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旨在探究大熊猫粪便中微生物组成以及耐药基因和寄生虫的真实情况。采集6只健康成年大熊猫的新鲜粪便,利用宏转录组学测序技术分析大熊猫粪便微生物组成及功能、耐药基因种类、丰度和寄生虫的组成,探讨优势细菌与耐药基因的相关性。结果表明,大熊猫粪便内微生物种类多样,包括细菌、真菌和病毒等,但以细菌为主。在门水平上,细菌类群中厚壁菌门（Firmicutes）和变形菌门（Proteobacteria）为优势菌门,在真菌菌门中担子菌门（Basidiomycota）、子囊菌门（Ascomycota）和毛霉亚门（Mucoromycota）相对丰度较高,雌性和雄性大熊猫粪便菌群丰度没有显著性差异（P>0.05）。Unigenes功能分析表明,大熊猫粪便微生物的功能主要涉及碳水化合物、氨基酸代谢等过程。在大熊猫粪便中共检测出25大类、304种耐药基因,其中,外排泵类基因的种类最多、相对丰度最高。此外,在大熊猫粪便中共发现63属126种寄生虫,寄生虫种包括线虫、绦虫和吸虫,其中,线虫为优势虫种。通过相关性分析发现,链球菌属（Streptococcus）、埃希杆菌属（Escherichia）、肠球菌属（Enterococcus）、苏黎世杆菌属（Turicibacter）与外排泵类、喹诺酮类、四环素类、糖肽类、多肽类和磺胺类耐药基因呈显著正相关性（P<0.05）。本研究从宏转录组水平揭示了大熊猫粪便中微生物、耐药基因组成以及寄生虫种类,对大熊猫微生物相关疾病和寄生虫病防控具有重要意义。 相似文献
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2018年10月贵州省从江县某水产养殖专业合作社鲤爆发死亡,本研究对死亡病例进行了流行病学调查、病理学观察、寄生虫学检查、细菌分离鉴定和病毒PCR检测等诊断。结果显示:病鲤病变以鳃丝溃烂、体表出血、肛门红肿和眼球凹陷为主要特征,组织的主要病变是肾小球萎缩出血、肾小囊空腔、鳃丝肿胀粘连及上皮细胞脱落等;细菌分离培养可得到圆形凸起、表面光滑的灰白色菌落,经染色镜检、生理生化鉴定和16S rRNA基因测序分析,鉴定该分离菌为嗜水气单胞菌;PCR检测显示鲤浮肿病毒(Carp edema virus,CEV)为阳性,未检出鲤春病毒血症病毒(Spring viremia of carp virus,SVCV)和鲤疱疹病毒(Koi herpesvirus,KHV);显微镜观察亦未见到寄生虫虫体;分别取分离菌和鲤浮肿病毒阳性病例组织悬液进行人工感染试验,均可引起健康鲤发生死亡。上述结果表明,从江县鲤的死亡是嗜水气单胞菌和鲤浮肿病毒混合感染所致。 相似文献
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卧龙自然保护区大熊猫粪样菌群的分离鉴定与分布研究 总被引：8，自引：0，他引：8
对四川卧龙中国保护大熊猫研究中心 6只不同年龄的健康大熊猫全年粪样内好氧和兼性厌氧菌的数量、种类和分布情况进行了初步研究。研究发现 ,全年粪样所含细菌数在 10 3cfu/g～ 10 7cfu/g之间 ,其中 ,亚成年大熊猫全年粪样含菌量为 7 3× 10 5cfu/g ,成年大熊猫为 7 8× 10 5cfu/g ,老年大熊猫为 2 0× 10 6 cfu/g。粪样中共分离鉴定出 16种细菌 ,优势菌群分别为肠球菌(4 0 2 % ) ,肠杆菌 (36 7% )和乳杆菌 (17 8% )。这些菌株的分离鉴定为研究大熊猫肠道内正常菌群的种类和分布 ,为今后进一步研究野外自然生态环境下大熊猫肠道正常菌群的种类和分布 ,为预防大熊猫感染细菌性疾病和亚成年大熊猫食性转换期食物结构的合理搭配提供了参考资料。 相似文献
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成年雄性大熊猫患病死亡，剖检：心、肝、肺肿大郁血，伴有胸水和腹水，从心、肝、肺、脾、肾和胸水中分离到纯粹的醋酸钙不动杆菌，该菌在加有1％醋酸钙的肉汤中培养后增菌1倍，该菌对丁胺卡那霉素、磺胺等敏感，对青霉素不敏感。不动杆菌为机会致病菌，广泛分布于自然界，少有致病性，但该菌株毒力很强，以0.001ml菌液腹腔注射小白鼠于20h内死亡，该菌是卢大熊猫死亡的致病菌。 相似文献