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试验旨在研究围脂滴蛋白2（PLIN2）基因在秦川肉牛皮下脂肪组织中的表达情况及基因多态性与肉质性状的关联分析。采用实时荧光定量PCR检测PLIN2基因mRNA在不同月龄（6~60月龄）秦川肉牛皮下脂肪组织中的表达情况;选取18~24月龄的健康秦川肉牛536头,采集血样并测定肉质性状指标,研究PLIN2基因单核苷酸多态性（SNP）和氨基酸突变,并与秦川肉牛肉质性状进行关联分析。结果发现,PLIN2基因在秦川肉牛皮下脂肪组织中的表达量呈先上升后下降趋势,18月龄时表达量最高。测序共发现9个SNPs位点,其中g.C7919>T位点不同基因型肌内脂肪含量差异显著（P<0.05）,CT基因型显著高于TT和CC基因型;g.C7933>T位点不同基因型背膘厚及肌内脂肪含量均呈显著差异（P<0.05）,CC和CT基因型个体背膘厚显著高于TT基因型,CT基因型个体肌内脂肪含量显著高于TT和CC基因型;g.G8015>C位点CC基因型个体肌内脂肪含量显著高于GG和GC基因型（P<0.05）;3'UTR区域g.T8496>C位点TC基因型个体肌内脂肪含量显著高于CC和TT基因型（P<0.05）;g.C8578>T位点TT基因型个体背膘厚显著高于CT和CC基因型（P<0.05）。综上,PLIN2基因对秦川肉牛肉质性状发育有一定影响,可作为秦川肉牛现代分子选育的候选参考基因。 相似文献
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秦川牛及其杂种牛生长性能及杂种优势研究 总被引：6，自引：0，他引：6
通过对4月龄纯种秦川牛(QQ)67头,安秦杂种牛(红安格斯牛♂×秦川牛♀,AQ)36头、德秦杂种牛(德国黄牛♂×秦川牛♀,DQ)14头和利秦杂种牛(利木赞牛♂×秦川牛♀,LQ)47头,共计164头牛生长发育性状特点及杂种优势的研究,发现LQ、DQ、AQ与QQ相比,在体重、体长、体高、胸围、十字部高等重要指标上具有明显的杂种优势。初步鉴定3个杂交组合后代在生长性能方面优于秦川牛纯种,表现杂种优势,达到改良目的。其中LQ与其他两个杂交群体相比,在生长发育过程中表现出更好的发育趋势,即LQ>DQ>AQ>QQ,是较为理想的杂交组合,而AQ和DQ群体在后期发育和被毛颜色上有不可替代的优越性。 相似文献
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本研究旨在黄牛中检测GBP2基因的拷贝数变异及其遗传效应分析。运用实时定量荧光PCR(q PCR)技术,分别在80头秦川牛和30头郏县红牛个体中检测GBP2基因2个拷贝数变异CNV1和CNV2,并对GBP2基因这2个拷贝数变异与黄牛的生长性状进行关联分析。结果表明:GBP2基因拷贝数在秦川牛和郏县红牛中均存在Gain(拷贝数增加)、Median(拷贝数正常)和Loss(拷贝数缺失)3种类型;关联分析发现,GBP2基因拷贝数变异对秦川牛体长、体高和体重等几个重要性状的影响差异显著(P0.05),其中CNV1和CNV2均表现为Loss/Median型在生长性状上优于Gain型;在郏县红牛中CNV1为Loss型的个体在腰角宽和坐骨端宽性状上显著强于Gain/Median型,CNV2则在体高上表现为Loss型优于Median型(P0.05)。因此,GBP2基因的拷贝数变异CNV1和CNV2均与生长性状显著相关,可作为秦川牛和郏县红牛的生长性状辅助选择分子标记之一。 相似文献
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PLIN基因多态性与秦川牛胴体、肉质性状的相关性研究 总被引：3，自引：0，他引：3
旨在研究PLIN基因第3、4外显子多态性与秦川牛部分产肉性状的关系。以相同饲养条件下18~24月龄的405头秦川牛为研究对象,利用PCR-SSCP方法和测序技术,对PLIN基因第3、4外显子进行SNPs位点检测,并将发现的SNPs位点与部分产肉性状进行关联性分析。结果,在第3外显子的156 bp处发生T→C突变,第4外显子的14 bp处发生C→T突变。方差分析表明:AB基因型个体的宰前活体质量、胴体质量、背膘厚和眼肌面积显著高于AA和BB基因型个体(P0.05),而且相对于AA基因型个体达到差异极显著水平(P0.01);DE基因型个体的胴体长、胴体胸深和背膘厚显著高于DD和EE基因型个体(P0.05),DD基因型个体的肌肉嫩度极显著高于EE和DE基因型个体(P0.01)。研究显示,PLIN基因单核苷酸多态性对秦川牛脂肪沉积有一定的影响,可作为影响胴体和肉质的候选基因,指导肉牛的育种工作。 相似文献
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试验旨在利用生物信息学方法对秦川牛肉用新品系(以下简称“秦川肉牛”)AdipoR1、AdipoR2基因的CDS区进行克隆及分析,并探究其在秦川肉牛不同组织及肌细胞诱导分化不同时间的表达情况。以秦川肉牛为研究对象,经PCR扩增得到AdipoR1、AdipoR2基因CDS区序列,运用生物信息学软件对其功能结构进行预测,同时采用实时荧光定量PCR术获得AdipoR1、AdipoR2基因在秦川肉牛15个组织和诱导分化后不同时间的表达量,再进行差异分析。结果显示,秦川肉牛AdipoR1基因编码序列全长为1128 bp,编码375个氨基酸,蛋白分子质量为42446.41 u,理论等电点为6.70,AdipoR1蛋白二级结构主要由α-螺旋构成,二、三级结构预测结果一致,属于亲水性蛋白,没有信号肽位点;AdipoR2基因编码序列全长1161 bp,编码386个氨基酸,蛋白分子质量为43707.70 u,理论等电点为6.27。亚细胞定位结果表明,AdipoR1蛋白有60.9%的可能定位在细胞膜,AdipoR2蛋白有73.9%的可能定位在细胞膜。不同物种氨基酸系统进化树结果显示,秦川肉牛AdipoR1、AdipoR2基因编码的氨基酸序列分别与瘤牛和野牦牛的亲缘性最近。实时荧光定量PCR结果显示,AdipoR1、AdipoR2基因在秦川肉牛心脏、肝脏、肌肉等15个组织中均有表达,且在肌肉组织中的表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01),在肌细胞诱导分化时序上也有明显差异。本试验揭示了AdipoR1和AdipoR2基因在秦川肉牛不同组织和肌细胞诱导分化后不同时间上的表达差异,以期为进一步探究AdipoR1、AdipoR2基因的生物学功能与调控机理奠定基础。 相似文献
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X Wang Z Ju J Huang M Hou L Zhou C Qi Y Zhang Q Gao Q Pan G Li J Zhong C Wang 《Veterinary immunology and immunopathology》2012,148(3-4):311-319
Mannose-binding lectin (MBL), a calcium-dependent collagenous lectin, plays an important role in the host immune defence against a wide range of pathogens. There are MBL1 and MBL2 genes which encode the MBL-A and MBL-C proteins, respectively. This study was carried out to investigate the relationship between the variants of the bovine MBL2 gene and milk production traits, mastitis, serum MBL-C levels and hemolytic complement activity in both classical pathway (CH50) and alternative pathway (ACH50) in Chinese Holstein cattle. Four single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in the exon 1 of the MBL2 gene in Chinese Holstein cattle and Luxi yellow cattle were identified by the direct sequencing method. The SNP g.201 G>A was identified as a non-synonymous mutation (codon 31, Arg>Gln) at the N-terminus cysteine-rich domain and the SNPs g.234 C>A and g.235 G>A (codon 42) made Pro to Gln at the 1st Gly-X-Y repeat of the collagen-like domain, while the SNP g.244 T>C (codon 45) was identified as a synonymous mutation (Asn>Asn) at the 2th Gly-X-Y repeat of the collagen-like domain. The SNP markers (g.201 G>A, and g.234 C>A) were significantly correlated with somatic cell score (SCS) (P<0.05). The concentration of MBL-C protein in serum ranges from 0.8 to 7.4μg/mL by enzyme-linked immunosorbent assay. Six combinations of different haplotypes from the four SNPs were identified in Chinese Holstein cattle. Statistical analysis revealed that cows with the haplotype combination H4H5 exhibited the lowest SCS. The CH50 value of H4H5 and H5H5 cow are significantly higher than H2H5 haplotype combination (P<0.05). The association analysis results showed that the haplotype combination H4H5 may be used as a tolerance haplotype combination for the bovine mastitis. 相似文献
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试验以CCAAT增强子结合蛋白A(CEBPA)为候选基因,采用直接测序的方法寻找秦川牛CEBPA基因SNP,筛查到一个新的多态位点T963G,该突变位于基因的编码区。运用PCR-RFLP方法验证并分析该位点在215头秦川牛群体中的多态性。结果表明:在秦川牛群体中分布A、B 2个等位基因,处于中度多态。经过χ2适合性检验,秦川牛群体在该位点达到Hardy-Weinberg平衡状态(P0.05)。将该T963G位点的基因型与体尺、胴体性状进行关联分析,表明该位点与胴体重显著相关(P0.05),BB为有利基因型,B等位基因为有利等位基因,提示该位点有可能作为秦川牛胴体性状标记辅助选择的标记之一。 相似文献
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试验旨在利用生物信息学方法对秦川牛肉用新品系（以下简称"秦川肉牛"）AdipoR1、AdipoR2基因的CDS区进行克隆及分析，并探究其在秦川肉牛不同组织及肌细胞诱导分化不同时间的表达情况。以秦川肉牛为研究对象，经PCR扩增得到AdipoR1、AdipoR2基因CDS区序列，运用生物信息学软件对其功能结构进行预测，同时采用实时荧光定量PCR术获得AdipoR1、AdipoR2基因在秦川肉牛15个组织和诱导分化后不同时间的表达量，再进行差异分析。结果显示，秦川肉牛AdipoR1基因编码序列全长为1 128 bp，编码375个氨基酸，蛋白分子质量为42 446.41 u，理论等电点为6.70，AdipoR1蛋白二级结构主要由α-螺旋构成，二、三级结构预测结果一致，属于亲水性蛋白，没有信号肽位点；AdipoR2基因编码序列全长1 161 bp，编码386个氨基酸，蛋白分子质量为43 707.70 u，理论等电点为6.27。亚细胞定位结果表明，AdipoR1蛋白有60.9%的可能定位在细胞膜，AdipoR2蛋白有73.9%的可能定位在细胞膜。不同物种氨基酸系统进化树结果显示，秦川肉牛AdipoR1、AdipoR2基因编码的氨基酸序列分别与瘤牛和野牦牛的亲缘性最近。实时荧光定量PCR结果显示，AdipoR1、AdipoR2基因在秦川肉牛心脏、肝脏、肌肉等15个组织中均有表达，且在肌肉组织中的表达量最高，极显著高于其他组织（P<0.01），在肌细胞诱导分化时序上也有明显差异。本试验揭示了AdipoR1和AdipoR2基因在秦川肉牛不同组织和肌细胞诱导分化后不同时间上的表达差异，以期为进一步探究AdipoR1、AdipoR2基因的生物学功能与调控机理奠定基础。 相似文献
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XUAN Jun-li MA Xiao-meng YUAN Ze-hu HU Shi-jin WANG Hui-hua WEI Cai-hong ZHAO Fu-ping ZHANG Li DU Li-xin 《中国畜牧兽医》2016,43(8):2081-2094
This study was aimed to investigate the distribution of genetic polymorphism of taste receptor family 1 member (T1R) gene between Ujimqin sheep and Hu sheep.DNA pools direct sequencing method and MALDI-TOFMS method were used to analyze genetic variation of T1R genes in 172 sheep of two Chinese sheep strains of Mongolian,and bioinformatics software predicted what impact polymorphic loci had to mRNA and protein secondary structure of T1R gene.The results showed that 9 SNPs were screened in T1R gene of two groups.Chi-square test for independence was taken to find the genotypes of the 5 SNPs which were significantly different between two sheep population(P<0.05),SNP2 located in TAS1R1 gene,SNP4,SNP7 and SNP8 located in TAS1R2 gene,SNP10 located in TAS1R3 gene.SNP2,SNP7 and SNP10 were silent mutations.SNP2 and SNP10 lead to corresponding gene mRNA secondary structure and the minimum free energy change,while the SNP7 only lead to the minimum free energy changes.SNP4 and SNP8 were missense mutations,the two missense mutations respectively led to asparagine(Asn) into serine (Ser),threonine (Thr) into methionine (Met),and according to online software forecast,the protein secondary structure of TAS1R2 gene all changed in mutations before and after. 相似文献
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皮埃蒙特牛与秦川牛杂交效果试验报告 总被引：2，自引：1，他引：1
为提高秦川牛生长发育和产肉性能,引进意大利著名肉牛品种皮埃蒙特牛与非保种我秦川牛进行杂交试验。并与同期同龄的短角红牛、利水赞牛杂种后代进行比较。试验结果表明,皮秦Ｆ１生长发育,产肉性能明显优于秦川牛、杂交效果也好地短角牛和利木赞牛的杂交后代。 相似文献
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Identification of leptin gene polymorphisms associated with carcass traits and fatty acid composition in Japanese Black cattle 
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下载免费PDF全文 Fuki Kawaguchi Kazuki Okura Kenji Oyama Hideyuki Mannen Shinji Sasazaki 《Animal Science Journal》2017,88(3):433-438
Previous studies have indicated that some leptin gene polymorphisms were associated with economically important traits in cattle breeds. However, polymorphisms in the leptin gene have not been reported thus far in Japanese Black cattle. Here, we aimed to identify the leptin gene polymorphisms which are associated with carcass traits and fatty acid composition in Japanese Black cattle. We sequenced the full‐length coding sequence of leptin gene for eight Japanese Black cattle. Sequence comparison revealed eight single nucleotide polymorphisms (SNPs). Three of these were predicted to cause amino acid substitutions: Y7F, R25C and A80V. Then, we genotyped these SNPs in two populations (JB1 with 560 animals and JB2 with 450 animals) and investigated the effects on the traits. Y7F in JB1 and A80V in JB2 were excluded from statistical analysis because the minor allele frequencies were low (< 0.1). Association analysis revealed that Y7F had a significant effect on the dressed carcass weight in JB2; R25C had a significant effect on C18:0 and C14:1 in JB1 and JB2, respectively; and A80V had a significant effect on C16:0, C16:1, C18:1, monounsaturated fatty acid and saturated fatty acid in JB1. The results suggested that these SNPs could be used as an effective marker for the improvement of Japanese Black cattle. 相似文献
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牛MyoD1基因遗传变异及其对胴体性状的影响 总被引：5，自引：1，他引：5
运用DNA池快速测序法寻找牛MyoD1基因SNPs，筛查到1个新的多态位点C1867T，该位点C-T突变引起甘氨酸/丝氨酸的转变。运用PCR RFLP法验证并分析该位点在不同群体间的多态性, 并与相应牛群体的胴体性状进行关联分析。结果显示，中国西门塔尔牛、鲁西牛群体的C1867T位点的突变达到了Hardy-Weinberg 平衡状态，而秦川牛未达到平衡状态。不同基因型对肉牛的背膘厚、大腿肉厚的影响差异极显著或显著(P<0.01或P<0.05)，对日增重、屠宰率、肌间脂肪、大理石花纹、嫩度的影响差异不显著。 相似文献
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为了探讨绵羊味觉受体第一家族（taste receptor family 1 member,T1R）基因外显子多态性及其基因型在乌珠穆沁羊和湖羊群体中分布的差异性,试验采用DNA池直接测序及飞行时间质谱（MALDI-TOFMS）法对中国蒙古系两个绵羊品种共172个个体T1Rs基因外显子的遗传变异情况进行分析,利用生物信息学软件预测多态位点对T1Rs基因mRNA二级结构和蛋白质二级结构的影响。结果表明,在两个群体的T1R家族基因中筛查到9个SNPs。独立性卡方检验显示有5个多态位点基因型的分布在两个绵羊群体中存在显著性差异（P<0.05）,分别为TAS1R1基因上的SNP2,TAS1R2基因上的SNP4、SNP7和SNP8,TAS1R3上的SNP10,其中,SNP2、SNP7和SNP10为同义突变;SNP2和SNP10导致相应基因mRNA二级结构和最小自由能的改变,而SNP7仅导致TAS1R2基因最小自由能发生改变;SNP4和SNP8为错义突变,分别导致TAS1R2蛋白质中第379位天冬酰胺变为丝氨酸和第701位苏氨酸变成蛋氨酸,且突变前后受体蛋白的二级结构均发生改变。 相似文献
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Growth hormone-releasing hormone (GHRH) is secreted by the hypothalamus and stimulates growth hormone (GH) released from the pituitary. Mutations detected in GHRH gene showed associations with animal production traits. The purpose of this study was to investigate the association of the GHRH gene with growth traits in Chinese native cattle. PCR-SSCP and sequencing were used to detect mutations of the GHRH gene in this study. One novel mutation 4251nt (C>T) was found and the frequencies of C allele were 0.8778 and 0.8476 for Qinchuan and Nanyang cattle, respectively. Body weight with the CT genotype was significantly higher (P<0.05 or P<0.01) than those with CC genotype for different growth periods (6, 12, 18, and 24 months old) in Nanyang cattle. Our findings suggested that polymorphism in bovine GHRH might be one of the important genetic factors to influence body weight. 相似文献
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试验旨在揭示ACTC1基因在秦川牛中的时空表达规律，为进一步研究ACTC1基因在肉牛肌肉发育和脂肪沉积等方面的功能奠定基础。利用实时荧光定量PCR技术检测了ACTC1基因在24月龄成年秦川牛13种组织和4日龄新生秦川牛12种组织中的表达规律，同时研究分析了该基因在秦川牛成肌细胞和前体脂肪细胞不同分化阶段（0、2、4、6、8 d）的表达特性。结果显示，ACTC1基因在秦川牛心脏中的表达量最高，骨骼肌中次之；除瘤胃和肾脏外，24月龄成年牛各组织中的表达量显著或极显著高于4日龄新生牛（P<0.05；P<0.01）；ACTC1基因在成肌细胞中的表达随着分化程度的增加呈现先升高后降低的趋势，在成肌细胞分化第2、4、6和8天ACTC1基因的表达量与第0天相比差异极显著（P<0.01），分别是第0天的2.6、4.7、5.6和4.2倍，这与成肌细胞的分化速率一致；在脂肪细胞中ACTC1基因的表达趋势为先降后升，第2、4天的表达量与第0天相比差异极显著（P<0.01），从分化第2天开始表达量随脂肪细胞分化程度增加而增加。ACTC1基因在不同年龄牛肌肉组织（心肌和骨骼肌）中的表达量最高，且其表达特性与肌细胞分化整体趋势一致；另外，ACTC1基因在脂肪细胞中的表达也有一定的规律。综上所述，推测ACTC1基因可能会影响牛肌肉组织的生长发育和脂肪沉积。 相似文献
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为了探究PRL基因多态性与鸡产蛋性能的相关性,试验以95只百宜黑鸡为研究对象,利用PCR扩增技术结合直接测序方法对鸡PRL基因SNP位点进行筛选.结果:在试验群体中找到4个SNPs,分别为g.6171 C>T、g.6232 C>G、g.6306 C>T、g.6440 T>C,且4个SNPs均处于第5外显子,g.6171 C>T和g.6232 C>G位点之间属于完全连锁平衡;χ2检验发现,该基因座的位点并不处于Hardy-Weinberg平衡状态;遗传参数分析发现,除了g.6306 C>T属于低度多态,其余位点均属于中度多态;关联分析表明,各SNP位点与产蛋性能之间不存在显著相关关系(P>0.05). 相似文献