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1.
本研究以温光敏小麦为试材,用TCA/丙酮和酚提取法提取小麦幼穗蛋白样品,进行了双向电泳优化分析,并对双向电泳过程中出现的问题进行了讨论。结果表明,用TCA/丙酮法提取小麦幼穗蛋白质其产率（浓度）高于酚提取法。SDS-PAGE电泳显示,用TCA/丙酮提取法提取的蛋白质能获得较清晰条带,分辨率较高,而酚提取法提取的蛋白质其条带模糊,分辨率低。对蛋白质纯化除盐可以提高分辨率,减少横竖纹,获得背景清晰的圆形蛋白点。通过ImageMasterTM 2D Platinum5.0软件分析凝胶图谱,结果显示纯化后可降低噪点,纯化后蛋白点数可从未纯化蛋白点数的216增加到583。显然,采用TCA/丙酮法可获得高浓度高质量的蛋白质,而进一步纯化、除盐离子可进一步获得背景清晰可高重复性的电泳图谱。在双向电泳实验过程中,观察到一些异常缺陷胶的出现,如双向电泳图谱中蛋白点扩散,蛋白聚集形成斑点串,没有点或点很少,出现纵纹横纹及图谱扭曲等影响图谱质量的严重问题,本研究对这些问题做了分析并提出了解决方案。 相似文献
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为建立一套适合于牡丹试管苗茎基部蛋白的双向电泳技术,以便更好地利用蛋白质组技术研究牡丹试管苗不定根的发生机理,本研究比较了三种不同蛋白质提取方法对双向电泳结果的影响,并在蛋白质上样量方面进行了比较。结果表明,乙酸铵/甲醇酚提取法所得2-DE图谱的蛋白点很少,仅检测到45个,且较模糊,有明显的拖尾现象,分辨率很低;乙醇/乙醚丙酮法所得的蛋白点也较少（101个）,较模糊,且横竖纹干扰较大;三氯乙酸/丙酮法所得蛋白点数较多,可检测到434个清晰的蛋白点,且形状规则,重复性好,适合后续分析,操作也较为简便。用三氯乙酸/丙酮法提取蛋白,采用800μg、1000μg和1200μg三个不同的上样量进行双向电泳,在上样量为1200μg时（IPGpH3～10,24cm）,蛋白质在12%SDS-PAGE胶上得到了较好的分离,在2-DE图谱上可分辨出562个蛋白点。因此,三氯乙酸/丙酮法是较适合于牡丹试管苗茎基部蛋白质提取的方法,1200μg是较为合适的上样量。 相似文献
3.
小麦花药蛋白质组双向电泳技术体系的优化 总被引：15，自引：1，他引：14
以小麦单核期花药为材料,比较了两种不同蛋白质提取方法TCA/丙酮法和酚提取法及不同的蛋白质裂解液组成对双向电泳的影响,并在蛋白质上样量和SDS-PAGE胶浓度等方面也进行了探索与优化。结果表明,采用TCA/丙酮提取法比用酚提取法提取的蛋白质所得的2-DE胶图谱上蛋白质点数增加,图谱背景也比较清晰;样品溶解于含有硫脲和TBP的蛋白质裂解液Ⅱ中,可显著提高蛋白质的溶解性,在2-DE图谱上可分辨出554个蛋白质点,比用蛋白质裂解液Ⅰ提取的蛋白多39个点。以TCA-丙酮法提取小麦花药组织中的蛋白,用蛋白质裂解液Ⅱ[7mol/L尿素、2mol/L硫脲、4%CHAPS、2%TBP、65mmol/L DTT、0.2%载体两性电解质(其中0.1%pH 3~10,0.1%pH4~6)]溶解蛋白,以pH4~7线性17cm的IPG胶条进行双向凝胶电泳,在上样量为800μg,13%SDS-PAGE胶浓度下,蛋白质得到了更好的分离,2-DE图谱上可分辨出631个蛋白点,图谱质量最佳。优化后的双向电泳技术体系,适合于小麦花药全蛋白质的双向电泳分析。 相似文献
4.
棉花胚珠蛋白三氯乙酸丙酮法与酚抽提法的比较分析 总被引：2，自引：0，他引：2
以亚洲棉（Gossypium arboreum）DPL971及DPL972初生壁合成期的胚珠为材料，通过蛋白质产率、纯度测定以及凝胶电泳图谱对三氯乙酸丙酮沉淀法和酚抽提法进行了比较分析，结果表明：1.两种方法均能获得大量的可溶性蛋白，但是酚抽提法获得的蛋白产率高、质量好、种类多；2.两种方法提取的蛋白种类有所不同，但酚抽提法在酸性区域以及对高分子量和低分子量蛋白的提取有更好的表现；3.酚抽提法可以更加有效地清除干扰物质，获得高质量的凝胶图谱，适合棉胚珠组织蛋白的提取。实验为棉纤维发育期蛋白质组学的研究提供了参考，同时对包含多种干扰物质的其它非模式植物蛋白提取也具有一定的借鉴意义。 相似文献
5.
野油菜黄单胞菌野油菜致病变种（Xanthomonas campestris pv.campestris,Xcc）是十字花科植物黑腐病的病原细菌。我们建立了Xcc的蛋白质组学研究平台,用于分离、鉴定该菌的致病相关蛋白。为了减少胞外多糖（exopolysaccharide,EPS）对蛋白材料质量的影响,我们构建了EPS缺陷的Xcc8004ΔgumB突变体。本研究以Xcc8004ΔgumB出发菌株,用诱导培养液培养,取细胞上清通过超滤浓缩得到蛋白质粗提物,分别采用丙酮沉淀法、试剂盒纯化法和丙酮沉淀-试剂盒联用法来纯化蛋白质粗提物,通过比较双向电泳的结果优选最佳的样品制备方法。结果证明丙酮沉淀-试剂盒联用法较为理想,所得双向电泳图片清晰,分辨率高。因此,此方法可以用于制备野油菜黄单胞菌分泌组双向电泳样品,并可以满足进一步研究的需要。 相似文献
6.
为了从蛋白质组学的角度探讨超强抗寒品种白菜型冬油菜‘陇油7号’的抗寒机理,本研究采用TCA(三氯乙酸)-丙酮沉淀法,提取低温胁迫(4℃,7 d)前后的叶片总蛋白,对蛋白提取方法、IPG(固定pH梯度)胶条种类等环节进行了优化,运用双向电泳和质谱分析技术,鉴定了低温胁迫下‘陇油7号’5叶期叶片总蛋白质组分的表达差异模式。结果表明:改进后的蛋白质提取液(含DTT,二硫苏糖醇)和PVPP(聚乙烯吡咯烷酮)得到的蛋白质平均浓度较改进前高3.42μg·μL-1,除盐时间较改进前短1.14 h;同时,含蛋白酶抑制剂苯甲基磺酰氟(PMSF)的蛋白提取液获得的蛋白质种类丰富,凝胶图谱中可检测到661个蛋白点,较改进前可测蛋白点数(587)提高11.2。采用17 cm p H 4~7的IPG胶条的电泳能更好地分离蛋白,得到重复性好、分辨率高的蛋白质组图谱。利用PDQuest 8.0软件分析比较了超强抗寒品种‘陇油7号’低温胁迫前后的蛋白组表达谱,发现低温胁迫前后共有15个质变的蛋白质点,推测这些差异蛋白点可能与低温胁迫的响应有关。进一步对质变的蛋白质点进行了质谱分析,鉴定出11个与低温胁迫相关的蛋白质点,这些蛋白包括光合作用相关的蛋白、糖代谢相关的蛋白、物质运输相关的蛋白和逆境响应相关的蛋白。而且,低温胁迫处理前后,‘陇油7号’叶片蛋白质的表达水平存在明显差异,这些差异蛋白可能在冬油菜抗寒响应中发挥重要作用。 相似文献
7.
绒山羊皮肤蛋白双向电泳条件的优化与常见问题分析 总被引：1，自引：0，他引：1
为建立和优化绒山羊(Capra cashmere)皮肤组织蛋白质双向电泳技术(2-DE),本研究从样品提取及纯化方法、上样量、IPG胶条的选择、等电聚焦程序等多个方面对双向电泳分离条件进行比较研究。结果显示,液氮研磨+超声波破碎法提取皮肤组织蛋白质,2-D clean up kit试剂盒进行纯化,采用17 cm pH4～7的IPG胶条450μg上样量,等电聚焦程序重复数次除盐步骤,获得的2-DE图谱效果较好;同时对实验中遇到的常见问题进行了讨论分析。结果表明,通过优化的双向电泳条件,建立了较高分辨率和较好重复性的绒山羊皮肤组织双向电泳图谱,可以进行后续实验。本研究获得良好的绒山羊皮肤组织蛋白双向电泳图谱,验证了绒山羊蛋白质组学研究的可行性,为后续进行绒山羊皮肤毛囊发育周期蛋白质组学研究、揭示毛囊发生发育规律提供了重要的技术资料。 相似文献
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猪肌肉组织双向电泳分离条件的建立及常见问题分析 总被引：1，自引：0，他引：1
为建立和优化猪肌肉组织蛋白质双向电泳技术,从提取方法、加样量、IPG胶条的选择、SDS-PAGE胶浓度、染色方法等多个方面对双向电泳分离效果进行比较研究.结果显示,液氮研磨+超声破碎法提取猪肌肉组织蛋白效果优于液氮研磨法,前者细胞破碎彻底蛋白质溶解性好且核酸污染少,图谱质量较好;18cm pH 4～7的IPG胶条分离效果比pH 3～10非线性IPG胶条好;对于银染,18 cm pH 4～7的IPG胶条150μg上样量比较适宜;同一肌肉样品的三块胶的重复性可达70％以上;同时,对双向电泳过程中的典型问题作了详尽分析.研究结果表明,通过优化的双向电泳条件获得了较高分辨率和较好重复性的猪肌肉组织双向电泳图谱,可用于后续蛋白质组学分析. 相似文献
9.
建立转乙肝表面抗原(HbsAg)基因樱桃番茄组培苗叶片的蛋白质组双向电泳体系,为转基因番茄的蛋白质组学研究提供技术参数。比较转HBsAg基因的樱桃番茄与野生型在不同蛋白裂解液、不同蛋白上样量及不同等电聚焦程序下,叶片总蛋白的双向电泳结果差异。以裂解液Ⅲ制备叶片总蛋白,采用一向13cm、pH3-10L IPG胶条,二向12.5%的SDS-PAGE凝胶,单次上样120μg叶片总蛋白,聚焦程序Ⅲ,银染时,可以得到最理想的双向电泳分析结果。在此操作程序下,野生型樱桃番茄叶片蛋白双向电泳最多可识别699个蛋白点,而转基因型樱桃番茄叶片蛋白双向电泳最多可识别545个蛋白点,其中有368个点匹配,选取丰度百分比差异2倍以上蛋白点25个进行质谱鉴定,16个蛋白点成功鉴定。本研究建立的转HBsAg基因番茄植株叶片总蛋白的双向电泳体系可为以番茄试管苗为材料进行的蛋白质组学研究提供技术支持。 相似文献
10.
鹿茸是目前唯一可以完全再生的哺乳动物附属器官,这种再生基于鹿茸再生干细胞。本研究以梅花鹿(Cervus nippon)鹿茸再生干细胞为样品,在处理方法、染色方法、蛋白纯化和等电聚焦条件4个方面对蛋白质组双向电泳进行优化。结果显示,利用Bullet Blender细胞组织破碎仪处理细胞优于超声波破碎;双染法染色能够得到更多且更清晰的蛋白点;等电聚焦总volt-hours在15 000 volt-hours时竖条纹相对较少;通过比较6种不同的蛋白提取方法与纯化方法组合,发现采用自制裂解液与双向电泳纯化试剂盒纯化相结合的方式获得的电泳图谱较好。通过综合优化后的双向电泳技术所得到的蛋白图谱中蛋白点相对较多且圆滑,条纹现象较轻,重复性较好,满足后续软件分析以及数据处理的要求,本研究为不同发育期梅花鹿鹿茸再生干细胞比较蛋白质组学研究提供了基础实验数据。 相似文献
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盐胁迫下AM菌侵染的棉花幼苗根系蛋白质组分析 总被引：1，自引：0，他引：1
研究了盐胁迫对棉花幼苗生长的抑制作用和AM真菌侵染根系对盐胁迫的缓解作用。分别以水(对照),0.5% NaCl(盐胁迫组)和AM组(盐胁迫组中加入AM接种剂,浓度为12g/L)培养棉花幼苗30d,取根部进行外观比较,并提取各组根系中的蛋白质,利用双向电泳技术分析棉花幼苗根系蛋白质组的变化。结果表明,盐胁迫组的幼苗根系主根稍细,侧根很少,而对照和AM组主根饱满且侧根丰富,说明AM真菌能抑制盐对幼苗根部的胁迫作用。通过扫描分析3组胶图,发现有4个蛋白质斑点表现出显著的变化,盐胁迫组中均表现为表达量下降,在AM真菌与盐共处理时,这4个蛋白质点的表达均有不同程度的恢复;经鉴定分析,其中2个蛋白质斑点(S1,S2)分别被鉴定为葡萄糖磷酸变位酶与异黄酮还原酶类;同时在AM组还出现3种对照中没有的蛋白质(S5、S6、S7),可能与AM提高作物耐盐性途径相关。 相似文献
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We studied the effects of high montmorillonite content in soil on the proteomic analysis of Cupriavidus metallidurans CH34 inoculated into model soils, containing a montmorilonite gradient. Bacterial proteomic analysis was conducted by two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) coupled to mass spectrometry. The results showed that increasing the montmorillonite content in artificial soil the bacterial viability did not affect but the amount of extracted proteins and the number of protein spots in 2-DE decreased. Higher soil montmorillonite content also affected the protein identification, likely due to montomrillonite-induced conformational changes in proteins or degradation. Therefore the development of soil proteomics needs to increase the studies of interaction between protein and soil components as clays or humic substances. This experiment showed how the use of a model study can be an help to achieve more information about the complexity of soil and the fate of proteins in soil. 相似文献
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Konečná H Müller L Dosoudilová H Potěšil D Buršíková J Sedo O Márová I Zdráhal Z 《Journal of agricultural and food chemistry》2012,60(10):2418-2426
Two-dimensional gel electrophoresis in combination with mass spectrometry has already been applied successfully to study beer proteome. Due to the abundance of protein Z in beer samples, prefractionation techniques might help to improve beer proteome coverage. Proteins from four lager beers of different origins were separated by two-dimensional electrophoresis (2-DE) followed by tandem mass spectrometric analysis. Initially 52 proteins mostly from Hordeum vulgare (22 proteins) and Saccharomyces species (25 proteins) were identified. Preparative isoelectric focusing by OFFGEL Fractionator was applied prior to 2-DE to improve its resolution power. As a result of this combined approach, a total of 70 beer proteins from Hordeum vulgare (30 proteins), from Saccharomyces species (31 proteins), and from other sources (9 proteins) were identified. Of these, 37 proteins have not been previously reported in beer samples. 相似文献
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Seed proteins were extracted from the African yam bean (AYB; Sphenostylis stenocarpa), an underutilized West African food legume. One- and two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis was then used to analyze the albumin fraction, galactose-specific lectins purified on immobilized galactose-Sepharose 4B, and abundant non-lectin seed proteins left over following affinity chromatography. N-terminal sequencing of prominently resolved polypetide bands led to identification of proteins having sequence homology with characterized legume seed proteins, namely, mung bean seed albumin, pea alpha-fucosidase, soybean Kunitz-type trypsin inhibitor, an endochitinase, pea pathogenesis-related protein, and/or cowpea seed storage proteins. Minor lectin-like proteins lacking hemagglutinating activity against rabbit and human erythrocytes were also identified. Because proteins such as protease inhibitors, chitinases, pathogenesis-related proteins, and lectins are known to have antimetabolic effects, the findings from this study may have relevance in the acceptability, adoption, and utilization of AYB as human food. 相似文献
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Characterization of royal jelly proteins in both Africanized and European honeybees (Apis mellifera) by two-dimensional gel electrophoresis 总被引：3，自引：0，他引：3
Sano O Kunikata T Kohno K Iwaki K Ikeda M Kurimoto M 《Journal of agricultural and food chemistry》2004,52(1):15-20
In this study, the proteins contained in royal jelly (RJ) produced by Africanized honeybees and European honeybees (Apis mellifera) haven been analyzed in detail and compared using two-dimensional gel electrophoresis, and the N-terminal amino acid sequence of each spot has been determined. Most spots were assigned to major royal jelly proteins (MRJPs). Remarkable differences were found in the heterogeneity of the MRJPs, in particular MRJP3, in terms of molecular weights and isoelectric points between the two species of RJ. Furthermore, during the determination of the N-terminal amino acid sequence of each spot, for the first time, MRJP4 protein has been identified, the existence of which had been only implied by cloning of its cDNA sequence. The presence of heterogeneous bands of glucose oxidase was also identified. Thus, the results suggest that two-dimensional gel electrophoresis provides a suitable method for the qualitative analysis of the proteins contained in RJ derived from different honeybee species. 相似文献
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Jong-Soon Choi Seong-Woo Cho Tae-Seon Kim Kun Cho Seok-Soon Han Hong-Ki Kim Sun-Hee Woo Keun-Yook Chung 《Soil biology & biochemistry》2008,40(6):1370-1378
The natural soil mineral conditioner illite effectively improved the germination and growth of lettuce when applied in particulate or powdered form. When illite was given in particulate and powdered forms, the germination rate of lettuce seeds improved remarkably up to 93% and 133%, respectively. Contrary to the developmental effects, the growth rate of lettuce treated with particulate illite improved slightly by 23%; powdered illite had no significant effects on lettuce growth rate. Thus, illite primarily affects seed germination rather than the growth of lettuce. To examine illite-induced proteins related to lettuce growth, differentially expressed proteins in lettuce leaves were analyzed by two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) and matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight/time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF/TOF MS) followed by Mascot search. From the proteomic analysis, five down-regulated proteins were identified related to storage protein, carbon metabolism and energy conversion. Three up-regulated proteins were related to energy production/conversion and carbon fixation. These results demonstrate that illite treatment as a soil conditioner helps lettuce seed germination and lettuce growth by regulating carbon metabolic flux. 相似文献
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牛骨蛋白与多糖的逐级提取及分离方法研究 总被引：1，自引：0，他引：1
为确定牛骨中蛋白质和多糖的提取及分离方法，该文在分析骨胶原蛋白和多糖存在状态的基础上，分别利用不同溶剂探讨了牛骨中蛋白质与多糖的逐级提取方法。首先碱性蛋白、酸性蛋白分别被0.6 mol/L KCl和0.5 mol/L K-P(K2HPO4/KH2PO4)溶液提取出来；0.1 mol/L HCl脱钙时溶解出酸性、中性及碱性蛋白，再经过NaOH中和后，酸性蛋白随羟基磷灰石沉淀、中性及碱性蛋白存留在上清液中；其他在胶原纤维上的有机物被0.5 mol/L NaCl和1% Na2CO3分别提取出来。各级提取有机物用SDS-PAGE电泳以及Stains All染色法、阿里新兰染色和CBB染色进行检测。利用DEAE-葡聚糖凝胶离子交换树脂有效地将碱性蛋白、酸性蛋白和多糖分离精制。 相似文献