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金鸡湖与尚湖中微生物数量及群落特征的研究 总被引：3，自引：0，他引：3
对苏州地区金鸡湖与尚湖水体中的微生物数量及种群组成的研究表明，异养细菌数金鸡湖比尚湖高，分别为1．7－26万个／mL和500－80000 个／mL，高峰期出现在10月份；放线菌和霉菌数量较少，金鸡湖为0－19个／mL和0－7个／mL，尚湖为1－25个／mL和0－37个／mL。从大肠菌群数看，金鸡湖明显高于尚湖，分别为350－16000个／L和20－250个／L， 表明金鸡湖接纳生活污水和施肥养鱼对大肠菌群数的升高至关重要；金鸡湖和尚湖水体 中分别检测出8个和9个属的异养细菌，优势菌分别为弧菌属、气单胞菌属、芽孢杆菌属和不动杆菌属、假单胞菌属、芽孢杆菌属。 相似文献
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采用细菌16SrDNA的PCR-RFLP技术,以西北地区土垫旱耕人为土为材料,模拟田间过量施肥水平,经室内恒温短期培养,研究了过量施肥下酰胺态氮、硝态氮和铵态氮对土壤细菌多样性的影响。结果显示：PCR-RFLP分析酰胺态氮（T1）、硝态氮（T2）和铵态氮（T3）过量施肥处理的细菌16SrDNA克隆文库,分别得到17、25和130个酶切分型,不施肥对照（CK1）和正常施肥对照（CK2）分别得到119和187个酶切分型,表明正常施肥处理的酶切分型最多,过量使用酰胺态氮和硝态氮减少了酶切类型,而过量施用铵态氮可以维持与不施肥对照相近的酶切类型数量。采用α多样性测度对试验结果进行分析统计表明,不同处理间土壤细菌的多样性指数（H＇、Ds）和物种丰富度指数（dM）a均为CK2〉T3〉CK1〉T2〉T1处理,表明合理施肥可显著增加土壤中细菌的多样性,而过量施用酰胺态氮则减少细菌的多样性,使用铵态氮处理可维持细菌多样性;除正常施肥对照（CK2）外,其余各处理都出现了优势菌种。通过对优势菌的16SrDNA序列比对发现,酰胺态氮处理都为未培养细菌,硝态氮处理和铵态氮处理的优势菌呈现了菌属多样性,前者包括变形菌门的假单胞菌属和寡养单胞菌属、芽单胞菌门的未培养芽单胞菌属和未培养土壤细菌,后者为未培养酸杆菌属、变形菌门寡养单胞菌属和厚壁菌门芽孢杆菌属,表明不同施肥方式改变了土壤细菌的群落结构。 相似文献
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通过16SrRNA高通量测序技术，以自然纳潮和微孔曝气两种水质调控方式池塘为对照，研究了养水机水质调控方式对春秋季刺参养殖池塘水细菌菌群结构的影响。结果表明：各池塘水前10优势门和前3优势纲组成基本一致，但优势属组成差异较大；试验后期（11月份），养水机池塘水与自然纳潮池塘水和微孔曝气池塘水中某些种群丰度具有明显的差异，养水机显著提高了池塘水乳酸菌目的丰度（lefse分析LDA Score＞4），分别提高了251和343倍，显著降低了交替假单胞菌科科和属的丰度（t-test检验），比自然纳潮池塘分别降低了4.1和5.4倍；各池塘水优势功能菌为化能异养12.78%～19.65%和好氧化能异养菌0.96%～4.97%，各功能菌丰度均值差异不显著，但试验后期养水机池塘水发酵菌和植物致病菌丰度增加明显，比自然纳潮池塘和微孔曝气池塘分别提高了32、50和159、216倍；硝酸盐还原菌丰度明显降低，分别降低了4.7和7.7倍；养水机池塘水α-多样性最高，养水机显著提高了池塘水乳酸菌和植物致病菌丰度，提高了细菌种群的α-多样性，前者抑制池塘大型藻生长，后者有益于水质稳定。 相似文献
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四川西北部主要森林植被类型土壤养分库比较研究 总被引：4，自引：0，他引：4
在四川西北部沿都江堰-映秀-小金在不同海拔梯度选择16个典型群落类型森林土壤测定了土壤有机碳、活性有机碳、有机质、全氮、全磷、全钾含量,揭示了该区域不同群落类型森林土壤氮储量及其垂直分布和土壤养分库状况,分析了不同群落类型土壤碳氮关系和碳氮与养分因子关系。结果表明,不同森林植被类型土壤氮储量差异明显,全氮含量在0.78～3.51g/kg,密度在0.77～2.84kg/m2。亚高山森林植被类型土壤的氮含量整体上高于低山森林植被类型;16种森林植被类型土壤养分库有明显差异,在36.07～73.45kg/m2之间。总体上原始天然林较人工林的土壤养分库高,反映出植被越原始则养分库越高,16种森林植被类型土壤中总有机碳、活性有机碳、碳库管理指数和全氮均表现出显著线性关系,其中活性有机碳含量为29.63%～87.00%,密度分配为29.49%～76.08%,以落羽杉人工林为参照碳库管理指数为70.63%～2 138.11%,碳库质量优良;碳氮比为6.89～13.80,对林木生长较为适宜。其成果为该区域森林经营和因5.12地震植被恢复和生态重建提供科学依据。 相似文献
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芒萁是最早侵入红壤退化裸地的先锋植物,其侵入过程对土壤环境的改变在退化裸地生态恢复进程中具有重要意义。以福建省长汀县红壤侵蚀裸地为研究对象,分析测定退化裸地中芒萁侵入区和非侵入区土壤理化性质和细菌组成及多样性。结果表明：芒萁侵入裸地显著提高土壤最大持水量、土壤含水率、全碳、全氮、全钾、有机质和pH,并显著降低土壤容重;芒萁侵入区增加根瘤菌目和慢生根瘤菌属等14种土壤优势细菌,变形菌门和甲型(α)变形杆菌的相对丰度显著提高(p<0.05),而土壤绿弯菌门和AD3菌纲的相对丰度显著降低(p<0.05),这些土壤细菌主要功能为化能异养、好氧化能异养和纤维素分解;芒萁侵入裸地显著提高土壤细菌群落结构多样性(p<0.05);芒萁侵入区和非侵入区土壤细菌群落结构差异显著(p<0.05);土壤细菌群落结构的主要影响因子是土壤含水率、全碳、有机质、土壤容重和pH。这些影响因子与疣微菌门、变形菌门、疣微菌纲和甲型(α)变形杆菌纲正相关。综上所述,芒萁侵入后可显著改善红壤侵蚀退化裸地的土壤理化性质,改善土壤细菌群落组成,增加土壤细菌群落多样性和优势菌群,对土壤细菌群落有积极效应。 相似文献
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红壤荒草地氨氧化细菌富集液16SrDNA文库的RFLP分析 总被引：6，自引：1，他引：6
分析红壤荒草地富集液中氨氧化细菌的种群组成,选取氨氧化细菌16S rDNA特异性引物序列,利用PCR技术对从富集液中抽提的细菌总DNA进行扩增,并建立了氨氧化细菌特异性的16S rDNA文库。用酶HhaⅠ和RsaⅠ对该文库特异性片段进行了限制性酶切片断长度多态性分析(Restriction fragment lengthpolymorphism,RFLP),随机挑选的35个特异性克隆片段被分成3个不同的RFLP类型,其中优势型占了所有分析克隆子的94%,另两个型各占3%。从每个RFLP类型中挑取一定的转化子进行测序,测序结果经GenBank检索,发现在该富集液体系文库中存在大量亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)细菌序列,由此推测红壤荒草地中存在氨氧化细菌,Nitrosomonas属细菌能在富集条件下成为优势菌。 相似文献
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土壤微生物是反映土壤环境质量的重要指标,为明确赤水河流域典型植被类型土壤微生物群落特征及优势菌属,为生态系统的恢复与管理提供理论依据,采用高通量测序技术研究了赤水河流域的5种典型植被类型(灌丛、针阔混交林、常绿阔叶林、杉木林和竹林)土壤的微生物群落结构及多样性,并探讨了其主要影响因子。结果表明:(1)不同植被类型的细菌和真菌丰富度Chao1指数差异均不显著,说明二者所观测到的物种总数没有差异。Shannon指数显示各植被类型微生物多样性存在一定差异,细菌多样性以竹林最低,显著性低于灌丛和针阔混交林(p<0.05); 真菌多样性以灌丛和杉木林显著性高于其他3种植被类型(p<0.05)。(2)5种植被类型土壤细菌优势门(相对丰度>10%)主要有变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteriota)和酸杆菌门(Acidobacteriota)。其中变形菌门(Proteobacteria)在灌丛、针阔混交林和常绿阔叶林中占绝对优势(相对丰度为29.70%～33.62%),而放线菌门(Actinobacteriota)则在杉木林和竹林中最为丰富,相对丰度占比分别为32.88%,29.88%。各植被类型土壤真菌门以子囊菌门(Ascomycota)为绝对优势菌群(相对丰度>49%)。(3)5种植被类型土壤细菌和真菌中优势菌属差异较大。在细菌属水平上,针阔混交林和竹林分别以未定名的Vicinamibacterales和芽孢杆菌属(Bacillus)为优势,而其他3种植被类型则以节杆菌属(Arthrobacter)最丰富。在真菌属水平上,灌丛和常绿阔叶林中优势关键属为子囊菌门(Ascomycota)未分类真菌属(unclassified_p_Ascomycota),杉木林以被孢霉属(Mortierella)最丰富,而针阔混交林和竹林中均以沙蜥属(Saitozyma)相对丰度最高。(4)NMDS分析表明,土壤细菌与真菌群落空间分布差异显著。(5)冗余分析表明,土壤含水量、pH值和TN(总氮)对土壤细菌群落结构具有显著性的影响,而pH值、容重、TOC(总有机碳)、TN和TP(总磷)对真菌群落结构影响显著。综合分析可知,针阔混交林土壤细菌群落较丰富,杉木林土壤真菌生长较旺盛,而灌丛土壤细菌和真菌多样性均较高,应采取有效措施提高主要林分土壤养分,从而激发微生物的生长,改善土壤环境。 相似文献
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异养硝化微生物的分子生物学研究进展 总被引：9，自引：2，他引：9
硝化作用是自然界N素循环的一个重要环节,对于农业生产、环境保护等都具有重要意义。除了传统上认为的自养硝化细菌以外,近几十年来已发现很多异养微生物和甲烷营养细菌可以进行硝化作用。现就异养硝化微生物的分子生物学研究作一综述。 相似文献
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Jing Wang Qian Liu Zucong Cai 《Acta Agriculturae Scandinavica, Section B - Plant Soil Science》2013,63(1):83-88
Land-use and management practices can affect soil nitrification. However, nitrifying microorganisms responsible for specific nitrification process under different land-use soils remains unknown. Thus, we investigated the relative contribution of bacteria and fungi to specific soil nitrification in different land-use soils (coniferous forest, upland fields planted with corn and rice paddy) in humid subtropical region in China. 15N dilution technique in combination with selective biomass inhibitors and C2H2 inhibition method were used to estimate the relative contribution of bacteria and fungi to heterotrophic nitrification and autotrophic nitrification in the different land-use soils in humid subtropical region. The results showed that autotrophic nitrification was the predominant nitrification process in the two agricultural soils (upland and paddy), while the nitrate production was mainly from heterotrophic nitrification in the acid forest soil. In the upland soils, streptomycin reduced autotrophic nitrification by 94%, whereas cycloheximide had no effect on autotrophic nitrification, indicating that autotrophic nitrification was mainly driven by bacteria. However, the opposite was true in another agricultural soil (paddy), indicating that fungi contributed to the oxidation of NH4+ to NO3?. In the acid forest soil, cycloheximide, but not streptomycin, inhibited heterotrophic nitrification, demonstrating that fungi controlled the heterotrophic nitrification. The conversion of forest to agricultural soils resulted in a shift from fungi-dominated heterotrophic nitrification to bacteria- or fungi-dominated autotrophic nitrification. Our results suggest that land-use and management practices, such as the application of N fertilizer and lime, the long-term waterflooding during rice growth, straw return after harvest, and cultivation could markedly influence the relative contribution of bacteria and fungi to specific soil nitrification processes. 相似文献
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Bacteria in peat forest soil play important role in global carbon cycling. The distribution of bacteria population in different peat soils as a whole and how forest management practices alter the bacterial populations are still poorly known. Using pyrosequencing analysis of 16S rRNA gene, we quantified the diversity and community structure of bacteria in eight peat forest soils (pristine and drained) and two mineral forest soils from Lakkasuo, Finland with either spruce-dominant or pine-dominant tree species. In total, 191,229 sequences which ranged from 15,710 to 22,730 per sample were obtained and affiliated to 13 phyla, 30 classes and 155 genera. The peat forest soils showed high bacterial diversity and species richness. The tree species seems to have more strong impact on the bacterial diversity than the type of peat soil, which drives the changes in bacterial community structure. The dominant taxonomic groups across all soils (>1% of all sequences) were Proteobacteria, Acidobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Planctomycetes and Verrucomicrobia. The relative abundance of bacteria phylum and genus differed between soil types and between vegetation. Significant differences in relative abundance of bacteria phyla were only found for Gemmatimonadetes and Cyanobacteria between the pristine and the drained peat forest soils. At genus level, the relative abundance of several genera differed significantly between the peat soils with same or different tree species, including Burkholderia, Caulobacter, Opitutus, Mucilanginibacter, Acidocella, Mycobacterium, Bradyrhizobium, Dyella and Rhodanobacter. 相似文献
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基于高通量测序研究草莓根际微生物群落结构和多样性 总被引：11，自引：3，他引：8
研究草莓根际土壤微生物群落组成和结构,对健康草莓土壤生态系统的构建和保持具有重要意义。以不同地区草莓根际土壤为研究样本,利用MiSeq平台Illumina第二代高通量测序技术并结合相关生物信息学分析土壤细菌16S rRNA基因V4+V5区域和真菌ITS1+ITS2区域的丰富度和多样性指数以及群落结构。结果表明:从15个草莓根际土壤样本中获得4554个细菌分类操作单元OTU和1298个真菌OTU,草莓根际土壤的优势细菌门为变形菌门、厚壁菌门、放线菌门、酸杆菌门和绿弯菌门,主要的优势细菌属有16种;优势真菌门为子囊菌门、接合菌门和担子菌门,主要的优势真菌属有8种。冗余分析(RDA)显示,全氮和pH对土壤微生物群落结构的影响最大,共解释了61%的群落变化,各因子的贡献率大小依次为土壤全氮pH有效磷全钾全磷有机质速效钾碱解氮;相关性分析也表明,土壤理化指标均与不同优势菌门存在密切的相关关系。本研究结果加深了对草莓根际微生物群落结构和多样性的认识,为深入研究草莓根际微生物多样性及功能与环境因子之间的关系提供了借鉴。 相似文献
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R. P. Griffiths E. R. Ingham B. A. Caldwell M. A. Castellano K. Cromack Jr 《Biology and Fertility of Soils》1991,11(3):196-202
Summary Specialized ectomycorrhizal fungi form dense mats in forest soils that have different enzyme levels, higher respiration rates, more biomass, different soil fauna, and different soil chemistry compared with adjacent soils not obviously colonized by these mats. In this study, mats formed by two genera of fungi collected in three locations were compared with a wide range of measurements. Per cent moisture, pH, chloroform fumigation-flush C, anaerobic N mineralization, exchangeable ammonium, and respiration, N2 fixation, and denitrification rates were compared between soils or litter colonized by ectomycorrhizal mat-forming fungi and adjacent non-mat material. Significant differences were observed between the two genera of mat-forming fungi and also between mats formed primarily in mineral soil and those formed in litter. These differences suggest that different mat-forming fungi perform different functions in forest soils and that these fungi function differently in mineral soil compared with litter.Published as Technical Paper 9496, Oregon Agricultural Experiment Station 相似文献
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黄河三角洲刺槐根际与非根际细菌结构及多样性 总被引：4，自引：0，他引：4
为精确分析黄河三角洲刺槐根际与非根际土壤细菌群落定殖情况,本研究采用高通量测序方法对刺槐根际与非根际土壤细菌结构及多样性进行了研究。研究表明,根际土壤细菌共有36门214属,非根际土壤细菌共有33门153属。变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)细菌丰度超过15%,是根际与非根际土壤中的优势菌落。根际与非根际土壤中酸杆菌门、硝化螺旋菌门(Nitrospirae)丰度差异显著。根际土壤中红游动菌属(Rhodoplanes)、溶杆菌属(Lysobacter)、热单胞菌属(Thermomonas)、链霉菌属(Streptomyces)及非根际土壤中红游动菌属、溶杆菌属、链霉菌属、Kaistobacter细菌丰度超过4%。根际土壤中固氮菌丰度显著高于非根际土壤,解磷、解钾细菌丰度差异不显著。根际与非根际土壤细菌Chao丰富度分别为2 054、2 376,差异显著。根际与非根际土壤细菌之间的权重(Weighted Unifrac)距离在0.12~0.25之间。综上所述,黄河三角洲刺槐根际与非根际土壤细菌结构具有一定差异,多样性差异显著。 相似文献
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施肥及秸秆还田对砂姜黑土细菌群落的影响 总被引：18，自引：1，他引：18
利用Illumina平台Miseq高通量测序技术对小麦分蘖期砂姜黑土耕层土壤细菌进行高通量测序,结合相关生物信息学分析,探讨了不施化肥秸秆不还田(CK)、施化肥秸秆不还田(F)以及不施化肥秸秆还田(W)3种处理土壤细菌群落组成、多样性和结构的变化。结果显示,测序共获得14 873个OTUs,计173 323条读数,平均读长439 bp。砂姜黑土细菌优势门(相对丰度10%)为变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes);优势纲(相对丰度10%)为α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria)、酸杆菌纲(Acidobacteria)、鞘脂杆菌纲(Sphingobacteriia)和γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria);优势属(相对丰度1%)共47个,3个处理中均有分布的优势属21个,F处理的细菌优势属的种类最多,为39个。相对丰度最大的门、纲和属分别是变形菌门(38.7%~43.1%)、α-变形菌纲(14.5%~18.1%)和鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)(4.6%~7.7%)。F处理细菌丰富度指数(Chao1指数和ACE指数)显著低于CK及W处理,W处理和CK处理土壤细菌丰富度指数无显著差异,与CK处理相比,F处理ACE指数降低22.8%。W处理土壤细菌Shannon多样性指数显著大于CK及F处理,W处理Shannon指数较CK处理提高4.1%,而F处理土壤细菌Shannon指数与CK处理无显著差异。F处理Simpson指数显著高于CK及W处理;F处理Simpson指数较CK处理提高38.1%,而W处理细菌Simpson指数最小,显著低于CK处理,较CK降低23.8%。分层聚类图显示在属的水平上,W处理和CK处理土壤细菌群落结构相似性较高,F处理与CK处理及W处理细菌群落结构差异较大。施化肥对土壤细菌优势类群组成、相对丰度及群落结构的影响大于秸秆还田,施化肥显著降低了土壤细菌丰富度,秸秆还田显著提高了土壤细菌的多样性。 相似文献
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浙江省丽水不同前茬杉木林土壤性质与林木生长 总被引：2，自引：0，他引：2
重点论述浙江省丽水地区花岗岩立地条件下不同前茬的杉木林的土壤性质变化及其与林木生长的关系。研究结果表明 ,前茬是马尾松、阔叶树和灌丛的杉木生长量均比连茬杉木林高 ,树龄 5a之后 ,差异十分显著。在不同前茬的杉木林土壤中细菌、真菌和固氮菌数量以连茬杉木林土壤最低 ,只是放线菌数量并不低 ;和其他不同前茬的杉木林土壤相比 ,连茬杉木林土壤中转化酶活性和脲酶活性较低 ,连茬杉木林土壤速效磷含量明显低于其他不同前茬杉木林样地土壤 ,Ca2 、Mg2 含量也有类似的规律。逐步回归分析结果显示 ,不同前茬杉木林土壤转化酶活性、速效氮、速效钾及Mg2 含量与林木生长呈正相关 ,有机质、脲酶及过氧化氢酶活性与林木生长呈负相关 相似文献
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对油田高矿化度废水不同污染程度土壤中微生物调查研究结果表明,当旱地土壤中石油浓度＞0.5%、废水浓度＞0.1%时,对异养菌、放线菌和固N菌产生显著的抑制作用,而真菌、酵母菌数量随石油浓度的增高而增加,当水田中石油浓度＞3％时即对好气民养菌有显著抑制作用,废水浓度＞0.1%时即对厌氧异养菌和施线力产生显著抑制作用。 相似文献