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1.
根据近缘种间同源基因序列保守的原理,设计20对可用于扩增菌草PEPC基因的特异性PCR反应引物。利用PCR-RFLP技术对46份菌草种质资源进行PEPC基因多样性分析。结果表明：12对引物可对供试材料实现有效特异性扩增,PCR产物经限制性核酸内切酶Hae III酶切,在46份材料上共给出176(平均每对引物14.7)个变异类型。UPGMA聚类分析结果表明,材料间遗传相似系数(SM)在0.86～1,在遗传相似系数为0.865时,46份材料可分为四大类群,这表明PCR-RFLP技术可有效用于菌草资源的遗传多样性分析。 相似文献
2.
应用SCoT标记对不同来源的28份木薯种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明：从36条引物中筛选出19条重复性好、条带清晰的引物对28份木薯材料进行PCR扩增。共扩增出171条带,其中多态性条带123条,平均每条引物扩增多态性条带6.5条,多态性条带比率为71.9％。经NTSYS-pc2.10e软件计算分析,28份木薯种质间遗传相似系数在0.631~0.930之间。利用UPGMA法进行聚类的结果显示：在系数0.68处,木薯材料分为2大类,品种BRA354单独成为一类;在系数为0.734处,28份木薯种质资源主要聚为5大类,聚类结果与材料来源有一定相关性。SCoT标记能在木薯种质间检测出一定程度的遗传多样性,可为木薯遗传育种提供新的技术支持。 相似文献
3.
为研究西藏白菜型黄籽油菜种质资源的遗传多样性，提高其育种利用效率。采用SCoT标记方法，对30份白菜型黄籽油菜种质资源进行遗传多样性分析，并结合生物学特性信息进行综合分析。通过对50条SCoT标记引物的筛选，获得24条重复性好、多态性高、遗传信息丰富的引物，并对参试种质资源进行PCR扩增，共获得214个DNA位点，其中具有多态性的位点有182个，平均多态性位点百分率为87.33%。应用NTSYSPc 2.10e软件分析得到，供试种质资源的相似系数在0.473～0.930之间，进行非加权组平均法（UPGMA）聚类分析得出树状图，在相似系数为0.797时，可将30份材料完全区分成5组。结果表明，西藏白菜型黄籽油菜之间的遗传多样性较为丰富，并综合生物学特性和分子水平试验研究，发现塔巴寺黄籽油菜某些性状与芥菜型油菜相似，初步认为塔巴寺黄籽油菜可能是与芥菜型油菜杂交的后代或者本身就携带类似芥菜型油菜的隐性基因，此假设可在后期分子水平实验中进一步论证。 相似文献
4.
利用SCoT标记对来源于四大洲的46份牛鞭草（Hemarthria spp.）种质资源[包括36份高牛鞭草（Hemarthria altissima）、8份扁穗牛鞭草（Hemarthria compressa）及2份Hemarthria uncinata]的遗传多样性和亲缘关系进行了研究。从48条SCoT引物中筛选出条带清晰、多态性好和重复性好的22条,对46份牛鞭草（Hemarthria spp.）种质资源进行扩增。结果表明：共获得597条带,多态性比率（PPB）为89.1％,平均每条引物扩增多态性条带24.3条,多态信息含量（PIC）范围为0.443~0.877,平均0.623。46份牛鞭草种质资源平均Nei's基因多样性指数为0.273,平均Shannon信息指数为0.486,表明46份牛鞭草种质资源具有丰富的遗传多样性。供试材料间的遗传相似系数介于0.611~0.943之间,聚类分析和主成分分析结果高度相似,基本将供试材料按牛鞭草种类及地理来源分为4大类,表明46份牛鞭草种质资源的遗传多样性与牛鞭草种类及其地理来源具有一定的相关性。可见,SCoT能用于牛鞭草种质资源遗传多样性研究,是一种有效的分子标记。本研究将有利于牛鞭草种质资源的收集及评价利用。 相似文献
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割手密种质资源遗传多样性的ISSR分析 总被引：1，自引：0，他引：1
为探讨国内割手密种质资源的遗传多样性,本研究采用ISSR分子标记对采自8省的52份割手密种质资源进行了分析。结果表明,22条ISSR引物共扩增出127条条带,其中多态性条带121条,多态率达95.3%。材料间遗传相似系数GS在0.60~0.91之间。UPGMA聚类分析结果表明:在遗传相似系数0.72时52份材料可分为4大类;ISSR分析结果显示,割手密遗传多样性丰富,可以用ISSR对割手密进行分子水平的鉴定和遗传多样性研究。 相似文献
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基于SCoT标记的福建茶树品种（系）遗传多样性分析 总被引：1，自引：0，他引：1
利用SCoT标记对福建茶树资源进行分析,构建适用于福建茶树资源SCoT-PCR扩增体系。从38条SCoT引物中筛选出的16条多态性引物,构建了55份茶树品种（系）的SCoT标记指纹图谱。对55份材料共扩增出219条条带,多态性条带为216条,平均每条引物扩增出13.8条,多态性比率PPB为93.15%,55份供试材料的遗传相似系数（Genetic similarity, GS）介于0.49~0.85,平均为0.67。SCoT标记分析55份供试材料共两个群体的观测等位基因数Na为1.93,有效等位基因数Ne为1.54,Nei基因多样性为0.32,香农指数Shannon为0.48,遗传分化Gst为0.067,基因流Nm为7.01。在遗传相似系数为0.64处,将55份茶树资源分成2大类。 相似文献
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橡胶树抗寒种质遗传多样性分析 总被引：2，自引：1，他引：1
应用RAPD和ISSR技术对20份橡胶树抗寒种质进行遗传多样性分析。结果表明，16个RAPD引物和12个ISSR引物分别扩增出条带113和101条，多态性条带指数(PPB)分别为61.1%和63.4%。据Nei-Li相似系数，ISSR标记在相似系数约0.74处，可将20份材料分为野生种质和栽培种质两大类；RAPD标记在相似系数约0.70处，也可将供试材料分为野生种质和栽培种质两类，但只有XJ002420为野生种质。对2种标记的分析结果进行相关分析，结果表明，RAPD和ISSR所检测的遗传相似系数呈极显著正相关，相关系数为0.672。以上结论表明，RAPD和ISSR标记可用于橡胶树种质资源的遗传多样性研究，但鉴于ISSR较RAPD有更强的多态性检出能力，ISSR技术应作为遗传多样性研究的首选单引物标记。 相似文献
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采用SRAP分子标记对134份木薯种质资源进行的遗传多样性分析,36对多态性引物对全部材料进行扩增,共获得348个稳定的谱带,其中多态性谱带306条(占87.9%),平均每对引物扩增条带数和多态性带数分别为9.7个和8.5个。应用Nei’s相似系数法估算了134份材料间的相似系数为0.536～0.971,说明木薯种质资源间的遗传基础一般。聚类分析将全部材料划分为8个组群,结合PCA分析说明,分组群体构成与其品系的地理来源具有一般相关性。平均遗传多样性指数为0.4630,各个组内存在差异,以第1、5组较高,分别由我国的自育品种和来自南美洲的品系构成。研究结果较全面反映了中国现有木薯种质资源遗传多样性特点,为我国进一步引进木薯优良资源,以及优异木薯基因资源挖掘和育种利用提供了理论借鉴。 相似文献
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菠萝蜜种质资源遗传多样性的SRAP分析 总被引：1，自引：0，他引：1
利用SRAP标记技术，对46份菠萝蜜种质资源进行遗传多样性研究。结果表明：20对SRAP引物组合共扩增出257条带，其中多态性条带194条，多态位点比率为75.5％，平均每对引物扩增条带数和多态性条带数分别为12.9条和9.7条。Shannon 遗传多样性指数I为0.365 7，Nei’s基因多样性指数H为0.241 4，表明供试样品遗传多样性不丰富。46份菠萝蜜种质间的遗传相似系数在0.674 8～0.975 5之间，平均为0.775 8，说明种质资源的亲缘关系较近。通过UPGMA构建树状图，当相似系数为0.771 0时，菠萝蜜种质资源可分为6个类群，我国的种质资源和东南亚来源的种质相对分开聚类，来源地相同或较近的种质表现出了较为亲密的亲缘关系。 相似文献
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选用6份有代表性的陕西茶树资源材料,从121条SCo T引物中筛选出38条扩增条带清晰、多态性高的引物,对陕西省50个茶树资源进行遗传多样性研究。结果表明,SCo T标记能够揭示材料间较高的遗传多样性,每条引物可检测到4~17个等位位点,平均为11个,38条SCo T引物共扩增出414条DNA片段,其中400条具有多态性,多态性比率(PPB)为96.62%。每个SCo T位点的遗传多态性信息含量在0.56~0.99之间,平均为0.90。供试材料的遗传相似系数集中在0.59~0.71之间。研究表明,SCo T标记可以用来对茶树进行遗传基础研究,基于SCo T标记的陕西省主要茶树资源遗传多样性较高。 相似文献
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我国甜菜多倍体品种的RAPD分析 总被引：4，自引：2，他引：2
利用RAPD分子标记技术对15个甜菜多倍体品种进行了遗传分析。从以前在甜菜中使用过的14个随机引物中筛选出具有非常明显多态性的引物8个,它们在多倍体品种间共扩增出47条不同位置的带,平均5.9条,特异带32条,特异带比率为68%;两个“双引物”共扩增出10条带,公共带仅1条,多态性频率高达90%。15份材料的遗传相似系数在0.75￣0.99。经聚类分析,可将这些材料分成5个组。RAPD聚类结果基本与血缘、系谱及其在生产实践中的表现相吻合,但也有例外。从分子水平上进一步证明了我国糖甜菜育种中存在的遗传材料基础狭窄的问题。 相似文献
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利用目标起始密码子(SCo T)标记对159份1923-2005年育成的中国黄淮海和南方大豆育成品种进行遗传多样性分析。从80条目标起始密码子(SCo T)标记引物中筛选出27条引物,27条引物共扩增出130条DNA条带,其中多态性条带110条,多态性比率为84.62%。Nei's基因多样性变化范围为0.24~0.49,平均为0.37;平均多态信息含量(PIC)为0.27。黄淮海大豆育成品种的Nei’s基因多样性指数和Shannon信息指数的平均值和变幅范围略高于南方品种,黄淮海大豆育成品种平均值多态信息含量(PIC)也略高于南方品种,但变幅范围略低于南方品种。基于SCo T标记遗传距离的聚类分析表明:I类群中99个主要是黄淮海大豆育成品种,Ⅱ类群中60个主要是南方大豆育成品种。随着时间的推移,大豆育成品种的遗传多样性呈递增趋势,至1971-1990年达到最高并保持不变,表明自70年代以来大豆育成品种遗传基础有所拓宽。结果表明SCo T可用于大豆育成品种遗传多样性研究,为拓宽大豆育成品种遗传基础提供重要参考。 相似文献
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凤凰单丛茶树资源遗传多样性的ISSR分析 总被引：3，自引：0，他引：3
采用ISSR分子标记技术对48份凤凰单丛茶品种(系)进行了遗传多样性分析。选用10个多态性高、分辨力强的ISSR引物分别对供试材料基因组DNA进行扩增,共获得121个位点,其中多态位点带98个,多态位点比率(PPB)为81.0%。品种(系)之间的遗传相似系数变化范围在0.590 9~0.967 4之间。UPGMA聚类分析结果表明,在GS值为0.792的水平上供试材料可划分为7大类,其亲缘关系远近与地理来源关系不大且与香味类型没有必然的联系。 相似文献
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《作物学报(英文版)》2015,(5)
Genetic diversity analysis and DNA finger printing are very useful in breeding programs,seed conservation and management. Jute(Corchorus spp.) is the second most important natural fiber crop after cotton. DNA fingerprinting studies in jute using SSR markers are limited. In this study, 58 jute accessions, including two control varieties(Huangma 179 and Kuanyechangguo) from the official variety registry in China were evaluated with 28 pairs of SSR primers. A total of 184 polymorphic loci were identified. Each primer detected 3 to 15 polymorphic loci, with an average of 6.6. The 58 jute accessions were DNA-fingerprinted with 67 SSR markers from the 28 primer pairs. These markers differentiated the 58 jute accessions from one another, with Co SSR305-120 and Co SSR174-195 differentiating Huangma 179 and Kuanyechangguo, respectively. NTSYS-pc2.10 software was used to analyze the genetic diversity in the 58 jute accessions. Their genetic similarity coefficients ranged from 0.520 to 0.910 with an average of 0.749, indicating relatively great genetic diversity among them. The 58 jute accessions were divided into four groups with the coefficient 0.710 used as a value for classification, consistent with their species and pedigrees. All these results may be useful both for protection of intellectual property rights of jute accessions and for jute improvement. 相似文献
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广东地区野生狗牙根遗传多样性的ISSR分析 总被引：3，自引：0，他引：3
应用ISSR标记,对广东地区30份野生狗牙根进行遗传多样性研究。从50个ISSR引物中筛选出15个多态性明显、反应稳定的引物,共扩增出151条谱带,平均每个引物能扩增出10.07条带,其中多态性条带总数为142条,多态性条带比率达93.7%。材料间遗传相似系数GS=0.58278～0.92715。基于遗传相似系数,利用UPGMA聚类分析表明,供试材料可聚为4类。POPGENE分析软件结果表明,平均Shannon信息指数I=0.5689,平均Nei's基因多样性h=0.3813,每位点平均有效等位基因数ne=1.6196。 相似文献
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Fatemeh Nejatzadeh-Barandozi Mohammad Reza NaghaviSattar Tahmasebi Enferadi Amir MousaviYounes Mostofi Mohammad Esmaiel Hassani 《Industrial Crops and Products》2012,37(1):347-351
In this study, genetic diversity of 10 accessions of Aloe vera, collected from different parts of Iran, were evaluated using horticultural and random amplified polymorphic DNA (RAPD) data. Statistical analysis showed significant differences for all horticultural characteristics among the accessions, suggesting that selection for relevant characteristics could be possible. The analysis of molecular diversity was used the RAPD technique, with 10 random primers of 10-mer oligonucleotides. Out of the 10 primers, five were polymorphic, producing 269 DNA bands, 189 of which were polymorphic among accessions. A dendrogram was prepared on the basis of a similarity matrix using the Unweighted Pair Group Method Arithmetic Mean (UPGMA) algorithm, separating the 10 accessions into two groups. Results show that both environmental and genetic factors are effective in observing variations. Our results also indicate that the RAPD approach, along with horticultural analysis, seemed to be best-suited for assessing with high accuracy the genetic relationships among distinct A. vera accessions. 相似文献