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沉香属植物基因组DNA提取及SSR反应体系的优化 总被引:2,自引:0,他引:2
以白木香为材料,研究沉香属植物基因组DNA提取方法 ,并优化SSR-PCR反应体系。通过改良CTAB法提取白木香叶片基因组DNA,经电泳和吸光度检测。优化影响白木香SSR-PCR主要参数,确立适合沉香属植物的SSR-PCR反应体系和扩增条件:在20μL反应体系中,模板DNA、引物、Mg2+、dNTP和Taq DNA聚合酶等5种主要成分的最适浓度分别为2.5 ng/μL、1μmol/L、2 mmol/L、0.2 mmol/L、1.2 U;并用9份沉香属植物DNA样品对SSR-PCR反应体系验证,能扩增清晰条带。SSR优化系统的建立为进一步利用SSR分子标记技术进行白木香种群及不同地区沉香属种群遗传多样性研究提供基础。 相似文献
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从GenBank数据库中龙井43的EST序列中筛查EST-SSR位点,设计并获得了65对茶树(Camellia sinensis)EST-SSR引物.以鄂茶1号、龙井43、龙井群体、云抗10号、雪芽100、矮丰的基因组DNA为模板,对所设计的65对EST-SSR引物进行筛选.结果表明,65对引物均能扩增出清晰条带,有效扩增率为100%;其中有4对引物的扩增产物在6个样本间具有多态性,能用于6个茶树品种的品种鉴别. 相似文献
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基于近缘物种SSR引物和EST-SSR序列的梅花SSR引物开发 总被引:2,自引:2,他引:0
为获得更多的梅花SSR引物,本研究筛选了84对梅花近缘物种的引物,并从梅花EST数据库的序列中设计了23对EST-SSR引物,用12个梅花品种对这些引物进行了多态性检测。结果表明,近缘物种的引物有69对能扩增出条带,有效扩增率达82.1%,从中筛选的14对引物共得到85个等位基因,平均值为6个。有效等位基因数在2.07... 相似文献
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[目的]筛选胡桃的EST-SSR分子标记并对其进行引物设计。[方法]利用生物信息学方法对NCBI网上公开的5213条胡桃(Juglans regia Linn.)ESTs序列进行EST-SSR特征分析,利用利用Primer3.0软件对筛选出的EST序列设计引物。[结果]在ESTs序列中共检索出207个SSR,其中无冗余序列188,检出率为3.97%,平均分布距离为21.12kb,包括92种重复基元,其中以二核苷酸和三核苷酸重复类型为主,分别占总数目的31.40%和35.27%;对随机筛选出的50条SSR引物进行PCR扩增验证,初步筛选出30对引物。[结论]通过对胡桃EST序列中SSR位点的发掘分析,有针对性地设计EST-SSR引物,将为胡桃科EST-SSR分子标记的开发奠定基础。 相似文献
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白木香为瑞香科沉香属植物,是中国特有的珍贵药用植物,也是国产沉香药材唯一资源植物,现已濒临灭绝,被载入<中国植物红皮书>采用改良CTAB法提取白木香DNA较传统方法简单高效.通过琼脂糖凝胶电泳和OD260/OD280比值测定,所得基因组DNA纯度高,可作为ISSR等以PCR为基础的DNA多态性标记.通过优化影响白木香ISSR-PCR的主要参数,确立了适用于白木香的ISSR反应体系和扩增条件.结果表明在20μl反应体中,模板DNA、引物、Mg2+、dNTP和Taq DNA聚合酶5种主要成分的最适浓度分别为25 ng、0.8 μmol/L、2.5 mm01/L、0.2 mmol/L、1.0 U,扩增出足量产物至少需要35个循环. 相似文献
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《江苏农业科学》2015,(9)
采用EST-SSR标记构建中国常熟尚湖牡丹园引栽的21个日本牡丹品种DNA指纹图谱并进行遗传多样性分析。以筛选出的10对多态性高、稳定性好且在染色体上分布均匀的引物作为核心引物,构建日本牡丹21个品种DNA指纹图谱,用NTSYS-PCV2.10软件分析遗传多样性。结果表明,10对EST-SSR引物在21份材料中共扩增出47个多态性基因型,平均每对引物扩增4.7个,变幅1~11个;10对引物的多态性频率(FP)平均值为0.522,变幅0.227~0.950;筛选出的2对核心引物可以将21个牡丹品种完全区分,以遗传相似系数0.55为阈值可将21个供试牡丹品种分成2类。由结果可知,EST-SSR标记在供试牡丹品种间多态性差异较大,适合用于牡丹的DNA指纹图谱的构建。 相似文献
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部分鸢尾属植物的AFLP标记 总被引:1,自引:0,他引:1
利用AFLP技术,选择EcoRI/MesI酶切组合,从48对EcoRI,3/MesI+3引物组合中筛选出6对引物进行选择性扩增,检测了鸢尾属植物26个样品基因组的DNA多态性,共扩增出536个遗传位点,并通过Jaccard的方法将电泳谱带矩阵转化为遗传相似性系数矩阵,进行了UPGMA聚类分析.26个样品的遗传相似性系数... 相似文献
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土沉香实生苗苗期生长节律研究 总被引:1,自引:0,他引:1
[目的]更好地了解土沉香苗期生长节律,培育优质种苗,适应市场需求。[方法]对土沉香半年生容器实生苗苗期生长规律进行研究,并分析气象因子对苗木生长的影响,采用有序样本聚类分析法对土沉香容器苗苗期日生长率进行分析。[结果]将土沉香半年生实生容器苗的高生长划分为生长前期、速生期、缓生期、生长后期4个阶段,地径生长划分为生长前期、速生期、生长后期3个阶段。应根据不同阶段的生长特性,采取不同的阶段性育苗措施,具体为生长前期注意遮阴、除草、喷药防病、喷淋等日常管护,促进地下根系生长;速生期施用高氮低磷低钾肥,薄肥勤施,保持土壤湿润,全面除草;缓生期减少氮肥施用比例,增加磷钾肥施用比例,适当减少淋水,注意病虫害防治;生长后期停止施肥,减少淋水,以促进苗木木质化,提高抗旱性和抗寒性,继续保持遮阴防霜害。[结论]该研究为科学合理地培育土沉香苗木提供了指导。 相似文献
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为了研究瑞香科沉香属植物柯拉斯那(Aquilaria crassna)沉香的化学成分,采用硅胶柱色谱,Sephadex LH-20柱色谱等进行分离纯化。结果表明:从其乙醇提取物的乙酸乙酯萃取物中分离得到10个化合物,运用波谱学方法分别鉴定为:2-(2-苯乙基)色酮(1),6-甲氧基-2-(2-苯乙基)色酮(2),2-[2-(4-甲氧基苯)乙基]色酮(3),6-甲氧基-2-[2-(4-甲氧基苯)乙基]色酮(4),6,7-二甲氧基-2-(2-苯乙基)色酮(5),5-羟基-6-甲氧基-2-[2-(4-甲氧基苯)乙基]色酮(6),6-甲氧基-2-[2-(3-甲氧基-4-羟基苯)乙基]色酮(7),6-甲氧基-2-[2-(3-羟基-4-甲氧基苯)乙基]色酮(8),6-羟基-2-[2-(4-甲氧基苯)乙基]色酮(9)和6-羟基-2-[2-(3-羟基-4-甲氧基苯)乙基]色酮(10)。化合物2~10为首次从柯拉斯那沉香中分离得到。活性测试结果显示化合物4,5,7和8对乙酰胆碱酯酶具有一定的抑制活性。 相似文献
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[目的]为建立白木香(Aquilariasinensis)细胞悬浮培养的结构化动力学模型和次生代谢产物的生产提供参考资料。[方法]以白木香愈伤组织为材料,应用正交设计对植物生长调节剂种类、浓度以及水解酪蛋白的含量进行了筛选,并对影响其生长的不同因子进行了考察。[结果]适合白木香细胞悬浮培养的培养基为:MS+1.0mg/L6-BA+1.0mg/LNAA+1.0mg/LKT+500.0mg/L水解酪蛋白,蔗糖含量为40g/L,pH值为5.3~5.8,初始接种量为6m1种子液/20ml,肌醇含量为0.25g/L。[结论]初步建立了一个细胞生长迅速且分散性较好的白木香细胞悬浮系。 相似文献
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土沉香启动培养及其生理特性研究 总被引:2,自引:0,他引:2
以珍贵树种土沉香(Aquilaria sinensis)幼茎为材料,研究土沉香启动培养中外植体消毒的最适方法和芽诱导、愈伤组织诱导的最适培养基,植株不同部位的幼茎褐变率比较以及幼茎褐变程度与相关生理指标的关系。结果表明,土沉香启动培养中外植体幼茎的消毒方法以75%的乙醇浸泡30 s、0.1%的升汞浸泡5 min为最佳;芽诱导的培养基以1/2 MS+0.01 mg/L NAA+0.2 mg/L 6-BA为最佳,诱导率为60%;愈伤组织诱导的培养基以MS+0.05 mg/L 2,4-D+2.0 mg/L 6-BA为最佳,诱导率为80%;上部幼茎和下部幼茎相比较,上部幼茎的褐化程度较低。幼茎褐变程度与相关生理指标的关系为:总酚含量越低,PPO活性越低,POD活性越高,褐变越严重。总酚含量下降是导致幼茎褐变的最主要原因。 相似文献