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相似文献
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1.
稻米垩白性状对高温耐性的QTL分析   总被引：1，自引：1，他引：0  
【目的】本研究旨在筛选与稻米外观品质高温耐性连锁的分子标记,为稻米品质育种提供参考。【方法】以耐热水稻品系996和热敏感水稻品系4628为亲本构建的重组自交系为材料,采用垩白粒率耐热指数、垩白大小耐热指数和垩白度耐热指数为评价指标,对水稻垩白性状的高温耐性QTL进行检测。【结果】采用复合区间作图法两年共检测到垩白性状高温耐性QTL 24个,包括垩白粒率高温耐性QTL 8个,垩白大小高温耐性QTL 12个,垩白度高温耐性QTL 4个。其中,第6染色体上的2个垩白粒率高温耐性QTL和第7染色体上的2个垩白度高温耐性QTL在两年中重复检测到,且这2个稳定表达的垩白度位点与2015年检测到的第7染色体上的垩白粒率位点重合。另外,发现有4个QTL一因多效,同时影响垩白粒率、垩白大小及垩白度。【结论】控制垩白粒率耐热指数的q HTCGR6.1和控制垩白度耐热指数的q HTCD7.1是新的QTL。  相似文献   

2.
粳稻垩白性状的QTL检测   总被引：1，自引：0，他引：1  
 利用大粒粳稻DL115与小粒粳稻XL005杂交获得的F2群体200个单株为作图群体,采用复合区间作图方法,利用SSR标记对稻米垩白性状进行了数量性状基因座(QTL)检测。研究结果表明,稻米垩白粒率、垩白大小和垩白度在F3株系均呈连续分布,表现为由多基因控制的数量性状。检测到与稻米垩白性状相关的QTL 8个,分别位于第3（5个）、第5（2个）和第6（1个）染色体上,包括与垩白粒率有关的QTL 3个,与垩白大小相关的QTL 2个,与垩白度有关的QTL 3个。其中位于第3染色体RM6832-RM411、RM15456-RM6832和RM6266-RM15456区间的qPGWC3、qACE3b和qDEC3b,分别解释垩白粒率、垩白大小和垩白度表型变异的43.89%、18.83%和19.57%,为主效QTL。上述3个主效QTL所在染色体上的位置与前人研究结果均不一致,认为是新的QTL。所检测到的8个QTL中,除qPGWC6的增效等位基因来自无垩白亲本XL005外,其他7个QTL的增效等位基因均来自垩白性状值较大的亲本DL115。垩白粒率和垩白大小基因作用表现为部分显性,垩白度基因作用表现为加性。  相似文献   

3.
不同生态地点下稻米外观品质性状的QTL定位分析   总被引：4，自引：3，他引：1  
 利用两个已测序品种93 11和日本晴为亲本,采取单粒传法创建由190个家系组成的重组自交系群体,并构建了包含178个SSR、CAP和STS标记的遗传连锁图谱。采用复合区间作图方法,在3个不同生态地点(陵水、合肥和怀远)对垩白(垩白率、垩白大小、垩白度)、粒形(粒长、粒宽、长宽比)等6个外观品质的数量性状基因座（QTL)进行了定位分析。共定位到39个QTL,单个性状QTL数目在6~7个,说明垩白和粒形是多基因控制的数量性状。8个QTL可在2个以上地点检测到,其中,两个垩白度相关QTL qCD 1、qCD 3(贡献率分别为288%、321%)在3个地点同时检测到;11个QTL具有一因多效性,单个QTL位点控制的性状为2~6个,如第3染色体RM16-RM143区段控制垩白率、垩白大小、垩白度、粒长、粒宽和长宽比等6个性状。比较3个地点的检测结果,发现外观品质性状的QTL定位都受环境影响,但不同性状受影响的程度不同。长宽比和垩白度受环境影响较小,粒宽受环境影响较大。  相似文献   

4.
玉米主要营养品质性状的QTL定位   总被引：1，自引：0，他引：1  
以LX00-6×E28的278个F2:3家系为作图群体,通过SSR标记利用MAPMAKER/EXP3.0和Mapdraw 2.0构建遗传连锁图谱.该连锁图覆盖玉米基因组1 508.1 cM,包含124个标记,相邻两标记的平均距离为12.2 cM.利用QTLMaper2.5软件,结合主要品质性状的检测结果,运用复合区间作图法,以LOD=2.0对玉米主要品质性状进行全基因组QTLs扫描,检测到两个与淀粉含量相关的QTL位点,分别位于第1、8条染色体上,表现为部分显性效应和加性效应,并在第1条染色体上检测到1个与油分含量相关的位点,表现为加性效应.  相似文献   

5.
《杂交水稻》2014,(6):56-61
利用穗部性状存在显著差异的籼稻材料千粒稻与粳稻材料日本晴为亲本,构建F2作图群体,采用复合区间作图法,以筛选出具多态性的136个分子标记对每穗总粒数、一次枝梗数、二次枝梗数、穗长、剑叶宽、着粒密度6个性状进行QTL检测。共检测到20个QTL,分别位于水稻第1,2,3,5,7,8,9和10号染色体上,单个QTL对相关表型变异的贡献率为3%18%,LOD值范围在2.5518%,LOD值范围在2.556.13,其中效应值≥10%的位点有13个,≤5%的位点检测到5个。相关性状QTL有成簇分布在染色体相同或者相近区域的趋势。  相似文献   

6.
不同环境条件下稻谷粒形数量性状的QTL分析   总被引：21，自引：2，他引：19  
以窄叶青8号和京系17构建的加倍单倍体群体为材料,系统分析了稻谷粒长、粒宽及长宽比3个性状在北京、杭州、海南3个不同环境下的表现,并进行了数量性状基因位点的比较定位。检测结果表明,3个环境下共检测到18个QTLs,分布于水稻第1、2、3、4、6、8和12染色体上,其中与粒长性状相关QTL 3个,LOD值为2.69~4.75,贡献率为9.9%~18.4%;与粒宽性状相关QTL 9个,LOD值为2.43~5.77,贡献率为8.4%~25.6%;与长宽比性状相关QTL 6个,LOD值为2.44~6.02,贡献率为9.8%~22.7%。  相似文献   

7.
水稻耐盐性数量性状位点的初步检测   总被引：40，自引：3，他引：37  
用RFLP分析技术和分蘖株系法对由耐盐性品种Pokkali和盐敏感品种Peta配制的BC1(Peta/Pokkali∥Peta)群体分别检测水稻苗期和成熟期耐盐性数量性状位点(QTLs)。表型鉴定在含(处理)或不含(对照)60 mol/m3 NaCl的营养液中进行,苗期观测盐害级别、苗Na+含量和鲜重/干重比值3项指标,成熟期测定10种农艺性状处理与对照的相对值。从水稻12条染色体上筛选出43个多态性标记,对上述指标分别作点分析,共检出15个连锁标记。连锁标记的分布特点显示,在研究所涉及的基因组范围内存在4个影响苗期耐盐性的QTL,其增效等位基因均来自耐盐品种Pokkali;影响成熟期耐盐性的QTL分布于7条染色体的1或2个连锁区间上,其有利基因来自双亲;RG678和RZ400B~RZ792附近的2个QTL在全生育期都能表达较强耐盐性。  相似文献   

8.
水稻籼粳交DH群体幼苗中胚轴长度的QTLs定位和上位性分析   总被引：14，自引：3，他引：11  
应用籼粳交IR64/Azucena的DH群体及其构建的分子标记遗传图谱,在遮光条件下,通过适温和低温逆境下发芽,测定中胚轴长度。采用QTL Mapper 基因定位软件检测控制中胚轴长度的加性效应QTLs和加性×加性上位性QTLs,在第1、3、6、7、8、12等6条染色体上定位了8个控制中胚轴长度的QTLs,其中在第1、3、7、8染色体上定位了4个具有加性效应的QTLs,位于第7染色体的1个加性效应QTL的增长等位基因来自于父本Azucena,它能使中胚轴伸长0.26 cm,其贡献率达17.5%,其余3个加性效应QTLs的增长等位基因来自于母本IR64,能使中胚轴伸长0.10～0.21 cm,在第3、7、12等3条染色体中共检测到2对加性×加性上位性效应,其贡献率分别为21.62%和2.27%,同时各检测到2对加性效应×环境的互作效应和上位性与环境的互作效应。对应用分子标记辅助育种选育中胚轴伸长的矮秆水稻的可能性进行了讨论。  相似文献   

9.
为挖掘真实有效的小麦耐盐性数量性状位点（quantitative trait loci，QTL），利用生物信息学方法，借助小麦高密度分子标记遗传图谱，对来自不同遗传背景群体的215个耐盐性QTL进行图谱整合、映射以及元分析。通过建立QTL一致性图谱，获得100个一致性QTL( meta quantitative trait loci，MQTL)位点，不均匀分布在21条染色体上；存在3个耐盐性MQTL热点区域，分别位于4A染色体的Xgwm219~Xbarc78标记区间、3B染色体的Xwpt 800213~Xwpt 9432标记区间和7B染色体的Xbarc176~Xwgp45标记区间，分别包含7、5和6个MQTL。  相似文献   

10.
两种供氮水平下水稻穗长QTLs的检测   总被引：15，自引：0，他引：15  
在水稻(IR64×Azucena) DH群体中应用分子标记连锁图,对不同供氮水平下的穗长性状进行QTL区间作图分析。在高氮水平下检测到控制穗长的QTLs 2个,分别位于第1和第4染色体上;在低氮水平下检测到5个穗长QTLs,其中3个分别位于第1、4和6染色体上,2个位于第3 染色体的不同部位,说明穗长QTL与供氮水平之间可能存在交互效应。基于这种互作效应及研究中观察到的两供试亲本对低氮胁迫的耐性差异,推测仅在低氮水平下检测到的穗长QTLs可能跟水稻对低氮胁迫耐性有一定的关联。  相似文献   

11.
稻米粒形和垩白度的QTL定位和上位性分析   总被引：11，自引：0，他引：11  
 利用由181个家系组成的Lemont/特青籼粳交重组自交系群体,以及由161个RFLP、SSR标记和3个形态标记构建的全长为1916.5 cM、覆盖水稻基因组12 条染色体的连锁图,采用线性模型的复合区间作图方法（QTLMapper V10）,对粒长、粒宽、长宽比和垩白度等4个稻米品质性状的数量性状座位（QTL）进行了分析。在水稻的所有12 条染色体上共定位到7个加性主效QTL和19对上位性QTL,其中控制粒长、粒宽、长宽比的主效QTL各2个,控制垩白度的QTL 1个,分别解释12.8%、40.0%、26.0%和42.1%的表型变异;共检测到6对影响垩白度、6对影响粒长、7对影响长宽比的上位性QTL,分别解释52.2%、31.3%和38.2% 的表型变异。结果表明,上位性QTL和主效QTL一样在稻米粒形和垩白度的遗传中起着重要的作用。  相似文献   

12.
Popping characteristics play a determinant role in the utilization of popcorn (Zea mays L.). In this study, the RIL population with 258 recombinant inbred lines was evaluated to detect quantitative trait loci (QTLs) for three popping characteristics (PF, popping fold; PV, popping volume; PR, popping rate) under four environments. Meta-analysis was used to integrate detected QTLs across three generations (RIL, F2:3 and BC2F2) derived from the same cross. All eleven QTLs were detected for three traits, on chromosomes 1, 2, 4, 6 and 10 for PF, on chromosomes 1, 4, 6, 7 and 10 for PV, and on chromosomes 1, 4, 6 and 10 for PR. Three, 1, 3, 6 and 6 QTL were detected in the same marker intervals in 4, 3, 2, 1 cases, respectively. Four QTLs at bins 1.05–1.06, 1.08–1.09 and 7.03–7.04 were commonly detected in the same or near bins in all three generations. Six and 2 QTLs showed consistency across RIL/F2:3 or RIL/BC2F2 generations respectively. Nine meta-QTLs (mQTL) were detected on chromosomes 1, 4, 6, 7, 8 and 10. Except mQTL7-1, only related with PV, other mQTLs included two or three traits, reflecting pleiotropic or tightly linkaged QTLs for popping characteristics. The QTL influencing all the three popping traits at bins 1.05–1.06 were also detected in other previous researches using different populations, which could be put into use in marker assisted breeding for popping characteristics in popcorn.  相似文献   

13.
Popping characteristics play a determinant role in the utilization of popcorn (Zea mays L.). In this study, the RIL population with 258 recombinant inbred lines was evaluated to detect quantitative trait loci (QTLs) for three popping characteristics (PF, popping fold; PV, popping volume; PR, popping rate) under four environments. Meta-analysis was used to integrate detected QTLs across three generations (RIL, F2:3 and BC2F2) derived from the same cross. All eleven QTLs were detected for three traits, on chromosomes 1, 2, 4, 6 and 10 for PF, on chromosomes 1, 4, 6, 7 and 10 for PV, and on chromosomes 1, 4, 6 and 10 for PR. Three, 1, 3, 6 and 6 QTL were detected in the same marker intervals in 4, 3, 2, 1 cases, respectively. Four QTLs at bins 1.05–1.06, 1.08–1.09 and 7.03–7.04 were commonly detected in the same or near bins in all three generations. Six and 2 QTLs showed consistency across RIL/F2:3 or RIL/BC2F2 generations respectively. Nine meta-QTLs (mQTL) were detected on chromosomes 1, 4, 6, 7, 8 and 10. Except mQTL7-1, only related with PV, other mQTLs included two or three traits, reflecting pleiotropic or tightly linkaged QTLs for popping characteristics. The QTL influencing all the three popping traits at bins 1.05–1.06 were also detected in other previous researches using different populations, which could be put into use in marker assisted breeding for popping characteristics in popcorn.  相似文献   

14.
 水稻叶片的形态改良是水稻株型育种和产量育种的重要目标之一。以9311/日本晴染色体片段置换系（CSSLs）群体为材料,定位了上3叶叶片长、宽、叶面积共9个性状QTL,分析了叶片性状与产量性状之间的相关性,同时定位了主穗重及产量构成因素（颖花数、千粒重、结实率）相关QTL。结果表明,CSSLs群体的叶片性状之间存在显著或极显著相关性;叶片性状与主穗重呈显著或极显著正相关,与主穗颖花数呈极显著正相关;叶片形态多数性状与结实率、千粒重没有显著相关性。两年共定位到20个叶片性状QTL,分布于第1、3、4、5、6、9、11共7条染色体的10个区间,贡献率为3.82%~14.61%,其中贡献率大于10%有6个,多个QTL成簇分布在相同区间,3个QTL在两年间重复检测到,8个QTL为前人未报道的新位点。两年共检测到16个与控制主穗产量相关的QTL,分布于第1、2、3、5、7、8、10共7条染色体13个区间,其中有7个主穗产量相关QTL所在5个区间与叶片形态14个QTL所在区间一致。  相似文献   

15.
水稻穗芽相关性状的QTL定位   总被引：6，自引：2，他引：4  
利用305个株系组成的源自籼稻品种中156和谷梅2号的重组自交系群体进行了水稻穗芽性状的QTL检测和遗传效应分析。以穗芽指数及相关指标作为穗芽性状的表型值,采用QTL Mapper 1.01统计软件进行QTL定位和上位性分析,共检测到控制穗芽指数的3个加性效应QTL,分别位于第2、9、11染色体上;控制穗芽速率的加性效应QTL 3个,分别位于第1、3、6染色体上;控制穗穗芽率的加性效应QTL 3个,分别位于第1、9、10染色体上;控制粒穗芽的加性效应QTL 2个,分别位于第9、11染色体上。还检测到3对影响穗芽指数的加性×加性上位性互作效应QTL;3对控制穗芽速率的上位性QTL和3对控制粒穗芽率的上位性QTL。  相似文献   

16.
Major efforts in wheat research are being made to improve the yield and quality of wheat. Loaf volume (Lv) is the main quality parameter deciding the bread making potential of wheat. To genetically dissect quantitative trait loci (QTLs) for Lv, a Recombinant Inbred Line (RIL) population (F8) was developed from a cross between two Indian wheat varieties “HI 977” and “HD 2329”. A total of 914 SSR and 100 ISSR primers were used for molecular analysis and the genetic map comprising 19 chromosomes was constructed with 202 SSR markers and 2 HMW glutenin subunit loci: Glu-B1 and Glu-D1. The phenotypic data were collected from six environments including three different agro-climatic zones for 2 consecutive years. Dissection of Lv through AMMI model revealed significant G×E variance for the trait. QTL analysis was performed using composite interval mapping. A total of 30 QTLs for Lv were detected and significant QTLs were identified on 6B and 6D chromosomes; 1B, 1D, 2A, 3A, 5B and 5D also contributed genetically to Lv. Association between 6B and 6D QTLs and variable expression of gliadins on group 6 chromosomes were discussed. QTLs detected in this study were compared with other QTL analysis in wheat.  相似文献   

17.
为挖掘更多的茎基腐病抗性QTL用于分子标记辅助育种,以中抗茎基腐病品种CI12633和感茎基腐病品种扬麦158的重组自交系群体为材料,采用SSR和SNP等分子标记对群体中的94个家系进行基因型分析,绘制遗传连锁图,并结合3次室内群体的茎基腐病抗性鉴定结果对小麦茎基腐病抗性QTL进行定位。结果表明,与小麦茎基腐病抗性相关的QTL分布在1D、2B、3B(2)、7A和7D染色体上,可解释9.2%～14.6%的表型变异;1D和3B染色体上的抗性QTL来自CI12633,2B、7A和7D染色体上的抗性QTL来自扬麦158;1D、2B和3B(与Chr3B_479785994紧密连锁)染色体上的抗性QTL为茎基腐病抗性主效QTL。发现的QTL及其紧密连锁的分子标记可为今后开展抗茎基腐病小麦分子标记辅助育种提供帮助。  相似文献   

18.
A backcross inbred line population derived from a cross between Koshihikari and Kasalath was used to dissect the genetic relationship among chalkiness, protein content, and paste viscosity properties in rice in three environments. A total of 11 traits (or parameters) were analyzed, including percentage of grains with chalkiness (PGWC), protein content (PC) and protein index (PI), and eight parameters from the viscosity profile. PGWC, PC and PI were significantly correlated with the paste viscosity parameters. We identified 39 QTLs in three environments; ten QTL clusters emerged. Eight QTLs were consistently detected across the three environments and further confirmed using a set of chromosome segment substitution lines (CSSLs) where Kasalath was used as the donor parent and Koshihikari as the recurrent parent. One and two major clusters on chromosome 6 corresponded to the Wx and Alk loci, respectively. The former was responsible for PGWC and most of the viscosity parameters, and the latter for PI and some viscosity parameters. Particularly, QTL qPI-6.1 was linked with both the Wx and Alk loci. The co-locations of QTLs for PGWC and viscosity parameters and the linkage of qPI-6.1 and qBDV-6 at the Wx locus could be largely responsible for the phenotypic correlations between these traits.  相似文献   

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