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[目的]研究柄海鞘和其他5个物种的热休克蛋白70家族的系统发育关系。[方法]通过在Ensembl中下载与筛选,获得柄海鞘和其他5种生物的热休克蛋白70家族的氨基酸序列,对其进行系统发育树和基因结构分析,并阐明其系统发育关系。[结果]经过筛选,共获得了来自线虫、果蝇、柄海鞘、斑马鱼、家鸡和人类6种生物的热休克蛋白70家族的33个氨基酸序列,其中25个具有明确的基因结构。系统发育分析表明,系统发育树并未完全按照来源物种聚类;6种生物热休克蛋白70的氨基酸序列相当保守,但其内含子插入位点并不整齐,表明热休克蛋白70家族是一个多基因、多结构的家族。[结论]这6个物种均发生了基因复制事件,新产生的基因仅仅是冗余的存在,还是具有新的功能,仍需作进一步的研究。 相似文献
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为了解贵州黔东南棘蛙的肌肉营养价值,采用常规氨基酸分析方法测定黔东南棘胸蛙、棘侧蛙和棘腹蛙3种野生棘蛙肌肉的氨基酸组成与含量,并以鸡蛋蛋白质为标准蛋白,以WHO/FAO氨基酸参考模式为标准对其进行氨基酸营养评价。结果表明:黔东南3种野生棘蛙肌肉的氨基酸组成一致,其中含有苏氨酸、缬氨酸、蛋氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、苯丙氨酸和赖氨酸7种人体必需氨基酸,非必需氨基酸5种,天冬氨酸、谷氨酸、甘氨酸和丙氨酸4种鲜味氨基酸。棘胸蛙、棘腹蛙和棘侧蛙肌肉中氨基酸总量分别为84.19%、87.43%和86.12%。必需氨基酸含量占总氨基酸含量的比值分别为39.79%、40.07%和39.06%,在蛙科动物中均属于较高水平。3种棘蛙肌肉中,均以谷氨酸的含量最高,天冬氨酸的含量次之,蛋氨酸含量最低。氨基酸评分(AAS)和化学评分(CS)表明,棘蛙肌肉中第一限制性氨基酸为蛋氨酸,第二限制性氨基酸为缬氨酸。必需氨基酸指数(EAAI)显示,棘胸蛙为86.72、棘腹蛙为89.79、棘侧蛙为86.22。综合各项指标分析,贵州黔东南3种野生棘蛙具有较高的经济价值。 相似文献
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为进一步丰富福建省毛木耳栽培品种,提高福建毛木耳生产品质,比较分析新引自台湾的褐色毛木耳与福建毛木耳主栽品种(漳耳43-28)的营养成分差异。结果表明:褐木耳的蛋白质、还原糖、维生素B1和维生素B2含量显著或极显著高于漳耳43-28,E/P值、Fe含量显著低于漳耳43-28(P0.05)。两种木耳的脂肪、灰分、膳食纤维、能量无显著性差异(P0.05);两种木耳均至少含18种氨基酸,褐木耳的单一氨基酸含量(除胱氨酸外)、必需氨基酸、非必需氨基酸、儿童必需氨基酸、氨基酸总量、甜味类氨基酸、酸味类氨基酸、苦味类氨基酸、呈味氨基酸、含硫氨基酸、支链氨基酸和芳香族氨基酸均显著高于漳耳43-28(P0.05);褐木耳的AAS、CS和SRCAA营养价值评价均高于漳耳43-28。说明漳耳43-28和褐木耳的营养特征存在明显的差异,褐木耳营养价值优于漳耳43-28。 相似文献
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烟台沿海4种常见海藻的氨基酸分析及营养评价 总被引：1，自引：0，他引：1
用高效液相色谱仪测定了烟台沿海4种常见海藻中各种氨基酸的组成,并对其进行营养评价。结果表明:4种海藻样品经酸水解处理,均含有16种氨基酸,包括7种人类必需的氨基酸,2种半必需氨基酸和其他7种非必需氨基酸;各种必需氨基酸的配比合理,除叉枝藻外,其他3种海藻的E/N和E/T值与WHO/FAO提出的E/N约为60%、E/T约为40%的蛋白质参考模式相接近;萱藻和叉枝藻总氨基酸含量比较高,分别为11.30%和10.32%;此外,4种海藻中普遍含有多种药效氨基酸。说明4种海藻具有丰富的营养价值和良好的药用价值,值得大力开发利用。 相似文献
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利用RT-PCR法和PCR法克隆到橄榄星室木虱乙酰胆碱酯酶基因(Ace)的2个片段,其中cDNA片段长66bp,翻译获得的氨基酸1～11位与家蝇等13种昆虫相应的序列相同或仅相差1个氨基酸,该序列在GenBank数据库中的接受号为DQ417582;基因组DNA片段长499bp,2个外显子连在一起与意大利蜜蜂等13种昆虫相应基因的氨基酸同源性均高于88%,该序列在GenBank数据库中的接受号为DQ425028。此结果为进一步研究橄榄星室木虱对杀虫剂抗性的分子机理奠定了基础。 相似文献
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[目的]为松江鲈鱼的人工养殖和产品开发提供基础研究数据。[方法]用秦皇岛渤海湾的野生松江鲈鱼为试验样品,对其肌肉的一般营养成分、脂肪酸和氨基酸组成进行测定,并对其营养价值进行评价。[结果]松江鲈的蛋白质含量为17.72%,脂肪含量为1.24%,灰分含量为1.22%。肌肉中不饱和脂肪酸含量占脂肪酸总量的52.2%,含丰富的EPA和DHA,EPA＋DHA占脂肪酸总量的23.2%。鱼肉中含17种氨基酸（色氨酸被水解未测出）,其中含8种必需氨基酸,必需氧基酸含量占氨基酸总量的49.21%,鲜味氨基酸占氨基酸总量的39.72%,氨基酸指数77.18。根据AAS和CS,松江鲈的第1限制氨基酸为蛋氨酸＋半胱氨酸,第2限制氨基酸为缬氨酸。[结论]与其他淡水鱼类相比,松江鲈鱼肌肉蛋白质和氨基酸含量较高,氨基酸组成合理,富含不饱和脂肪酸,有较高的营养价值,是一种非常值得开发利用的淡水鱼类资源。 相似文献
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采用生物信息学方法对GenBank中已登录的10种不同植物中的查尔酮合成酶基因的核苷酸序列及所推测的氨基酸序列的理化性质、信号肽、跨膜结构、亲/疏水性、功能结构域以及其二级结构进行了详细的分析,构建了不同植物CHS的系统进化树。结果表明,10种植物中CHS基因的开放阅读框的全长在1.2 kb左右,大约编码399个氨基酸;不同植物中的CHS的氨基酸序列均包括1个N-糖基化位点(32NMSS),4个蛋白激酶c磷酸化位点(69TIR、158SVK、202TFR、359SAK)和1个查尔酮合成酶活性位点(161RLMMYQQGCFAGGTVLR),均不存在信号肽、无跨膜结构域,是一个疏水性蛋白。 相似文献
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Cloning and Expression Profile of Deoxyhypusine Snyhtase Gene and Deoxyhypusine Hydroxylase Gene in Silkworm, Bombyx mori 总被引：1，自引：0，他引：1
Deoxyhypusine snyhtase （DHS） and deoxyhypusine hydroxylase （DOHH） are the two enzymes that catalyze the synthesis of hypusine within eukaryotic initiation factor 5A （eIF5A）. Synthesis of hypusine is essential for the function of eIF5A in eukaryotic cell proliferation and survival. Here we described the cloning and expression of two full-length cDNAs, encoding respectively DHS-like protein and DOHH-like protein from Bombyx mori by using the methods of bioinformatics, RACE, and RT-PCR technology, named as BmDHS and BmDOHH. Sequencing results indicate that they are 1 311 and 1 874 bp in length including complete open reading frame （ORF） 1 116 and 915 bp, which encode 371 amino acids （molecular weight is about 41.11 kD and isoelectric point is 5.84） and 304 amino acids （molecular weight is about 34.30 kD and isoelectric point is 4.86）, respectively. BmDHS contains only 1 exon, and BmDOHH contains 4 exons and 3 introns. The deduced amino acid sequence of BmDHS contains a deoxyhypusine synthase domain from 47 to 361 amino acid residues, and the deduced amino acid sequence of BmDOHH contains 6 E-Z type HEAT repeat domains （23-52, 54-83, 87-116, 177-206, 208-237, and 241- 270）. Compared to DHS and DOHH amino acid sequences from other species, such as Homo sapiens and Drosophila melanogaster, both silkworm DHS protein and DOHH protein have more than 55% identity. The conservative regions are very similar with each other. The phylogenetic tree analysis indicated that not only DHS but also DOHH from different species has genus-specific features. The expressions of BmDHS and BmDOHH are no tissue and stage specific in our tested samples. 相似文献
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A cDNA encoding aminopeptidase N was cloned by degenerated PCR combined with RACEtechnique in this paper. The full-length of APN-Harm is 3 043 bp. Open reading frame is 2 856 bp inlength, encoding 951 amino acid residues. Its predicted molecular weight and isoelectric point are 108.3kDa and 5.29, respectively. This deduced amino acid sequence shares some common structural features withaminopeptidase N from several moth species, including the consensus zinc-binding motif HEXXHX18 E and the GAMEN motif common to gluzincin aminopeptidases. The first 20 amino acid residues at N-termini ishydrophobic transmembrane helix. The sequence of APN-Harm was deposited in GenBank and the accessionnumber is AY181026. 相似文献
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棉铃虫中肠氨基氨肽酶N基因的克隆及序列分析 总被引：3，自引：0，他引：3
通过简并引物PCR结合RACE技术 ,从棉铃虫中肠中克隆了 1个氨基氨肽酶N基因 ,该基因全长 30 4 3bp ,阅读框包括 2 85 6bp ,编码 95 1个氨基酸。预测蛋白分子量为 10 8.3kD ,等电点为 5 .2 9。序列中具有谷氨酸锌化氨肽酶的保守结构GAMEN以及锌结合位点HEXXHX18E。N 末端 2 0个氨基酸具有信号肽的特征 ,C 末端 2 5个氨基酸具有明显的亲脂性 ,并且具有跨膜特征。该基因已经在GenBank中登记 ,序列号为 :AY1810 2 6。 相似文献
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采用GC-MS分析方法测定了黄东海生态系统的关键种中华哲水蚤的氨基酸含量,并对氨基酸相对含量及组成特征进行了比较。 相似文献
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根据Myostatin基因的保守性,选择牛(Bos taurus cattle登录号:AB076403)的Myostatin序列为模板进行引物设计,首次从东北马鹿基因组中扩增出Myostatin序列,扩增产物连接pMD18-T载体,克隆出3个外显子片断。根据5-′GU-AG-3′规则和同源基因比对拼接出完整的编码序列,全长为1 128 bp(发表到GenBank登录号:EF629535),Myostatin蛋白前体由375个氨基酸组成。同源比较结果表明:Myostatin在进化过程中具有高度保守性,东北马鹿与猪Myostatin编码序列同源性最高达到98%,鸟类与哺乳动物间Myostatin编码序列同源性为85%~89%,鱼类与其他动物间编码序列同源性为60%~67%。Myostatin编码序列能够真实反映远缘物种的进化关系,可以作为远缘物种进化分析较理想的标记。 相似文献
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贵州白香猪的白细胞介素2基因的克隆及其序列分析 总被引：1，自引：0，他引：1
为获得贵州白香猪白细胞介素2基因,以提取的经刀豆蛋白A诱导培养的贵州白香猪外周血淋巴细胞总RNA为模板,扩增全长猪白细胞介素2(IL-2)基因,并克隆至pMD18-T Simple载体后测序。结果表明:贵州白香猪IL-2基因ORF长为465bp,可编码154个氨基酸,其中前20个氨基酸为信号肽,后134个氨基酸为成熟肽,具有一个潜在的N-糖基化位点;贵州白香猪除与FJ543109(99.4%)、Neijiang(98.7%)、JN851821(98.7%)、AB194099(98.5%)氨基酸一致性相对较低外,与其他猪源IL-2的一致性均为100%,而与其他种属动物的IL-2基因氨基酸一致性则较低,为11.9%～75%。 相似文献
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G Steinman 《Science (New York, N.Y.)》1966,154(754):1344-1346
The side chains of amino acid residues can be converted from nonreactive to reactive species. Under the influence of electrical discharge, alanine is converted to aspartic acid in the presence of CO(2), for example. The possible implications of these findings to events taking place on primitive Earth are discussed. 相似文献
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Rac基因是普遍存在于真核生物细胞中参与环境应急反应的重要基因。本文采用RT-PCR方法从哈茨木霉中成功克隆了哈茨木霉的Rac基因的eDNA,全长718bp,推测编码204个氨基酸,蛋白分子量为22.4kD。通过数据库检索等生物信息学方法分析发现哈茨木霉Rac与羊茅香柱菌相似性高达82％。与柄篮状菌相似性也达到75％。哈茨木霉Rac基因含有GTP／GDP结合和Effeetor区。Rac基因的cDNA序列及推测的氨基酸序列在GenBank上登录（登录号分别FJ595933和ACM24223）。 相似文献