高蛋白栽培大豆品种遗传多样性的SSR分析     

胡根海  张志勇  王清连  陈全求 《湖北农业科学》2009,48(1)

利用47对SSR引物对我国80份高蛋白栽培大豆的遗传多样性进行了分析.结果表明,47对SSR引物在上述品种中共检测到309个等位变异.平均为6.57个:引物遗传多样性指数在0.279 6～0.8694之间,平均为0.639 0;品种间遗传相似系数变异在0.102～0.150之间,说明高蛋白大豆中存在丰富的遗传变异.利用品种间的遗传相似系数进行聚类分析.结果可将80份材料分为5个类群,其类群分布表现出一定的地域相关性.  相似文献   

用SSR标记分析高油栽培大豆品种的遗传多样性     

胡根海  胡海燕 《江西农业大学学报》2008,30(4)

利用47 对SSR 引物对我国56份高油栽培大豆的遗传多样性进行分析.结果表明: 47对SSR引物在上述品种中共检测到289个等位变异,平均6.15个;引物遗传多样性指数在0.223 9～0.858 7,平均0.667 9;品种间遗传相似系数变异在0.117～0.926,说明高油大豆中存在丰富的遗传变异.利用品种间的遗传相似系数进行聚类分析结果可将56份材料分为6个类群, 其类群分布表现出一定的地域相关性.  相似文献   

利用SRAP和SSR标记对汉中地区主要油菜品种的遗传多样性分析     

《四川农业大学学报》2013,(4):370-376

【目的】掌握陕西省汉中地区主要推广油菜品种的遗传多样性,了解其遗传背景,明确各品种间的亲缘关系,为油菜育种提供理论依据。【方法】利用24对有多态性的SRAP标记和17对SSR标记,PCR扩增采用复性变温法,对34份陕西省汉中地区主要推广的油菜品种资源进行遗传多样性分析。【结果】2种不同的复性温度都取得了好的扩增条带,SRAP标记共检测到145个等位变异,平均每个标记检测到6个等位变异,每个SRAP位点的遗传多态性信息含量在0.19⁰.74之间,平均值为0.48。供试材料的遗传相似系数集中在0.560.74之间,平均值为0.48。供试材料的遗传相似系数集中在0.56⁰.94之间。SSR标记共检测到99个等位变异,平均每个标记检测到6个等位变异,每个SSR位点的遗传多态性信息含量在0.120.94之间。SSR标记共检测到99个等位变异,平均每个标记检测到6个等位变异,每个SSR位点的遗传多态性信息含量在0.12⁰.74之间,平均值为0.40,遗传相似系数集中在0.620.74之间,平均值为0.40,遗传相似系数集中在0.62⁰.91之间。【结论】SRAP标记的遗传多态性比SSR标记高,SRAP标记聚类更接近系谱分析。陕西省汉中地区主要推广的油菜品种遗传相似度较高,亲缘关系较近。  相似文献   

基于SSR标记的小粒大豆品种(系)遗传多样性分析     

卢婧妍  胡刘涛  赵洪锟  刘晓冬  袁翠平  齐广勋  王玉民  董英山 《吉林农业科学》2021,46(3):27-33

为了解东北地区小粒大豆品种(系)的遗传多样性特点,利用21对SSR引物对来自东北不同地区来源的44份小粒大豆品种(系)进行遗传多样性分析.结果表明,供试的44份东北地区小粒大豆品种(系)共检测到115个等位变异,平均每个位点等位变异数5.5个,等位变异数在3～11个之间,多态性信息含量指数(PIC)在0.309 1～0.8157之间,平均为0.629 7.利用6对高多态性的SSR引物构建了 44份小粒大豆品种(系)的指纹图谱,可以有效区分44份小粒大豆材料.44份小粒大豆品种(系)间的遗传相似系数变异范围为0.25～0.95,聚类分析结果表明44份小粒大豆材料可以分为5个类群,可以反映不同来源的小粒大豆品种(系)间的亲缘关系,可为小粒大豆遗传改良提供参考.  相似文献   

贵州省区试小麦品系遗传多样性的SSR标记研究   总被引：9，自引：0，他引：9  

徐如宏  任明见  杨英苍  张庆勤 《山地农业生物学报》2005,24(1):12-16

采用微卫星分子标记(SSR)对贵州省2001～2003年参加省和高海拔区试的30个小麦品系的遗传多样性进行了研究。结果表明,12对引物共检测到37个等位位点,每对引物等位位点数为1～8个,平均为3．08个。聚类分析表明,品种间遗传相似系数(Gs)变异范围为0.048～0.346,平均值为0．197,SSR标记能将全部品系区分开来,30个小麦品系可分为5类。研究表明SSR分子标记在鉴别品种和品种遗传多样性方面具有重要作用。  相似文献   

汕油系列和粤油系列花生品种遗传多样性的SSR标记分析   总被引：5，自引：1，他引：5  

刘冠明  郑奕雄  陈建萍  麦俊伟  黎国良 《安徽农业科学》2006,34(11):2338-2339,2345

利用19对SSR标记引物对汕油系列和粤油系列的15个主要品种进行了遗传多样性分析,结果表明:有6对标记引物扩增出多态性,在15个品种间共检测到18个多态性等位点,每对引物分别检测出2~4个等位点变异,平均为3.0个,6个标记的多态性信息含量(PIC)在0.124~0.622;品种间的遗传相似系数在0.167~0.833,大部分品种间的遗传相似系数大于0.5;以遗传相似系数0.535为界,15个品种聚为4类。  相似文献   

福建省春大豆地方品种遗传多样性分析     

李明松  吴俐  吕美琴  康蓉蓉  王金线  曾红英 《福建农业学报》2014,29(6)

采用表型和SSR标记对23份福建省春大豆地方品种进行遗传多样性分析,结果表明:17个性状的平均变异系数为26.56％,平均多样性指数为1.29,聚类分析将23份种质资源聚为3大类;SSR分子标记分析,23份种质中共检测到163个等位变异,平均每个位点的等位变异系数为3.26,有效等位变异系数为2.286.PIC变幅为0.131 8～0.728 5,平均值为0.454 9.Shannon-Weaver指数平均值为0.899 5,成对相似系数范围为0.1944～0.725 2,平均相似系数为0.450 9,基于SSR分子标记结果的聚类也将23份材料聚为3大类,聚类结果与地理来源没有明显相关性.  相似文献   

谷子种质资源遗传多样性研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

孙加梅  王雪梅  王东建  杨延兵  李华  段丽丽  王晓宇  张晗 《山东农业科学》2013,45(3):33-37,60

利用谷子基因组序列开发出SSR引物205对,其中171对可以稳定扩增出目的条带,149对有多态性。利用30个多态性SSR标记对41份谷子种质资源进行遗传多样性分析,共检测出291个等位变异,平均每个位点9.7个。谷子地方品种基因多样性指数平均为0.7907,育成品种基因多样性指数平均为0.7571。对41个谷子品种进行聚类,在遗传相似系数为0.164时聚为6组,与生态型基本一致。  相似文献   

吉林省主推中晚熟期玉米品种遗传多样性分析（摘要）   总被引：1，自引：0，他引：1  

付玉芹  隋光磊  关淑艳  江源  孙靖然  李鲁华  王丕武 《农业科学与技术》2010,11(7):33-37

[目的]应用SSR分子标记研究吉林省主推中晚熟期玉米品种的遗传多样性。[方法]通过10对引物对供试材料进行扩增,并用聚丙烯凝胶电泳进行检测。[结果]10对SSR引物在供试材料中共检测出110个等位基因变异,每对SSR引物检测出的等位基因数为4～17个,平均每个位点11个,每个SSR位点的PIC变化范围在0.63～0.93之间,平均0.842。43个玉米杂交种之间的遗传相似系数变化范围为0.664～0.918,平均为0.774,其中样本间遗传相似系数在0.85以上的共有30个。结合聚类分析和各品种的谱系来源,结果表明43份吉林省主推中晚熟期玉米品种的遗传相似性相对较大。[结论]吉林省中晚熟期种质资源相对狭窄,有待于进一步引种创新。  相似文献   

利用SSR标记对陕西地方桑树品种的遗传多样性分析     

楚渠  彭云武 《陕西农业科学》2015,(6):17-20

应用SSR分子标记技术分析了55份陕西地方桑树种质资源的遗传多样性,结果表明,28对SSR引物在55份桑树品种中共扩增出261条带,多态性比率为100%;55份桑树品种间的遗传相似系数变异范围为0.6398~0.9655,平均遗传相似系数为0.8027。采用UPGMA法对55份桑树品种的遗传关系进行聚类分析,供试材料被分成3个大类。结果显示,供试桑树种质材料的亲缘关系与地理分布不存在关联。  相似文献   

长江流域片国家区试大豆品种分子ID构建及遗传多样性分析     

何琳  何艳琴  刘业丽 《黑龙江八一农垦大学学报》2014,(3):5-9

以长江流域片国家区域试验的45份大豆品种为材料,选择分布在大豆基因组8个连锁群的13对SSR标记进行分子ID构建及遗传多样性分析。结果表明:利用Satt138、Satt514、Satt231、Satt380、Satt442和Satt369这6对引物可以将45个参试大豆品种区分开,并获得唯一的分子ID;参试大豆品种间遗传相似系数为0~1.00,平均相似系数为0.442 4,结果说明长江流域片国家区试大豆品种间遗传同源性较小,差异性较大。  相似文献   

我国北方地区花生品种的遗传多样性分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

王金彦  潘丽娟  杨庆利  禹山林 《中国农业科技导报》2009,11(6):43-49

利用SSR分子标记对我国北方地区育种品种以及区试品种共计68个栽培花生品种进行遗传多样性分析,结果表明,104对SSR引物中有15对在品种间存在多态,多态率为14.4%,平均每个标记产生3.8个位点。15对引物的多态信息量在0.397~0.667之间。山东地区花生品种的遗传多样性要高于我国北方其他地区供试品种。小粒组品种的遗传多样性要略高于大粒组品种。聚类分析表明我国北方68个育成和区试品种的遗传相似系数在0.64~0.91之间,分成两个大类,第一个大类可分成四小类,其中第三小类又可以分成六个亚类。这些结果表明我国北方地区现有育成和区试品种的遗传多样性较低,为拓宽花生育种的遗传基础,应从中发掘出有利用价值的品种。  相似文献   

晋大78~(60)Co诱变M_5代的遗传变异分析     

杨凯敏  李贵全  郭数进  薛云云 《天津农业科学》2014,(7):11-15

为分析辐射诱变对拓宽大豆种质资源遗传基础的作用,以晋大78及其经60Co辐射处理产生的66份M5代群体为材料,利用60对SSR引物进行遗传多样性分析。结果表明:18对筛选出的引物共检测到45个等位变异,平均每个等位变异数为2.5,不同位点的等位变异数为2～6个;多态信息量的变幅为0.058～0.760,平均每个引物的多态信息量是0.359;Shannon's指数范围为0.134～1.642,平均值=0.581;M5代群体与未辐射的晋大78之间的遗传相似系数的变幅为0.625～1.000。在遗传相似系数GS=0.72处,可将材料分为三大类。诱变后代中47份诱变后代材料诱变成功,与晋大78之间的相似系数GS小于1。诱变成功的材料遗传多样性丰富,与晋大78差异明显。  相似文献   

基于SSR标记的桃品种遗传多样性分析及遗传相似系数比较     

叶宇芸  王清明  马建伟  张银平  陈其阳  汤浩茹  张勇 《华南农业大学学报》2017,38(3):39-45

【目的】利用NCBI数据库中桃的EST信息开发SSR引物,分析成都平原主栽桃品种的遗传多样性,探讨各遗传相似系数在桃SSR分析中的适用性,以期为桃种质资源的研究提供参考。【方法】利用来自NCBI-EST数据库的100对SSR引物对12个不同形态的桃品种进行PCR扩增,分析筛选20对多态性好、稳定性高且均匀分布于桃8个连锁群的引物对40个桃品种进行PCR扩增,并采用5个遗传相似系数分别对扩增结果进行分析。【结果】使用20对引物共检测出68个多态性等位基因位点,每对引物的等位基因数在2~5之间,平均为3.4。多态信息含量在0.36~0.73间变化,平均为0.54。Jaccard相似系数为0.106~1.000;Jaccard系数的共表型相关系数rc最高,为0.772;Dice系数次之,为0.719;Jaccard和Dice系数的系统树一致性最高,CI_c为1。Nei’s基因多样性指数在种级水平上和类群水平上分别为0.603和0.374,相应的Shannon’s信息指数分别为1.041和0.591。40个桃品种在聚类中首先分为观赏桃和食用桃2大类,再细分为各类群,聚类结果与传统系谱基本吻合。【结论】基于NCBI数据库中桃的EST信息开发的SSR引物多态性较好,可用于桃的SSR分析。Jaccard和Dice系数适合桃的SSR分析。桃品种总体遗传多样性较丰富,但水蜜桃品种仍需加强种质创新。  相似文献   

利用SSR标记评价甘蔗品种遗传多样性   总被引：5，自引：0，他引：5  

游建华  吴凯朝  梁俊  方锋学  莫磊兴 《安徽农业科学》2008,36(10):3990-3993

[目的]探讨甘蔗品种的遗传多样性。[方法]利用15对多态性SSR引物对20个广西主栽甘蔗品种的基因组DNA进行分析,研究现代甘蔗品种的遗传亲缘关系及各品种间的遗传距离。[结果]利用15对多态性SSR引物对20个甘蔗品种的基因组DNA进行扩增,共获得185条谱带。平均每个引物扩增出12.33条谱带,其中多态性条带占87.6%。供试甘蔗品种之间的遗传相似系数为0.554～0.826,平均值为0.679。根据UPGMA聚类分析结果,20个供试甘蔗品种可分为2个类群。[结论]20个供试甘蔗品种具有丰富的遗传多态性。SSR标记能较好地揭示供试甘蔗品种之间的遗传差异和亲缘关系。  相似文献   

Genetic diversity analysis of Brassica oleracea L.by SSR     

TIAN Yuan WANG Chao 《东北农业大学学报(英文版)》2007,14(3):202-205

SSR analysis on genetic diversity of 30 samples was carried out.Five primers selected from 36 primers were used to amplify 30 samples in this experiment,PCR products were separated by 6% polyacrylamide gel electrophoresis,silver staining and photographed.The results of SSR were analyzed by UPGMA clustering.The results showed that a total of 21 gene alleles were detected by 5 SSR primers.The number of alleles ranged from 2 to 5 with an average of 4.2.PIC range was 0.257-0.921,with an average of 0.543.The average coefficient of genetic similarity of SSR markers among materials was 0.432.Some of cabbage cultivars in the experiment were divided into four groups except cultivars which come from Japan.  相似文献   

吉林省龙井保护区野生大豆居群遗传多样性的研究     

孙晓环  刘晓冬  赵洪锟  王玉民  刘宪虎 《吉林农业科学》2010,35(2):1-4

利用28对SSR引物对吉林省龙井保护区一个居群的32份野生大豆进行了遗传多样性分析,共检测到120个等位变异,平均等位变异数为4.29个。32份野生大豆的遗传相似系数为0.58～1.0,平均相似系数为0.63。聚类分析结果表明,此居群野生大豆的生长趋势与地理位置有明显的相关性,呈遗传斑块生长。28对SSR引物得到的Simpson指数分布范围为0.119 1～0.673 8,平均值为0.454 4;Shannon-weaver指数分布范围为0.277 1～1.478 3,平均值为0.8865。通过遗传多样性指数表明:吉林省龙井保护区此居群的野生大豆具有较高的遗传多样性。  相似文献   

新疆早熟陆地棉SSR标记遗传多样性分析及指纹图谱构建   总被引：1，自引：0，他引：1  

叶春秀  李全胜  李有忠  庄振刚  谢宗铭 《西北农业学报》2015,24(2):73-78

采用SSR分子标记对41份北疆地区早熟陆地棉品种进行遗传多样性分析,并构建其DNA指纹图谱。最终100对引物筛选出8对多态性较好引物,共检测50条带,其中多态性33条,多态性比率66%,每对引物平均扩增到6.25条条带。多态信息含量(PIC)为0.568 0~0.784 6,平均值为0.646 2。聚类分析表明,供试材料在遗传距离为0.42时可划分为3类,第3大类又可以划分为2大亚类,多数品种属于第3大类。利用其中7个特异性标记引物获得的数据构建供试材料的分子指纹图谱。新陆早系列在选育过程中亲本的来源较为广泛,遗传背景较复杂,获得的SSR分子指纹图谱能够用于新疆早熟陆地棉品种及相关材料的鉴定。  相似文献   

山西省野生大豆资源遗传多样性分析   总被引：11，自引：4，他引：11  

王果  胡正  张保缺  王成社  张辉 《中国农业科学》2008,41(7):2182-2190

 【目的】明确山西省野生大豆的遗传多样性程度及其数量性状多样性的地理分布,为山西省野生大豆种质资源的利用和保护提供依据。【方法】以山西省已编目入库的544份野生大豆为材料,对其质量性状、数量性状及SSR标记进行遗传多样性分析。【结果】研究的8个质量性状,山西省半野生大豆的遗传多样性高于野生大豆;太原材料的遗传多样性高于山西省材料。4个数量性状的研究结果显示,野生大豆的变异程度高于半野生大豆,山西材料的变异程度高于太原材料;初步推断37～38°N、112～113°E经纬小区为山西省野生大豆数量性状的多样性中心。利用30对SSR引物分析了49份山西太原野生大豆材料,共检测到208个等位变异,每个SSR位点的等位变异范围为4～11个,平均为7个;引物的Shannon-weaver指数的分布范围为0.7451～2.1081,平均为1.5030;位点多态信息量（PIC）值的分布范围为0.3813～0.8575,平均为0.7007。【结论】表型和分子检测结果都表明,太原野生大豆材料的变异类型丰富、多样性程度较高。  相似文献