型变异较大(14%)。同时,我们还发现存在一些QTL区域同时影响多个性状,如第2染色体RM2634区域,第6染色体RM510-RM225区域,第10染色体RM228和第11染色体RM536区域,暗示其可能是一因多效或紧密连锁的基因的效应。该结果将为鉴定分析氮利用相关基因以及氮高效育种提供一定试验依据。  相似文献   

粳稻米碱消值的数量性状基因座检测     

黎毛毛  徐磊  任军芳  曹桂兰  余丽琴  贺浩华  韩龙植  高熙宗 《作物学报》2010,36(1):115-120

利用碱消值差异显著的大粒粳稻DL115与小粒粳稻XL005杂交获得的200个单株F2群体为作图群体,采用复合区间作图方法,利用SSR标记进行了粳稻碱消值数量性状基因座的检测。结果表明,在F2群体中碱消值呈正态连续分布,表现为由多基因控制的数量性状。共检测到与碱消值相关的QTL3个,qADV3、qADV5和qADV11,分别位于第3、第5和第11染色体的RM14870～RM1284、RM3838～RM3351和RM1812～RM332区间,对表型变异的解释率分别为6.5%、10.3%和8.1%。qADV5的增效等位基因来自碱消值较小的亲本XL005,qADV3和qADV11的增效等位基因来自碱消值较大的亲本DL115;基因作用方式表现为显性或超显性。  相似文献   

大豆幼苗根系性状的QTL分析   总被引：7，自引：0，他引：7  

周蓉  陈海峰  王贤智  伍宝朵  陈水莲  张晓娟  吴学军  杨中路  邱德珍  江木兰  周新安 《作物学报》2011,37(7):1151-1158

为研究大豆幼苗期根系性状的遗传规律,以中豆29和中豆32构建的RIL群体为材料,在V2期测定水培幼苗根系性状(主根长、侧根数、根重、根体积和根冠比等)及相关性状(株重、茎叶重和下胚轴重等),以方差分析方法估算遗传参数,并采用复合区间作图法对大豆幼苗期根系等性状进行QTL定位。结果表明,在8个染色体上检测到20个根系及相关性状QTL,其中9个主效QTL位于第11和第14染色体,表型贡献率在10.5%~26.1%之间。在第11和第14染色体上,部分根系性状QTL与地上部性状QTL处于同一位置,其QTL的共位性与形态性状表型相关分析结果一致,反映了根系性状与地上部性状存在一定的关联。  相似文献   

缺磷胁迫下不同磷效率小麦品种及其杂种F1的磷吸收利用特性   总被引：7，自引：0，他引：7  

李宾兴  郭程瑾  王斌  肖凯  李雁鸣 《作物学报》2006,32(2):267-272

在缺磷胁迫下，对磷低效、磷吸收高效和利用高效3个小麦品种及其杂种F₁的磷吸收、利用特性进行了研究。结果表明，与磷低效品种Nc37相比，磷吸收高效品种81(85)单株次生根数较多、次生根直径较大、根系干物质重量较大、TTC（氯化三苯基四氮唑）还原力较高和单株全磷量较多。其对磷素吸收量的增加，是根系形态和根体构型改变和对土壤中难溶性磷素利用能力增强两方面共同作用的结果。利用高效品种（蚂蚱麦）具有较高的旗叶酸性磷酸化酶活性和较高的磷利用效率，对于改善植株体内磷的代谢周转和再利用能力，进而提高植株的磷利用效率可能具有较重要作用。在F_1-1 [Nc37×81(85)], F_1-2 (Nc37×蚂蚱麦)和 F_1-3 [81(85) ×蚂蚱麦]3个杂种F₁中，单株次生根数、次生根粗度、单位土体根系干重、根系TTC还原力、植株成熟期全磷量和旗叶酸性磷酸化酶活性的离中优势（Hm）和超高亲优势（Hh）多为正向优势。其单株籽粒产量的Hm和Hh均为正值，分别变化在31.7%~32.8%（Hm）和18.5%~29.6%（Hh）之间。用高效吸收、利用2个不同类型的小麦品种作亲本配制杂交组合，充分利用F1代在磷吸收利用上的杂种优势，对于改善在磷胁迫下小麦的磷素营养可能具有重要作用。  相似文献   

利用极端材料定位水稻粒形性状数量基因位点   总被引：1，自引：0，他引：1  

张强  姚国新  胡广隆  汤波  陈超  李自超 《作物学报》2011,37(5):784-792

利用极端大粒材料GSL156(千粒重71.9 g)与特小粒材料川七(千粒重12.1 g,轮回亲本)杂交、回交获得的BC₂F₂ 216个个体为作图群体,在北京进行稻谷粒长、粒宽、粒厚、长宽比、千粒重等粒形性状的鉴定。采用单标记分析和复合区间作图法,利用SSR标记对粒形性状进行数量性状基因座检测。结果表明,上述粒形性状在BC₂F₂群体均呈正态连续分布,表现为由多基因控制的数量性状;共检测到与粒形性状相关的QTL 28个,分布于第1、2、3、4、5、6和12染色体上。其中qGL3-2、qGL3-3、qGT12-1、qGT2-1、qGT5-1、qGW1-1、qGW12-1、qGW2-1、qGW5-1、qRLW3-1、qTGW12-1、qTGW2-1、qTGW3-3和qTGW5-1对表型变异的贡献率分别为13.70%、52.51%、21.13%、18.79%、20.92%、14.59%、18.33%、30.03%、20.05%、24.53%、13.47%、11.43%、21.30%和15.68%,为主效QTL。其中,第3染色体上检测出来的QTL最多。在所有检测到的28个QTL中,6个QTL的增效等位基因来源于小粒亲本川七,而其余QTL的增效等位基因均来源于大粒亲本GSL156,基因作用方式主要表现为加性或部分显性。第3染色体RM7580~RM8208区间是分别与粒宽、长宽比和千粒重相关的3个主效QTL的共同标记区间,第2染色体的RM7636~RM5812区间、第5染色体的RM3351~RM26区间和第12号染色体的RM1103~RM17区间是分别与粒宽、粒厚和千粒重相关的3个主效QTL的共同标记区间,这些区间对粒形贡献率较大,为进一步精细定位或克隆这些新的粒重或粒形QTL奠定了基础。同时大粒亲本对稻谷粒长、粒宽、粒厚和千粒重等性状的增效作用显著。  相似文献   

水稻芽期与幼苗前期耐碱性状QTL定位   总被引：9，自引：0，他引：9  

程海涛  姜华  薛大伟  郭龙彪  曾大力  张光恒  钱前 《作物学报》2008,34(10):1719-1727

利用包含120个株系的籼粳交来源(春江06/TN1)的加倍单倍体群体, 在Na₂CO₃胁迫下, 以发芽期和幼苗前期的相对发芽势等10个性状作为耐碱性评价指标, 进行水稻耐碱性的QTL定位。相关性分析表明, 相对发芽势和相对发芽率显著正相关, 相对苗高、相对根数和相对根长之间显著正相关。采用QTLNetwork统计软件共定位到14个加性QTL和13个上位性QTL。在第3染色体RM251~RM3280间有2个QTL, 在第7染色体RM3286~RM1279区域有3个QTL; 在第1、2和7染色体同一位置同时检测到2个上位性QTL, 在第12染色体RM1246~RM5199之间集中了4个上位性QTL, 耐碱数量基因表现出一因多效或紧密连锁现象。耐碱性盐QTL可能包括两类, 一类与K+、Na+等离子胁迫有关, 另一类与高pH胁迫有关。不同类型的水稻品种都具有一些耐碱基因, 可以通过有性杂交和分子标记辅助选择的方法选育优良的耐碱品种。  相似文献   

Identification of quantitative trait loci associated with drought tolerance traits in rice (<Emphasis Type="Italic">Oryza sativa</Emphasis> L.) under PEG and field drought stress     

Bing Han  Jiao Wang  Yafei Li  Xiaoding Ma  Sumin Jo  Di Cui  Yanjie Wang  Dongsoo Park  Youchun Song  Guilan Cao  Xingsheng Wang  Jianchang Sun  Dongjin Shin  Longzhi Han 《Euphytica》2018,214(4):74

Two recombinant inbred line F₁₀ rice populations (IAPAR-9/Akihikari and IAPAR-9/Liaoyan241) were used to identify quantitative trait loci (QTLs) for ten drought tolerance traits at the budding and early seedling stage under polyethylene glycol-induced drought stress, and two traits of leaf rolling index (LRI) and leaf withering degree (LWD) under field drought stress. The results showed that the drought-tolerance capacity of IAPAR-9 was stronger than that of Akihikari and Liaoyan241. Thirty-four QTLs for 12 drought tolerance traits were detected, and among them, in the IAPAR-9/Akihikari population, qLRI9-1 and qLRI10-1 for LRI were repeatedly detected in RM3600-RM553 on chromosome 9 and in RM6100-RM3773 on chromosome 10, respectively, at two times points of July 31 and August 13 in 2014. The two QTLs are stable against the environmental impact, and qLRI9-1 and qLRI10-1 explained 6.77–13.66% and 5.01–8.32% of the phenotypic variance, respectively, at the two times points. qLWD9-2 for LWD in the IAPAR-9/Liaoyan241 population contributed 8.73% of variation was detected in the same marker interval with the qLRI9-1, and qLRI1-1 for LRI and qLWD1-1 for LWD were located in the same marker interval RM11054-RM5646 on chromosome 1, which contributed 18.82 and 5.78% of phenotype variation respectively. qGV3 for germination vigor and qRGV3 for relative germination vigor at the budding stage were detected in the same marker interval RM426-RM570 on chromosome 3, which explained 14.98 and 16.30% of the observed phenotypic variation respectively, representing major QTLs. The above-mentioned stable or major QTLs regions could be useful for molecular marker assisted selection breeding, fine mapping, and cloning.  相似文献   

碱胁迫下粳稻幼苗前期耐碱性的数量性状基因座检测   总被引：7，自引：0，他引：7  

祁栋灵  郭桂珍  李明哲  杨春刚  张俊国  曹桂兰  张三元  徐锡哲  周庆阳  韩龙植 《作物学报》2009,35(2):301-308

以粳粳交“高产106/长白9号”F_2:3代200个家系为作图群体, 在0.15% Na₂CO₃溶液的碱性胁迫下, 进行了水稻耐碱性鉴定, 并以SSR标记构建的分子连锁图谱为基础, 对水稻幼苗前期的根数、根长和苗高及其相对碱害率进行了数量性状基因座(QTLs)的检测。结果表明, 上述性状在F₃家系群中均表现为具有1~2个峰的连续分布, 认为由主效基因和微效基因共同控制的数量性状。共检测到与碱胁迫下幼苗前期根数、根长和苗高及其相对碱害率相关的QTL 26个, 分布于第1、5、6、7、8、9和11染色体上。其中, 碱胁迫下与根数相关的QTL 4个, qRN6-1和qRN11对表型变异的解释率较大, 分别为29.91%和13.42%;与根数相对碱害率相关的QTL 5个, qRRN11-2对表型变异的解释率较大, 为23.86%;与根长相关的QTL 6个, qRRL11-2对表型变异的解释率较大, 为21.06%;与根长相对碱害率相关的QTL 2个, 但对表型变异的解释率均较低;与苗高相关的QTL 5个, qSH1和qSH11-2对表型变异的解释率较大, 分别为15.81%和16.53%;与苗高相对碱害率相关的QTL 4个, qRSH5和qRSH6-2对表型变异的解释率分别为29.89%和34.63%。而这些解释率较大的QTL所处的标记区间距离, 除qRN6-1相对较小(19.0 cM)外, 其余QTL的标记区间距离均大于26.3 cM, 需作进一步的精细定位。在所检测到的QTL中, 13个QTL的增效等位基因均来自耐碱亲本长白9号, 而其余QTL的增效等位基因来自敏碱亲本高产106;基因的主要作用方式为超显性或部分显性。  相似文献   

Identification of quantitative trait loci for seedling cold tolerance using RILs derived from a cross between japonica and tropical japonica rice cultivars     

J. P. Suh  C. K. Lee  J. H. Lee  J. J. Kim  S. M. Kim  Y. C. Cho  S. H. Park  J. C. Shin  Y. G. Kim  K. K. Jena 《Euphytica》2012,184(1):101-108

Cold tolerance at the seedling stage of rice is an important phenotypic trait that causes normal plant growth and stable rice production in temperate regions as well as tropical high-lands in Asia and Africa. In order to find quantitative trait loci (QTLs)/genes associated with cold tolerance, we constructed a linkage map using 153 recombinant inbred lines (RILs) derived from a cross between a cold-tolerant temperate japonica cultivar, Geumobyeo, and a cold-sensitive tropical japonica breeding line, IR66160-121-4-4-2. The RILs were phenotyped for cold tolerance or sensitivity based on the degrees of cold tolerance as cold tolerance indices at the seedling stage. The seedlings for cold-tolerance/-sensitive traits were scored on the 7th day of the recovery period at 25°C after cold treatment at 10°C. Two QTLs (qCTS4a and qCTS4b) associated with cold tolerance at the seedling stage were identified on the long and short arms of chromosome 4 with an LOD score of 2.89 and 2.75, respectively, using composite interval mapping. The QTLs were flanked by simple sequence repeat (SSR) markers RM3648-RM2799 and RM3375a-RM558 that explained 8.3 and 7.8% of the total phenotypic variation, respectively. Seven of the selected RILs expressed cold tolerance at both the seedling and reproductive stages. The SSR markers associated with the QTLs will be useful for tracking favorable QTLs/genes into cold-sensitive elite cultivars and may have potential for pyramiding different QTLs for the improvement of cold tolerance in rice.  相似文献   

水稻苗期模拟干旱胁迫条件下表型性状QTL定位     

姜雪  马孝松  罗利军  刘鸿艳 《作物杂志》2016,32(5):31-70

以耐旱性差异较大的两个亲本珍汕97B（ZS97B）和IRAT109构建的重组自交系（RIL）为试验材料,在正常水分条件和干旱胁迫[浓度为18%的聚乙二醇-6000（PEG-6000）模拟干旱]条件对水稻苗期苗高、根长、苗高生长速率、根长苗高比、叶卷曲进行QTL定位分析,共检测到24个相关的QTL,贡献率变幅在7.35%~39.30%。其中正常条件下检测到13个相关的QTL位点,分布在第1、2、3、5、6、10、12染色体上;干旱胁迫条件下检测到11个相关的QTL位点,分布在第1、3、5、7、10、12染色体上。2种条件下检测到的QTL位点差异很大,表明不同处理条件下相关性状的遗传机制不同。此外,在第1染色体上的RM472~RM104存在控制苗高、苗高生长速率、根长、根长苗高比多个性状的QTL,并且此区间在2种处理条件下能重复检测到控制苗高位点。  相似文献   

东乡野生稻抗褐飞虱QTL分析   总被引：5，自引：0，他引：5  

黄得润  陈洁  赖凤香  刘光杰  庄杰云 《作物学报》2012,38(2):210-214

野生稻是水稻抗褐飞虱基因的重要种质资源。应用东乡野生稻与栽培稻协青早B构建的2套材料,开展水稻抗褐飞虱基因鉴定研究。先以协青早B//协青早B/东乡野生稻BC₁F₅群体为材料,应用褐飞虱田间种群进行抗虫鉴定,检测到2个抗褐飞虱QTL,其中,qBph2位于水稻第2染色体RM29–RG157区间,东乡野生稻等位基因可降低死苗率22.2%;qBph7位于第7染色体RM11–RM234区间,东乡野生稻等位基因可降低死苗率43.7%。进一步以协青早B为轮回亲本,构建了BC₃F₃群体,应用褐飞虱生物型I、II和III进行抗虫鉴定,QTL分析表明qBph2抗褐飞虱生物型I和II,qBph7抗褐飞虱生物型I和III。这2个QTL对培育抗褐飞虱水稻品种具有重要应用价值。  相似文献   

Identification of QTLs for the resistance to rice stripe virus in the <Emphasis Type="Italic">indica</Emphasis> rice variety Dular     

Shu-Jun Wu  Huan Zhong  Yong Zhou  Hui Zuo  Li-Hui Zhou  Jin-Yan Zhu  Cao-Qiu Ji  Shi-Liang Gu  Ming-Hong Gu  Guo-Hua Liang 《Euphytica》2009,165(3):557-565

The indica variety Dular has a high level of resistance to rice stripe virus (RSV). We performed quantitative trait locus (QTL) analysis for RSV resistance using 226 F₂ clonal lines at the seedling stage derived from a cross between the susceptible japonica variety Balilla and the resistant indica variety Dular with two evaluation criteria, infection rate (IR) and disease rating index (DRI). The experiments were performed in both 2004 and 2005. Based on IR, three putative QTLs were detected and had consistent locations in the 2 years, one QTL was detected in the RM7324–RM3586 interval on chromosome 3. The other two QTLs were linked and located in the RM287–RM209 and RM209–RM21 intervals on the long arm of chromosome 11, and accounted for 87.8–57.8% of the total phenotypic variation in both years. Based on DRI, three putative QTLs were also detected and had consistent locations in both years. One of them was located in the RM1124–SSR20 interval on the short arm of chromosome 11, while the other two linked QTLs had the same chromosomal locations on chromosome 11 as those detected by IR, and accounted for 55.7–42.9% of total phenotypic variation in both years. In comparison to the mapping results from previous studies, one of the two linked QTLs had a chromosomal location that was similar to Stv-b ⁱ , an important RSV resistance gene, while the other appeared to be a newly reported one.  相似文献