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1.
北京黑猪RBP4基因与繁殖性状的关联分析 总被引：5，自引：0，他引：5
以北京黑猪为研究对象，选取视黄醇结合蛋白4（Retinol—binding proteins4，RBP4）基因为繁殖性状的候选基因，其扩增产物经MspI酶切后，在北京黑猪群体中发现AA、AB和BB3种基因型，其A、B等位基因的频率、多态信息含量、杂合度分别为0．5296、0．4704、0．3741和0．4982，表明该位点处于中度多态。x^2适合性检验表明北京黑猪群体该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态（P〉0．05）。用SAS8．0软件最小二乘法拟合线性模型，将不同基因型与总产仔数（TNB）、产活仔数（NBA）和出生重（WB）进行了关联分析，结果表明：经产母猪各基因型间的TNB、NBA、WB差异均不显著（P〉0．05）。初产母猪BB型比AA和AB型个体的TNB分别多1．04（P〈0．05）和0．31头；BB和AB型比AA型个体的NBA分别多1．47（P〈0．05）和1．35头。基因效应分析结果表明，初产母猪该位点的B等位基因对TNB、NBA和WB都表现为正效应，分别使各性状增加了0．2820头、0．4085头和0．0009kg，即B等位基因可能为北京黑猪繁殖性能的有利等位基因。 相似文献
2.
籽鹅GH基因内含子3多态性及其与体重和屠体性状的关联分析 总被引：1，自引：0，他引：1
根据鸭生长激素基因内含子3的序列设计引物，利用PCR—SSCP方法对籽鹅进行了单核苷酸多态性分析，并检测其多态性。结果表明，籽鹅生长激素基因内含子3长约364bp，共发现了7个突变位点，分别为A160G、C167G、T264C突变，以及AA型个体在176、177位点G、A碱基缺失和BB型个体在231、232位点C、T碱基缺失。产生AA、AB和BB3种基因型，其中BB基因型为优势基因型，且基因型频率表现为BB〉AB〉AA；卡方检验结果表明，基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡（P〉0．05）。不同基因型与体重和屠体性状的关联分析结果表明：BB基因型个体的7周龄体重、9周龄体重、10周龄体重、胸肌重、胸肌率及心脏重显著高于AA型个体（P〈0．05）；BB基因型个体8周龄体重显著高于AB型个体（P〈0O．05）；在所分析的性状中，BB基因型个体的均值最大，AB型次之，AA型最小。 相似文献
3.
鸡AMPD1基因PCR-SSCP分析与相关性状的研究 总被引：4，自引：0，他引：4
5′-磷酸腺苷脱氨酶1(AMPD1)是嘌呤代谢中的一种重要酶类,它的功能是催化AMP(一磷酸腺苷)脱氨,生成肌苷酸(IMP),从而影响肉质风味。试验采用单链构象多态性(PCR-SSCP)技术,以隐性白羽肉鸡、白来航蛋鸡和两个地方品种(北京油鸡、三黄胡须鸡)纯系鸡为试验材料,对AMPD1基因进行SNPs检测和基因类型判别。卡方检验结果表明: 除三黄胡须鸡和隐性白羽肉鸡、北京油鸡和白来航鸡间差异不显著(P>0.05)外,其他各品种间差异极显著(P<0.01)。AMPD1基因多态性与北京油鸡生产和屠体性状(活重、胸肌率、肌苷酸含量等)相关分析结果表明:肌苷酸含量在三种基因型间差异显著(P<0.05)。初步推断AMPD1可能为影响鸡肉中肌苷酸生成的主效基因或与主效基因相连锁。 相似文献
4.
胰岛素样生长因子I（IGF—I）是动物生长发育和代谢的主要调节因子，是生长激素启动生长活性的主要介导者。采用PCR—SSCP技术检测了山西白猪群体IGF-I基因第3外显子的多态性，共检测到3个等位基因A、B、C，形成了AA、AB、AC、BB、BC和CC6种基因型。A等位基因的频率较高，为0．549，等位基因B和C的频率较低，分别为0．173和0．278．就基因型频率的分布来看，纯合子AA型、杂合子AB和AC型频率较高，分别为0．230、0．204和0．434，其他类型频率较低，均低于10％。利用最小二乘法分析了突变位点对山西白猪初生重、断奶重、6月龄体重和体高、体长、胸围、背膘厚等性状的影响。结果表明，该突变位点对6月龄猪的体高有显著影响（P〈0．05），BC型个体的6月龄体高显著低于其他类型个体（P〈0．05），而对其他性状的影响不显著（P〉0．05）。 相似文献
5.
采用测序，结合PCR—RFLPs的方法在民猪、长白猪及其杂种母猪的催乳素受体（Prolactin Receptor，PRLR）cDNA序列（＋1628～＋1878）中首次发现一处NaeⅠ多态位点。该位点的多态性是由于第1789位点的碱基发生了A→G的突变，并导致氨基酸的变化（S→G），即由丝氨酸→甘氨酸的变化。分析结果表明，NaeⅠ酶切位点的基因型频率和等位基因频率在3个母猪群体间有显著差异（P〈0．01）。最小二乘分析结果显示，在民猪群体中，只存在AA和AB两种基因型，AB型母猪的初生窝重和21日龄仔猪均匀度显著高于AA型（P〈0．05）；在长白猪群体中，AA型母猪的21日龄窝重显著高于BB型（P〈0．05）；在F1代长民杂种猪群体中，BB基因型母猪的21日龄仔猪均匀度显著高于AB和AA型（P〈0．05）。 相似文献
6.
小尾寒羊高繁殖力候选基因RBP4的研究 总被引：6，自引：0，他引：6
以视黄醇结合蛋白4（retinol binding protein 4，RBP4）基因为候选基因，采用PCR-SSCP技术分析了RBP4基因在高繁殖力绵羊品种（小尾寒羊、湖羊）以及低繁殖力绵羊品种（多赛特羊、萨福克羊）中的单核苷酸多态性，同时研究这个基因对小尾寒羊高繁殖力的影响。结果表明：RBP4基因扩增片段在4个绵羊品种中存在PCR-SSCP多态性。BB基因型只出现在高繁殖力绵羊品种中，而低繁殖力绵羊品种则没有BB基因型；AB基因型频率随着绵羊繁殖力的降低而升高；AA基因型只出现在小尾寒羊、多赛特羊中。BB基因型小尾寒羊产羔数分别比AA和AB基因型多0．52只（Pd0．05）和0．67只（Pd0．05），AA和AB基因型小尾寒羊产羔数没有显著差异（P〉0．05）。本研究检测的绵羊RBP4基因座位与小尾寒羊高繁殖力相关。 相似文献
7.
本研究旨在阐明Toll样受体6(TLR6)基因的多态性与荷斯坦母牛乳房炎抗性之间的关系.采用PCR-SSCP和PCR-RFLP技术检测208头荷斯坦母牛TLR6基因多态性,用最小二乘法分析该基因多态性与荷斯坦母牛钵细胞评分(somatic cell score,SCS)的关系.结果发现,TLR6基因mRNA序列中存在T853A、G855A、G1793A、C1859A、G1934A和A1980G 6个多态位点,其中T853A突变使编码氨基酸由缬氨酸变为谷氨酸,G855A突变使天冬氨酸变为天冬酰胺,A1980G突变使异亮氨酸变为缬氨酸.T853A和G855A突变位点经SSCP检测发现3种基因型AA、AB和BB,其频率分别为0.308、0.490和0.202;X~2检验表明荷斯坦母牛在该位点处于Hardy-Weinberg平衡;BB基因型SCS最小二乘均值极显著低于AB和AA基因型所对应的值(P<0.01);AB基因型SCS最小二乘均值极显著低于AA基因型所对应的值(P<0.01).G1793A突变位点经BsiY Ⅰ酶切产生2种基因型CC和CD,其频率分别为0.332和0.668;荷斯坦母牛在该位点偏离了Hardy-Weinberg平衡,CC和CD基因型SCS最小二乘均值差异不显著(P>0.05).C1859A突变位点经BstX Ⅰ酶切产生2种基因型EE和EF,其频率分别为0.178和0.822;荷斯坦母牛在该位点偏离了Hardy-Weinberg平衡;EE和EF基因型SCS最小二乘均值差异不显著(P>0.05).G1934A突变位点经BsiY Ⅰ酶切产生2种基因型GG和GH,其频率分别为0.356和0.644;荷斯坦母牛在该位点偏离了Hardy-Weinberg平衡;GG和GH基因型SCS最小二乘均值差异不显著(P>0.05).A1980G突变位点经Bcl Ⅰ酶切产生3种基因型II、IJ和JJ,其频率分别为0.260、0.567和0.173,荷斯坦母牛在该位点处于Hardy-Weinberg平衡;JJ基因型SCS最小二乘均值极显著低于IJ和II基因型所对应的值(P<0.01);IJ基因型SCS最小二乘均值极显著低于II基因型所对应的值(P<0.01).对于奶牛乳房炎抗性,BB和JJ是有利基因型,AA和II是不利基因型.本研究结果初步表明TLR6基因T853A和G855A突变位点的B等位基因以及A1980G突变位点的J等位基因是提高奶牛乳房炎抗性的2个潜在的DNA标记. 相似文献
8.
郏县红牛CLPG基因的SNP及对生长发育性状的影响 总被引：1，自引：1，他引：0
利用PCR-SSCP检测了113头郏县红牛CLPG基因的SNP，发现了AA、AB、AC 3种基因型，测序结果显示AA型在第150和419碱基处分别表现为C和T，为野生型；AB型在第419处发生碱基T→C突变；AC型在第150处发生碱基C→T突变。多态信息含量为0．226，属低度多态。分析了不同基因型与部分生长发育性状的相关性，结果显示，AA、AC基因型个体在体重、体长指标上显著（P〈0．05）或极显著（P〈0．01）大于AB型个体；在管围指标上，AA基因型个体优于AB基因型个体，差异显著（P〈0．05）；在坐骨端宽指标上，AA与AB基因型个体之间差异显著（P〈0．05），AB与AC基因型个体间差异极显著（P〈0．01）。 相似文献
9.
ESR与PRLR基因对民猪产仔数的影响 总被引：13，自引：0，他引：13
采用PCR－SSCP，检测ESR与PRLR基因的多态性，并采用混合模型统计了基因型与表型值（产仔数）的相关性，分析了民猪ESR与PRLR基因各基因型及其合并基因型对民猪产仔数性状的影响。结果表明：就民猪总产仔数、活产仔数的最小二乘均值而言：ESR基因基因型间，AB型较AA和BB高，差异不显著（P＞0.05）；PRLR基因基因型间，AA＞BB＞AB，差异也不显著（P＞0.05）；两基因的互作效应显著（P＜0.05），其中ESR与PRLR基因的合并基因型AAAA为最佳的合并基因型（P＜0.05）。 相似文献
10.
11.
本试验旨在分析钙调素(Calmodulin,CAM)基因启动子区域碱基多态性与京海黄鸡产蛋性状和鸡蛋蛋壳质量性状间的关系。采用PCR-SSCP法检测京海黄鸡CAM基因启动子区域碱基多态性。结果表明:京海黄鸡CAM基因启动子区域有3个SNPs(G326A、A327G、C366T),PCR扩增产物SSCP出现6种基因型:AA、AB、AC、BB、BC和CC。AA基因型个体的300日龄产蛋数和66周龄产蛋数显著高于BB型个体(P<0.05)。AA型个体的蛋壳强度和蛋壳重显著小于AB、BB、AC和BC型个体(P<0.05)。CAM基因座对京海黄鸡300日龄蛋重、蛋型指数、蛋壳强度和壳重百分率的主效应指数(MEI)均大于3%。初步推断CAM基因座可能是影响京海黄鸡产蛋数和蛋壳质量性状重要候选基因。 相似文献
12.
为探索SLA-DRA基因作为猪抗病育种分子标记的可能性,本研究采用PCR-SSCP和克隆测序方法对大白、长白和杜洛克共216头猪的SLA-DRA基因外显子2进行了多态性研究,分析了该基因与仔猪腹泻的关联性。结果,在SLA-DRA外显子2上检出了3个等位基因和6种基因型;6种基因型(AA、AB、BB、AC、BC和CC)在大白猪和长白猪中都存在,而在杜洛克猪中只检出4种基因型(AA、BB、AB和BC)。杜洛克猪与大白猪和长白猪间基因型分布均差异极显著(P<0.01);3个品种的基因型分布均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。最小二乘法分析表明,品种和性别对仔猪腹泻影响不显著(P>0.05),基因型与仔猪腹泻显著相关(P<0.05);AA和BB基因型个体腹泻评分的最小二乘均值均显著高于AC和CC基因型个体(P<0.05)。本研究表明,SLA-DRA基因不同基因型对仔猪腹泻有着重要的影响,可作为猪抗病育种应用中的一个潜在遗传标记。 相似文献
13.
A. Ardiyanti F. Abe H. Kobashikawa T. Hirayama T. Sugino K. Suzuki K. Katoh 《Domestic animal endocrinology》2009,37(4):243-249
Bovine growth hormone (bGH) gene polymorphism of leucine (Leu)-threonine (Thr) (allele A), valine (Val)-Thr (allele B), and Val-methionine (Met) (allele C) at codons 127 and 172 was shown to relate with carcass trait variations in Japanese Black cattle. In this study, 10-mo-old Japanese Black heifers with growth hormone (GH) genotypes AA, AB, BB, AC, BC, and CC (N = 141) were compared for basal GH, insulin-like growth factor-1 (IGF-1), insulin, ghrelin, glucose, and nonesterified fatty acid (NEFA) concentrations. Growth hormone release was also measured as response to growth hormone–releasing hormone (GHRH) (0.4 μg/kg body weight [BW]) using 18 heifers with GH genotypes AA, BB, and CC (n = 6 for each group). The genotype AA heifers showed the greatest BW among genotypes (P < 0.05). Genotype AC, BC, and CC heifers showed greater GH concentrations than genotype AA, AB, or BB heifers, in which genotype CC heifers had the highest concentrations (P < 0.05). However, IGF-1 concentrations did not significantly differ. The genotype AA and BB heifers had a greater GH release at 60 min following GHRH injection than did the genotype CC heifers. The area under the curve (AUC; P < 0.07) and incremental area (IA; P < 0.08) of GH responses to the GHRH challenge tended to be the highest in the genotype AA heifers and the lowest in the genotype CC heifers. In conclusion, GH gene polymorphism altered GH, which may have contributed to differences in BW and carcass traits among genotypes. 相似文献
14.
试验旨在研究拜城油鸡公鸡中脂肪型脂肪酸结合蛋白（adipocyte fatty acid binding protein,A-FABP）基因的多态性及其与生产性能的相关性,寻找可用于拜城油鸡选育的分子遗传标记。随机选取92只6周龄拜城油鸡公鸡,采用PCR-RFLP方法检测A-FABP基因的多态性。每种基因型选取15只体重相近的个体随机分为3组,每组每种基因型个体各5只,分别在12、18、24周龄时屠宰并对生产性能指标进行测定。结果显示,在拜城油鸡公鸡中检测到A-FABP基因有3种基因型：AA、AB、BB,BB为优势基因型,B为优势等位基因,不符合哈代-温伯格平衡定律（P<0.01）。12周龄时,各基因型间各生产性能指标差异均不显著（P>0.05）;18周龄时,BB基因型肌间脂宽显著高于AA基因型（P<0.05）,BB和AB基因型腹脂重极显著高于AA基因型（P<0.01）,腹脂率显著高于AA基因型（P<0.05）;24周龄时,BB基因型体重、肌间脂宽、腹脂重均显著高于AA基因型（P<0.05）。推测A-FABP基因可以作为与拜城油鸡公鸡脂肪性状相关的候选标记之一。 相似文献
15.
In order to search the molecular genetic markers for breeding of Baicheng fatty chicken, the relationship between the polymorphism of adipocyte fatty acid binding protein (A-FABP) gene and the productive performance of the male chickens at different ages was studied. Ninety two chickens with age of 6 weeks were randomly selected. The polymorphism of A-FABP gene was detected by PCR-RFLP method. In each genotype group, fifteen chickens with similar body weight were categorized, each group was randomly divided into three sub-groups with equal numbers. The productive performance of the chickens was measured at their age of 12, 18 and 24 weeks. The results showed that there were three genotypes of A-FABP gene:AA,AB and BB, BB genotype was the dominant genotype,allele B was the advantageous allele,and it was not in Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.01). At the age of 12 weeks,no significant difference was found among the measured productive performance (P>0.05). At the age of 18 weeks, it was found that the intramuscular fat width of BB genotype was significantly higher than AA genotype (P<0.05), the abdominal fat weight of BB and AB genotypes were extremely significantly higher than AA genotype (P<0.01),and the abdominal fat weight percentage of BB and AB genotypes were significantly higher than AA genotype (P<0.05). At the age of 24 weeks, it was found that the body weight, intramuscular fat width and abdominal fat weight of BB genotype were significantly higher than that of AA genotype (P<0.05). Therefore, this results suggested that A-FABP gene could be used as a potential candidate marker for the association of fatty traits in male Baicheng fatty chicken. 相似文献
16.
温岭草鸡GH基因多态性及其与生长和屠体性状的相关性研究 总被引：2，自引：0，他引：2
以温岭草鸡优质、中速和快大3个品系为试验材料,采用PCR-RFLP方法,研究其生长激素(GH)基因的多态性及其对生长和屠体性状的影响。结果表明:(1)PCR产物酶切得到AA、AB、BB、CC、AC和BC共6种基因型。优质系(Ⅰ)中,C基因频率最高,A基因频率最低;中速系(Ⅱ)中,各等位基因频率接近;快大系(Ⅲ)中,B基因频率最低,A、C基因频率接近。(2)3个品系PIC值均大于0.5,χ2检验显示3个品系中,6种基因型分布差异极显著(P<0.01);Hardy-Weinberg平衡检验表明,品系Ⅰ和Ⅱ符合平衡定律,品系Ⅲ不符合。(3)GLM分析表明,基因型对全净膛重、腿肌重和腹脂重影响显著(P值分别为0.039、0.047、0.016),对活重、屠体重、半净膛重及胸肌重影响不显著(P>0.05)。多重比较显示,BC基因型的活重、屠体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重和腿肌重的平均值最大,AA基因型最小;BB基因型的腹脂重平均值最大,AA基因型最小,二者差异极显著(P<0.01)。 相似文献
17.
以京海黄鸡、AA鸡、尤溪麻鸡、边鸡等4个鸡品种为研究对象,采用PCR-SSCP方法检测胰岛素样生长因子结合蛋白1(insulin-like growth factor-binding protein-1,IGFBP-1)第4外显子的多态性,并分析其对京海黄鸡生长性能的遗传效应。结果显示,在IGFBP-1第4外显子区检测到2处变异(5550T→C、5692AAT插入)。对于P3扩增片段,在尤溪麻鸡群体中检测到AA、AB、BB 3种基因型,在AA鸡和边鸡品种中检测到AA和AB 2种基因型,京海黄鸡中只检测到AA基因型;对于P4扩增片段,在4个鸡品种中均检测到CC、CD、DD 3种基因型。最小二乘分析结果表明,京海黄鸡3种基因型个体的初生重存在显著差异(P＜0.05)。 相似文献
18.
通过建立一般线性模型,对5个水貂群体、300个个体的4个经济性状与16个微卫星遗传标记位点进行相关性研究。结果表明：珍珠色水貂的Mvi4013的AA和BB针毛长度差异显著,A基因起正面效应。珍珠色水貂Mvi586的BB和CC、BC和CC之间的针毛直径差异显著,银蓝色水貂Mvi4015的AA和BB基因型、AB和BB基因型的绒毛长度之间差异显著,A基因起正面效应;Mvi4013的AA和AB基因型、AB和BB基因型的绒毛长度之间差异显著,Mvi4001BB基因型的绒毛长度显著高于其他两种类型,B基因起正面效应。在金州黑水貂群体中Mvi4006的AC型与BD、CC型绒毛直径有显著差异,A基因起正面效应。在银蓝色水貂。Mvi2243的AA型和AB型绒毛直径差异显著,Mvi4001AA型绒毛直径和AB基因型差异显著,B基因起负面效应。 相似文献
19.
IGF-I与IGFBP-1基因对京海黄鸡生长性状的遗传效应分析 总被引：1，自引：0，他引：1
旨在对IGF-I和IGFBP-1基因部分SNPs与鸡生长性状进行关联分析。试验以京海黄鸡为材料,采用PCR-SSCP方法检测2个候选基因的单核苷酸多态性(SNPs),采用一般线性模型(GLM)分析基因型与生长性状的遗传效应。结果表明,IGF-I基因外显子3序列的60bp处有A→G的点突变,在京海黄鸡中检测到AA、AB、BB 3种基因型,A等位基因频率为0.613,B等位基因的频率为0.387;IGFBP-1基因外显子2序列的21bp处有A→T的点突变,104bp处有T→C的突变,在京海黄鸡中检测到CC、CD和DD 3种基因型,C等位基因频率为0.558,D等位基因频率为0.442。IGF-I基因BB基因型个体4周龄体质量显著高于AA和AB型个体(P<0.05);IGFBP-1基因DD基因型个体8周龄体质量显著高于CC基因型个体(P<0.05),4、12和16周龄体质量差异极显著(P<0.01)。因此,推测这些SNPs对京海黄鸡生长性状具有一定的影响,应用于鸡育种过程中的标记辅助选择可以加快育种进程。 相似文献