五唇兰基因组DNA提取方法的优化     

司更花  朱国鹏 《热带林业》2012,(2):37-39

五唇兰组织内含有大量的酚类、多糖以及此生代谢产物,DNA提取较为困难。为获得高质量的五唇兰基因组DNA,文中采用传统十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法、常规十二烷基硫酸钠(SDS)法和改进的CTAB法对五唇兰基因组DNA的提取进行比较。结果表明:改进的CTAB法比传统CTAB法和常规SDS法都好,可以得到质量较好的DNA,电泳条带清晰,通过紫外分光光度计检测,A260/A280为2.0以上。  相似文献   

平邑甜茶基因组DNA提取方法的比较     

张丽杰  王玉霞  郜亚婷  董文轩 《经济林研究》2012,30(1):114-117

为获得高质量的基因组DNA,以平邑甜茶及其与扎矮山定子杂交所得四倍性矮生后代33#、45#新鲜叶片为试材,分别采用常规CTAB法、改良的CTAB法和基因组试剂盒法提取平邑甜茶总DNA,进行琼脂糖凝胶电泳,使用核酸蛋白仪对DNA质量和纯度进行检测。结果表明:利用基因组试剂盒法、常规CTAB法和改良CTAB法均可获得DNA,但获得的DNA质量和纯度存在一定的差异。试剂盒法和CTAB法可以获得较高质量的DNA。但由于基因组试剂盒法成本相对较高,改良CTAB法较耗时,建议采用常规CTAB法提取平邑甜茶及其杂交后代33#、45#品种基因组DNA。  相似文献   

柳树DNA提取改良方法研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

郑纪伟  孙冲  周洁  何开跃  何旭东 《江苏林业科技》2014,(6):4-6

高质量的DNA是进行林木分子生物学研究的基础与关键。该研究利用改良的CTAB法提取垂柳基因组DNA,并与常规CTAB法、CTAB-硅珠裂解法、SDS法和试剂盒法进行了比较。琼脂糖凝胶电泳检测显示,改良CTAB法提取的DNA浓度和纯度较高,质量优于其他4种提取方法。同时利用改良CTAB法提取了柳树16个自然种及杂交种基因组DNA,并经SSR-PCR扩增反应验证,表明改良CTAB法可作为一种柳树基因组DNA提取的通用方法。  相似文献   

4种不同广玉兰基因组DNA提取方法的比较   总被引：3，自引：1，他引：2  

陈永华  相阳  张冬林  李志辉  陈亮明  彭婧  马倩 《中南林业科技大学学报(自然科学版)》2008,28(3)

采用常规CTAB法、常规SDS法、改良CTAB法、改良SDS法4种方法对广玉兰（Magnolia grandiflora）叶片基因组DNA的提取进行比较,并进行ISSR—PCR检测,结果表明：改良的CTAB法提取的基因组DNA效果比常规CTAB法、常规和改良SDS法都好,提取DNA的浓度和纯度高,无蛋白质和RNA等杂质影响,并且可以很好的应用于ISSR分子标记分析,ISSR—PCR反应体系中模板DNA的最佳浓度是30ng／20μl．  相似文献   

从白刺老干中提取高纯度DNA的方法     

陈淑华  张玉玲  黄雪峰  谢琦  丁海燕  冷志巍 《辽宁林业科技》2012,(6)

采用CTAB法、SDS法和匀浆CTAB法对白刺越冬老干进行基因组DNA提取,通过琼脂糖凝胶电泳及分光光度计对DNA纯度进行检测,结果表明,用常规的CTAB法和SDS法提取DNA纯度低,匀浆CTAB法得到高纯度的DNA,其OD260/OD280值为1.873～1.923。  相似文献   

马尾松针叶DNA提取方法研究   总被引：6，自引：2，他引：4  

杨模华  李志辉  张冬林  唐效蓉  张斌  张党权  刘儒 《中南林业科技大学学报(自然科学版)》2008,28(3)

采用3种不同的方法（CTAB法、SDS法和试剂盒法）提取马尾松幼嫩针叶基因组DNA,并分别从取样材料类型、样品的保存、提取液中PVP含量、取样质量、抽提过程中提取程序的改进等方面进行提取马尾松基因组DNA效果的凝胶电泳比较．结果表明：CTAB法适合于在马尾松群体分子生物学研究中基因组DNA的提取：采用低温冷藏法保存的春季抽梢针叶0．2g,在CTAB的提取液中加入2％的PVP,常规CTAB法提取程序中添加等体积的混合液（V酚：V氯仿：V异戊醇=25：24：1）并在此前加入1／10体积的10×CTAB,可以有效地提高马尾松基因组DNA的提取质量,获得显带平直、纯度较高的马尾松基因组DNA,OD260／OD280值在1．8左右．这为马尾松群体分子生物学的研究提供了一个经济、简便而有效的DNA提取方法．  相似文献   

樟树总DNA提取技术的研究   总被引：4，自引：0，他引：4  

潘晓华  黄儒珠  朱锦懋 《福建林业科技》2004,31(1):31-33,41

比较了常规的CTAB法与改进的CTAB法对樟树总DNA提取的结果。在常规的CTAB法基础上,采取先破碎细胞收集细胞核,将存在于细胞质中的大量影响DNA提取质量的多酚等次生代谢物除去后,再加核裂解液释放DNA,经分离纯化,提得的DNA通过A260/A280比值的测定及电泳,限制性内切酶消化,PCR扩增,结果表明,用改进的CTAB法提取的DNA纯度和完整性均优于常规的CTAB法。  相似文献   

适于AFLP分析的澳洲坚果DNA提取方法   总被引：2，自引：0，他引：2  

李惠波  倪书邦  贺熙勇 《热带农业科技》2005,28(1):1-2,5

利用SDS法和改良CTAB法对澳洲坚果两个品种的基因组DNA进行提取试验,结果表明:SDS法与改良CTAB法提取的基因组DNA完整性都比较好,但SDS法获得的DNA含有较多杂质,不能被限制性内切酶消化,改良CTAB法提取的基因组DNA可以完全酶切,DNA质量符合AFLP分析的要求。  相似文献   

槭属树种DNA提取方法比较研究     

马冬菁 《辽宁林业科技》2018,(2)

采用3种DNA提取方法对8种槭属树种基因组DNA进行质量、浓度和纯度对比研究,结果表明,3种方法提取的基因组DNA差异较大,浓度由高到低依次为改良CTAB法TIANGEN试剂盒法改良SDS法;提取的基因组DNA纯度为TIANGEN试剂盒法CTAB法SDS法。3种方法中TIANGEN试剂盒法提取的槭属树种基因组DNA含有的杂质最少,但成本较高;改良CTAB法提取的基因组DNA质量、浓度和纯度均优于改良SDS方法,适用于槭属树种的后续研究。  相似文献   

高质量丝栗栲基因组DNA的提取方法   总被引：1，自引：0，他引：1  

伍艳芳  江香梅  肖复明  熊振宇  邱凤英 《林业科技开发》2012,26(5):82-85

为了促进丝栗栲分子生物学的研究,采用尿素法、柠檬酸钠法、改良CTAB法和SDS法4种方法提取丝栗栲叶片基因组DNA,并对提取效果进行了比较和分析。结果表明,改良CTAB法较适合丝栗栲基因组DNA提取,其提取的DNA产率高,凝胶检测条带整齐清晰,杂质少、无明显降解,OD260/OD280比值在1.8左右;而尿素法难以提取基因组DNA,SDS法提取的DNA得率较低,柠檬酸钠法有蛋白质、多糖等杂质污染均不太适用丝栗栲基因组DNA提取。采用改良CTAB法提取得到丝栗栲幼叶、老叶、嫩芽和幼茎基因组DNA,产率分别为177.3、167.1、242.0和156.7μg/g。酶切分析也证明,改良CTAB法提取的不同组织DNA适用于进行后续分子生物学研究。  相似文献   

山核桃基因组DNA提取方法的比较研究   总被引：7，自引：0，他引：7  

郭传友  黄坚钦  王正加 《福建林业科技》2004,31(2):12-15

植物体内所含的蛋白质、单宁、酚类、多糖及色素等次生代谢物质影响TaqDNA聚合酶的活性,是导致PCR扩增反应失败的主要因素。以山核桃嫩叶为材料,对分别用经过改良的SDS法、改良的CTAB法、简易CTAB法及改良的高盐低pH法提取的基因组DNA进行检测比较,结果显示,改良的SDS法更适合于山核桃基因组DNA的提取,此方法提取的DNA能很好地用于PCR扩增。  相似文献   

无患子总DNA提取方法研究   总被引：1，自引：2，他引：1  

刘宝  范辉华  彭朱清 《福建林业科技》2013,40(2):28-31

针对无患子富含多酚、多糖、蛋白质及其他次生代谢物质的特点,以无患子叶片为材料,分别采用改良的CTAB法和CTAB与SDS相结合法提取不同种源无患子的总DNA。结果显示,改良的CTAB法提取的总DNA,得率较高,纯度好,可用于酶切、PCR扩增等后续试验,并能获得清晰、稳定的扩增产物。而采用CTAB与SDS相结合的方法得到的基因组DNA效果不稳定,无法检测出DNA。改良的CTAB法具有简单、经济的特点,可用于无患子总DNA的提取,成功地进行SRAP分子标记分析,为研究无患子遗传资源多样性奠定基础。  相似文献   

Methodological comparison of DNA extraction from Holcocerrus hippophaecolus (Lepidoptera: Cossidae) for AFLP analysis     

CHEN Min  ZHU Yang-yu  TAO Jing  Luo You-qing 《中国林学(英文版)》2008,10(3)

Amplified fragment length polymorphism (AFLP) is a powerful DNA fingerprinting technique for studying genetic rela-tionships and genetic diversity in insects. However, the crucial prerequisite for AFLP analysis is to extract DNA of high quality. In this study, we evaluate four different protocols (SDS method, improved SDS method, CTAB method and a complex method with SDS and CTAB) for isolating DNA from the seabuckthorn carpenter moth (Holcocerrus hippophaecolus (Lepidoptera: Cossidae)). The results indicate that the CTAB method does not produce DNA suitable for AFLP analysis. The SDS method and the complex method with SDS and CTAB are comparatively time-consuming and resulted in low yields of DNA and were therefore not used for AFLP assay. The improved SDS method is recommended for preparing DNA templates from H. hippophaecolus for AFLP analysis.  相似文献   

Methodological comparison of DNA extraction from Holcocerrus hippophaecolus （Lepidoptera： Cossidae） for AFLP analysis   总被引：1，自引：1，他引：0  

CHEN Min ZHU Yang-yu TAO Jing Luo You-qing 《中国林学(英文版)》2008,10(3):189-192

Amplified fragment length polymorphism （AFLP） is a powerful DNA fingerprinting technique for studying genetic relationships and genetic diversity in insects. However, the crucial prerequisite for AFLP analysis is to extract DNA of high quality. In this study, we evaluate four different protocols （SDS method, improved SDS method, CTAB method and a complex method with SDS and CTAB） for isolating DNA from the seabuckthorn carpenter moth （Holcocerrus hippophaecolus （Lepidoptera： Cossidae））. The results indicate that the CTAB method does not produce DNA suitable for AFLP analysis. The SDS method and the complex method with SDS and CTAB are comparatively time-consuming and resulted in low yields of DNA and were therefore not used for AFLP assay. The improved SDS method is recommended for preparing DNA templates from H. hippophaecolus for AFLP analysis.  相似文献   

基于CTAB法提取毛竹基因组DNA的探讨   总被引：9，自引：2，他引：9       下载免费PDF全文

高志民  范少辉  高健  李雪平  蔡春菊  彭镇华 《林业科学研究》2006,19(6):725-728

应用CTAB法、改良CTAB法、改良CTAB-高盐沉淀法对毛竹基因组DNA进行了提取,并用紫外分光光度计(UV3300)、琼脂糖凝胶电泳和PCR分析对提取的DNA进行了检测,对DNA的产量、质量、PCR效果等方面进行了综合比较.结果表明:改良CTAB-高盐沉淀法是提取高质量毛竹基因组DNA的较好方法.  相似文献   

八角基因组DNA的提取方法     

陈海云  吴涛  耿树香  白平  陈少瑜  宁德鲁 《福建林业科技》2012,39(4):26-29

采用4种植物基因组DNA提取方法(CTAB法、SDS法、高盐法、试剂盒法)对八角基因组DNA进行提取试验.结果表明,对传统CTAB法稍加改良可以得到较为理想的提取效果,改良的内容包括①在加入CTAB提取缓冲液之前,先用CTAB-free缓冲液抽提1～2次;②将CTAB提取缓冲液中CTAB的用量从2％提高到3％;③提取缓冲液的用量由样品干重的10倍增加到60倍.用改良CTAB法提取的DNA经RAPD-PCR扩增,条带清晰,其质量能够满足分子标记的要求.  相似文献   

爱玉子基因组DNA的提取和质量分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

吴文珊  朱晓东  郑翠芳  方丽娜  方玉霖 《福建林业科技》2008,35(3)

以爱玉子的叶片为材料,对CTAB分离总DNA的方法进行了改进,即在提取液中加入β-巯基乙醇、PVP,将CTAB的浓度提高到3%,用氯仿-异戊醇取代酚进行抽提。结果表明,改进后的方法可有效地去除杂质,防止材料褐化,获得的DNA样品OD260nm/OD280nm比值为1.8左右,质量好且产率较高,能完全满足SRAP分析及限制性内切酶酶切的要求。  相似文献   

喙尾琵甲DNA提取方法比较与AFLP反应体系的建立   总被引：3，自引：1，他引：2       下载免费PDF全文

赵敏  冯颖  和锐  陈晓鸣  冀焕红 《林业科学研究》2010,23(2):234-240

采用CTAB法、改进SDS-蛋白酶K法、SDS-饱和氯化钠法和提取试剂盒对喙尾琵甲的肌肉、虫卵和幼虫进行DNA提取,比较了DNA的提取和保存质量,并对AFLP试验的酶切时间、预扩增产物稀释倍数和选择性扩增引物量等关键因子进行试验和优化。结果表明:4种方法对肌肉组织提取的DNA质量都较好;3种传统方法提取的DNA的保存时间长于试剂盒提取的DNA;使用EcoR Ⅰ/Mse Ⅰ内切酶组合,10 U EcoR Ⅰ和2 U Mse Ⅰ分两步各酶切2 h,T4连接酶3 h连接后,以20倍稀释的预扩增产物和5 ng/35 ng的E+3/M+3引物量进行选择性扩增,建立了喙尾琵甲AFLP分子标记体系。  相似文献