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1.
大白菜花蕾败育相关基因的cDNA-AFLP差异表达分析 总被引：2，自引：0，他引：2
本研究以大白菜(Brassica campestris ssp.pekinensis(Lour.)Olsson)败育花蕾到正常花蕾的10个连续时期的花蕾为材料,采用cDNA-AFLP技术和生物信息学分析等方法研究了败蕾过程中的基因表达差异,获得了192个大白菜败蕾相关差异表达片段,随机挑选88个序列进行测序,获得72个新表达序列标签(ESTs),将长度大于100 bp的67个ESTs在GenBank进行了登录,登录号为GR308155-GR308221.根据生物信息学分析结果,其中Blastx比对分值大于80的62条ESTs可分为能量和新陈代谢、膜和运输、转录和翻译、氨基酸合成和加工、信号传导、防御及分类不确定7类.其中EST46、EST3-1、EST13-2、EST20-1和EST30-2等5个ESTs为大白菜花蕾败育材料中新发现的. 相似文献
2.
玉米耐旱自交系在干旱条件下的mRNA差异表达 总被引：3，自引：3，他引：3
用16%PEG-6000对玉米耐旱自交系“81565”进行模拟干旱处理,用DD-PCR技术研究干旱与正常浇水对照的mRNA差异表达,发现3个干旱条件下差异表达的特异片段MD1、MD2和MD3。MD1和MD2在干旱条件下减量表达,MD3为干旱诱导表达。序列分析和同源性比对表明,MD1与玉米叶绿体基因组中编码参与RNA转录本Ⅱ型内含子剪切的成熟酶的matK基因有93%的相似性,MD2与极端耐旱的Sporobolus stapfianus的丝氨酸/苏氨酸2C型蛋白磷酸酶基因PP2C的相似性达99%,MD3与属天冬氨酸特异性半胱氨酸蛋白酶类的水稻metacaspase基因有99%的相似性。根据各自序列相似同源基因的功能推测,MD1、MD2和MD3三个片段可能与“81565”的耐旱机制有关。 相似文献
3.
通过PCR扩增,从融安金柑基因组DNA中克隆出一条2 361 bp的DNA片段,该DNA克隆含有1个2 081 bp的LEAFY同源基因全长序列(FcLFY)。金柑LEAFY同源基因包含2个内含子和3个外显子,编码398个氨基酸。比对结果表明,金柑LEAFY同源基因与甜橙、枳的LEAFY同源基因的核苷酸和氨基酸序列的同源性均为98%。该研究为今后从分子水平上研究金柑开花调控机理打下了坚实的基础。 相似文献
4.
拟南芥(Arapidopsis)同源异型基因AP2对花分生组织和花器官的发育具有重要的表达调控作用。根据AP2基因信息利用同源序列法分离了油菜(Brassicarapa)的AP2基因(BAP2,GenBank登陆号:AF941097),并且比较了正常油菜与无花瓣油菜BAP2基因序列的差异。研究结果表明,BAP2基因的DNA序列长度为2138bp,包含9个内含子,外显子区与AP2基因的同源性达90%以上;推导的氨基酸序列为433aa,具有完整的核定位信号区和高度保守的AP2结构域,推测与AP2基因具有相似的功能。正常油菜和无花瓣油菜的BAP2基因序列仅有2处碱基存在差异,这2处碱基均位于内含子区,推导的氨基酸序列则完全一致,因此初步认为白菜型油菜花瓣缺失突变与BAP2基因无关。 相似文献
5.
几种菊科植物BADH基因同源片段的克隆与序列分析 总被引：3，自引：0，他引：3
利用PCR-Southern的方法对菊科26个种和2个菊花（Dendranthema × grandiflora ）栽培品种的甜菜碱醛脱氢酶（betaine aldehyde dehydrogenase,BADH）基因进行了检测,其中18个种和2个栽培品种呈现明显的阳性信号。对其中7个种和1个栽培品种的PCR产物进行了测序（GenBank登录号：EF683587- 683595）,其中旋覆花中获得两个长度差异较大的序列。序列分析表明：在被克隆的基因片段中,外显子的长度在各种间是一致的,且同源性在83%以上,推测的氨基酸序列的同源性在90%以上,其中旋覆花长片段中保守十肽的第二个氨基酸由苏氨酸变异为丙氨酸。各序列内含子的长度差异较大,泽兰（Eupatorium lindleyanum）、祁州漏芦（Stemmacantha uniflora）、旋覆花（Inula japonica）长片段的内含子之间,及与其它序列的内含子之间均无明显的同源性,而其它序列的内含子间则表现出较高的同源性,且由内含子所反映的基因间的系统关系与外显子反映的系统关系基本一致。 相似文献
6.
快速碱化因子是近年来新发现的一种植物多肽类信号分子。根据已知的普通白菜两用系中可育株系特异表达的快速碱化因子基因BcMF14序列,在其编码框两侧设计引物,从紫菜薹中克隆出该类信号分子基因,命名为BcMF14p(登陆号:EF523517),全长273 bp,不含内含子,编码框包含222个核苷酸,编码73个氨基酸。NCBI在线同源比对结果表明该基因属于快速碱化因子家族,与花椰菜、拟南芥等的快速碱化因子核苷酸序列相似性达到86%以上。对该信号分子的表达进行RT-PCR分析,结果显示BcMF14p只在紫菜薹花蕾、花、角果等生殖器管中表达,在茎、叶等营养器官中不表达,说明BcMF14p可能参与紫菜薹生殖发育过程中的信号传导。 相似文献
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外源DNA导入普通小麦雄性不育变异体的花粉母细胞减数分裂观察 总被引：4，自引：1，他引：4
将外源λDNA导入受体普通小麦品系 81 45 2 7,获得一雄性不育变异体。对该不育变异体和受体花粉母细胞减数分裂过程进行观察。结果发现 ,不育变异体花粉母细胞染色体异常比率达到 1 8% ,而受体花粉母细胞染色体异常比例为 0 8% ,二者存在明显差异。染色体异常类型主要有单价体、染色体落后、染色体断片、染色体桥、微核及二分体、四分体异常等。染色体异常可能是外源DNA导入受体后 ,整合进受体染色体中的DNA片段影响其正常的遗传过程而造成的。花粉母细胞减数分裂过程染色体异常可以引起部分花粉败育 ,但不是该变异体败育的主要原因 相似文献
8.
用Pot2-rep-PCR方法获得的稻瘟病菌（Magnaporthe grisea）指纹图谱基本反映了中等重复倒位单元Pot2的拷贝数和在基因组中的分布,理论扩增最短片段长度应为1 199 bp.而在江苏和中国北方来源粳稻菌株中常发现有600 bp左右长度的条带.经回收测序该片段P1长度为606 bp,其中Pot2-1端384 bp命名为S1,与Pot2的对应序列完全同源,Pot2-2端222 bp命名为S2,与Pot2对应序列同源性达89.3%.以P1及Pot2引物对可扩增的理论片段范围内的另一新扩增片段P2作为探针分别与10个DNA指纹差异明显并均含606 bp片段的菌株PCR产物进行Southern杂交,结果为P1与Pot2 rep-PCR产物的每条带均有同源性,而P2与扩增产物的最小条带没有同源性,认为P1片段的产生原因为Pot2片段的部分缺失或者部分片段在基因组中移动后整合到另一个Pot2之前. 相似文献
9.
山药PAL基因全长cDNA序列的克隆、表达与分析 总被引：2，自引：0，他引：2
为了阐明苯丙氨酸解氨酶(PAL,EC4.3.1.5)基因在山药地下块茎酚类物质积累过程中的分子机理,本研究运用普通PCR、RACE和TAIL-PCR技术从大薯(Dioscorea alataL.)’Zixiao’地下块茎中克隆到同一个PAL基因的3个片段,即长度分别为1 145bp、1 151bp和424bp的中间片段、3’端和5’端的cDNA序列;将3段cDNA序列拼接后获得大小为2 376bp的PAL基因全长cDNA序列,该序列含有一个1986bp的最大开放阅读框(ORF),一个28bp的5’端非翻译区,一个362bp含25 nt的Poly(A+)尾的3’端非翻译区,最大ORF可推测编码一个包括PAL酶活性中心的特征序列(GTITASGDLVPLSYIA)在内的661个氨基酸的多肽,分子量为71.974kDa,等电点6.310;大薯地下块茎的PAL基因分别在核苷酸与氨基酸水平上和GenBank中所选已知其他物种的同源性为73%~77%和76%~82%,说明PAL基因在系统进化上相对保守;RT-PCR分析表明该基因仅在地下块茎中表达,而且表达丰度在收获前逐渐降低。 相似文献
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甘蓝S-位点受体激酶（SRK）激酶结构域编码区分子特性及其与类硫氧还蛋白（THL1）相互作用检测 总被引：2，自引：1，他引：1
以甘蓝(Brassica oleracea L)E1为材料,采用PCR和RT-PCR技术,扩增S-位点受体激酶(SRK)激酶结构域(SRKE1)基因组DNA和cDNA序列,得到片段长度分别为1711和1 241 bp.序列分析表明,该基因组DNA序列由5个内含子和6个外显子组成,编码407个氨基酸;将sRKE1编码序列克隆到原核表达质粒pET43.1和真核表达质粒pPIC9K中,分别在表达宿主菌大肠杆菌(Eschedchia coli)BL21和毕赤酵母(Pichia pastoris)GS115中进行表达.利用表达的类硫氧还蛋白(THL1)与SRKE1孵育,结果显示SRKE1可与THL1结合并形成稳定的复合体. 相似文献
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Class-Ⅰ KNOX(KNOX1)基因是真核生物中高度保守的同源盒转录因子,在植物的器官和胚胎发生中起着重要作用。本研究从狗蔷薇(Rosa canina L.)的类原球茎中克隆出了其同源基因,通过对其编码的蛋白质序列比对和系统发育分析,认为其属于KNOX1 在狗蔷薇中的同源基因;该基因全长 1 509bp,其中编码区 1 185 bp,编码 395 个氨基酸,将其命名为 RcKN1 基因 (GenBank 登录号:JN998201)。RT-PCR分析表明,其在叶芽、花芽、类原球茎等幼嫩的器官中表达;进一步构建了组成型表达载体并导入烟草(Nicotiana tabacum L.)中分析其功能,转基因烟草出现了叶片浅裂、叶脉紊乱、叶片基部歪斜、叶片皱缩甚至类似于复叶的叶片等多种表型。研究结果表明,RcKN1 基因在植物发育中起着重要作用,是研究叶片发育机理和培育叶型奇特的花卉新品种有价值的目的基因。 相似文献
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小麦抗秆锈突变系龙辐03D51的筛选及其抗病性的遗传分析与RAPD标记 总被引：2，自引：2，他引：0
以龙6239幼胚为外植体,利用辐射诱变和组织培养相结合的方法,选育出突变系龙辐03D51,经秆锈接种鉴定,发现其对优势小种21C3CPH免疫,而亲本龙6239对21C3CPH高度感染。遗传分析表明,抗病性由显性单基因控制。该突变系还具有其亲本的优质、高产特点,已成为优异的后备品系。在RAPD检测中,所用的60个随机引物中有3个引物在龙辐03D51和其亲本龙6239中具有多态性,引物E07、E11、E17在龙辐03D51中分别扩增出380bp、700bp和600bp的特异带,初步认为这些谱带可能与秆锈抗性有关。 相似文献
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Wei Liu Duan-Wei Zhu Da-Hui Liu Wen-Bing Zhou Te-Wu Yang Ming-Jian Geng 《Journal of plant nutrition》2013,36(13):1905-1918
The effects of potassium (K) deficiency on primary and secondary metabolism in leaves of Chrysanthemum morifolium Ramat. were investigated in five different stages throughout the growing season of the plant to understand the relationship between potassium and the metabolism of C. morifolium. The results suggested that flavonoids content of K-deficient was related to 4-coumarate coenzyme A ligase (4CL) activity closely through the growth stage. Flavonoid and chlorogenic acid concentrations of K-deficient were lower than that of full K supply control (except flower bud differentiation period and budding stage in upper leaves), and the concentration in upper leaves was higher than that in bottom. The mechanism might be that the net photosynthetic rate was decreased in leaves of K1, which reduced the carbohydrate synthesized in leaves so that the coumarin concentration, which was the substrate of 4CL activity, decreased and consequently lead to the flavonoid and chlorogenic acid concentration decrease. 相似文献
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磁场处理对绿豆芽鲜重和芽长的影响 总被引：3，自引：1，他引：2
以绿豆为试验材料,研究不同磁场强度和切割速度对绿豆芽鲜重和芽长的影响。结果表明,磁场处理对绿豆芽的生长有显著促进作用,在磁场强度1.2T、切割速度0.7m/s时促进作用最明显;但这种促进作用并不随磁场强度及切割速度的增加而增加,当磁场强度超过1.2T,切割速度超过0.7m/s时,磁场对绿豆芽的鲜重和芽长的促进作用随磁场强度和切割速度的增加而降低。利用磁场处理可以促进绿豆芽生长,是一项操作简便、促进增产的有效方法, 相似文献
15.
NAC转录因子是植物特有的一类转录调控因子,在植物的生长发育、激素调节和境胁迫应答中具有重要的功能。为研究NAC转录因子在巴西橡胶树（Hevea brasiliensis）抗逆胁迫中的功能,本项目组根据巴西橡胶树NAC转录因子-HbNAC1基因序列,通过Genome Walking方法从巴西橡胶基因组DNA中获得了长度为1861bp的HbNAC1基因的5＇调控区片段,序列分析表明该段序列含有一个典型的真核生物核心启动子区域,转录起始位点T位于起始密码子上游52bp处。该启动子序列除了含有TATA-box、CAAT-box等基本顺式作用元件外,还具有茉莉酸响应元件以及大量光顺式作用元件和逆境胁迫诱导相关的顺式调控元件,这表明HbNAC1基因在橡胶树逆境胁迫应答过程具有重要功能,其启动子可能是一个光诱导型和组织特异性启动子。 相似文献
16.
M. Gogniashvili I. Maisaia A. Kotorashvili N. Kotaria T. Beridze 《Genetic Resources and Crop Evolution》2018,65(7):1995-2002
Three types of plasmon (A, B and G) are present for genus Triticum. Plasmon B is detected in polyploid species - Triticum turgidum L. and Triticum aestivum L. By now, 21 complete sequences of chloroplast DNA of the genus Triticum is published by different authors. Many inaccuracies can be detected in the sequenced chloroplast DNAs. Therefore, we found it necessary to study of plasmon B evolution to use only those sequences obtained by our method in our laboratory. Complete nucleotide sequences of chloroplast DNA of 11 representatives of Georgian wheat polyploid species were determined. Chloroplast DNA sequencing was performed on an Illumina MiSeq platform. Chloroplast DNA molecules were assembled using the SOAPdenovo computer program. Using T. aestivum L. subsp. macha var. palaeocolchicum as a reference, 5 SNPs were identified in chloroplast DNA of Georgian indigenous polyploid wheats. 38 and 56 bp inversions were observed in paleocolchicum subspecies. The phylogeny tree shows that subspecies macha, durum, carthlicum and palaeocolchicum occupy different positions. According the simplified scheme based on SNP and indel data the ancestral, female parent of all studied polyploid wheats is an unknown X predecesor, from which four lines were formed. 相似文献
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一例特异细胞质雄性不育小麦mtDNA特异片段的克隆和测序 总被引：2，自引：1，他引：1
以具有同质同核的二角型小麦花药外露不育系与花药不外露突变不育系为试材,对其mtDNA进行了RAPD分析,筛选出特异片段S32-1582、OPAA16-1753,并进行克隆与测序。结果表明:花药外露型不育系与花药不外露型不育系细胞质内mtDNA存在明显差异,而ctDNA之间不存在差异;二角型花药外露型不育系转化为花药不外露型不育系,很可能是由于mtDNA自发的重排引起的。其差异片段S32-1582、OPAA16-1753序列与核基因组上的序列具有同源性;供试线粒体基因组能够在较短的演化时间内发生变异,从而引起二角型花药外露型不育系向花药不外露型不育系的变异,其特异质核互作可能起重要作用。 相似文献
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为探明药用植物根围AM真菌遗传多样性,于2010年8月在河北省安国市3个样地(中药材种植基地、霍庄、大户村)用随机抽样法采集7种中药材根围土壤样品,分离筛选双网无梗囊霉(Acaulospora bi-reticulata)为试验菌种,进行孢子DNA提取、PCR扩增、序列测定及聚类分析,研究了双网无梗囊霉遗传多样性与土壤因子的关系,并选取两条代表菌株所测序列,连同从NCBI数据库中下载的4属28种AM真菌相应序列构建系统发育树。结果表明,双网无梗囊霉可侵染不同样地不同宿主植物,3个样地7种中药材双网无梗囊霉DNA相似性达99.2%以上,其遗传特征保持了高度稳定性,双网无梗囊霉在样地和植物间具有广谱性。同一样地不同中药材根围土壤因子相似性很高,AM真菌DNA碱基序列相似系数也很高,而不同样地同一中药材根围AM真菌DNA碱基序列相似系数低于前者,可见遗传多样性与土壤因子密切相关。土壤因子对双网无梗囊霉基因序列的影响大于宿主植物的影响。 相似文献
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促花生长调节剂(Ethrel、PP333)和夏剪成花机理的初步研究 总被引：2，自引：0，他引：2
应用放射免疫法测定了IAA、ABA、CTK和C_2H_4等4种内激素的含量。结果表明,促花生长调节剂和夏剪处理的成花机理之一是造成枚条茎尖有利于花芽分化的激素环境,即CTK类物质和内源乙烯含量较高,ABA适中,生长物质(IAA—GA_3)含量下降,建立了一种以促花激素占优势的激素平衡系统。此结果为进一步揭示果树花芽分化机理和制定控制花芽分化的技术措施提供了重要的科学依据。 相似文献