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烟草染色体片段代换系的构建与遗传评价 总被引：1，自引：0，他引：1
以综合性状优良的烤烟种质Y3为轮回亲本,抗烟草黑胫病(0、1号生理小种)和赤星病的雪茄烟种质Beinhart1000-1及优质烤烟品种K326为供体亲本,连续回交并结合分子标记辅助选择,构建国内外第一套由256个具有烤烟Y3遗传背景并渐渗有Beinhart1000-1和K326染色体片段株系代换系群体。该群体携带377个代换片段,分布于烟草24条连锁群上。每个株系携带1~5个代换片段,代换片段长度介于0.05~36.88 cM,平均长度7.75 cM。代换片段重叠累加总长度为2922.57 cM,是烟草基因组总长度的2.61倍。代换片段覆盖总长度为1114.32 cM,烟草基因组覆盖率为99.45%。本研究构建的片段代换系可用于烟草基因定位、复杂性状的QTL分析和标记辅助选择育种。 相似文献
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赤星病是烟草上的重要叶部病害,每年给烟草生产造成巨大损失,培育抗赤星病品种是防治烟草赤星病为害的根本措施,而对赤星病抗性关联遗传位点的发掘、鉴定和利用是培育抗赤星病烟草品种的关键基础。本研究利用抗赤星病的烟草材料‘Beinhart 1000-1’和加工品质好但不抗赤星病的烟草品种‘K326’,通过种间杂交和F1代自交分离,创建了‘Beinhart 1000-1’和‘K326’的F2代杂交分离群体。随后,通过赤星病抗病性鉴定,本研究在F2代分离群体中选择了19株抗赤星病材料和19株感赤星病材料,分别进行了基因组DNA提取,并通过BSA法进行了基因组重测序。在重测序数据分析基础上结合表型鉴定结果,本研究鉴定出差异SNP位点约170万个,进行烟草赤星病抗性关联SNP位点分析,找到赤星病抗性相关基因10个,促进了烟草抗赤星病分子育种的发展。 相似文献
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棉花枯萎病抗性的QTL定位 总被引：2，自引：0，他引：2
棉花抗病育种是棉花遗传改良的重要内容.本研究以高抗枯萎病的陆地棉品系(Gossypium hirsutum L.)98134和海岛棉(Gossypium barbadence L.)感病品种新海14号为亲本,构建98134×新海14的F2及F2:3分离群体.运用SSR标记构建连锁图谱,用复合区间作图法对F2:3家系的病情指数(RD进行基因组QTL扫描,共检测到4个与棉花枯萎病相关QTL效应,分别位于3、15、23和26连锁群上.经标记值分析,该QTL能解释高值亲本的增效作用,分别解释F2:3家系变异的12.4%、20.96%、4.7%和11.9%.本研究为分子标记辅助选择抗枯萎病棉花育种提供了重要理论依据. 相似文献
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小麦骨干亲本繁6条锈病成株抗性特异位点及其在衍生品种中的遗传解析 总被引：2，自引：0，他引：2
基于已获得的控制小麦条锈病成株抗性“一致性”QTL区段80个SSR标记,结合小麦骨干亲本繁6及其衍生的39个后代小麦品种进行田间条锈病成株期抗性表型鉴定,揭示了骨干亲本繁6遗传物质及其成株抗性在其衍生品种的遗传规律。结果表明,骨干亲本繁6在条锈病条中31、32和33混合生理小种诱导下表现成株抗性,7个衍生后代品种表现全生育期抗性;用控制小麦条锈病成株抗性QTL区段的80个SSR标记对繁6及其后代衍生品种的其他亲本进行分子扫描,共发现9个来自繁6基因组的特异SSR标记,即Xwmc631、 Xgwm359、 Xwmc407、 Xgwm501、 Xgwm148、 Xgwm539、 Xgwm533、 Xgwm299和Xgwm639,其中,Xwmc631、 Xgwm359、 Xgwm501、 Xgwm299和Xgwm639在繁6衍生后代的4个子代中表现较高的遗传贡献率。以SSR标记与小麦条锈病成株抗性的关联分析发现6个SSR标记与小麦条锈病成株抗性显著相关,其中来自繁6的特异SSR等位变异Xgwm539-2D和Xgwm299-3B与严重度、反应型、普遍率、病情指数及病程曲线下面积(AUDPC)均具显著相关性,表明繁6的成株抗性及其控制遗传位点在其衍生后代品种选育过程中得到了很好的定向选择,并在西南麦区小麦条锈病抗性育种中发挥了重要作用。 相似文献
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《华北农学报》2017,(5)
为了丰富马铃薯分子标记,定位青枯病抗性基因位点,利用具有抗青枯病遗传背景的二倍体马铃薯亲本USW5337.3(C)和772102.37(E)及其123份杂交一代无性系,进行了马铃薯SSR遗传图谱的构建。根据马铃薯全基因组序列设计了864对SSR引物,其中187对在亲本间表现出差异,135对(72.2%)能够在杂交一代中扩增出清晰的条带,最终构建了一张由12个连锁群组成,包含135个SSR标记的马铃薯分子标记遗传图谱。12个连锁群总长度为948.4 c M,标记间平均间距7.03 c M,含有5个标记偏分离区域。不仅为马铃薯饱和分子遗传图谱的构建提供新的SSR标记,对于马铃薯抗青枯病QTL定位、基因克隆和分子标记辅助选择也具有重要的参考意义。 相似文献
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【目的】定位棉花产量相关性状的数量性状基因座(Quantitative trait locus,QTL)。【方法】以中棉所70的F_2分离群体为遗传作图群体,利用从14 820对简单序列重复(Simple sequence repeat,SSR)引物中筛选出的267对两亲本间的多态性引物检测F_2群体250个单株的标记基因型,利用Joinmap 4.0进行连锁分析,并通过WinQTLCart 2.5复合区间作图法对F_(2:3)群体的株高、单株结铃数和单株果枝数性状进行QTL定位。【结果】在F_2群体中共获得342个SSR标记位点,并构建了包括312个标记、35个连锁群,总长1 929.9 cM的遗传连锁图谱(标记间平均距离为9.2 cM,覆盖棉花基因组的43.4%)。经QTL定位,共检测到19个QTL,其中涉及株高的7个、单株果枝数4个、单株结铃数8个,这些QTL分布在8条染色体上,解释0.25%~11.28%的表型变异。【结论】这些与农艺性状相关的QTL有助于棉花产量分子标记辅助选择。 相似文献
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《分子植物育种》2021,(11)
‘冀1518’是以优质品种‘冀228’为母本,丰产品系‘冀567’为父本配制的适机采杂交棉新品种,为挖掘‘冀1518’的优异纤维品质相关分子标记,本研究利用杂交棉‘冀1518’的亲本构建了F_2、F_(2:3)和F_(2:9)(重组近交系)(recombinant inbred lines, RILs)三个世代的分离群体,并利用SSR分子标记分别以F_2群体和RIL(F_(2:9))群体构建遗传连锁图谱,并对纤维品质性状进行定位。结果表明,F_2作图群体共有15个标记位点连锁,包含4个连锁群,全长覆盖237.10 cM,RIL (F_(2:9))作图群体共有45个标记位点连锁,包含11个连锁群,全长覆盖554.42 cM。利用QTL IciMapping 4.1对F_2、F_(2:3)和RIL (F_(2:9))群体的纤维品质性状进行复合区间作图法分析,在F_2及F_(2:3)分离群体能同时检测到15个与纤维品质相关的QTLs,其中,与马克隆值相关的QTL位点q FM-4-2解释表型变异率最高,为21.10%,显性或超显性效应的QTLs占总数的66.7%,表明显性基因是‘冀1518’纤维品质杂种优势的主要来源。在RIL (F_(2:9))群体定位到6个与纤维品质性状相关的QTLs,解释表型变异率在5.10%～10.26%之间。F_2、F_(2:3)和RIL (F_(2:9))群体均能在HAU2349附近(F_(2:9)作图, 0.31 cM)检测到与断裂比强度和马克隆值相关的QTL位点,在HAU2710附近(F_(2:9)作图, 0.84 cM)检测到与整齐度相关的QTL位点,且上述两标记连锁,连锁区段被定位在A6染色体上。本研究获得在多世代中稳定表达的QTLs,有望用于纤维品质分子标记辅助选择,提高育种效率。 相似文献
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普通小麦白粉病成株抗性的QTL分析 总被引：6，自引：1，他引：6
以抗白粉病的日本小麦品种Fukuho-komugi和以色列小麦Oligoculm杂交F1的DH（doubled haploid）群体107个系为材料，利用313个SSR标记和37个RFLP标记，对Fukuho-komugi和Oligoculm的白粉病成株抗性进行QTL分析。试验材料于2003－2004年度种植在北京、2003－2004和2004－2005年度种植在安阳，调查白粉病发病情况。构建了由350个位点组成的遗传连锁图，覆盖小麦21个连锁群，全长3 101 cM。采用复合区间作图法进行白粉病成株抗性QTL分析，在1A、2B、4B和7D上发现4个抗白粉病QTL，分别解释13.6%、6.6%、8.9%和12.7%的表型变异。抗白粉病基因及其紧密连锁分子标记的发掘，将为小麦抗白粉病育种的分子标记辅助选择提供理论和技术支持。 相似文献
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Mapping and validation of QTLs for resistance to an Indian isolate of Ascochyta blight pathogen in chickpea 总被引：1，自引：0，他引：1
Pratibha Kottapalli Pooran M. Gaur Sanjay K. Katiyar Jonathan H. Crouch Hutokshi K. Buhariwalla Suresh Pande Kishore K. Gali 《Euphytica》2009,165(1):79-88
Ascochyta blight (AB) caused by Ascochyta rabiei, is globally the most important foliar disease that limits the productivity of chickpea (Cicer arietinum L.). An intraspecific linkage map of cultivated chickpea was constructed using an F2 population derived from a cross between an AB susceptible parent ICC 4991 (Pb 7) and an AB resistant parent ICCV 04516. The
resultant map consisted of 82 simple sequence repeat (SSR) markers and 2 expressed sequence tag (EST) markers covering 10
linkage groups, spanning a distance of 724.4 cM with an average marker density of 1 marker per 8.6 cM. Three quantitative
trait loci (QTLs) were identified that contributed to resistance to an Indian isolate of AB, based on the seedling and adult
plant reaction. QTL1 was mapped to LG3 linked to marker TR58 and explained 18.6% of the phenotypic variance (R
2) for AB resistance at the adult plant stage. QTL2 and QTL3 were both mapped to LG4 close to four SSR markers and accounted
for 7.7% and 9.3%, respectively, of the total phenotypic variance for AB resistance at seedling stage. The SSR markers which
flanked the AB QTLs were validated in a half-sib population derived from the same resistant parent ICCV 04516. Markers TA146
and TR20, linked to QTL2 were shown to be significantly associated with AB resistance at the seedling stage in this half-sib
population. The markers linked to these QTLs can be utilized in marker-assisted breeding for AB resistance in chickpea. 相似文献
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烤烟6个农艺性状的QTL定位 总被引：3，自引：0，他引：3
由于烟草的分子标记开发和遗传图谱构建十分困难,迄今烟草中有关数量性状基因座(QTL)的定位研究仍非常有限。本研究利用一个由207个株系组成的烤烟DH群体及基于该群体所构建的含有24个连锁群、611个SSR标记,总长为1 882.1 cM的遗传图谱,采用复合区间作图方法,对株高(PH)、茎围(SG)、节距(IL)、叶片数(LN)、最大腰叶长(LWL)和最大腰叶宽(WWL) 6个与叶片产量有关的农艺性状进行QTL定位分析。共检测到69个QTL,大部分QTL的效应值较小,仅有4个具有较大的效应值,可解释大约15%~20%的表型变异。6个性状之间大多彼此相关。与此相符,在基因组中发现存在许多小区域,每个区域包含两个或两个以上紧密连锁的不同性状的QTL。 相似文献
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Waraluk Kasettranan Prakit Somta Peerasak Srinives 《Journal of Crop Science and Biotechnology》2010,13(3):155-161
Powdery mildew disease in mungbean is caused by the fungus, Erysiphe polygoni D.C. We identified two quantitative trait loci (QTLs) controlling resistance to the disease in a RIL population of 190 F7 lines. The population was developed from the cross between a susceptible cultivar, “Kamphaeng Saen 1” and a resistant line,
“VC6468-11-1A”. Reaction to the disease was evaluated for resistance in field and greenhouse conditions. Results from analysis
of variance revealed that 15 SSR loci on three linkage groups (LG) associated with the resistance. Composite interval mapping
consistently identified two QTLs on two LGs, qPMR-1 and qPMR-2, conferring the resistance. qPMR-1 and qPMR-2 accounted for 20.10 and 57.81% of the total variation for plant response to the disease, respectively. Comparison based on
common markers used in our and previous studies suggested that qPMR-2 is possibly the same as the major QTL reported earlier using another resistant source. The SSR markers flanking and closely
linked to qPMR-1 (CEDG282 and CEDG191) and qPMR-2 (MB-SSR238 and CEDG166) are useful for marker-assisted selection for mungbean resistance to powdery mildew. 相似文献
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Molecular mapping of a new gene for resistance to frogeye leaf spot of soya bean in 'Peking' 总被引：5，自引：0，他引：5
Amplified fragment length polymorphism (AFLP) and microsatellite (simple sequence repeat, SSR) techniques were used to map the _RGSpeking gene, which is resistant to most isolates of Cercospora sojina in the soya bean cultivar ‘Peking’. The mapping was conducted using a defined F2 population derived from the cross of ‘Peking’(resistant) בLee’(susceptible). Of 64 EcoRI and MseI primer combinations, 30 produced polymorphisms between the two parents. The F2 population, consisting of 116 individuals, was screened with the 30 AFLP primer pairs and three mapped SSR markers to detect markers possibly linked to RcsPeking. One AFLP marker amplified by primer pair E‐AAC/M‐CTA and one SSR marker Satt244 were identified to be linked to ResPeking. The gene was located within a 2.1‐cM interval between markers AACCTA178 and Satt244, 1.1 cM from Satt244 and 1.0 cM from AACCTA178. Since the SSR markers Satt244 and Satt431 have been mapped to molecular linkage group (LG) J of soya bean, the ResPeking resistance gene was putatively located on the LG J. This will provide soya bean breeders an opportunity to use these markers for marker‐assisted selection for frogeye leaf spot resistance in soya bean. 相似文献
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崇化大梨×新世纪梨F1代分子遗传图谱的构建及两个果实性状的QTL分析 总被引：1，自引：0，他引：1
利用崇化大梨×新世纪梨杂交得到的94株F1代实生苗为作图群体,应用mapmaker/exp 3.0软件构建了一张包括19个SSR标记,315个SRAP标记,合计335个标记分属于18个连锁群的遗传图谱,图谱总长度为1 300 cM,平均图距为3.9 cM。采用区间作图法检测到与果实发育期、果形指数两个果实性状相连锁的QTL位点7个,其中主效的QTL位点2个(LOD≥3.5),分别位于LG2和LG17连锁群。 相似文献
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A. Badea F. Eudes R. J. Graf A. Laroche D. A. Gaudet R. S. Sadasivaiah 《Euphytica》2008,164(3):803-819
Fusarium head blight (FHB) caused by Fusarium species, is among the most devastating wheat diseases, causing losses in numerous sectors of the grain industry through yield
and quality reduction, and the accumulation of poisonous mycotoxins. A germplasm collection of spring and winter wheat, including
nine reference cultivars, was tested for Type II FHB resistance and deoxynivalenol (DON) content. Genetic diversity was evaluated
on the basis of Simple Sequence Repeat (SSR) markers linked to FHB resistance quantitative trait loci (QTLs) and Diversity
Arrays Technology (DArT) markers. The allele size of the SSR markers linked to FHB resistance QTLs from known resistance sources
was compared to a germplasm collection to determine the presence of these QTLs and to identify potentially novel sources of
resistance. Forty-two accessions were identified as resistant or moderately resistant to Fusarium spread, and two also had very low DON concentrations. Genetic relationships among wheat accessions were generally consistent
with their geographic distribution and pedigree. SSR analysis revealed that several resistant accessions carried up to four
of the tested QTLs. Resistant and moderately resistant lines without any known QTLs are considered to be novel sources of
resistance that could be used for further genetic studies. 相似文献
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栽培种花生是异源四倍体,基因组大,构建花生的分子遗传连锁图谱并对相关性状进行QTL定位研究的工作缓慢。本研究以遗传差异大的亲本组配杂交组合富川大花生×ICG6375构建F2作图群体,采用公开发表的2653对SSR引物,构建了一张含有234个SSR标记、分布于20个连锁群的栽培种花生遗传图谱。该图谱覆盖基因组的长度为1683.43c M,各个连锁群长度在36.11~131.48 c M之间,每个连锁群的标记数在6~15个之间,标记间的平均距离为7.19 c M。结合F3在湖北武汉和阳逻环境下的主茎高和总分枝数鉴定结果,应用Win QTLCart 2.5软件采用复合区间作图法进行了QTL定位和遗传效应分析。共检测到17个与主茎高和总分枝数相关的QTL位点,贡献率在0.10%~10.22%之间,分布于8个连锁群上。综合分析武汉和阳逻环境的鉴定结果,获得重复一致的与主茎高相关的6个QTL,其中q MHA061.1和q MHA062.1位于连锁群LG06上TC1A2~AHGS0153标记区间,贡献率为5.49%~8.95%;q MHA061.2和q MHA062.2位于LG06上AHGS1375~PM377标记区间,贡献率为2.93%~5.83%;q MHA092.2和q MHA091.1位于连锁群LG09上GM2839~EM87标记区间,贡献率为0.53%~9.43%。 相似文献
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由Puccinia triticina引起的叶锈病是小麦主要病害之一, 引进种质C615具有叶锈病成株期抗性, 但其抗病性遗传机制尚不清楚。本研究以抗病亲本C615与高感叶锈病亲本宁麦18构建的F2:7代重组自交系群体为材料, 利用337对多态性SSR标记构建遗传连锁图谱, 结合2016、2017连续两年的叶锈病鉴定结果进行复合区间作图, 结果在1BL、2DS、3BS、4DL和6BS染色体上共发现了5个抗性QTL, 暂命名为QLr.njau-1BL、QLr.njau-2DS、QLr.njau-3BS、QLr.njau-4DL和QLr.njau-6BS。其中, QLr.njau-1BL、QLr.njau-3BS和QLr.njau-4DL在两年均被检测到, 分别解释10.1%~15.7%、10.9%~13.5%和8.2%~9.0%的表型变异; 另2个QTL只在一年被检测到, 解释6.2%和9.2%的表型变异。除QLr.njau-2DS外的4个抗性QTL均来源于抗病亲本C615。QLr.njau-1BL和QLr.njau-4DL分别与已报道的慢病性基因Lr46、Lr67在同一区域, QLr.njau-3B可能为一个新的抗叶锈病QTL。此外, 本研究在C615/扬麦13 (轮回亲本)BC4F5回交群体中选出了15个农艺性状优良且抗叶锈病的株系, 利用与C615所含抗性QTL紧密连锁的7个SSR标记对其进行基因型检测, 结果显示所有这15个株系均含有来自C615的抗性QTL, 且有3个株系聚合了全部抗性位点, 表明C615可作为抗源亲本用于高产、抗病育种。本研究结果将为分子标记选育抗叶锈品种提供材料和技术支撑。 相似文献