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1.
本研究在对选择性扩增引物进行筛选的基础上,对银白杨、N001杨及银白杨×N001杨杂交子代共10个样本进行了AFLP试验,并利用Popgene和NTsys软件分别对遗传多样性参数及个体聚类进行分析。结果表明:筛选出的8对选择性扩增引物,共扩增出969条谱带,多态性条带数929条,多态性比例为95.76%,平均有效等位基因数为1.4329,Nei's平均遗传多样性指数为0.2662,Shannon平均信息指数为0.4161。不同杂交子代在E-ACC/M-CAC引物对上均有特异位点,这些特异位点用于申报优良品种保护。在通过NTsys软件聚类后,在遗传相似系数为0.76时,将10个试样分为2个大支,其中N001杨为1个AFLP群,银白杨及8个杂交子代为1个AFLP群;当遗传相似系数为0.79时,银白杨与8个杂交子代的AFLP群又细化为2个亚群,其中杂交子代2和杂交子代6聚合为亚群1,银白杨和其余6个杂交子代为亚群2。本研究的结果多态性比例很高,对样品的区分率达到100%,为杨树AFLP分析检测提供了较好的应用和指导借鉴价值。 相似文献
2.
《西部林业科学》2015,(4)
利用RAPD标记对银白杨(♀)×新疆杨(♂)杂交后代及其亲本进行DNA多态性鉴定。结果表明,8对引物共扩增出46条带,平均每对引物扩增出5.75条带,多态性带占扩增总带数的41.3%,扩增片段大小在300~3 000 bp之间。父母本的特异性条带在子代中出现的频率分别为51.25%和46.88%。杂交后代的带型分为叠加型、缺失型和特异型。父母本之间的遗传相似系数为0.652 2,子代8与父本遗传相似系数最高为0.913 0,子代6与母本遗传相似系数最高为0.847 8。本研究从分子水平鉴定杂交种,为开展分子标记辅助杨树杂交亲本选配和杂种子代表现预测奠定了基础。 相似文献
3.
广东鼎湖山3个树种在不同群落演替过程中的遗传多样性 总被引：10，自引：0，他引：10
用扩增片段长度多态性 (AFLP)方法对木荷、锥栗、厚壳桂在广东省鼎湖山 3个不同群落 :针叶林群落 ,针阔叶混交林群落 ,常绿阔叶林群落中的遗传多样性进行了研究。其中木荷和锥栗样品分别在上述 3个群落中采集到 ,总样品数都为 4 8个 ;厚壳桂样品只在针阔叶混交林群落和常绿阔叶林群落中采集到 ,总样品数为 4 0个。研究中把各物种同一群落中的所有个体视为一亚种群。木荷的AFLP分析结果表明 ,4组引物对分别扩增出 2 4、2 7、4 0和 2 7条带 ,其中分别有 1 5、2 3、2 3和 1 6条是多态性带 ,其 3个亚种群的平均遗传多样性分别是 0 35 3、0 336、0 30 4 ;锥栗的AFLP分析结果为 4组引物对分别扩增出 2 7、2 0、33和 39条带 ,其中分别有 1 5、1 5、1 8和 2 6条是多态性带 ,其3个亚种群的平均遗传多样性分别是 0 1 97、0 2 97、0 31 1 ;厚壳桂的AFLP分析结果为 4组引物对分别扩增出 2 3、30、4 2和 31条带 ,其中分别有 1 2、1 9、37和 1 8条是多态性带 ,其 2个亚种群的平均遗传多样性分别是 0 2 85、0 2 95。上述结果的产生既是这 3个物种的生物学特性的反映 ,也是不同群落微环境不同的反映。 相似文献
4.
研究不同核桃品种的遗传多样性,为今后新品种的培育和种质创新提供理论依据,以西北农林科技大学资源苗圃的18个核桃品种(包括3个实生优系)嫩叶做材料,选用SSR分子标记技术对其进行了遗传多样性研究。建立了最适PCR反应体系,从27对引物中筛选出多态性强重复性好的12对引物,共检测出174条条带,其中91条呈现多态性,多态性条带的比例平均为67.82%,平均每条引物扩增出多态性位点9.8个。新疆2号与辽宁4号的相似系数最大(0.803 6),青林和西林2号最小(0.159 4)。多态信息含量(PIC)变化范围在0.742 2~0.896 2,平均值为0.815 0,其值均大于0.500 0。基于遗传相似性系数的UPGMA聚类结果表明,在遗传相似系数阈值为0.39左右可将供试品种分成4大类。以上说明12条引物扩增的位点均表现出高度多态,同时表明供试样品遗传资源非常丰富,可作为育种来源。 相似文献
5.
采用8对SRAP引物对加拿大19个种源的东部白松进行分析,获得97个扩增位点,多态性位点57个,平均多态性水平58.8%;每对引物产生等位基因7～22个,条带分布在100～1 000 bp。19个种源相似系数为71%～95%,根据不同种源的遗传相似系数,利用UPGMA法进行聚类分析,遗传相似系数69%为阈值,将19个东部白松种源分为4个群体。4个群的Nei指数为0.1557,Shanonn指数为0.2426,其中平均等位基因数为1.5876,有效等位基因数为1.2603;全部种源的基因多样性平均值为0.1840,群内基因多样性平均值为0.0340,基因分化系数为0.8152,群体间基因流为0.1132。 相似文献
6.
利用AFLP分子标记技术对松树脂溃疡病菌及其近缘种进行DNA指纹分析,筛选出10对多态性较高的引物.上述引物在供试的9种17个菌株中共扩增出298条带,其中有多态性带283条,多态性位点百分率为94.97%.每对引物产生的多态性位点百分率在89.29%-100%之间,表明松树脂溃疡病菌及其近缘种间在DNA水平上存在广泛变异.根据AFLP标记结果计算松树脂溃疡病菌及其近缘种间的相似系数,对它们的亲缘关系进行定量描述.聚类分析结果表明,菌株间的聚类与生物学种分类的结果一致.分析引物E-AT/M-CAA绘制的镰刀菌AFLP指纹图谱遗传多样性,确定李瑟组镰刀菌各交配群的特异带、差异带,区分供试的7个交配群. 相似文献
7.
利用AFLP分子标记技术对筇竹2个种群的遗传多样性进行了分析,筛选出10对多态性和清晰度较高的引物组合,共获得680个AFLP位点,其中多态性位点662个,平均多态性检出率为97.20%,并用PopGen32软件对AFLP多态性数据进行分析,结果表明,供试2个筇竹种群均具有丰富的遗传多样性,多态位点百分率分别为89.86％和91.95％,等位基因数分别为1.898 6和1.919 5,有效等位基因数分别为1.585 0和1.568 3,种群内遗传多样性为0.332 1,种群水平平均Nei’s 遗传多样性为0.394 9,Shannon信息指数为0.575 4,基因流为2.900 9,遗传一致度为0.821 9,遗传距离平均值为0.196 1。并根据遗传距离进行了UPGMA聚类分析。 相似文献
8.
为研究44份楸树种质资源的遗传多样性及亲缘关系,利用AFLP分子标记技术,对采自鲁豫地区的44份楸树优良种质进行了分析。结果表明:筛选出的8对PstI/MseI引物组合从44份楸树种质中共扩增出1087条清晰条带,其中多态性条带(NPB)1043条,多态性比率(PPB)达到95.60%。平均每对引物可扩增出135.88条带和130.38条多态性带。每个位点的平均有效等位基因数(Ne)、Nei’s平均基因多样性(H)、Shannon平均信息指数(Ⅰ)分别为1.3210、0.2003和0.3204,且8对引物组合共产生261条特异性条带,表明楸树资源间具有丰富的遗传多样性。通过计算种质间遗传相似系数和进行UPGMA聚类分析得出,各种质材料间的遗传相似性系数在0.5022~0.7919间,平均为0.6527。以遗传相似性系数0.65为界44份楸树种质可划分为5组,其中第1组包括15个山东种质和2个河南种质;第2组包括18个山东种质和3个河南种质;第3组包括3河南种质;第4组包括1个河南种质;第5组包括2个河南种质。这表明不同地理生态条件造就了各种质材料间丰富的遗传多样性,其遗传多样性以及亲缘关系与其地理分布并不完全一致。综上,AFLP标记技术能较好的揭示楸树种质资源的遗传多样性和亲缘关系,可为楸树优良种质资源的收集、鉴别及利用提供参考依据。 相似文献
9.
利用SSR分子标记技术,对采自新疆额尔齐斯河流域阿尔泰市哈巴河及北屯地区的白杨派3个树种银白杨、银灰杨、欧洲山杨的半同胞家系子代进行遗传多样性分析.结果表明:筛选12对SSR引物在90个样本中共检测到58个等位基因(A)、112种基因型,多态位点百分率是100％,Nei遗传多样性指数(h)平均为0.648 5,Shannon多样性指数平均为1.234.基因分化系数(Fst)为0.337 l,即在总的遗传变异中有33.71％的变异来自于不同树种之间,绝大部分存在于子代个体间.白杨派内种间分化程度较高,种间遗传距离为0.3863～1.869;银灰杨的遗传变异最大,而银白杨的遗传变异最小. 相似文献
10.
珍稀濒危观赏竹种筇竹遗传多样性研究 总被引：1，自引：0，他引：1
《竹子研究汇刊》2016,(1)
对筇竹Qiongzhuea tumidinoda居群间及居群内遗传多样性进行了研究。通过基因组多态性分析,筛选出13个随机引物对筇竹样品进行扩增,得到清晰可重复且多态性明显的条带,多态位点率为76.38%。在NTSYS程序中,统计这些扩增产物用来计算遗传相似性系数和遗传距离,建立UMPGA(不加权算术平均法)聚类图,得出筇竹居群间的基因多样性大于居群内的结论,在此基础上,探讨筇竹保护对策和建议。 相似文献
11.
为了解和掌握广西乌榄的资源类型及其遗传变化规律,利用SCoT分子标记技术,对桂西南地区收集到的42份乌榄种质资源进行遗传多样性分析。筛选出14条引物对供试材料进行PCR扩增,共获得124条带(DNA位点),其中具有多态性条带74条,平均多态性比例(PPB)59.68%;经Ntedit软件计算,其遗传相似系数(GS)的范围值在0.726~0.903,平均为0.817,表明SCoT能够揭示乌榄种质间的遗传变异。UPGMA法聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.812时,可将乌榄种质资源分为A、B 2个大组,每大组又各分2个亚组,亚组内种质资源按照采样地聚集,说明乌榄的亲缘关系与地理起源有一定的相关性。总体上,橄榄种质资源遗传多样性水平相对较低。 相似文献
12.
利用筛选出的5对引物,对来自菏泽的2号、8号、172号、sH4、SH7、SH9、SH10、SH15、SH17、SH18、SH22、SH25、SH26、SH28、SH31、SH32、SH37、SH39、SH48、SH49共20个柳树种质进行了AFLP分子鉴别和多态性分析研究。结果表明：5对引物共产生645条谱带,多态带542条,多态带的比例为84．03％;每对引物鉴别效率为100％。AFLP是进行鉴别亲缘关系比较近的柳树种质的有效方法。 相似文献
13.
Marcucci Poltri SN Zelener N Rodriguez Traverso J Gelid P Hopp HE 《Tree physiology》2003,23(9):625-632
A Eucalyptus dunnii Maiden breeding population of 46 accessions originated in Australia and selected for fitness to subtropical and cold environments was screened by Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) and microsatellite markers to obtain quantitative estimates of genetic diversity. A randomly chosen group of AFLP primers generated 205 AFLP bands that were used to fingerprint the genotypes and to evaluate genetic relationships among accessions. Sixty-eight percent (140) of the bands were polymorphic markers. The mean diversity index (DI) was 0.33 and about 52% of the loci had values greater than 0.4. Cluster analysis derived from similarity indices (SI) revealed no particular grouping among accessions suggesting the absence of closely related genotypes, except for five pairs of genotypes. Bootstrap analysis results confirmed the suitability of AFLP to describe genetic relationships in this breeding population. In addition, four highly informative microsatellites were used to construct an identification matrix that discriminated nearly all of the genotypes. Mean values for the number of alleles per locus, DI and SI among accessions were 13, 0.78 and 0.19, respectively, indicating that the breeding population has high genetic diversity. However, several genotypes showed the presence of single microsatellite bands suggesting a putatively important degree of homozygosity. Molecular data were used to design a clonal seed orchard. To achieve this aim, the nine most divergent pairs of genotypes were chosen, thereby retaining 95.2% of the total number of alleles from the 140 polymorphic AFLP loci and the four microsatellite loci analyzed. Mean DI and SI for AFLP and microsatellites showed no significant differences between the original breeding population and the selected seed orchard, confirming that a seed orchard can be designed with a limited number of individuals, which allows similar accessions to be discarded and avoids inbreeding. 相似文献
14.
利用AFLP分子标记技术 ,以毛新杨×毛白杨BC1群体中的 12 0个单株为材料 ,在整个基因组水平上研究AFLP标记在该群体中期望的孟德尔分离情况 .4 1对AFLP引物组合共检测到 2 70 7个位点 ,其中在分离群体的亲本毛新杨和毛白杨间具有多态性的位点有 712个 .经卡方检验后得到在P <0 .0 1水平上 ,符合期望孟德尔 1∶1分离的位点共有 5 71个 ,占多态性位点的 80 .2 % ,该结果表明AFLP标记技术很适合用于毛白杨指纹分析和遗传连锁图谱构建 相似文献
15.
采用ISSR分子标记技术对湖北三潭风景区野生省沽油群体32个样本进行遗传多样性分析,从18条ISSR引物中筛选出10条引物用于PCR扩增,共扩增出147条DNA条带,其中多态性条带134条,占91.16%,平均每个引物扩增条带的数目为14.7条。利用POPGENE1.32和NTSYS-pc软件分析得出该野生省沽油样本的平均有效等位基因数为1.4319,平均Nei′s基因多样性指数为0.2653,平均Shannon信息指数为0.4118;样本间的遗传相似系数在0.47～0.87之间;UPGMA聚类结果,在遗传相似性系数0.6558处可把供试的32个样本分为3大类,表明该野生省沽油群体的遗传多样性比较丰富。 相似文献
16.
采用ISSR技术对37个锥栗农家品种进行遗传多样性及亲缘关系分析。从65条通用引物中筛选出13条扩增效果较好的引物进行扩增,每条引物的扩增谱带从9(引物828) 16条(引物821)不等,平均每个引物产生12个ISSR片段,共扩增出156条谱带,其中多态性条带129条,占82.69%,平均每个引物扩增的DNA多态性条带为9.9条。结果表明:锥栗农家品种具有丰富的遗传多样性水平;供试农家品种的观测等位基因数1.826 9,有效等位基因数1.509 7,Nei's基因多样度(He)为0.292 3,Shannon信息指数为
0.434 4;13条引物可区分37份农家品种及其优株。根据遗传一致度构建反映品种间亲缘关系的UPGMA聚类图,37个锥栗品种可划分为2大类群7个亚类。 相似文献
17.
18.
苹果属种、杂交种及品种之间关系的AFLP分析 总被引：3，自引：1，他引：2
用AFLP技术,对72个苹果属植物样本(34个种、变种、杂交种及38个品种)进行遗传多样性分析.在64对AFLP引物中选出6对引物进行扩增,得到有效谱带1692条,其中多态谱带1547条,多态谱带比率为91.4%.对72个样品的试验数据进行聚类分析,它们的相似系数为0.54～0.82.在相似系数0.60处参试材料被分为4大类,即佛罗伦萨苹果(Malus florentina)为一类;绿苹果组(Sect.Choromeles)和多胜苹果组(Sect.Docyniopsis)分别各聚一类;花楸组(Sect.Sorbomalus)、脱萼组(Sect.Gymnomeles)和苹果组(Sect.Malus)聚为一类,所有苹果品种和观赏海棠品种全聚在原产亚洲的花楸组、脱萼组及苹果组中.亚洲原产的苹果属植物对于苹果及观赏海棠品种的发展起重要作用.根据试验结果及文献资料,支持将佛罗伦萨苹果组(Sect.Florentinae Cheng M.H.)成立单种组;建议将原属花楸组植物除佛罗伦萨苹果外,全部并入苹果组;取消脱萼组,将其组内的植物全部并入苹果组. 相似文献
19.
利用ISSR分子标记技术对广西南宁金花茶公园29份金花茶组物种进行遗传关系分析。筛选出的14条引物扩增得到133条清晰条带,其中126条为多态性条带,多态性位点百分比为94.74%。29份金花茶种质材料的Nei’s基因多样性指数为0.360 6,Shannon’s 信息指数为0.531 4,遗传相似系数介于0.481 0.835,金花茶组物种的遗传基础较宽。用NTSYS软件对样品进行UPGMA聚类分析,29份金花茶样品聚为3大类群,其中扶绥中东金花茶单独为一类,顶生金花茶和龙州金花茶聚为一类,其它金花茶聚为一类。分析结果表明：夏石金花茶和小花金花茶的遗传相似系数最高,支持将两者归并到柠檬黄金花茶;弄岗金花茶和毛籽金花茶亲缘关系很近,支持合并到同一个种;龙州金花茶和薄叶金花茶分别归为单独的种。 相似文献