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应用SRAP标记对茄子品种进行遗传多样性分析与指纹图谱构建 总被引：2，自引：0，他引：2
利用SRAP技术对36份茄子栽培品种进行了分子鉴定。结果表明:选用25对引物组合对其基因组DNA进行PCR扩增,共获得566条扩增带,其中多态性谱带102条,平均每个引物组合扩增出4.08条多态性条带;品种间‘望哈茄’与‘本溪早紫茄’遗传相似系数最大,为0.986,‘辐射1号’与‘沪紫长茄’间遗传相似系数为0.581。同时使用8对引物组合构建了36个品种的指纹图谱,其中引物FC8ME10可以把‘闽长茄’与其他茄子品种完全区分开。引物SA1OD3可以把‘敦和茄’和‘苏大青茄’同其他茄子品种区分开来。表明:SRAP标记技术能较好地从分子水平揭示出茄子品种的遗传多样性,并能有效应用于茄子品种指纹图谱构建。 相似文献
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为了更深入地揭示芦笋品种（系）的遗传多样性,本研究采用SRAP技术对国内外12 个芦笋栽培种和杂交种的遗传多态性进行分析。结果表明,从170 对引物中筛选出29 对多态性强、条带清晰的引物,每对引物产生12~36 条谱带,共产生551 条谱带,其中多态性条带343 条,占总带数的61.21%。平均每个引物扩增的DNA带数是20.41 条,多态性带数是12.7 条。采用NTSYSpc2.1 软件对SRAP扩增结果进行聚类分析,12 份芦笋材料的相似系数在0.39~0.97 之间,平均相似系数为0.69。在Coefficient=0.69处划等值线,可将12份芦笋材料划分为4类。第一类：‘鲁芦笋一号’、‘88-5’、‘格兰德’、‘07-1’和‘06-6’。第二类：‘阿波罗’、‘泽西巨人’和‘阿特拉斯’。第三类：‘西班牙达玛斯’。第四类：‘荷兰全雄’、‘UC800’和‘西德全雄’。 相似文献
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【目的】基于 SSR 分子标记对 12 份非洲菊种质进行亲缘关系分析及部分种质杂交 F1 后代真假杂种鉴定，以期为非洲菊种质资源鉴评及创新利用提供技术支撑。【方法】收集 12 个非洲菊种质资源，提取其基因组 DNA 后，利用 50 对 SSR 引物进行 PCR 扩增，通过检测相关多态性结果进行聚类分析和指纹图谱构建，以及部分品种杂交 F1 后代鉴定。【结果】18 对引物在 12 份非洲菊材料中共扩增出 74 个多态性等位变异片段，平均每对引物扩增出多态性等位变异片段 4.1 个。利用 74 个等位位点，构建了 12 份非洲菊种质资源的系统进化树，UPGMA 聚类分析结果显示，当遗传系数为 0.75 时，可将受测的 12 份种质分为 5 组，Ⅰ组为‘云南红’‘大088’‘情人’，Ⅱ组为‘粉佳人’‘粉球’‘真爱’和‘福娃’，Ⅲ组为‘绣色’‘淑女’和‘黄球’， Ⅳ组和Ⅴ组均只包含 1 个品种，分别是‘紫水晶’和‘深圳 5 号’。筛选出 GHSSR-1、GHSSR-18、GHSSR-20和 GHSSR-21 等 4 对引物，可完全区分 12 份种质；其中，后 3 对引物鉴定出兼具双亲特异位点的单株分别是Gh-5、Gh-4 和 Gh-1，单独 1 对引物的鉴定率为 33%。且受检的 3 个单株均为真杂种，真杂种率为 100%。【结论】成功构建 12 份非洲菊品种的指纹图谱，综合 3 对多态性较好的引物鉴定出 3 株非洲菊杂交 F1 后代实生苗为真杂种，为非洲菊资源鉴评和创新利用提供可靠的 SSR 标记引物。 相似文献
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扁桃品种的SSR分析 总被引：1，自引：0，他引：1
利用SSR方法对16个扁桃品种、1个榆叶梅品种和1个晚熟毛桃进行了基因组多态性分析，从15对引物中筛选出12对多态性、稳定性较好的引物用于正式试验，12对引物在18个供试品种中共扩增出80条DNA谱带，平均每对引物扩增出5～6条，用W0622106、W0622114、W0622094、W0622116等4对引物可以鉴别18个供试品种中的17个品种，根据SSR分析结果，应用NTSYS软件进行相似性系数计算，利用UPGMA法构建聚类树状图。供试扁桃品种可分为5个类群，与传统的系谱有一定的误差。 相似文献
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新高系梨9个品种SSR 标记分析 总被引：2，自引：0，他引：2
为了有效区分和利用亲缘关系较近的新高系梨品种,利用简单序列重复（SSR）分子标记技术对新高系梨9个品种进行了多态性分析、遗传相似性和聚类分析。从12对引物中筛选出3对多态性高、分辨能力强的引物,在供试材料中共扩增出22条带,其中多态性带22条,多态性达100%;每对引物扩增出的条带数4 ～ 9条不等,平均为7.3条;且这3对引物组合可以成功地区分全部供试品种。9份材料之间遗传相似系数变化范围为0.47 ～ 0.91,平均值为0.67,揭示出它们的遗传基础相对比较狭窄。加权成组配对法（UPGMA）聚类分析结果表明,供试材料可以分为3个组和2个亚组,其中新高Pyrus pyrifolia ‘Niitaka’和黄金‘Whangkeum Bae’,大果水晶‘Sujeong’和华丰‘Huafeng’的相似系数最大,为0.91,说明其亲缘关系最近;天皇‘Yewang’和鲜黄‘Sunhwang’分别单独聚为一类,并对其结果的原因进行了初步探讨。图3表3参17 相似文献
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利用SSR分子标记技术对以‘淡丰后’(或‘丰后’)为母本,分别与其他梅花品种及近缘种杂交的F1代及其亲本进行杂种鉴定。用47对从梅花近缘种(包括桃、李、杏、酸樱桃、甜樱桃)中已开发出的SSR引物和3对梅花EST-SSR引物对亲本进行SSR-PCR扩增,其中8对引物(aprigms18、BPPCT001、BPPCT002、BPPCT004、BPPCT034、UDP96005、UDP98409、PES16)对23个父本中的21个有稳定、特异扩增(相对于母本),包括12个梅花品种和9个近缘种,有效扩增率为91.3%。再用以上8对引物对10个杂交组合进行扩增,有6对引物(BPPCT001、BPPCT004、BPPCT034、UDP96005、UDP98409、PES16)能够初步鉴定出其中7个杂交组合中21个杂种F1代的真实性(父本分别为江梅、‘变绿萼’、‘白须朱砂’、‘小红朱砂’、‘辽梅’山杏、毛樱桃、‘寿红’桃),鉴别率为77.8%。证明梅花近缘种基因组SSR引物及梅花EST-SSR引物在梅花杂种鉴定中的适用性,拓宽了SSR分子标记技术在梅花杂交育种中的应用。 相似文献
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浙江丽水16个柑橘特色品种的RAPD分析 总被引：3，自引：0，他引：3
以浙江省丽水市生产的16个柑橘品种为试验材料,利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对其亲缘关系进行研究.用21个引物扩增出了216个RAPD位点,平均每个引物10.29个位点,其中多态性位点达96.76%.每个引物不同的品种能扩增出0～10个条带.引物S13信息量最少,扩增出了48个条带,而引物S317信息量最大,扩增出了143个条带.文旦Citrus grandis var.wentanyu是最特殊的品种,21个PCR扩增引物中有8个引物未扩增出任何条带.UPGMA聚类结果是瓯柑类、椪柑类、温州蜜柑类及柚类基本上能聚在一起;南香Citrus unshiu × Citrus clementina与天草Citrus hybrid在遗传上与温州蜜柑类接近;属于杂柑的胡柚Citrus paradisi‘Changshanhuyou’与红肉脐橙Citrus sinensis var.brasiliensis在遗传上接近.另外,用引物S304可以区分无籽瓯柑Citrus suavissima ‘Seedless'与普通瓯柑C.suavissima,用S356可以区分无籽柑Citrus poonensis‘Seedless’与普通椪柑C.poonensis.研究结果表明,这些柑橘不仅在DNA水平上是有差异的,而且RAPD标记技术可用于柑橘DNA水平的鉴别.图4表1参8 相似文献
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黄瓜品种RAPD指纹图谱的构建及遗传相似性分析 总被引：4，自引：0，他引：4
利用RAPD技术对22个具有广泛遗传基础的黄瓜品种进行了指纹图谱构建及遗传相似性分析,从240条RAPD随机引物中筛选出27条具有稳定多态性的引物.27条引物共扩增出163条带谱,其中多态性带70条,平均多态性比例为43.10%.9条RAPD引物产生的12个特异性标记可以单一地鉴别9个品种,利用不同引物的组合可将其他品种鉴别出来.通过UPGMA法进行聚类分析,当GSC=0.688 8时,可将22个黄瓜品种分为4个群.22个品种间的平均遗传相似系数为 0.800 4,说明黄瓜的遗传变异较低,遗传基础狭窄. 相似文献
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研究应用SRAP分子标记对亚洲百合杂种系亲本(‘橙色热情’ב迷恋’)、东方百合杂种系亲本(‘热情’ב甜梦’)及其杂交子代植株的DNA分别进行扩增,分析杂交后代植株与亲本间扩增谱带差异。从80对引物组合中筛选出具有父本特征带的引物组合,选出带型清晰、稳定、特征带较多的引物组合进行杂种真实性鉴定。结果如下:具有父本特征带的引物组合共有57对,选取其中6对引物对亲本(‘橙色热情’ב迷恋’)及其子代进行标记,选取其中7对引物对亲本(‘热情’ב甜梦’)及其子代进行标记。2个杂交组合共计10个后代,均具有父本特征带,鉴定其为真杂种。 相似文献
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北美冬青Ilex verticillata作为切枝观赏和景观美化植物在中国花卉市场受到越来越多的关注。为给北美冬青新品种选育提供保障,采用简单重复序列间扩增多态性（ISSR）分子标记分析了北美冬青品种间的亲缘关系,从12个ISSR引物中筛选出4个多态性引物;对12个北美冬青品种进行了扩增,共获得63个条带,其中多态性条带占90.48%,所选引物的多态性较高,可用于鉴定北美冬青品种间的相对亲缘关系;12个北美冬青品种间的遗传相似系数为0.54~0.87,亲缘关系相对较近;品种间的遗传相似系数聚类结果表明,各品种间存在不同程度的亲缘关系,其中I. verticillata ‘Jim Dandy’和I. verticillata ‘Cacapon’间亲缘关系最近。研究结果为北美冬青品种的选育奠定了理论和实践基础。 相似文献
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不同核桃品种的SSR分析 总被引：4，自引：0，他引：4
应用SSR技术对21个核桃品种和1个枫杨品种的基因组DNA进行遗传多样性的研究。用筛选出的10对引物对供试材料进行SSR分析,共扩增出67条清晰的谱带,不同引物扩增出的DNA条带数量在4～24条之间,分子量大小在85～300 bp之间,依据特征谱带,可直接鉴别出供试品种,其中引物WGA32的鉴别效率最高。对扩增出的67条带进行聚类分析,结果表明,普通核桃和枫杨亲缘关系较远,不同地域起源的品种界限不明显。 相似文献
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【目的】‘粤秀 3 号’黄瓜具有生长势强、产量高、抗病及抗逆性强的特点，是华南地区推广面积较多的品种，本研究以期为其建立一套快速、准确、有效的种子纯度鉴定方法。【方法】利用 200 对 SSR 引物，根据杂种带为父母本互补带型的原则，对‘粤秀 3 号’黄瓜及其亲本进行特异性 SSR 标记物的筛选。将种子纯度鉴定结果与田间生物学鉴定结果进行比较，鉴定所筛选 SSR 引物的准确性。选取‘中农 108’‘园丰 6 号’‘津绿 5 号’‘中农 8 号’‘津研四号’5 个黄瓜品种种子及其他 49 份黄瓜种质材料，与‘粤秀 3 号’黄瓜品种同时检测，对所筛选的 SSR 引物特异性进行鉴定。【结果】从 200 对引物中筛选出符合父母带间成互补带要求的两对 SSR 引物（3B-10 和 2B-41）。3B-10 引物经 PCR 扩增后产生 160 bp 的母本特异条带（P1-A）及 190 bp 的父本特异条带（P2-B），测序比对这两条特异性条带，发现 P2-B 在 49~79 bp 处比 P1-A 多了 5 个 6 碱基的简单重复序列。2B-41 引物经 PCR 扩增后产生 218 bp 的母本特异条带（P1-C）和 206 bp 的父本特异条带（P2-D），经测序比对后发现，与 P2-D 相比，P1-C 在 120~131 bp 处有 12 个碱基的缺失。表明两对 SSR 引物均可有效区分‘粤秀 3 号’杂交种子及其父母本，可快速准确地鉴定‘粤秀 3 号’黄瓜种子纯度。此外，两对 SSR 引物的种子纯度鉴定结果均与田间生物学鉴定结果一致。两对引物均可有效区分‘粤秀 3 号’黄瓜种子与‘中农 108’‘园丰6 号’‘津绿 5 号’‘中农 8 号’‘津研四号’5 个黄瓜品种种子及其他 49 份黄瓜种质资源。但 3B-10 在 49 份种质资源中多态性较高，故 SSR 标记 2B-41 更适用于‘粤秀 3 号’的真实性鉴定。【结论】3B-10 和 2B-41 两对 SSR 引物可快速、准确、有效地对‘粤秀 3 号’杂交种子纯度进行鉴定，鉴定操作较简单、成本较低，可替代传统杂交种子纯度鉴定的方法，其商业应用价值极高。 相似文献
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通过对数据库中32 295条非冗余的辣椒EST序列进行搜索,发现3 396个SSR分布于3 277条EST序列中,EST-SSR频率为10.52%,平均分布距离为4.46 kb.在辣椒EST-SSR中,二核苷酸和三核苷酸重复基元占主导地位,分别占总SSR的43.02%和37.84%.优势重复基元为GA/TC、AG/CT和AT,分别占15.99%、11.98%和11.37%.用Primer Premier 5.0软件设计了420对引物,对辣椒抗疫病自交系‘B072’和感疫病自交系‘B088’进行PCR扩增,403对引物有扩增产物,引物有效扩增率为95.96%,其中76对引物有多态性,多态性引物占可扩增引物的18.86%.试验证明,利用辣椒EST序列开发SSR标记是可行的. 相似文献
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观赏及砧木用苹果品种的SRAP-PCR反应体系优化及其多态性检测 总被引：1，自引：0，他引：1
通过建立和优化PCR扩增体系,开展观赏及砧木用苹果品种的SRAP分子标记遗传多样性研究,根据所获得的多态位点探究不同材料间的亲缘关系。研究结果表明SRAP-PCR最佳反应体系为(20μL):模板DNA30ng,1×Buffer,Mg2+1.5 mmol/L,dNTP 0.3 mmol/L,引物各0.4μmol/L,TaqDNA聚合酶1.0 U。应用筛选出的12对多态性丰富的SRAP引物组合对8个观赏和砧木用苹果品种进行遗传多样性分析,共得到97条扩增谱带,其中多态性谱带78条,多态性比率80.4%,平均每个引物组合产生6.5个多态性位点,供试材料间遗传变异相对丰富。运用NTSYS软件中的UPGMA算法分析,各材料的遗传相似系数为0.62~0.92。树状图中,芭蕾苹果‘舞乐’、‘舞佳’聚为同组,遗传变异较小;砧木种质‘CX3’、‘CX5’遗传差异相对较大;‘秋幸’、‘秋实’具有较近的遗传关系。此研究结果可为观赏及砧木用苹果种质资源的品种鉴定及分子标记辅助育种提供参考。 相似文献
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利用同工酶和RAPD技术分析辣椒杂种优势 总被引：2，自引：0，他引：2
采用POD同工酶和RAPD技术对辣椒7个亲本和6个杂交组合进行遗传差异和亲缘关系的研究,结果表明：不同辣椒品系扩增出4～7条POD同工酶带,其中相同酶带在部分材料间表现的强弱有所不同;经聚类分析,可把13个不同辣椒品系分为6个大类。经RAPD扩增,10条引物共扩增出103条带,平均每个引物10．3条;13个不同辣椒品系可分为7个大类,其中有4组与同工酶的分类相同。因此,POD同工酶技术和RAPD技术都可进行辣椒杂种优势的划分且可以互补,但RAPD标记检测的多态性要高于POD同工酶标记。 相似文献
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【目的】以7份选育出的观赏桃新种质和15份市面上常见桃品种的叶片为试验材料,通过简单重复序列（SSR）分子标记对其遗传多样性及亲缘关系进行分析鉴定,旨在探讨新种质与市面上常见桃品种的种间遗传距离与亲缘关系,为观赏桃起源演化、开发利用和亲本选配提供参考。【方法】利用36对引物进行TP-M13-SSR PCR扩增以及荧光毛细管电泳检测,并对扩增产物的扩增效率及引物多态性进行分析。对7份观赏桃新种质‘T20’、‘T22’、‘T28’、‘T10’、‘T13’、‘T9-1’、‘早花’与15份已有常见桃品种的亲缘关系进行鉴定,利用6个SSR位点构建22份观赏桃种质资源的指纹图谱,进行Neighbor-Joining聚类并结合表型性状开展综合分析。【结果】36对引物中筛选得到25对高多态性引物,共检测到183个多态性等位基因和98.396个有效等位基因,观察杂合度平均值为0.341,预期杂合度平均值为0.739,Shannon’s信息指数平均值为1.546,引物多态性信息指数平均值为0.683,介于0.510～0.841之间。新种质‘T20’和‘T10’与已有‘台阶’品种相似系数最大,分别为0.95... 相似文献
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【目的】‘汇丰 2 号’辣椒为杂交一代新品种，具有中早熟、抗病性强、耐储运和品质佳等特性，深受农户和消费者喜爱。为保障种子质量，拟建立一套快速、简便的种子纯度和真实性鉴定方法。【方法】基于辣椒基因组已公开的 SSR 分子标记资源，以‘汇丰 2 号’父、母本为材料，筛选多态明显、条带清晰且扩增稳定的 SSR 标记，对‘汇丰 2 号’杂交种子进行纯度鉴定，并结合田间形态鉴定验证分子标记鉴定的准确性。此外，利用筛选出的 SSR 标记对‘粤红 1 号’、‘汇丰 1 号’、‘汇丰 2 号’和‘汇丰 5 号’4 个品种进行真实性鉴定。【结果】筛选出 2 个 SSR 标记 L0143 和 L0622，其多态明显，且条带清晰、扩增稳定。其中，标记L0143 在母本 W2280 中 PCR 扩增条带为 149 bp，在父本 W2102 中的扩增条带为 141 bp；标记 L0622 在母本和父本中的扩增条带分别为 208 bp 和 196 bp。2 个标记单独使用时均可以准确鉴定‘汇丰 2 号’种子纯度，且 2个标记同时使用可以将‘粤红 1 号’、‘汇丰 1 号’、‘汇丰 2 号’和‘汇丰 5 号’4 个品种区分开，即可鉴定它们的真实性。【结论】筛选出的 SSR 分子标记 L0143 和 L0622 能够快速、准确、低成本、有效的对‘汇丰 2 号’杂交种子进行纯度和真实性鉴定，该鉴定方法操作简单，能够替代传统杂交种子纯度和真实性鉴定的方法，具有较高的商业应用前景。 相似文献
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AFLP技术对梅花杂交种的快速鉴定 总被引：5，自引：1，他引：5
应用银染法AFLP鉴定以父本‘多萼朱砂”与母本‘雪梅’杂交所得 12株F1 子代。以E AT +P AT选择性引物对扩增 ,父本 180bp的特异带在 12株F1 代中都呈阳性带 ;母本 170bp和 171bp两条特异带在 12株F1 代中也都呈阳性带 ,双亲基因组DNA中这 3个特异位点在F1 子代中稳定遗传。结果表明 ,这 12株均为‘多萼朱砂’ב雪梅’的F1 子代 ,AFLP是适合梅花亲子鉴定的简便技术。AFLP对梅花杂交选育新品种的早期选择具有应用前景。 相似文献