核桃早实性相关性状的SCAR标记   总被引：4，自引：0，他引：4  

牛建新  吕建强  王林  叶春秀  张虎平  张录霞 《果树学报》2008,25(5):732-735

用RAPD技术对新疆核桃早实特性的分子标记进行了研究。用180个10-mer随机引物分别扩增早实和晚实近等基因池DNA筛选出5个多态性引物,结果只有引物OPG15(5′-ACTGGGACTC-3′)扩增得到1条约710bp的早实核桃特异片段。对该片段进行克隆和序列分析,并根据序列分析结果将该RAPD标记转化为重复性和特异性更好的SCAR标记。研究设计出了1对早实核桃特异SCAR引物P1(5'-ACTGGGACTCCAATTGTATC-3')和P2(5'-ACTGGGACTCTCAACTAT-3'),用这对特异引物对14份材料进行PCR扩增,结果所有晚实核桃材料无任何扩增,但早实材料均扩增出了预期大小759bp的特异带。  相似文献   

中国工厂化栽培杏鲍菇菌株的RAPD和ISSR分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

《食用菌》2015,(5)

为了研究国内工厂化栽培的杏鲍菇菌株的遗传多样性,对筛选的34个杏鲍菇菌株进行RAPD(Randomly Amplifiled Polyrnorphic DNA)和ISSR(Inter-Stmple sequence Repeat)分析。从31个RAPD引物中选取了23个引物对34株杏鲍菇工厂化生产菌株进行PCR扩增,共扩增出266条稳定清晰的DNA条带;从32个ISSR引物中选取了23个引物对34株杏鲍菇工厂化生产菌株进行PCR扩增,共扩增出211条稳定清晰的DNA条带。根据扩增结果,对34个杏鲍菇菌株进行了RAPD标记、ISSR标记及二者相结合的聚类分析。3种方法的分析结果相近,可分别将34个供试菌株分为4~5大类。研究为国内工厂化杏鲍菇栽培菌株的筛选、育种和栽培奠定基础。  相似文献   

罗汉果性别相关的SCAR标记筛选     

谢文娟  吴钰坡  黄江  刘彦延  林军  莫长明 《北方园艺》2019,(8):32-39

以罗汉果雌雄单株各30份为试材,采用随机引物筛选法,筛选与罗汉果性别相关的RAPD标记,并根据特异片段的测序结果,将RAPD标记转化为特异性和稳定性更好的SCAR标记,以期为罗汉果的性别早期鉴定和分子辅助育种研究提供参考依据。结果表明:在330条随机引物中获得了分别与罗汉果雌性和雄性相关的RAPD引物S2124和S343。根据特异序列测序结果,对雌性特异带S2124-1K和雄性特异带S343-1.4K各自设计并合成了2对SCAR引物,经验证,SCAR引物SC2124-1K-14在62℃和SC2124-1K-8在56℃均可扩增出1 019bp的雌性特异带,SC343-1.4K-12在64℃和SC343-1.4K-4在56℃均可扩增出1 373bp的雄性特异带。这些特异的SCAR标记具有较好的应用价值,可为罗汉果的性别早期鉴定提供分子依据。  相似文献   

金棚1号番茄种子纯度检测的SCAR标记   总被引：1，自引：0，他引：1  

王飞  姚明华  巩振辉  李晓东 《中国蔬菜》2009,1(2):26-29

以金棚1号番茄及其父、母本为试材，提取叶片DNA，优化构建了稳定的RAPD反应体系。从在番茄上多态性丰富的100条随机引物中筛选获得1条可用于鉴别母本和F₁的引物S130，2条可用于鉴别父本和F₁的引物S296和S114。将扩增所得到的差异条带进行克隆、测序，设计出1对SCAR引物RF2/FF2，能特异鉴别F₁和母本。进一步建立了以干种子为试材检测金棚1号番茄种子纯度的SCAR标记检测体系。  相似文献   

甘蓝显性春性不育基因的延长随机引物扩增DNA（ERPAD）标记   总被引：8，自引：3，他引：5  

王晓斌  方智远等 《园艺学报》1999,26(1):23-27

获得了一个与甘蓝显性雄性不育基因连锁的延长随机引物扩增DNA（Extended Random Primer AmplifiedDNA,ERPAD)标记EPT11900。EPT111900是在与甘蓝显性雄性不育基因连锁的RAPD标记OT11900的基础上,通过逐步筛选3’端延长的随机引物的方法转化而成的稳定性和特异性都得到增强的新标记,这种标记的稳定性和特异性接近SCAR标记,但不埯要克隆和测序,该方法首先根据OPT11的序列合成3’端添加A、T、C、G4种碱基的4个引物,组成10个引物对,以不育池为模板筛选出OT11-C OT11-G为唯一能够扩增长度与OT11900相同的一个片段的引物对,在此引物对基础上,又添加4种碱基得到8个新的引物,相互组合成16个引物对,进一步以不育池为模板筛选出OT11-CT OT11-GA,在严格条件下,它可特异扩增长度与OT11900相同的一个片段EPT11900。通过分离群体分析证实这一片段与OT119000处于同一位点。  相似文献   

辽宁省主栽香菇菌株ISSR遗传差异性分析     

宋莹  刘俊杰  刘岩岩  李宏亮  刘娜  张士义 《北方园艺》2017,(5)

以20个辽宁省主栽香菇菌株为试材,采用ISSR分子标记方法,研究了20个菌株的遗传差异性,并采用NTSYS-PCR软件进行聚类分析。结果表明:从30个随机引物中筛选出9个ISSR备用引物,并用这9个引物对供试香菇菌株基因组DNA进行了ISSR-PCR扩增,共扩增出72条清晰条带,其中多态性条带占83.3%。通过聚类分析发现,异化系数在0.36为阈值时,20个菌株聚为4个组群。  相似文献   

基于SRAP的松茸特异性分子标记     

《中国食用菌》2015,(5)

为了准确鉴定松茸,确保消费者品尝到货真价实的松茸,该研究基于SRAP(sequence-related amplified polymorphism分子标记,从300对引物组合中分别筛选出1对松茸特异性引物(ME10、EM6),并将这对引物扩增的特异条带进行克隆、测序和设计引物后,成功地构建了松茸特异性分子标记(304 bp)。松茸在特异性分子标记(304 bp)均能扩增出条带,该标记在分子水平上可准确、快速地鉴定出松茸,并可有效地保证松茸的品质。  相似文献   

香菇135菌株特异SCAR标记的分布和遗传特性   总被引：1，自引：0，他引：1  

张美彦  尚晓冬  谭琦  陈明杰  潘迎捷 《食用菌学报》2008,15(4)

用香菇（Lentinula edodes）135菌株的特异SCAR（Sequence Characterized Amplified Region）引物135F／R（扩增601bp的条带）对135菌株的58个原生质体单核体和97个孢子单核体的基因组DNA进行扩增，检验此特异标记在单核体中的分布和遗传规律。原生质体单核体分为两种交配型A1B1和A282，此标记仅存在于后一种核中；另外，此标记在四种交配型的孢子单核体后代中随机分布，显示这个SCAR标记可以稳定遗传到后代，而且与交配型A、B因子之间没有连锁关系。  相似文献   

黄瓜全雌性基因连锁的AFLP和SCAR分子标记   总被引：32，自引：5，他引：32  

娄群峰  陈劲枫  Molly Jahn  陈龙正  耿红  罗向东 《园艺学报》2005,32(2):256-259

 本研究以全雌品种‘戴多星’自交系和弱雌品种‘北京截头’自交系为双亲杂交获得F₁ ,然后得到F₂ 性型分离群体, 利用分离群体分组分析法(Bulked Segregant Analysis, BSA) 构建全雌和弱雌两个基因池, 筛选了64对AFLP选择性引物EcoR I-NN +Mse I-NNN组合, 发现EcoR I-TG +Mse I-CAC引物组合在全雌基因池中扩增出一条分子量为234 bp的特异带。经F₂ 代单株验证, 该特异条带能在全雌单株中稳定出现。以MAP MAKER (Version 310) 软件分析, 该标记与全雌性位点的连锁距离在617 cM。命名该连锁标记为TG/CAC₂₃₄。将该特异条带回收、克隆、测序, 设计特异SCAR引物, 再对F₂ 代单株基因组DNA进行扩增, 仅在全雌单株中扩增出1条分子量为166 bp 的特异带, 表明已成功地将与黄瓜全雌性连锁的AFLP标记转化为操作简便、表现稳定的SCAR标记, 该标记命名为SA₁₆₆。  相似文献   

灵芝菌株的DNA指纹分析   总被引：5，自引：0，他引：5  

罗联忠  林树钱  谢宝贵  林志彬 《食用菌学报》2005,12(3):7-13

CTAB法提取灵芝菌丝体总DNA,再以核糖体DNA转录间隔区（ITSⅡ、IGR IPCR RFLP）结合随机引物扩增多态性（RAPD）标记分析30个灵芝菌株间的亲缘关系.结果表明,ITSⅡ、IGR I-PCR RFLP产生了47条带,其中42条显示出多态性,通过聚类分析将30个菌株分成七大类,包括紫芝、黑灵芝、树舌灵芝、薄树灵芝四大类,以及另外三个无法确定具体归属的类群,但没能将赤芝与松杉灵芝区分开.RAPD从247个随机引物中筛选出8个随机引物,共检测到69个多态性位点并全部显示出多态性,通过聚类分析将供试的30个灵芝菌株全部区分开.  相似文献   

甜菜SRAP扩增产物两种不同检测方法的比较     

吴则东  王华忠  韩英 《中国甜菜》2010,(2):9-11

为了研究不同电泳及染色方法对甜菜SRAP扩增产物的影响,以6个甜菜二倍体品系为材料,比较变性聚丙烯酰胺凝胶电泳与非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对SRAP—PCR扩增产物用不同银染方法的检测效果进行了比较分析。结果显示：非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳与变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的分辨率差异不大,但非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳具有灌胶简单易学,显色时间短,节省药品等特点,可以作为今后甜菜SRAP电泳及显色的首选方法。  相似文献   

荔枝AFLP分析体系的建立   总被引：24，自引：2，他引：24  

易干军  霍合强  蔡长河 《果树学报》2002,19(6):361-364

以39份荔枝种质资源为试材,建立起荔枝AFLP分析体系。对AFLP分析过程中的影响因子(酶切与连接、预扩增、标记)进行了研究。双酶切必须完全彻底。选出适于荔枝AFLP分析的引物组合3对,分别为EcoRIAAC+MseICTG,EcoRIAGC+MseICAT,EcoRIACC+MseICAT。应用其中2对引物(EcoRIAAC+MseICTG,EcoRIACC+MseICAT),共在106个位点扩增出条带,多态性带92个(86.7%)。对荔枝AFLP分析的影响因子进行了分析。  相似文献   

SRAP分析体系的优化及在枇杷种质资源研究上的应用   总被引：16，自引：2，他引：14  

乔燕春  林顺权  刘成明  杨向晖 《果树学报》2008,25(3):348-352

以me7(5’-TGAGTCCAAACCGGTCC-3’)和em7(5’-GACTGCGTACGAATTCAA-3’)正反向引物组合对西班牙枇杷品种Javierin进行了SRAP分析体系的优化,结果表明,在25μL反应体系中,5种主要成分的适宜浓度或用量分别是:dNTPs0.3mmol/L,Mg2+2.5mmol/L,TaqDNA聚合酶1.0U,引物0.3μmol/L,模板DNA20ng,优化的扩增程序为:94℃预变性5min,94℃变性1min,35℃复性1min,72℃延伸1min30s,5个循环;之后94℃变性1min,50℃复性1min,72℃延伸1min30s,35个循环;最后72℃下延伸10min。并将该优化的体系在来自中国、西班牙、日本、意大利和美国的46份枇杷种质资源上进行了SRAP扩增的初步应用,经琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳均获得了清晰、重复性好的SRAP指纹图谱。  相似文献   

辣椒抗疫病研究中的RAPD反应体系优化     

胡勇胜  毛胜利  刘明月  张宝玺 《辣椒杂志》2007,5(1):5-8

以高抗疫病的perenial、高感疫病的83-60,及perenial×83-60的F2代辣椒苗为材料,采用CTAB法提取辣椒基因组DNA,研究RAPD-PCR反应的相关影响因子,建立并优化了一组适合辣椒抗疫病研究的RAPD-PCR反应体系和程序。  相似文献   

大丽菊杂合花色突变体的发现及RAPD鉴定   总被引：2，自引：1，他引：1  

阚雪芹  方向明  贾俊丽  郑必平  谈建中 《北方园艺》2009,(3)

以新发现的大丽菊花色突变体为材料,选取10个具有10个碱基长度的随机引物,对5种突变个体的基因组DNA进行了RAPD分析.结果表明:10个随机引物共扩增出152条DNA条带,分子量大小在250～1 600 bp之间,其中有4个引物的扩增结果中检测到了差异性条带,在DNA水平上初步证实了5种花色突变体是由于遗传因素导致的稳定变异.  相似文献   

Conversion of chromosome-specific RAPDs into SCAR-based anchor markers for onion linkage maps and its application to genetic analyses in other Allium species     

Shin-ichi Masuzaki  Tomoya Miyazaki  John A. McCallum  Sjaak van Heusden  Chris Kik  Ken-ichiro Yamashita  Yosuke Tashiro  Naoki Yamauchi  Masayoshi Shigyo 《Scientia Horticulturae》2008

Integration of previously developed Allium cepa linkage maps requires the availability of anchor markers for each of the eight chromosomes of shallot (A. cepa L. common group Aggregatum). To this end, eight RAPD markers originating from our previous research were converted into SCAR markers via cloning and sequencing of RAPD amplicons and designing of 24-mer oligonucleotide primers. Of the eight pairs of SCAR primers, seven resulted in the amplification of single bands of the original RAPDs, and the remaining primer set amplified an additional band. The results of Southern hybridization using RAPD amplicons from genomic DNA of Japanese bunching onion (Allium fistulosum L.)—shallot monosomic addition lines indicated that five SCAR markers were single shallot chromosome-specific markers and were not detected in genomic DNA of A. fistulosum. The eight SCAR primer pairs were applied to other Allium species and exhibited three types of amplification profiles, namely RAPD amplicons observed only in shallot, in shallot and Allium vavilovii, and in several Allium species. A mapping study using 65 F₂ plants generated by the selfing of one interspecific cross A. cepa × Allium roylei individual integrated the SCAR marker SAOE17₅₀₀ into chromosome 5 as expected. The results of the present study show that the eight SCAR primer sets specific to shallot can facilitate the mapping in A. cepa and can also serve as anchor points between maps of different Allium species.  相似文献   

两种柑橘线粒体DNA的获得与AFLP分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

曹庆芹  伊华林  邓秀新 《园艺学报》2003,30(4):389-393

为了研究柑橘种属间线粒体基因组的遗传多样性以及温州蜜柑胞质雄性不育的分子基础，采用了两个柑橘品种‘国庆1号’温州蜜柑和无核‘冰糖橙’的胚性愈伤组织作为提取线粒体的材料。不连续蔗糖梯度超速离心法纯化线粒体。提取的线粒体完整，具很强的荧光活性。mtDNA片段在20kb左右，且无降解。叶绿体探针rubisco L、核探针45 s rRNA Southem blotting没有检测到叶绿体DNA与核DNA，而线粒体探针apt6杂交获得一条5kb大小的带，说明用此提取方法可获得无污染的mtDNA。4对AFLP引物共得到98条带，其中14条带有多态性。  相似文献   

基于SRAP标记构建野生香菇核心种质库     

刘俊  马超君  向星洁  李闯  边银丙  张健  肖扬 《食用菌学报》2017,(1):7-17

以95份野生香菇(Lentinula edodes)种质和1份栽培种质为材料,在利用相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)标记开展遗传多样性分析的基础上,采用属性约简启发式算法和逐步聚类位点优先取样法分别构建核心种质。两种方法分别得到35份(Core 1)和29份(Core 2)种质,其核心种质保留比分别为36.5%和30.2%,位点保留比分别为100%和94.7%。基于有效等位基因数,Nei’s基因多样性指数,香农信息指数等四个参数对两组核心种质进行t测验,结果显示两组核心样本均能很好的代表原始种质的遗传多样性,但Core1具有更高的位点保留比例且地理来源更加广泛,确定为代表96个原始菌株的核心种质库。  相似文献   

野生和栽培桔梗种质遗传多样性的SRAP研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

吴松权  于亚彬  严一字  金东淳  吴基日 《北方园艺》2010,(12):132-135

采用SRAP分子标记技术,对8份野生和8份栽培桔梗种质资源进行遗传多样性研究,旨在为桔梗的遗传育种提供理论依据。结果表明:12对随机引物组合共扩增出109条谱带,平均每对引物组合扩增出9.1条谱带,其中扩增出80条多态性谱带,平均每对引物组合扩增出6.7条多态性谱带,多态率为73.4%,显示出了较高的多态性。试验中SRAP数据的遗传相似系数范围为0.56~0.88,并以遗传相似系数0.56为标准,将16份桔梗种质资源分为野生桔梗和栽培桔梗二大类群。  相似文献   

秀珍菇菌株遗传差异研究初报   总被引：5，自引：0，他引：5  

郭力刚  陈金华 《食用菌学报》2000,7(4):4-7

分析了在不同国家和地区栽培的８个秀珍菇株的农艺性状,利用现代分子生物学技术扩增获得秀珍菇菌株ＲＡＰＤ的ＤＮＡ指纹图谱,并构建其树状遗传聚类图。结果表明,这些菌株存在较大的遗传差异。  相似文献