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1.
为了研究牦牛Ihh基因多态位点基因型组合与生产性状间的相关性,发现与牦牛生产性状相关的分子标记,同时进一步研究Ihh基因在牦牛和黄牛各个组织的分布和表达,试验采用高分辨率熔解曲线分析技术(High resolution melting curve,HRM)进行基因型分型和统计等位基因频率,同时,运用荧光定量PCR分析Ihh基因在牦牛和黄牛不同器官的表达差异。试验结果表明,Ihh基因在牦牛和黄牛的所有组织中均表达。然后采用SHEsis和PHASE软件对Ihh基因多态位点进行配对连锁不平衡和单倍型分析,采用SPSS17.0进行多态位点单倍型组合与生产性状关联性分析。结果检测到牦牛Ihh基因外显子3的2个多态位点5855(C/T)和6383(G/A)。群体遗传学分析显示,2个多态位点均表现为高度多态(PIC0.25);χ2检验表明,甘南牦牛和大通牦牛群体在两个突变位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P0.05),而天祝牦牛在2个突变位点处未达到Hardy-Weinberg平衡(P0.05);多态位点配对连锁不平衡分析发现,2个突变位点之间存在强连锁平衡,有4种单倍型组合;基因型组合主要发现了3种。关联分析表明,Ihh基因2个突变位点的3种基因型组合对牦牛体斜长、体高、胸围、管围和体重有显著差异(P0.05),具有CTGA基因型组合的牦牛个体在体斜长、体高、胸围、管围和体重方面显著高于CCGG和TTAA型(P0.05)。因此,综上推断Ihh基因基因型组合与牦牛体斜长、体高、胸围、管围和体重存在相关性。 相似文献
2.
苏淮猪是我国培育的一个优良品种,具有肉质好、抗逆性强等优良特性,但生长相对较慢,瘦肉率偏低,导致养殖效益偏低,改良其体型、生长等性能指标对苏淮猪的推广具有重要意义。该实验中首先测量了354头苏淮母猪的部分体尺,对其体尺性状进行了表型相关分析。性状相关分析结果表明苏淮母猪体长与体高、胸围、腹围、管围极显著相关(P0.01);体高与体长、胸围、腹围、腿臀围极显著相关(P0.01);胸围与体长、体高、腹围、腿臀围极显著相关(P0.01);腹围与体长、体高、胸围、腿臀围极显著相关(P0.01);管围与体长极显著相关(P0.01);腿臀围与体高、胸围、腹围极显著相关(P0.01)。利用网上已有的猪基因组测序数据,对RasGRP1基因进行了选择信号分析,结果表明RasGRP1基因在西方猪种中受到高强度选择。通过对RasGRP1基因启动子区域G/A多态位点进行PCR-RFLP分型,结果表明,在苏淮母猪群体中存在多态,其中A等位基因频率为0.672 3,为优势等位基因;关联分析结果显示RasGRP1基因G/A多态与苏淮母猪体高呈显著关联(P0.05),与管围关联接近显著(P=0.054 8)。其中,AG型个体的体高及管围性状均值均高于GG型个体(P0.05),但AA和GG个体间差异不显著(P0.05),这表明该位点对体尺性状的效应主要是由非加性效应导致的。该实验结果为苏淮母猪种质特性研究提供了基础数据。 相似文献
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鲁西黄牛GH基因3′末端序列多态性及其与生产性状的关联分析 总被引：1，自引：0，他引：1
本研究检测了鲁西黄牛GH基因3′末端序列的多态性,并分析了其与生产性状的相关性。结果发现,由于2639 bp处碱基C→G的突变造成HaeⅢ内切酶增加了一个酶切位点,该位点检测到AA、AB、BB 3种基因型。利用最小二乘拟合线性模型对GH基因多态位点不同基因型与生产性状指标进行显著性检验,结果发现,GH位点上AB基因型的体重、体高、体斜长、胸围和肉用指数显著高于AA、BB基因型(P0.05);BB基因型的个体体重、体高、体斜长、胸围和肉用指数略高于AA基因型,但差异不显著(P0.05)。因此,等位基因B可初步确定为影响牛体重、体高、体斜长、胸围和肉用指数的优势基因。 相似文献
5.
为了探寻影响杜寒杂交羊体尺性状的遗传标记，试验通过Multiplex SNaPshot技术对72只6月龄杜寒杂交羊的HMGA1、HMGA2、PLAG1和BMPR1B四个影响体型大小的候选基因中的20个SNPs位点进行了基因型分型，应用PLINK v1.07软件对单核苷酸多态性(SNPs)位点与体尺性状(体斜长、体高和管围)进行单点关联分析，利用Excel软件进行等位基因替代效应分析，并应用HaploView version 4.2软件进行单倍型构建及连锁不平衡分析。结果表明：除2个SNPs位点外，其他18个SNPs位点均存在突变基因型。HMGA1基因上游的rs405972023位点与体斜长和管围呈显著相关(P<0.05),rs404165907位点与体斜长呈显著相关(P<0.05);HMGA2基因第2内含子区域的rs399648873位点和该基因上游rs409565324位点与体高呈显著相关(P<0.05);位于PLAG1和BMPR1B基因及其周边区域的SNPs位点与杜寒杂交羊体尺性状未呈现显著相关(P>0.05)。HMGA1基因rs405972023位点TT基... 相似文献
6.
试验旨在探讨心脏脂肪酸结合蛋白(heart fatty acid-binding protein,H-FABP)基因在绵羊中的遗传多态性,并寻找可用于辅助选择的分子标记。本研究以滩羊(250只)及滩羊×湖羊杂交F1代(174只)为试验动物,利用SNaPshot分型技术对H-FABP基因(GenBank登录号:AY157617)的多态位点进行单核苷酸多态性(SNP)分析,统计基因频率和基因型频率,进行Hardy-Weinberg平衡性检测,计算期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ne)等遗传多态指标,分析候选基因不同基因型与体重、体长、体高、胸围、胸深、胸宽和管围等生长性状的关联性。结果显示:(1)检测到9个多态位点:939[A/G]、980[G/A]、1018[T/C]、2878[C/T]、2956[C/T]、3017[G/A]、3341[G/C]、3394[T/A]、1056[-/G],其中有6处转换、2处颠换、1处单碱基插入。(2)939[A/G]、980[G/A]、2956[C/T]、3341[G/C]、3394[T/A]和1018[T/C]的He为0.3200~0.4666,PIC为0.2688~0.3577;2878[C/T]、3017[G/A]位点的He为0.0283~0.1272,PIC为0.0279~0.1191,为低度多态;1056[-/G]位点的He在滩羊、滩羊×湖羊杂交F1代群体中分别为0.0120和0,PIC在滩羊、滩羊×湖羊杂交F1代群体中分别为0.0119和0;9个多态位点在滩羊、滩羊×湖羊杂交F1代群体中均符合Hardy-Weinberg平衡定律。(3)5个多态位点:939[A/G]、980[G/A]、2956[C/T]、3341[G/C]、3394[T/A]处于紧密连锁(D’0.99),将H-FABP基因分为3个单倍型:AA、AB和BB。(4)在41只滩羊×湖羊杂交F1代羊中,BB单倍型在各生产性状上具有最大值,但各单倍型间差异不显著(P0.05)。结果表明,绵羊H-FABP基因具有丰富的遗传多态性,939[A/G]、980[G/A]、2956[C/T]、3341[G/C]、3394[T/A]5个位点紧密连锁,BB单倍型可能是与绵羊生产性状相关的优势单倍型。 相似文献
7.
李突純良欧阳晓芳等 《上海畜牧兽医通讯》2014,(1):32-35
为了研究云南省肉牛杂交改良效果,筛选适合云南地区肉牛杂交最佳组合,为今后开展肉牛杂交工作和制定肉牛改良技术路线提供参考。通过4年的试验研究,测定分析了BMY本、西本、短本F1牛和本地牛(滇中牛)的初生、6月龄、12月龄、18月龄牛体重和体尺指标(体斜长、体高、胸围、胸宽、胸深、管围、腹围、臀围、腰角宽、尻长和十字部高)及对当地气候的适应性能。结果显示:3个杂交组合F1代不同年龄的生长速度和体尺指标均显著优于滇中牛,说明肉牛改良效果显著,其中西本F1代的杂种优势最显著。 相似文献
8.
《畜牧与兽医》2017,(10):8-12
为了研究延边黄牛肌联蛋白(Titin,TTN)基因的多态性对延边黄牛生长性状的影响,选取208头健康的32月龄延边黄牛,利用PCRRFLP和PCR-SSCP方法进行TTN基因遗传变异检测。结果表明:延边黄牛TTN基因存在2个突变位点,分别为A47751G突变,导致氨基酸Ile→Val的错义突变,C73301A同义突变;χ2检验显示,2个突变位点在所检测延边黄牛群体中处于Hard-Weinberg平衡状态(P005);关联分析显示,延边黄牛TTN基因2个突变位点的不同基因型与体高、体斜长、胸围和尻长上差异显著(P005)。将2个突变位点合并基因型分析结果表明,组合AACC基因型个体在体高和体斜长显著高于AATT型个体(P005),初步认为TTN基因对延边黄牛生长性状的有显著影响,其中组合AACC可能是影响延边黄牛生长性状的最佳基因型组合。 相似文献
9.
【目的】 检测牦牛结缔组织生长因子（CTGF）和G蛋白调节诱导神经突增生家族亚型因子3（Gprin3）基因的单核苷酸多态性（SNP），并分析多态位点与牦牛体尺性状的关联性。【方法】 以西藏的斯布牦牛、帕里牦牛、类乌齐牦牛、申扎牦牛及四川的麦洼牦牛5个类群260头个体为研究对象，利用基因池筛选技术检测CTGF、Gprin3基因SNP位点，分析其多态信息含量、有效等位基因数、纯合度及杂合度等指标，利用最小二乘线性模型分析不同基因型与牦牛体尺性状的关联性。【结果】 牦牛CTGF基因存在3个SNPs位点，分别为T1537A、C2195T和C2421T，均位于内含子区，其中T1537A位点在斯布牦牛和麦洼牦牛中均处于Hardy-Weinberg平衡状态，而在帕里牦牛、类乌齐牦牛和申扎牦牛中均偏离Hardy-Weinberg平衡状态，该位点与牦牛体高呈显著相关（P<0.05）；C2195T位点在5个牦牛类群中均处于Hardy-Weinberg平衡状态，且处于中度多态（0.25<PIC<0.5）；C2421T位点在5个牦牛类群中均处于Hardy-Weinberg平衡状态，该位点与牦牛体重、体斜长、胸围、管围和前肢长均呈显著相关（P<0.05）。牦牛Gprin3基因共发现4个SNPs，分别为G310C、C414T、C1100T和G1213A，其中G310C、C414T及C1100T位点在5个牦牛类群中均处于Hardy-Weinberg平衡状态；G1213A位点在类乌齐牦牛中偏离Hardy-Weinberg平衡状态，在其余4个类群中均处于Hardy-Weinberg平衡状态；G310C位点在5个牦牛类群中均处于低度多态（PIC<0.25），C414T和C1100T位点在类乌齐牦牛、斯布牦牛中均处于中度多态，G1213A位点在类乌齐牦牛中处于中度多态，在其余牦牛类群中为低度多态；C414T位点与牦牛体重、体高、体斜长和胸围均呈显著相关，而在斯布牦牛和申扎牦牛中C1100T位点与其胸围和前肢长均呈显著相关（P<0.05）。【结论】 牦牛CTGF和Gprin3基因具有丰富的多态性，CTGF基因T1537A、C2421T位点及Gprin3基因C414T、C1100T位点均与牦牛体尺性状有关，可作为影响生长发育性状的候选基因及基因座用于牦牛定向选育。 相似文献
10.
试验旨在探讨心脏脂肪酸结合蛋白（heart fatty acid-binding protein，H-FABP）基因在绵羊中的遗传多态性，并寻找可用于辅助选择的分子标记。本研究以滩羊（250只）及滩羊×湖羊杂交F1代（174只）为试验动物，利用SNaPshot分型技术对H-FABP基因（GenBank登录号：AY157617）的多态位点进行单核苷酸多态性（SNP）分析，统计基因频率和基因型频率，进行Hardy-Weinberg平衡性检测，计算期望杂合度（He）、多态信息含量（PIC）和有效等位基因数（Ne）等遗传多态指标，分析候选基因不同基因型与体重、体长、体高、胸围、胸深、胸宽和管围等生长性状的关联性。结果显示：①检测到9个多态位点：939[A/G]、980[G/A]、1018[T/C]、2878[C/T]、2956[C/T]、3017[G/A]、3341[G/C]、3394[T/A]、1056[-/G]，其中有6处转换、2处颠换、1处单碱基插入。②939[A/G]、980[G/A]、2956[C/T]、3341[G/C]、3394[T/A]和1018[T/C]的He为0.3200~0.4666，PIC为0.2688~0.3577；2878[C/T]、3017[G/A]位点的He为0.0283~0.1272，PIC为0.0279~0.1191，为低度多态；1056[-/G]位点的He在滩羊、滩羊×湖羊杂交F1代群体中分别为0.0120和0，PIC在滩羊、滩羊×湖羊杂交F1代群体中分别为0.0119和0；9个多态位点在滩羊、滩羊×湖羊杂交F1代群体中均符合Hardy-Weinberg平衡定律。③5个多态位点：939[A/G]、980[G/A]、2956[C/T]、3341[G/C]、3394[T/A]处于紧密连锁（D'>0.99），将H-FABP基因分为3个单倍型：AA、AB和BB。④在41只滩羊×湖羊杂交F1代羊中，BB单倍型在各生产性状上具有最大值，但各单倍型间差异不显著（P>0.05）。结果表明，绵羊H-FABP基因具有丰富的遗传多态性，939[A/G]、980[G/A]、2956[C/T]、3341[G/C]、3394[T/A]5个位点紧密连锁，BB单倍型可能是与绵羊生产性状相关的优势单倍型。 相似文献
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［目的］本研究旨在探究河北省西门塔尔牛体重和体尺性状的遗传参数,为育种提供参考。［方法］本研究以2015～2021年河北天和肉牛养殖有限公司266头西门塔尔牛的体重体尺性状为研究材料,包括体重性状及体高、十字部高、体斜长、胸围、腹围和管围等6个体尺性状,使用DMU软件采用AI-REML结合EM算法并配合动物模型对体重、体尺性状进行了遗传参数估计。［结果］结果表明：体重、体高、十字部高、体斜长、胸围、腹围和管围的遗传力分别为0.41、0.41、0.45、0.45、0.48、0.31和0.66。体重与体尺之间的遗传相关范围为0.20（体高）~0.79（胸围）,表型相关范围为0.14（十字部高）~0.23（胸围）;体尺性状间的遗传相关范围为-0.70（腹围和管围）~0.92（体高和十字部高）,表型相关范围为-0.10（腹围和管围）~0.94（体高和十字部高）。［结论］体重与体尺性状均属于高遗传力性状,体重及体尺性状间除管围外其他体尺性状间均呈较强的遗传正相关,在选育过程中加强对这些性状的选育,有利于提高西门塔尔牛的生长发育性能。 相似文献
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为估计鲁中肉羊初生重、体高、体长、胸宽、胸深、胸围和管围的遗传参数,利用2018年上半年出生的611只鲁中肉羊的初生体尺体重数据,采用AI-REML (Average information restricted maximum likelihood)算法,借助DMU软件分析以产羔数为固定效应、个体加性遗传效应为随机效应的多性状动物模型。结果表明:鲁中肉羊初生重、胸宽、胸深、体高、体长、胸围和管围的遗传力分别为0.16、0.10、0.22、0.44、0.43、0.46和0.52,各性状之间遗传相关为-0.517～0.773,表型相关为-0.197～0.503。说明鲁中肉羊初生重、胸宽和胸深为低遗传力性状,体高、体长、胸围和管围为中等遗传力性状。 相似文献
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本试验在新疆畜牧厅乌鲁木齐种牛场选择新疆褐牛 121 头,对其出生重、体高、胸围、管围、体斜长与产奶性能的资料进行分析,研究新疆褐牛的出生重、体高、胸围、管围、体斜长与产奶性能的相关性.结果表明:新疆褐牛的初生重对产奶量有显著的影响(P相似文献
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本研究利用PCR-SSCP技术结合DNA测序确定UCP2基因SNP位点,检测其在宁夏西门塔尔杂种牛群体中的多态性,并分析其与生长性状的关联性。结果表明,UCP2基因第1外显子存在3个SNPs位点,分别为T632C、A655G和A689C,结合PCR-SSCP结果分析后,分为AA、BB、AB 3种基因型。不同月龄体高、体重、胸围、体斜长,总体呈AA>AB>BB。AA基因型个体在不同月龄体高、胸围显著或极显著高于BB基因型（P < 0.05;P < 0.01）,与AB基因型之间存在差异,但差异不显著（P > 0.05）。可以确定,T632C位点发生的碱基突变对宁夏西门塔尔杂种牛的体重性状选育存在显著意义,AA基因型个体可作为后期选育方向。 相似文献
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【目的】探究黔北麻羊黑素皮质素受体-4（melanocortin receptor-4,MC4R）基因多态性及其与生长性状的关联性,为黔北麻羊的选种选育提供理论依据。【方法】选取196只6月龄黔北麻羊,利用DNA混合池结合Sanger测序筛选MC4R基因单核苷酸多态性（SNP）位点,并采用SPSS 22.0软件中的一般线性模型（GLM）对MC4R基因SNP位点与黔北麻羊生长性状进行关联分析。【结果】在黔北麻羊MC4R基因中发现4个SNPs位点：g.59345469 C>A和g.59346773 T>C位点分别位于5'-和3'-端非编码区（UTR）;g.59345871 A>C位点突变导致第37位天冬氨酸（Asp）变为丙氨酸（Ala）,引起RNA二级结构及蛋白质二级结构、三级结构发生明显改变;g.59346263 A>G位点突变导致第168位异亮氨酸（Ile）变为缬氨酸（Val）,对RNA二级结构和蛋白质二级结构有明显影响。关联分析结果显示,g.59345469 C>A位点对黔北麻羊体重、胸围和管围均有显著影响（P<0.05）;g.59345871 A>C位点对黔北麻羊体重、体高、管围和胸围均有显著影响（P<0.05）;g.59346263 A>G位点对黔北麻羊体高、体重和胸围均有显著影响（P<0.05）;g.59346773 T>C位点对黔北麻羊体重和胸围均有显著影响（P<0.05）。4个SNPs位点联合共检测到9种单倍型和21种双倍型,其联合对黔北麻羊体重、体高、胸围和管围均产生显著遗传效应（P<0.05）,纯合双倍型H5H5（AAAAGGCC）个体的生长性状优于其他双倍型。【结论】黔北麻羊MC4R基因存在4个SNPs位点,与黔北麻羊体重和胸围均存在显著关联,可作为黔北麻羊体重和胸围的遗传标记用于分子育种。 相似文献
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JIANG Qiu-fei LUO Xiao-yu HONG Long LI Xin FENG Yuan WU Liang HAN Li-yun GU Ya-ling 《中国畜牧兽医》2016,43(7):1843-1849
To find genotype with fast growth rates in Ningxia hibrid Simmental cattle,the genetic variation of UCP2 gene were detected by PCR-SSCP method and DNA sequencing,then analyzed UCP2 gene polymorphism related with some growth traits.The results showed that there were three SNPs (T632C,A655G and A689C) in UCP2 gene exon 1,which divided into AA,BB and AB genotypes by PCR-SSCP method.Individuals with different genotypes in different months of age,body weight,body height, chest circumference and body length were AA > AB > BB.AA genotype in different age of body height and chest circumference were significantly different than BB genotype (P < 0.05;P < 0.01),and were no significant difference with AB genotype (P > 0.05).The results demonstrated that T632C locus had significant meaning for improving weight trait breeding of Ningxia hibrid Simmental cattle,AA genotype could be the breeding genotype. 相似文献
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Mapping the quantitative trait loci (QTL) for body shape and conformation measurements on BTA1 in Japanese Black cattle 总被引：1，自引：0，他引：1
Aduli Enoch Othniel MALAU-ADULI Tomomi NIIBAYASHI Takatoshi KOJIMA Kazunaga OSHIMA Yasushi MIZOGUCHI Masanori KOMATSU 《Animal Science Journal》2005,76(1):19-27
The detection and mapping of segregating quantitative trait loci (QTL) that influence withers height, hip height, hip width, body length, chest width, chest depth, shoulder width, lumbar width, thurl width, pin bone width, rump length, cannon circumference, chest girth, abdominal width and abdominal girth at weaning was conducted on chromosomal regions of bovine chromosome one. The QTL analysis was performed by genotyping half‐sib progeny of five Japanese Black sires using microsatellite DNA markers. Probability coefficients of inheriting allele 1 or 2 from the sire at specific chromosomal locations were computed. The phenotypic data of progeny were regressed on these probability coefficients in a within‐common‐parent regression analysis using a linear model that included fixed effects of sex, parity and season of birth, as well as age as a covariate. F‐statistics were calculated every 1 cM on a linkage map. Permutation tests of 10 000 iterations were conducted to obtain chromosome‐wide significance thresholds. A significant QTL for chest width was detected at 91 cM in family 3. The detection of this QTL boosts the prospects of implementing marker‐assisted selection for body conformation traits in Japanese Black beef cattle. 相似文献
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郏县红牛CLPG基因的SNP及对生长发育性状的影响 总被引：1，自引：1，他引：0
利用PCR-SSCP检测了113头郏县红牛CLPG基因的SNP，发现了AA、AB、AC 3种基因型，测序结果显示AA型在第150和419碱基处分别表现为C和T，为野生型；AB型在第419处发生碱基T→C突变；AC型在第150处发生碱基C→T突变。多态信息含量为0．226，属低度多态。分析了不同基因型与部分生长发育性状的相关性，结果显示，AA、AC基因型个体在体重、体长指标上显著（P〈0．05）或极显著（P〈0．01）大于AB型个体；在管围指标上，AA基因型个体优于AB基因型个体，差异显著（P〈0．05）；在坐骨端宽指标上，AA与AB基因型个体之间差异显著（P〈0．05），AB与AC基因型个体间差异极显著（P〈0．01）。 相似文献
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伊犁马速步赛成绩与体尺性状的相关性研究 总被引：1，自引：0，他引：1
试验对伊犁马速步赛的体尺性状与比赛成绩之间的相关性进行了研究。测定速步赛中不同比赛项目伊犁马的体高(X1)、体长(X2)、胸围(X3)和管围(X4),计算体长率(X5)、胸围率(X6)和管围率(X7),并用SPSS 18.0软件分析其与比赛成绩之间的相关性。结果表明,在不同的比赛项目中,体尺性状与比赛用时有显著或极显著的相关性(P<0.05;P<0.01)。1000 m速步赛中比赛用时随体高、体长、胸围的增大而减少,随管围、胸围率和管围率的减小而减小;3000 m速步赛中比赛用时随体高、体长的增大而减小,随胸围率和管围率的减小而减小;5000 m速步赛中比赛用时随体高、胸围、体长的增大而减小,随管围率的减小而减小。 相似文献