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1.
苎麻种质资源核心种质构建 总被引：1，自引：0，他引：1
选用国家长沙苎麻圃的790份种质资源,在已有的25个性状数据的基础上,采取优先取样+多次聚类变异度取样方法,利用离差平方和法的聚类方法,无序质量性状采用simple matching,有序质量性状和数量性状采用欧氏距离,在20%的抽样水平下,构建了158份苎麻核心种质.构建的核心种质的质量性状多样性指数均值、数量性状方差差异百分率、变异系数变化率均高于原种质,极差符合率100%;质量性状的性状频率分布与原种质有差异的性状为12.5%;原种质的各数量性状间的相关性共适应基因系统基本上在核心种质中得到保留.构建的核心种质可以很好的代表原种质的遗传多样性. 相似文献
2.
建立浙江地方籼型稻种资源的核心样品的研究 总被引：9，自引：0，他引：9
以480份浙江籼型地方稻种为材料,通过评价15个数量性状和5个质量性状,建立了浙江籼型地方稻种资源的核心样品。每一生态类型内,应用15个农艺性状的系统聚类进行分组,从每一组中随机选择一个品种以构成核心样品。组数根据类型间的表型多样性而定。由60份品种所组成的核心样品,能够代表原来样品集的变异量,并使低频率质量性状的频率有所增加 相似文献
3.
利用基因型值构建水稻核心种质的方法研究 总被引：5，自引：1，他引：4
以992份水稻品种为材料,通过13个性状的测定和评价,进行水稻核心种质的构建方法研究。采用调整无偏预测法（AUP）无偏预测水稻性状的基因型值,用基因型值计算不同遗传材料间的马氏距离,分别用3种聚类方法(最长距离法、不加权类平均以及离差平方和)结合随机取样法、优先取样和变异度取样3种抽样方法构建出9个不同的水稻核心种质。水稻核心种质和原种质资源群体的方差差异百分率、均值差异百分率、极差符合率和变异系数变化率的比较结果表明,采用不加权类平均法进行多次聚类、结合变异度取样的方法可以较好地构建出水稻核心种质。基于基因型值构建的水稻核心种质比利用表现型值构建的核心种质更能代表原种质资源群体的遗传多样性。 相似文献
4.
对亚麻种质资源进行了聚类分析并探讨了核心品种的抽取方法.以134份亚麻品种为材料,通过14个性状的分析,采用离差平方和法进行聚类,根据树状图,将该亚麻群体分为7个类群,对各类群品种性状进行了分析.根据取样比例,将该群体分为23个组,在各组内,采用随机抽样、按样品间最小遗传距离和最大遗传距离抽样三种方法,构建了3个亚麻核心种质库,并加以比较.结果显示最大遗传距离法构建的核心种质库,能最大限度地保存原群体的遗传多样性. 相似文献
5.
中国茶树初级核心种质取样策略研究 总被引：5，自引：0，他引：5
为了快速、准确地从丰富的茶树种质资源中鉴定出育种上迫切需要的优异基因源,需要建立茶树资源的核心种质。利用"茶树种质资源鉴定评价数据库"中数据齐全的1048份资源的基本数据和鉴定评价数据,从总体取样比例、分组方法、组内取样比例和取样方法等方面进行了茶树核心种质构建取样策略研究,为进行茶树核心种质构建提供方法依据。结果表明,以20%的总体取样比例遗传多样性指数最高,能够保留95%以上的表型性状。在此比例下,对3种分组方法、4种组内取样比例、2种组内取样方法与不分组完全随机取样共25种取样方法构建的茶树初级核心种质进行了比较,用表型保留比例、表型方差、表型频率方差、多样性指数、数量性状变异系数5个参数对不同取样方法与原始种质都进行了的比较分析,发现不同检验指标下各种方法的排序结果不同,分组方法与确定组内取样比例的方法之间存在明显的互作效应。综合5种检验参数的排序结果,确定茶区-对数比例-聚类取样为茶树初级核心种质构建的最佳取样策略。 相似文献
6.
对亚麻种质资源进行了聚类分析并探讨了核心品种的抽取方法。以134份亚麻品种为材料，通过14个性状的分析，采用离差平方和法进行聚类，根据树状图，将该亚麻群体分为7个类群，对各类群品种性状进行了分析。根据取样比例，将该群体分为23个组，在各组内，采用随机抽样、按样品间最小遗传距离和最大遗传距离抽样三种方法，构建了3个亚麻核心种质库，并加以比较。结果显示最大遗传距离法构建的核心种质库，能最大限度地保存原群体的遗传多样性。 相似文献
7.
《北方水稻》2021,51(3)
以170份辽宁省审定水稻品种资源的12个品质性状为基础数据,分析其多样性水平,构建核心样本群体,并通过平均性状极差符合率(CR)、变异系数变化率(VR)、多样性指数率(H)3个参数对核心样本群体进行评价。结果表明,170份水稻品种12个品质性状变异系数在1.18%～100%,多样性指数在0.693～2.097。构建由42份水稻品种构成的核心样本群体,其平均性状极差符合率、变异系数变化率、多样性指数率分别为86.04%、109.31%、100.75%,可以较好的代表全部种质的表型多样性。同时对核心样本群体主坐标及方差分析表明,42个核心样本形成5个品质性状有明显差异的性状类群,为核心样本利用指明了方向。 相似文献
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黄灯笼辣椒核心种质资源比较构建研究 总被引：1，自引：0，他引：1
核心种质的构建为种质资源的研究和有效利用提供了便利条件。以146份黄灯笼辣椒种质资源为试验材料,基于10个性状表型数据,采用混合线性模型分析方法无偏地预测基因型值,利用马氏距离计算种质间的遗传距离,分别采用2种取样方法（随机取样法和优先取样法）,2种聚类方法（离差平方和法和类平均法）,按照30％的抽样比率构建黄灯笼辣椒核心种质库。采用均值、方差、极差和变异系数4个指标评价不同取样方法和聚类方法构建核心种质库的优劣。试验结果表明,优先取样法优于随机取样法,类平均法优于离差平方和法。基于马氏距离、优先取样法、类平均法获取的43份黄灯笼椒核心资源能够代表原群体的遗传多样性。 相似文献
9.
基于SSR标记构建甜玉米群体的核心种质 总被引：1，自引：0，他引：1
利用40对SSR引物分别分析56份超甜玉米和88份普甜玉米群体材料,基于非加权算术平均配对法(UPGMA)聚类分析和位点优先取样法,分别筛选出14个超甜玉米核心材料和19个普甜玉米材料作为两个亚群体种质。t测验表明,两个亚核心种质与原始群体的等位变异无显著差异(P0.05),等位变异保留率分别为87.81%和89.13%,有效地保留了原始材料群体的遗传变异。两个亚群核心种质与原始材料群体13个表型性状的均值、标准差、极差、变异系数和Shannon-Weaver多样性指数(H’)的平均符合率都在80%以上,并且均值差异百分率(MD)和方差差异百分率(VD)均小于20%,极差符合率(CR)和变异系数变化率(VR)均大于80%,符合核心种质的质量评价标准。构建的甜玉米核心种质最大程度地保留了原始群体的遗传多样性和表型变异,能够有效地代表原始甜玉米材料群体。 相似文献
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11.
本研究以收集的248份薏苡种质资源为基础,按地理来源将标准化的14表型数据分组,采用最短距离逐步取样法并按一定比例抽样,共获得8个候选核心子集,利用变异系数变化率、均值差异百分率、极差符合率、方差差异百分率、表型保留比例、表型频率方差和Shannon-Wiener指数7个参数进行核心种质代表性检验和评价。结果表明：薏苡初级核心种质库包含67份资源,保留了原始种质27.02%的样品（25%组内取样比例）,其变异系数变化率、均值差异百分率、极差符合率、方差差异百分率、表型保留比例、表型频率方差和Shannon-Wiener指数的检验指标分别为110.05%、0、93.03%、10%、96%、0.655和0.881;t测验结果表明,核心种质库14个表型性状均值与原始种质无显著性差异,仅有3个表型的某一性状级别丢失,其余11个表型均保留了原始种质的所有性状级别（RPR=1.0）,保留表型性状级别比例为96.49%,且多数表型性状的变异系数和遗传多样性指数均略高于原始种质。其结果说明,获得的核心种质库代表性好,遗传多样性丰富。该结果为后期薏苡种质资源的收集、保护、创新利用奠定了重要基础。 相似文献
12.
芝麻资源核心收集品的建立 总被引：4，自引：2，他引：2
通过对预选出的８８４ 份芝麻资源核心收集品农艺性状的进一步鉴定核查和修正之后,采用离差平方和法分组进行系统聚类分析,依据决选核心收集品数量为预选核心品的５０％ 的原则、并考虑组间遗传多样性差异,随机挑选出４５３ 份核心资源,建立了中国芝麻资源核心收集品。对４５３ 份核心收集品代表性分析结果表明：核心资源的株型、花色等１０ 个非数值型性状共３５ 种表现型各占比例与预选核心品基本一致,含油量、千粒重等４ 个数量性状的均值,标准差等６ 个特征值与预选品相近 相似文献
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Florence Esnault Roland Pellé Jean-Paul Dantec Aurélie Bérard Marie-Christine Le Paslier Jean-Eric Chauvin 《Potato Research》2016,59(4):329-343
This study presents the development of a core collection capturing the genetic diversity of a collection of 350 tetraploid cultivated potato varieties (Solanum tuberosum L.). The core collection was established by using simple sequence repeats (SSR) data and the M strategy, which aims at maximizing the allelic diversity. A 48-core collection was defined which captured 99.5% of the SSR alleles used to establish it, and 96.9% of the SSR alleles which belonged to an independent set of markers. The defined core collection was further validated by analysing 35 agro-morphological traits. The class coverage value and the estimates of the Shannon-Weaver diversity index indicated a good representation of the phenotypic diversity in the core collection. Furthermore, the core set included accessions having the most desirable status for several agronomic traits. A linkage disequilibrium (LD) analysis, using data obtained with the SolCAP SNP array on the defined core collection, was performed. The population structure analysis showed that the core collection did not present a clear genetic structure. The linkage disequilibrium analysis carried out between markers located on the same pseudomolecule within 10,000 bp concluded that 41.3% of these pairs of SNP markers have a significant LD. We conclude that this core collection, representative of the genetic diversity of cultivated potato varieties, is a relevant tool for a first screening for genetic variation regarding novel traits of interest. 相似文献
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Muhammad Qasim SHAHID 《水稻科学》2011,18(1):46
The development of a core collection could enhance the utilization of germplasm collections in crop improvement programs and simplify their management. Selection of an appropriate sampling strategy is an important prerequisite to construct a core collection with appropriate size in order to adequately represent the genetic spectrum and maximally capture the genetic diversity in available crop collections. The present study was initiated to construct nested core collections to determine the appropriate sampl... 相似文献
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全世界已收集到的高粱种质资源168500份,其中国际热带半干旱地区作物研究所（ICRISAT）有36774份,占总数的21．8％,美国42221份,占25．1％,印度20812份,占12．4％,中国12836份,占7．6％,其他国家合计55857份,占33．1％。1CRISAT和主要国家对高梁种质资源的遗传多样性进行了鉴定和评价,从中筛选出许多具有优良农艺性状、品质性状、抗性性状的种质,满足了高梁遗传改良的需要,成为当代人类和未来人类有价值的资源。 相似文献
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Leymus chinensis is an economically and ecologically important grass that is widely distributed across eastern areas of the Eurasian steppe. A better knowledge of genetic diversity of L. chinensis could be valuable in the efficient utilization, conservation and management of germplasm collections. Genetic diversity in thirty‐seven morphological characters of 293 accessions was assessed in three successive years. Based on these qualitative and quantitative characters, the genetic diversity indices (Shannon indices) of traits and geographical populations were estimated, and a principal coordinates analysis and a path analysis were undertaken. Compared with the yellow‐green type of L. chinensis, the grey‐green type had significantly (P < 0·05) more genetic diversity. In addition, the path analysis suggested that the combined effects of genetic diversity and vegetative traits could explain 0·206 of the total variance in plant reproductive traits. The highest Shannon genetic diversity index of accessions (H = 2·252) was observed in accessions from the region of longitude of 124–128°E, suggesting the most abundant germplasm of L. chinensis in this region. 相似文献
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